| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 90,435 | T→C | R114R (CGT→CGC) | rsmH → | 16S rRNA m(4)C1402 methyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 90,435 | 0 | T | C | 97.1% | 331.2 / ‑0.3 | 103 | R114R (CGT→CGC) | rsmH | 16S rRNA m(4)C1402 methyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/2); new base C (55/45); total (56/47) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.91e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.45e-01 | |||||||||||
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |