| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 92,354 | A→G | V314V (GTA→GTG) | ftsI → | peptidoglycan DD‑transpeptidase FtsI |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 92,354 | 0 | A | G | 98.9% | 302.8 / ‑4.2 | 89 | V314V (GTA→GTG) | ftsI | peptidoglycan DD‑transpeptidase FtsI |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base G (39/49); total (39/50) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.51e-01 | |||||||||||
GGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACAACCCTAACAATCTGAGCGGCACGCCGAAAGAGGCGATGCGTAACCGTACCATCACCGACGTGTTTGAACCGGGCTCAACGGTTAAACCGATGGTGGTAATGACCGCGTTGCAACGTGGCGTGGTGCGGGAAAACTCGGTACTCAATACCATTCCTTATCGAATTAACGGCCACGAAATCAAAGACGTGGCACGCTACAGCGAATTAACCCTGACCGGGGTATTACAGAAGTCGAGTAACGTCGGTGTTTCCAAGCTGGCGTTAGCGATGCCGTCCTCAGCGTTAGTAGATACTTACTCACGTTTTGGACTGGGAAAAGCGACCAATTTGGGGTTGGTCGGA > NC_000913/92108‑92597 | ggggtggAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCGGGTTGATCGCGAACAGAACAATGAGGTGGCCGTTAACAAGGCGGAATCTGGTAGAGCCGTGATGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCACGTCATACAACCCTAACAATCTGAGCGGCACGCCGAAAGAGGCGATGCGTAACCGTACCAGCACCGACGTGTTTGAACCTGGCTCAACGGTTAAACCGATGGTGGtgatga < 2:189080/245‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |