| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 89,103 | G→C | intergenic (+71/‑531) | cra → / → mraZ | DNA‑binding transcriptional dual regulator Cra/DNA‑binding transcriptional repressor MraZ |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 89,103 | 0 | G | C | 94.4% | 179.7 / ‑1.4 | 55 | intergenic (+71/‑531) | cra/mraZ | DNA‑binding transcriptional dual regulator Cra/DNA‑binding transcriptional repressor MraZ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/2); new base C (19/32); total (21/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.66e-01 | |||||||||||
GAACTGCTCGACTTCTTACAGTGTCCGGTGCTGGCAGTGGCTCAACGTCACCGCGATGTCGCAGAGCGTGTGCTGGAGATTGTCCTGGCAAGCCTGGACGAACCGCGTAAGCCAAAACCTGGTTTAACGCGCATTAAACGTAATCTCTATCGCCGCGGCGTGCTCAGCCGTAGCTAAGCCGCGAACAAAAATACGCGCCAGGTG‑AATTTCCCTCTGGCGCGTAGAGTACGGGACTGGACATCAATATGCTTAAAGTAAATAAGACTATTCCTGACTATTATTGATAAATGCTTTTAAACCCGCCCGTTAATTAACTCACCAGCTGAAATTCACAATAATTAAGTGATATCGACAGCGCGTTTTTGCATTATTTTGTTACATGCGGCGATGAATTGCCGATTTAACAAACACTTTTCTTTGCTTTTGCGCAAACCCGCTGGCATCAAGCGCCACACAGACGTAACAAGGACTGTTAACCGGGGAAGATATGTCCT > NC_000913/88856‑89349 | gAACTGCTCGACTTCTTACAGTGTCCGGTGCTGGCAGTGGCTCAACGTCACCGCGATGTCGCAGAGCGTGTGCTGGAGATTGTCCTGGCAAGCCTGGACGAACCGCGTAAGCCAAAACCTGGTTTAACGCGCATTAAACGTAATCTCTATCGCCGCGGCGTGCTCAGCCGTAGCTAAGCCGCGAACAAAAATACGCGCCAGGTG‑AATTTCCCTCTGGCGCGTAGAGTACGGGAATGGACATCAATATCCtt < 1:459199/251‑1 (MQ=255) acggCTCGACTTCTTACAGTGTCCGGTGCTGGAAGTGGCTAAACGTCACCGCGATGGCGCAGAGCGTGTGCTGGAGATTGTCCTGGCAAGCCTGGACGAACCGCGTAAGCCAAAACCTGGTTTAACGCGCATTAAACGTAATCTCGATCGCCGCGGCGTGCTCAGCCGTAGCTAAGCCGCGAACAAAAATACGCGCCAGGTG‑AATTTCCCGCTGGCGCGTAGAGTACGGGAATGGACAGCAATATGCTTaa < 2:724662/248‑1 (MQ=255) tGCTCGACTTCTTACAGTGTCCGGTGCTGGCAGTGGCTCAACGTCACCGCGATGTCGCAGAGCGTGTGCTGGAGATTGTCCTGGCAAGCCTGGACGAACCGCGTAAGCCAAAACCTGGTTTAACGCGCATTAAACGTAATCTCTATCGCCGCGGCGTGCTCAGCCGTAGCTAAGCCGCGAACAAAAATACGCGCCAGGTG‑AATTTCCCTCTGGCGCGTAGAGTACGGGAATGGACATCAATATCCTTaa > 1:774132/1‑249 (MQ=255) tGCTCGACTTCTTACAGTGTCCGGAGCTGGCAGTGGCTCAACGTCACCGCGATGTCGCAGAGCGTGTGCTGGAGATTGTCCTGGCAAGCCTGGACGAACCGCGTAAGCCAAAACCTGGTTTAACGCGCATTAAACGTAATCTCTATCGCCGCGGCGTGCTCAGCCGTAGCTAAGCCGCGAACAAAAATACGCGCCAGGTG‑AATTTCCCTCTGGCGCGTAGAGTCCGGGAATGGACCTCAATATCCTTaa > 2:436915/1‑249 (MQ=255) gACTTCTTACAGGGTCCGGTGCTGGCAGTGGCTCAACGTCACCGCGATGTCGCAGAGCGTGTGCTGGAGATTGTCCTGGCAAGCCTGGACGAACCGCGTAAGCCAAAACCTGGTTTAACGCGCATTAAACGTAATCTCTATCGCCGCGGCGTGCTCAGCCGTAGCTAAGCCGCGAACAAAAATACGCGCCAGGTG‑AATTTCCCTCTGGCGCGTAGAGTACGGGAATGGACATCAATATCCTTAAAGTAAAt < 1:96537/251‑1 (MQ=255) cttcttACAGTGTCCGGTGCTGGCAGTGGCTCAACGTCACCGCGATGTCGCAGAGCGTGTGCTGGAGATTGTCCTGGCAAGCCTGGACGAACCGCGTAAGCCAAAACCTGGTTTAACGCGCATTAAACGTAATCTCTATCGCCGCGGCGTGCTCAGCCGTAGCTAAGCCGCGAACAAAAATACGCGCCAGGTG‑AATTTCCCTCTGGCGCGTAGAGTACGGGAATGGACATCAATATCCTTAAAGTAAATa > 1:766889/1‑250 (MQ=255) tACAGTGTCCGGTGCTTGCAGTGGTTCAACGTCCCCGCGATTGCGCATGGCGTGTGCTGGAGATTGTCCTGGCAAGCCTGGACGAACCGCTTAAGCCAAAACCTGGTTTAACGCGCATTAAACGTAATCTCTATCGCCGCGGCGTGCTCATCCGTAGCTAAGCTGCGAACAAAAATACGCGCCAG‑TGTAATTTCACTCTGGCTCGTAGAGTACGGGAATTGACATCAATATCCTTAAAGTAAAGAAGACt < 2:524778/250‑1 (MQ=255) tACAGTGTCCGGTGCTGGCAGTGGCTCAACGTCACCGCGATGTCGCAGAGCGTGTGCTGGAGATTGTCCTGGCAAGCCTGGACGAACCGCGTAAGCCAAAACCTGGTTTAACGCGCATTAAACGTAATCTCTATCGCCGCGGCGTGCTCAGCCGTAGCTAAGCCGCGAACAAAAATACGCGCCAGGTG‑AATTTCCCTCTGGCGCGTAGAGTACGGGAATGGACATCAATATCCTTAAAGTAAATAAGa < 1:594090/248‑1 (MQ=255) gtgtCCGGTGCTGGCAGTGGCTCACCGTCACCGCGATGTCGCAGAGCGTGTGCTGGAGATTGTCCTGGCAAGCCTGGACGAACCGCGTAAGCCAAATCCTGGTTTAACGCGCATTAAACGTAATCTCTATCGCCGCGGCGTGCTCAGCCGTAGCTAAGCCGCGAACAAAAATACGCGCCAGGTG‑AATTTCCCTCTGGCGCGTAGAGTACGGGAATGGACAGCAATATCCTTAAAGTAAATAAGACTATTcc < 2:476617/251‑1 (MQ=255) ggTGCTGGCAGTGGCTCAACGTCACCGCGATGTCGCAGAGCGTGTGCTGGAGATTGTCCTGGCAAGCCTGGACGAACCGCGTAAGCCAAAACCTGGTTTAACGCGCATTAAACGTAATCTCTATCGCCGCGGCGTGCTCAGCCGTAGCTAAGCCGCGAACAAAAATACGCGCCAGGTG‑AATTTCCCTCTGGCGCGTAGAGTACGGGAATGGACATCAATATCCTTAAAGTAAATAAGCCTATTCCTgcctt > 1:346025/1‑247 (MQ=255) ggCAGTGGCTCAACGTCACCGCGATGTCGCAGAGCGTGTGCTGGAGATTGTCCTGGCAAGCCTGGACGAACCGCGTAAGCCAAAACCTGGTTTAACGCGCATTAAACGTAATCTCTATCGCCGCGGCGTGCTCAGCCGTAGCTAAGCCGCGAACAAAAATACGCGCCAGGTG‑AATTTCCCTCTGGCGCGTAGAGTACGGGAATGGACATCAATATCCTTAAAGTAAATAAGACTATTCCTGACTATTATTg < 1:436915/251‑1 (MQ=255) aGTGGCTCAACGTCACCGCGATGTCGCAGAGCGTGTGCTGGAGATTGTCCTGGCAAGCCTGGACGAACCGCGTAAGCCAAAACCTGGTTTAACGCGCATTAAACGTAATCTCTATCGCCGCGGCGTGCTCAGCCGTAGCTAAGCCGCGAACAAAAATACGCGCCAGGTG‑AATTTCCCTCTGGCGCGTAGAGTACGGGACTGGACATCAATATGCTTAAAGTAAATAAGACTATTCCTGACTATTATTGAt > 1:397238/1‑250 (MQ=255) tGGCTCAACGTCACCGCGATGTCGCAGAGCGTGTGCTGGAGATTGTCCTGGCAAGCCTGGACGAACCGCGTAAGCCAAAACCTGGTTTAACGCGCATTAAACGTAATCTCTATCGCCGCGGCGTGCTCAGCCGTAGCTAAGCCGCGAACAAAAATACGCGCCAGGTG‑AATTTCCCTCTGGCGCGTAGAGTACGGGAATGGACATCAATATCCTTAAAGTAAATAAGACTATTCCTGACTATTATTGATa > 1:359102/1‑249 (MQ=255) ggCTCAACGTCACCGCGATGTCGCAGAGCGTGTGCTGGAGATTGTCCTGGCAAGCCTGGACGAACCGCGTAAGCCAAAACCTGGTTTAACGCGCATTAAACGTAATCTCTATCGCCGCGGCGTGCTCAGCCGTAGCTAAGCCGCGAACAAAAATACGCGCCAGGTG‑AATTTCCCTCTGGCGCGTAGAGTACGGGAATGGACATCAATATCCTTAAAGTAAATAAGACTATTCCTGACTATTATTGATaagt < 1:561376/251‑3 (MQ=255) gCTCAACGTCACCGCGATGTCGCAGAGCGTGTGCTGGAGATTGTCCTGGCAAGCCTGGACGAACCGCGTAAGCCAAAACCTGGTTTAACGCGCATTAAACGTAATCTCTATCGCCGCGGCGTGCTCAGCCGTAGCTAAGCCGCGAACAAAAATACGCGCCAGGTG‑AATTTCCCTCTGGCGCGTAGAGTACGGGAATGGACATCAATATCCTTAAAGTAAATAAGACTATTCCTGACTATTATTGATaagtt > 1:465036/1‑248 (MQ=255) aaCGTCACCGCGATGTCGCAGAGCGTGTGCTGGAGATTGTCCTGGCAAGCCTGGACGAACCGCGTAAGCCAAAACCTGGTTTAACGCGCATTAAACGTAATCTCTATCGCCGCGGCGTGCTCAGCCGTAGCTAAGCCGCGAACAAAAATACGCGCCAGGTG‑AATTTCCCTCTGGCGCGTCGAGTACGGGAATGGCCATCAATATCCTTAAAGTAAATAAGACTATTCCTGACTATTATTGATacgttcttt > 2:233832/1‑243 (MQ=255) aaCGTCACCGCGATGTCGCAGAGCGTGTGCTGGAGATTGTCCTGGCAAGCCTGGACGAACCGCGTAAGCCAAAACCTGGTTTAACGCGCATTAAACGTAATCTCTATCGCCGCGGCGTGCTCAGCCGTAGCTAAGCCGCGAACAAAAATACGCGCCAGGTG‑AATTTCCCTCTGGCGCGTAGAGTACGGGACTGGACATCAATATCCTTAAAGTAAATAAGACTATTCCTGACTATTATTGATaagttcttt > 2:818029/1‑244 (MQ=255) cACCGCGATGTCGCAGAGCTGGTGCTGGAGATTGTCCTGGTAAGCCTGGACGAACCGCGTAAGCCAAAACCTGGTTTAACGCGCATTAAACGTAATCTCTATCGCCGCGGCGTGCTCAGCCGTAGCTAAGCCGCGAACAAAAATACGCGCCAGGTG‑AATTTCCCTCTGGCGCGTAGAGTACGGGAATGGACATCAATATCCTTAAAGTAAATAAGACTATTCCTGACTATTATTGATAAGTTCTTTTAAAc < 2:343393/251‑1 (MQ=255) cgcgATGTCGCAGGGCGTGTGCTGGAGATTGTCCTGGCAAGCCTGGACGAACCGCGTAAGCCAAAACCTGGTTTAACGCGCATTAAACGTAATCTCTATCGCCGCGGCGTGCTCAGCCGTAGCTAAGCCGCGAACAAAAATACGCGCCAGGTG‑AATTTCCCTCTGGCGCGTAGAGTACGGGAATGGACATCAATATCCTTAAAGTAAATAAGACTATTCCTGACTATTATTGATAAGTTCTTTTAAAcccg < 2:81791/251‑1 (MQ=255) gATGTCGCAGAGTGTGGGCTTGAGATTGTCCTGGCAAGCATGGACGACCCGCGTAAGCCAAAACCTGGTTTAACTCGCATTAAACGTAAGCTCGATCGCGGCGGCGTGCTCAGCCGGAGCTAAGCCGCGAACAAAAATACGCGCCAGGTG‑AATGTCCCTATGGCGCGTAGAGTACGGGAATGGACATCAATATCCTTAAAGTAAATAAGACTATTCCTGACTATTAGTGATAAGTTCTTTTAAAcccgccc < 2:827764/251‑1 (MQ=255) tGTCGCAGAGCGTGTGCTGGAGATTGTCCTGGCAAGCCTGGACGAACCGCGTAAGCCAACACCTGGTTTAACGCGCATTAAACGTAATCTCTATCGCCGCGGCGTGCTCAGCCGTAGCTAAGCCGCGAACAAAAATACGCGCCAGGTG‑AATTTCCCTCTGGCGCGGAGAGTACGGGAATGGACATCAAGATCCTTAAAGTAAATAAGACTATTACTGACAAATATTGaaaaggtctttaaaaccagacagg > 2:661965/1‑228 (MQ=255) gtgCTGGAGATTGTCCTGGCAATCCTGGACGAACCGCGTAAGCCAAAACCTGGTTTAACGCGCATTAAACGTAATCTCTATCGCCGCGGCGTGCTCAGCCGTAGCTAAGCCGCGAACAAAAATACGCGCCAGGTG‑AATTTCCCTCTGGCGCGTAGAGTACGGGAATGGACATCAATATCCTTAAAGTAAATAAGACTATTCCTGACTATTATTGATAAGTTCTTTTAAACCCGCCCGTTAATTAACTCAcc < 2:263692/251‑1 (MQ=255) agaTTGTCCTGGCAAGCCTGGACGAACCGCGTAAGCCAAAACCTGGTTTAACGCGCATTAATCGTAATCTCTATCGCCGCGGCGTGCTCAGCCGTAGCTAAGCCGCGAACAAAAATACGCGCCAGGTG‑AATTTCCCTCTGGCGCGTAGAGTACGGGAATGGACATCAATATCCTTAAAGTAAATAAGACTATTCCTGACTATTATTGATAAGTTCTTTTAAACCCGCCCGTTAATTAACTCACCAGCTGaa < 1:16643/251‑1 (MQ=255) ccTGGCAAGCCTGGACGAACCGCGTAAGCCAAAACCTGGTTTAACGCGCATTAAACGTAATCTCTATCGCCGCGGCGTGCTCAGCCGTAGCTAAGCCGCGAACAAAAATACGCGCCAGGTG‑AATTTCCCTCTGGCGCGTAGAGTACGGGAATGGACATCAATATCCTTAAAGTAAATAAGACTATTCCTGACTATTATTGATAAGTTCTTTTAAACCCGCCCGTTAATTAACTCACCAGCTGAAATTcac < 1:699800/250‑1 (MQ=255) ggCAAGCCTGGACGAACCGCGTAAGCCAAAACCTGGTTTAACGCGCATTAAACGTAATCTCTATCGCCGCGGCGTGCTCAGCCGTAGCTAAGCCGCGAACAAAAATACGCGCCAGGTG‑AATTTCCCTCTGGCGCGTAGAGTACGGGAATGGACATCAATATCCTTAAAGTAAATAAGACTATTCCTGACTATTATTGATAAGTTCTTTTAAACCCGCCCGTTAATTAACTCACCAGCTGAAATTCACaat < 1:862926/250‑1 (MQ=255) gCAAGCCAGGACACACCGCGTAAGCAAAAACCTTGTTTAACGCGCATTAAACGTAATCTCTAACGCCGCGGCGTGCTCAGCCGTAGCTAAGCCGCAAACAAAAATACGCGCCATGTG‑AATTTCCCTCTTGCGCGTAGAGTACGGGACTGGACATCAATATGCTTAAAGTAAATAAGACTATTCCTGACTATTATTTATAAATGCTTTTAAACCCGCCCGTTAATTAACTCACCAGCTTAAATTCACaataa < 2:375728/251‑1 (MQ=255) cAAGCCTGGACGAACCGCGTAAGCCAAAACCTGGTTTAACGCGCATTAAACGTAATCTCTATCGCCGCGGCGTGCTCAGCCGTAGCTAAGCCGCGAACAAAAATACGCGCCAGGTG‑AATTTCCCTCTGGCGCGTAGAGTACGGGAATGGACATCAATATCCTTAAAGTAAATACGACTATTCCTGACTATTATTGCTAAGTTCTTTTAAACCCGCCCGTTAATTAACTCCCCAGCTGAAATTCACattaat > 2:183955/1‑251 (MQ=255) aaGCCTGGACGAACCGCGTAAGCCAAAACCTGGTTTAACGCGCATTAAACGTAATCTCTATCGCCGCGGCGTGCTCAGCCGTAGCTAAGCCGCGAACAAAAATACGCGCCAGGTG‑AATTTCCCTCTGGCGCGTAGAGTACGGGAATGGACATCAATATCCTTAAAGTAAATAAGACTATTCCTGACTATTATTGATAAGTTCTTTTAAACCCGCCCGTTAATTAACTCACCAGCTGAAATTCACAATAAtt < 1:29695/251‑1 (MQ=255) aCGAACCGCGTAAGCCAAAACCTGGTTTAACGCGCATTAAACGTAATCTCTATCGCCGCGGCGTGCTCAGCCGTAGCTAAGCCGCGAACAAAAATACGCGCCAGGTG‑AATTTCCCTCTGGCGCTTAGAGTTCGGGAATGGACATCAATATCCTTAAAGTAAATAAGACTATTCCTGACTATTATTGATAAGTTCTTTTAAACCCGCCCGTTAATTAACTCACCAGCTGAAATTCACAATAATTAAGTGata < 2:848709/251‑1 (MQ=255) aaCCGCGTAAGCCAAAACCTGGTTTAACGCGCATTAAACGTAATCTCTATCGCCGCGGCGTGCTCAGCCGTAGCTAAGCCGCGAACAAAAATACGCGCCAGGTG‑AATTTCCCTCTGGCGCGTAGAGTACGGGAATGGACATCAATATCCTTAAAGTAAATAAGACTATTCCTGACTATTATTGATAAGTTCTTTTAAACCCGCCCGTTAATTAACTCACCAGCTGAAAGTCACAATAATTAAGTGATATCg < 2:289382/251‑1 (MQ=255) ccGCGTAAGCCAAAACCTGGTTTAACGCGCATTAAACGTAATCTCTATCGCCGCGGCGTGCTCAGCCGTAGCTAAGCCGCGAACAAAAATACGCGCCAGGTG‑AATTTCCCTCTGGCGCGTAGAGTACGGGAATGGACATCAATATCCTTAAAGTAAATAAGACTATTCCTGACTATTATTGATAAGTTCTTTTAAACCCGCCCGTTAATTAACTCACCAGCTGAAATTCACAATAATTAAGTGATATCGAc < 1:315910/251‑1 (MQ=255) cgcgTAAGCCAAAACCTGGTTTAACGCGCATTAAACGTAATCTCTATCGCCGCGGCGTGCTCAGCCGTAGCTAAGCCGCGAACAAAAATACGCGCCAGGTG‑ACTTTCCCTCTGGCGCGTAGAGTACGGGAATGGACATCAATATCCTTAAAGTTAATAAGACTATTCCTGACTATTATTGATAAGTTCTTTTAAACCCGCCCGTTAATTAACTAACCAGCTGAAATTCCCAATAATTAAGTGATATCGaa > 2:22558/1‑249 (MQ=255) tAAGCCAAAACCTGGTTTAACGCGCATTAAACGTAATCTCTATCGCCGCGGCGTGCTCAGCCGTAGCTAAGCCGCGAACAAAAATACGCGCCAGGTG‑AATTTCCCTCTGGCGCGTAGAGTACGGGAATGGACATCAATATCCTTAAAGTAAATAAGACTATTCCTGACTATTATTGATAAGTTCTTTTAAACCCGCCCGTTAATTAACTCACCAGCTGAAATTCACAATAATTAAGTGATATCGACAgcgc > 1:84650/1‑251 (MQ=255) aaaCCTGGTTTAACGCGCATTAAACGTAATCTCTATCGCCGCGGCGTGCTCAGCCGTAGCTAAGCCGCGAACAAAAATACGCGCCAGGTG‑AATTTCCCTCTGGCGCGTAGAGTACGGGAATGGACATCAATATCCTTAAAGTAAATAAGACTATTCCTGACTATTATTGATAAGTTCTTTTAAACCCGCCCGTTAATTAACTCACCAGCTGAAATTCACAATAATTAAGTGATATCGACAGCGCGTTTTTg < 1:850668/251‑1 (MQ=255) aaaCCTGGTTTAACACGCATTAAACGTAATCTCTATCGCCGCGGCGTGCTCAGCCGTAGCTAAGCCGCGAACAAAAATACGCGCCAGGTG‑AATTTCCCTCTGGCGCGTAGAGTACGGGAATGGACATCAATATCCTTAAAGTAAATAAGACTATTCCTGACTATTATTGATAAGTTCTTTTAAACCCGCCCGTTAATTAACTCACCAGCTGAAATTCACAATAATTAAGTGATATCGACAGCGCGTTTTTg < 2:766889/251‑1 (MQ=255) ccTGGTTTAACGCGCATTAAACGTAATCTCTATCGCCTCGGCGTGCTCAGCCGTAGCTAAGCCGAGAACAAAAATACGCGCCAGGTG‑AATTTCCCTCTGGCGCGTAGAGTACGGGAATGGATATCAATATCCTTAAAGTAAATAAGACTATTCCTGACTATTATTGATAAGTTCTTTTAAACCCGCCCGTTAATTAACTCACCAGCTGAAATTCACAATAATTAAGTGATAGCGACATCGCGTTTTTGCat < 2:780517/251‑1 (MQ=255) ggTTTAACGCGCATTAAACGTAATCTCTATCGCCGCGGCGTGCTCAGCCGTAGCTAAGCCGCGAACAAAAATACGCGCCAGGTG‑AATTTCCCTCTGGCGCGTAGAGTACGGGAATGGACATCAATATCCTTAAAGTAAATAAGACTATTCCTGACTATTATTGATAAGTTCTTTTAAACCCGCCCGTTAATTAACTCACCAGCTGAAATTCACAATAATTAAGTGATATCGACAGCGCGTTTTTGCatta < 1:332828/250‑1 (MQ=255) aaCGGGCATTTAACGTAAACTCCATCGCCGCGGCGTGCTTAGCCGTAGCTAAGCCGCGAAAAAAAATACGCGCCAGGTG‑AATTTCCCTCTGGCGCGTAGAGTACGGGAATGGACATCAATATCCTTAAAGTAAATAAGACTATTCCTGACTATTATTGATAAGTTCTTTTAAACCCGCCCGTTAATTAACTCACCAGCTGAAATTCACAATAATTAAGTGATATCGACAGCGCGTGTTTGCATTATTTTGt < 2:346025/251‑1 (MQ=255) cGTAATCTCTATCGCCGCGGCGTGCTCAGCCGTAGCTAAGCCGCGAACAAAAATACGCGCCAGGTG‑AATTTCCCTCTGGCGCGTAGAGTACGGGAATGGACATCAATATCCTTAAAGTAAATAAGACTATTCCTGACTATTATTGATAAGTTCTTTTAAACCCGCCCGTTAATTAACTCACCAGCTGAAATTCACAATAATTAAGTGATATCGACAGCGCGTTTTTGCCTTATTTTGTTACATgcag > 2:853206/1‑245 (MQ=255) cGTAATCTCTATCGCCGCGGCGTGCTCAGCCGTAGCTAAGCCGCGAACAAAAATACGCGCCAGGTG‑AATTTCCCTCTGGCGCGTAGAGTACGGGAATGGACATCAATATCCTTAAAGTAAATAAGACTATTCCTGACTATTATTGATAAGTTCTTTTAAACCCGCCCGTTAATTAACTCACCAGCTGAAATTCACAATAATTAAGTGATATCGACAGCGCGTTTTTGCATTATTTTGTTACATgcagagat < 1:453537/251‑7 (MQ=255) cgctATCGCCGCGGCGTGCTCAGCCGTAGCGAAGCCGCGAACAAAAAGACGCGCCAGGTT‑AATTTCCCTCTGGCGCGTAGAGTACGGGAATGGACATCAATATCCTTAAAGTAAATAAGACTATTCCTGACTATTATTGATAAGTTCTTTTAAACCCGCCCGTTAATTAACTCACCAGCTGAAATTCACAATAATTAAGTGATATCGACAGCGCGTTTTTGCATTATTTTGTTACATGCAGAGATGAAtt < 2:667460/248‑1 (MQ=255) ctATCGCCGCGGCGTGCTCAGCCGTAGCTAAGCCGCGAACAAAAATACGCGCCAGGTG‑AATTTCCCTCTGGCGCGTAGCGTACGGGAATGGACATCAATATACTTAAAGGAAATAAGCCTATTCCTGACTATTATTGTTACGTTCTTTTACACCCGCCCGTTAATTAACTCACCAGCTGAAATTTACAATACTTATGTGATATCGCCAGCGCGTTTTTGCATTATTTTGTTACATGCCAAGATGAATTGcc > 2:865544/1‑251 (MQ=255) gcggcgTGCTCAGCCGTAGCTAAGCCGCGAACAAAAATACGCGCCAGGTG‑AATTTCCCTCTGGCGCGTAGAGTACGGGAATGGACATCAATATCCTTAAAGTAAATAAGACTATTCCTGACTATTATTGATAAGTTCTTTTAAACCCGCCCGTTAATTAACTCACCAGCTGAAATTCACAATAATTAAGTGATATc < 1:246892/196‑1 (MQ=255) gcggcgTGCTCAGCCGTAGCTAAGCCGCGAACAAAAATACGCGCCAGGTG‑AATTTCCCTCTGGCGCGTAGAGTACGGGAATGGACATCAATATCCTTAAAGTAAATAAGACTATTCCTGACTATTATTGATAAGTTCTTTTAAACCCGCCCGTTAATTAACTCACCAGCTGAAATTCACAATAATTAAGTGATATc > 2:246892/1‑196 (MQ=255) ggcgTGCTCAGCCGTAGCTAAGCCGCGAACAAAAATACGCGCCAGGTG‑AATTTCCCTCTGGCGCGTAGAGTACGGGAATGGACATCAATATCCTTAAAGTAAATAAGACTATTCCTGACTATTATTGATAAGTTCTTTTAAACCCGCCCGTTAATTAACTCACCAGCTGAAATTCACAATAATTAAGTGATATCGACAGCGCGTTTTTGCATTATTTTGTTACATGCAGAGATGAATTGCCGATTTaaca > 1:169844/1‑250 (MQ=255) ggcgTGCTCAGCCGTAGCTAAGCCGCGAACAAAAATACGCGCCAGGAG‑AATTTCCATCTGGCGCGTAGAGTACGGGAATGGACATCAATATCCTTAAAGTAAATAAGACTATTCCTGACTATTATTGCTACGTTCTTTTAAACCCGCCCGTTAATTAAATCACCAGCTGTAATTCACAATAATTAAGTGATATCGAAAGCTCGTTTTTGCATTATTTTGTTACATACAGAGATGAATTgacgcttaaact > 2:118913/1‑239 (MQ=255) cAGCCGTAGCTAAGCCGCGAACAAAAATACGCGCCAGGTG‑AATGTCCCTCTGGCGCGTAGAGTACGTGAATGGTCATCAATATCCTTAAAGTAAATAAGACTATTCCTGTCTATTATGGATAAGTTCTTTTAAACCCGCCCGTTAATTAACTCACCAGCTGAAATTCACAATAATTAAGGGATATCGGCAGCGCGTTTTTGCAGTATGTTGTTACGTGCAGAGATGAATTGCCGATTGAACAAGCACtt < 2:846675/249‑1 (MQ=255) gcgAACAAAAATACGCGCCAGGTG‑AATTTCCCTCTGGCGCGTAGAGTACGGGAATGGACATCAATATCCTTAAAGTAAATAAGACTATTCCTGACTATTATTGATAAGTTCTTTTAAACCCGCCCGTTAATTAACTCACCAGCTGAAATTCACAATAATTAAGTGATATCGACAGCGCGTTTTTGCATTATTTTGTTACATGCAGAGATGAATTGCCGATTTAACAAGCACTTTTCTTTGCTTTTGCGCa > 1:64366/1‑250 (MQ=255) gAACAAAAATACGCGCCAGGTG‑AATTTCCCTCTGGCGCGTAGAGTACGGGAATGGACATCAATATCCTTAAAGTAAATAAGACTATTCCTGACTATTATTGATAAGTTCTTTTAAACCCGCCCGTTAATTAACTCACCAGCTGAAATTCACAATAATTAAGTGATATCGACAGCGCGTTTTTGCATTATTTTGTTACATGCAGAGATGAATTGCCGATTTAACAAGCACTTTTCTTTGCTTTTGCGCAAAc > 2:193337/1‑251 (MQ=255) aCGCGCCAGGTG‑AATTTCCCTCTGGCGCGTAGAGTACGGGAATGGACATCAATATCCTTAAAGTAAATAAGACTATTCCTGACTATTATTGATAAGTTCTTTTAAACCCGCCCGTTAATTAACTCACCAGCTGAAATTCACAATAATTAAGTGATATCGACAGCGCGTTTTTGCATTATTTTGTTACATGCAGAGATGAATTGCCGATTTAACAAGCACTTTTCTTTGCTTTTGCGCAAACCCGCTGGCa < 1:865540/250‑1 (MQ=255) ggTG‑AATTTCCCTCTGGCGCGTAGAGTACGGGAATGGACATCAATATCCTTAAAGTAAATAAGACTATTCCTGACTATTATTGATAAGTTCTTTTAAACCCGCCCGTTAATTAACTCACCAGCTGAAATTCACAATAATTAAGTGATATCGACAGCGCGTTTTTGCATTATTTTGTTACATGCAGAGATGAATTGCCGATTTAACAAGCACTTTTCTTTGCTTTTGCGCAAACCCGCTGGCATCAAGCGcc < 1:786963/251‑1 (MQ=255) cccTCTGGCGCGTAGAGTACGGGAATGGACATCAATATCCTTAAAGTAAATAAGACTATTCCTGACTATTATTGATAAGTTCTTTTAAACCCGCCCGTTAATTAACTCACCAGCTGAAATTCACAATAATTAAGTGATATCGACAGCGCGTTTTTGCATTATTTTGTTACATGCAGAGATGAATTGCCGATTTAACAAGCACTTTTCTTTGCTTTTGCGCAAACCCGCTGGCATCAAGCGCCACACAGAc < 1:603214/250‑1 (MQ=255) gTAGAGTACGGGAATGGACATCAATATCCTTAAAGTAAATAAGACTATTCCTGACTATTATTGATAAGTTCTTTTAAACCCGCCCGTTAATTAACTCACCAGCTGAAATTCACAATAATTAAGTGATATCGACAGCGCGTTTTTGCATTATTTTGTTACATGCAGAGATGAATTGCCGATTTAACAAGCACTTTTCTTTGCTTTTGCGCAAACCCGCTGGCATCAAGCGCCACACAGACGCAACAGGGACt < 1:818029/251‑1 (MQ=255) ccatatCCTTAAAGTAAATAAGACTAGTCCTGACTATTATTGATATGTTCTTTTAAACCCGCCCGTTAAGTAACTCACCAGATGAAATTCACAATAATTAAGTGATATCGACAGCGCGTTTTTGCATTATTTTGTTACATGCAGAGATGAATTGCCGATTTAACAAGCCCTGTTCTTTGCTTTTGCGCTAACCCGCTGGCATCAAGCGCCACACAGACGCAACAGGGACTGTTAACCGGGGAAGATATGTc < 2:226494/249‑1 (MQ=255) atatCCTTCAAGTAAATAAGACTATTCCTGCCTATTATTGATAAGTTCTTTTAAACCCGACCGTTAATTAAATCACCAGCTGCAATTAACAATAATTAAGTGATATCGACAGCGCGTTTTTGCATTATTTTGTTACATGCGGAGATGAATAACCGATTTAACAAGCACTTTTCTTTCCTTTTGCGCAAACCCGCTAGCATCAAGCGCCACACAGACGCAACATGGACTGTTAACCGGGAAAGatatttgct > 2:80093/1‑246 (MQ=255) | GAACTGCTCGACTTCTTACAGTGTCCGGTGCTGGCAGTGGCTCAACGTCACCGCGATGTCGCAGAGCGTGTGCTGGAGATTGTCCTGGCAAGCCTGGACGAACCGCGTAAGCCAAAACCTGGTTTAACGCGCATTAAACGTAATCTCTATCGCCGCGGCGTGCTCAGCCGTAGCTAAGCCGCGAACAAAAATACGCGCCAGGTG‑AATTTCCCTCTGGCGCGTAGAGTACGGGACTGGACATCAATATGCTTAAAGTAAATAAGACTATTCCTGACTATTATTGATAAATGCTTTTAAACCCGCCCGTTAATTAACTCACCAGCTGAAATTCACAATAATTAAGTGATATCGACAGCGCGTTTTTGCATTATTTTGTTACATGCGGCGATGAATTGCCGATTTAACAAACACTTTTCTTTGCTTTTGCGCAAACCCGCTGGCATCAAGCGCCACACAGACGTAACAAGGACTGTTAACCGGGGAAGATATGTCCT > NC_000913/88856‑89349 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |