| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 1,303,314 | IS186 (+) +6 bp :: Δ1 bp | coding (416‑421/921 nt) | oppB → | murein tripeptide ABC transporter/oligopeptide ABC transporter inner membrane subunit OppB |
| New junction evidence | |||||||||||
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| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 609350 | NA (NA) | 57 (0.880) | 54/474 | 0.2 | 94.9% | noncoding (1344/1345 nt) | IS186 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 1303314 = | 3 (0.050) | coding (416/921 nt) | oppB | murein tripeptide ABC transporter/oligopeptide ABC transporter inner membrane subunit OppB | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 1303319 | 4 (0.060) | 43 (0.670) | 42/472 | 0.5 | 91.3% | coding (421/921 nt) | oppB | murein tripeptide ABC transporter/oligopeptide ABC transporter inner membrane subunit OppB |
| ? | NC_000913 | 2514273 = | NA (NA) | noncoding (1/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
GCAGAAAATTGCTTCCACGCTCTCTCCGCGTGCTGAAGGCATCATCTCTGTGTTCCTGGTTTCCTTCGCTAACTTCTCTTCAATCGGGATTATCGCAGGTGCAGTTAAAGGCCTGAATGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGGGGATGTCATTACGTGAAGTCACTGCATGGGC > NC_000913/2514025‑2514521 | gCAGAAAATTGCTTCCACGCTCTCTCCGCGTGCTGAAGGCATCATCTCTGTGTTCCTGGTTTCCTTCGCTAACTTCTCTTCAATCGGGATTATCGCAGGTGCAGTTAAAGGCCTGAATGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAAtt < 1:156898/249‑1 (MQ=255) cACGCTCTCTCCGCGTGCTTAAGGCATCATCTCTTTGTTCCTGGTTTCCTTCGCTAACTTCTCTTCAATCGGGATTATCGCAGGTGCAGTTAAAGGCCTGAATGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACtt < 2:495630/251‑1 (MQ=255) cACGCTCTCTCCGCGTGCTGAAGGCATCATCTCTGTGTTCCTGGTTTCCTTCGCTAACTTCTCTTCAATCGGGATTATCGCAGGTGCAGTTAAAGGCCTGAATGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACtt > 1:481972/1‑251 (MQ=255) cGCTCTCTCCGCGTGCTGAAGGCATCATCTCTGTGTTCATGGTTTCCTTCGCTAACTTCTCTTCAATCGGGATTATCGCAGGTGCAGTTAAAGGTCTGAATGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCGCGCTTTGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGGTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTaa < 1:331609/251‑1 (MQ=255) tctcCGCGTGCTGAAGGCATCATCTCTGTGTTCCTGGTTTCCTTCGCTAACTTCTCTTCAATCGGGATTATCGCAGGTGCAGTTTAAGGCCTGACTGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGATTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGACGGGGATACTTCCCATAAGCGCTAACTTACGGGtt > 2:77715/1‑251 (MQ=255) ccGCGGGCTGAAGGCAACATCTCTGTGGTCCTGGTTGCCTTCGCTAACTTCTCGTCAATCGGGATTATCGCAGGTGCAGTTAAAGGACTGAATGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACAGAAAAAAGCCGGGGAGAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTtgt < 2:126139/250‑1 (MQ=255) cgTGCTGAAGGCATCATCTCTGTGTTCCTGGTTTCCTTCGCTAACTTCTCTTCAATCGGGATTATCGCAGGTGCAGTTAAAGGCCTGAATGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTa < 1:531726/251‑1 (MQ=255) 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gggATTATCGCAGGTGCAGTTAAAGGCCTGAATGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCa < 1:282672/251‑1 (MQ=255) aTTATCGCAGGTGCAGTTAAAGGCCTTAATGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATGCCCATAAGCGCTAACGTAGGGGTTGTGGTATTACGCCTAATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAAtt < 1:63305/251‑1 (MQ=255) ttcaaGGCCTGTATGCAGAGCACGGTACCGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATACTTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTCAGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGCCAGCAATTCTGCCCCATATTGGt > 2:93140/4‑250 (MQ=37) 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tggattCTAGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGTGTGTGCTGTCTGCGTCACTCGCAGCACTGGTGCAGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTCAGGGTTATGGTATTAAGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAGTTACTCTCACGCTAGCTCGTCAGCAGTTCTGGCCAATATTGGTAAGCCCGAACAACTggctccttaggcccgt > 2:558018/5‑236 (MQ=255) ggTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTa < 1:77715/250‑1 (MQ=255) atcGCTTTGGTCTGAAGCTGGTTTGCGGCTCTACCCGGGTGAGTGTGCTGTCTGCGGCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGTCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTACTGcc < 2:655788/249‑1 (MQ=21) cGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTTTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAGAAAGCCGGGGATAATTCACATGAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTGACGTGCCGATGAATTACTCTAACGGTAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGGAAGCCCGAAGACCTGGATACTTCGGCACGTAATGCCggg > 2:55762/1‑251 (MQ=21) cGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATACGCGCTAACTTCAGGGTTGTGGAATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCggg > 2:285054/1‑251 (MQ=255) ttCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCCGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGcc > 1:358990/1‑141 (MQ=255) ttCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCCGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGcc < 2:358990/141‑1 (MQ=255) 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gCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGt < 1:382175/248‑1 (MQ=255) cGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGTGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGggctggc < 1:93140/251‑1 (MQ=255) gcagcaCTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGggctggct > 1:471338/1‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |