| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,696,909 | G→A | G151E (GGA→GAA) | bcsE → | c‑di‑GMP‑binding protein BcsE |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,696,909 | 0 | G | A | 95.3% | 187.1 / ‑0.9 | 64 | G151E (GGA→GAA) | bcsE | c‑di‑GMP‑binding protein BcsE |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/2); new base A (34/27); total (35/29) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.86e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
TAGATGATTCTCAAGGGCCGGAAAAAATAAAATTATTTTCAATGCTAAATCATGAAAAAGGTCTATACTATTTGACCCGTGATTTGCAGTGTTCTATTGATCCCCATAATTACCTTTTTATTCTTGTTTGCGCAAATAACGCATGGCAAAACATTCCTGCCGAGCGGCTTCGCTCATGGTTGGATAAAATGAATAAATGGAGCAGGTTAAACCATTGTTCGCTTTTGGTAATTAATCCCGGAAATAATAACGATAAACAATTTTCATTGTTGCTTGAGGAATACCGTTCACTTTTTGGTCTTGCCAGTTTGCGTTTTCAGGGTGACCAACATTTGCTGGATATTGCCTTCTGGTGCAACGAAAAAGGGGTCAGCGCCCGTCAGCAGCTTAGCGTTCAGCAACAAAATGGTATCTGGACATTAGTTCAAAGCGAAGAGGCGGAGATCCAACCACGCAGCGACGAAAAACGCATTCTGAGT > NC_000913/3696669‑3697147 | tAGATGATTCTCAAGGGCCGGAAAAAATAAAATTATTTTCAATGCTAAATCATGAAAAAGGTCTATACTATTTGACCCGTGATTTGCAGTGTTCTATTGATCCCCATAATTACCTTTTTATTCTTGTTTGCGCAAATAACGCATGGCAAAACATTCCTGCCGAGCGGCTTCGCTCATGGTTGGATAAAATGAATAAATGGAGCAGGTTAAACCATTGTTCGCTTTTGGTAATTAATCCCGAAAAtaataa < 1:299173/250‑1 (MQ=255) aGATGATTCTCAAGGGCCGGAAAAAATAAAATTATTTTCAATGCTAAATCATGAAAAAGGTCTATACTATTTGACCCGTGATTTGCAGTGTTCTATTGATCCCCATAATTACCTTTTTATTCTTGTTTGCGCAAATAACGCATGGCAAAACATTCCTGCCGAGCGGCTTCGCTCATGGTTGGATAAAATGAATAAATGGAGCAGGTTAAACCATTGTTCGCTTTTGGTAATTAATCCCGAAAATAATAAc < 1:132604/250‑1 (MQ=255) aGATGATTCTCAAGGGCCGGAAAAAATAAAATTATTTTCAATGCTAAATCATGAAAAAGGTCTATACTATTTGACCCGTGATTTGCAGTGTTCTATTGATCCCCATAATTACCTTTTTATTCTTGTTTGCGCAAATAACGCATGGCAAAACATTCCTGCCGAGCGGCTTCGCTCATGGTTGGATAAAATGAATAAATGGAGCAGGTTAAACCATTGTTCGCTTTTGGTAATTAATCCCGAAAATAATAAc < 1:376499/250‑1 (MQ=255) cAAGGGCCGGAAAAAATAAAATTATTTTCAATGCTAAATCATGAAAAATGTCTATACTATATGACCCGTGATTTGCAGTGTTCTATTGATCCCCATAATTACCTTTTTATTCTTGTTTGCGCAAATAACGCATGGCAAAACATTCCTGCCGAGCGGCTTCGCTCATGGTTGGATAAAATGAATAAATGGAGCAGGTTAAACCATTGTTCGCTTTTGGTAATTAATCCCGAAAATAATAACGATAAACAAtt < 2:35373/251‑1 (MQ=255) cAAGGGCCGGAAAAAATAAAATTATTTTCAATGCTAAATCATGAAAAAGGTCTATACTATTTGACCCGTGATTTGCAGTGTTCTATTGATCCCCATAATTACCTTTTTATTCTTGTTTGCGCAAATAACGCATGGCAAAACATTCCTGCCGAGCGGCTTCGCTCATGGTTGGATAAAATGAATAAATGGAGCAGGTTAAACCATTGTTCGCTTTTGGTAATTAATCCCGAAAATAATAACGATAAACAAtt > 2:265629/1‑251 (MQ=255) aGGGCCGGAACAAATAAAATTATTTTCAATGCTAAATCATGAAAAGGGTCTATACTATTTGACCCGTGATTTGCAGTGTTCTATTAATCCCCATAATTACCTTTTTATTCTTGTTTGCGCAAATAACGCATGGCAAAACATTCCTGCCGAGCGGCTTCGATCATGGTTGGATAAAATGAATAAATGGAGCAGGTTACACCATTGTTCGCTTTTGGTAATTAATCCCGAAAATAATAACGATaacacatttt > 2:347581/1‑243 (MQ=255) gggCCGGAAAAAATAAAATTATTTTCAATGCTAAATCATGAAAAAGGTCTATACTATTTGACCCGTGATTTGCAGTGTTCTATTGATCCCCATAATTACCTTTTTATTCTTGTTTGCGCAAATAACGCATGGCAAAACATTCCTGCCGAGCGGCTTCGCTCATGGTTGGATAAAATGAATAAATGGAGCAGGTTAAACCATTGTTCGCTTTTGGTAATTAATCCCGAAAATAATAACGATAAACAATTTTc > 1:4599/1‑251 (MQ=255) ggCCGGAAAAAATAAAATTATTTTCAATGCTAAATCATGAAAAAGGTCTATACTATTTGACCCGTGATTTGCAGTGTTCTATTGATCCCCATAATTACCTTTTTATTCTTGTTTGCGCAAATAACGCATGGCAAAACATTCCTGCCGAGCGGCTTCGCTCATGGTTGGATAAAATGAATAAATGGAGCAGGTTAAACCATTGTTCGCTTTTGGTAATTAATCCCGAAAATAATAACGATAAACAATTTTc > 1:420932/1‑250 (MQ=255) gAAAAAATAAAATTATTTTCAATGCTAAATCATGAAAAAGGTCTATACTATTTGACCCGTGATTTGCAGTGTTCTATTGATCCCCATAATTACCTTTTTATTCTTGTTTGCGCAAATAACGCATGGCAAAACATTCCTGCCGAGCGGCTTCGCTCATGGTTGGATAAAATGAATAAATGGAGCAGGTTAAACCATTGTTCGCTTTTGGTAATTAATCCCGAAAATAATAACGATAAACAATTTTCAttgtt < 2:352709/251‑1 (MQ=255) aaaaaaTAAAATTATTTTCAATGCTAAATCATGAAAAAGGTCTATACTATTTGACCCGTGATTTGCAGTGTTCTATTGATCCCCATAATTACCTTTTTATTCTTGTTTGCGCAAATAACGCATGGCAAAACATTCCTGCCGAGCGGCTTCGCTCATGGTTGGATAAAATGAATAAATGGAGCAGGTTAAACCATTGTTCGCTTTTGGTAATTAATCCCGAAAATAATAACGATAAACAATTTTCAttgttg > 1:64122/1‑251 (MQ=255) attattTTCAATGCTAAATCATGAAAAAGGTCTATACGATTTGACCCGGGATTTGCAGTGTTATATTGATCCACATAATTACCTTTTTATTCTTGTTTGCGCAAATAACGCATGGCAAAACATTCCTGCCGAGCGGCTTCGCTCATGGTTGGATAAAATGAATAAATGGAGCAGGTTAAACCATTGTTCGCTTTTGGTAATTAATCCCGAAAATAATAACGATAAACAATTTTCATTGTTGCTTGAGGAAt < 2:64122/251‑1 (MQ=255) tcaattcgaaaTCATGAAAATGCTCTATACTATTTGACCCGTTAGTTGCAGTGAGCTATAGATCCCCATAATTACCTTTTTATTCTTGTTTGCGCAAATAACACATGGCAAAACCTTCCTGCCGAGCTGCTTCGCTCATGGTTGGATAAAATTAATAAATGGAGCAGGTTAAACCATTGTGCGCTTTTGGTAATGAATCCCGAAAATAATAACGAGAAACAAGCGTCATTTTTGCTTGAGTAATAccatt < 2:107982/242‑4 (MQ=255) aaagtcTAAACCATGAAAAAGGTCTTTACTATTTGACCCGTGATTTGCAGTGTTCTATTGAGCCCCATAATTACCTTTTTATTCTGGTTTGCGAAAATAACGCATGGCAAAACATTCCTGCCGAGCGGCTTCGCTCATGGTTGGATAAAATGAATGAATGGAGCAGGTTAAACCATTGTTCGCTTTTGGTAATTAAGCCCGGAAATAATAACGATAAACAATTTTCATTGTGGCTTGAGGAATACCGTTCa < 2:767811/246‑1 (MQ=255) aTCATGAAAAAGGTCTATACTATTTGACCCGTGATTTGCAGTGTTCTATTGATCCCCATAATTACCTTTTTATTCTTGTTTGCGCAAATAACGCATGGCAAAACATTCCTGCCGAGCGGCTTCGCTCATGGTTGGATAAAATGAATAAATGGAGCAGGTTAAACCATTGTTCGCTTTTGGTAATTAATCCCGAAAATAATAACGATAAACAATTTTCATTGTTGCTTGAGGAATACCGTTCACTTTTTGGt < 2:420932/251‑1 (MQ=255) tGAAAAAGGTCTATACTATTTGACCCGTGATTTGCAGTGTTCTATTGATCCCCATAATTACCTTTTTATTCTTGTTTGCGCAAATAACGCATGGCAAAACATTCCTGCCGAGCGGCTTCGCTCATGGTTGGATAAAATGAATAAATGGAGCAGGTTAAACCATTGTTCGCTTTTGGTAATTAATCCCGAAAATAATAACGATAAACAATTTTCATTGTTGCTTGAGGAATACCGTTCACTTTTTGGTCTTg > 2:294086/1‑251 (MQ=255) aaaaGGTCTAATCTATTTGTCCCGTGATTTGCAGTGTTCTATTGATCCCCATAATTACCTTTTTATTCTTGTTTGCGCAAATAACGCATGGCAAAACATTCCTGCCGAGCGGCTTCGCTCATGGTTGGATAAAATGAATAAATGGAGCAGGTTAAACCATTGTTCGCTTTTGGTAATTAATCCCGAAAATAATAACGATAAACAATTTTCATTGTTGCTTGAGGAATACCGTTCACTTTTTGGTCTTGCCa < 2:4307/251‑1 (MQ=255) aGGTCTATACTATTTGACCCGTGATTTGCAGTGATCTATTGATCCACCTAATTACCTTTTTATTCTTGTTTGCGCAAATAACGCATGGCAAAACATTCCTGCCGAGCGGCTTCGCTCATGGTTGGATAAAATGAATAAATGGAGCAGGTTAAACCATTGTTCGCTTTTGGTAATTAATCCCGAAAATAATAACGATAAACAATTTTCATTGTTGCTTGAGGAATACCGTTCACTTTTTGGTCTTGCCCGtt > 1:505265/1‑251 (MQ=255) tATTTGACCCGTGATTTGCAGTGTTCTATTGATCCCCATAATTACCTTTTTATTCTTGTTTGCGCAAATAACGCATGGCAAAACATTCCTGCCGAGCGGCTTCGCTCATGGTTGGATAAAATGAATAAATGGAGCAGGTTAAACCATTGTTCGCTTTTGGTAATTAATCCCGAAAATAATAACGATAAACAATTTTCATTGTTGCTTGAGGAATACCGTTCACTTTTTGGTCTTGCCAGTTTGCGTTTTc > 1:618426/1‑250 (MQ=255) agttgatccttGATTTGAAGTTTTCTATTGATCCCCATAATTACCTTTTTATTCTTGTTTGCACAAATAACTCATGGCAAAACATTCCTGCCGAGCGGCTTCGTTCATGGTTGGATAAAATGAATAAATGGAGCAGGTTAAACCATTGTTCGCTTTTGGTTATTAATCCCGAAAATAATAACGATAAACAATTGTCATTGTTGCTTGAGGAATTCCGTTCACTTTTTGGGCTTGCCAGTTTGCGTTTTCa < 2:456818/240‑1 (MQ=255) aTTTGACCCGTGATTTGCAGTGTTCTATTGATCCCCATAATTACCTTTTTATTCTTGTTTGCGCAAATAACGCATGGCAAAACATTCCTGCCGAGCGGCTTCGCTCATGGTTGGATAAAATGAATAAATGGAGCAGGTTAAACCATTGTTCGCTTTTGGTAATTAATCCCGAAAATAATAACGATAAACAATTTTCATTGTTGCTTGAGGAATACCGTTCACTTTTTGGTCTTGCCAGTTTGCGTTTTCa < 1:294086/250‑1 (MQ=255) tttGACCCGTGATTTGCAGTGTTCTATTGATCCCCATAATTACCTTTTTATTCTTGTTTGCGCAAATAACGCATGGCAAAACATTCCTGCCGAGCGGCTTCGCTCATGGTTGGATAAAATGAATAAATGGAGCAGGTTAAACCATTGTTCGCTTTTGGTAATTAATCCCGAAAATAATAACGATAAACAATTTTCATTGTTGCTTGAGGAATACCGTTCACTTTTTGGTCTTGCCAGTTTGCGTTTTCAgg > 1:529130/1‑251 (MQ=255) ttGACCCGTGATTTGCAGGGGTCTATTGATCCCCATAATTACCTTGTTATTCTTGTTTTCGCAAATAACGCATGGCAAAACATTCCTGCCGAGCGGCTTCGCTCATGGTTGGATAAAATGAATAAATGGAGCAGGTTAAACCATTGTTCGCTTTTGGTAATTAATCCCGAAAATAATAACGATAAACAATTTTCATTGTTGCTTGAGGAATACCGTTCACTTTTTGGTCTTGCCAGTTTGCGTTTTCAgg < 2:51062/250‑1 (MQ=255) aGTGTTCTATTGATCCCCATAATTACCTTTTTATTCTTGTTTGCGCAAATAACGCATGGCAAAACATTCCTGCCGAGCGGCTTCGCTCATGGTTGGATAAAATGAATAAATGGAGCAGGTTAAACCATTGTTCGCTTTTGGTAATTAATCCCGAAAATAATAACGATAAACAATTTTCATTGTTGCTTGAGGAATACCGTTCACTTTTTGGTCTTGCCAGTTTGCGTTTTCAGGGTGACCAACATGTGCTg < 1:717819/251‑1 (MQ=255) cTATTGATCCCCATAATTACCTTATTATTCTTGTTTGCGCAAATAACGCATGGCAAAACATTCCTGCCGAGCGGCTTCGCTCATGGTTGGATAAAATGAATAAATGGAGCAGGTTAAACCATTGTTCGCTTTTGGTAATTAATCCCGAAAATAATAACGATAAACAATTTTCATTGTTGCTTGAGGAATACCGTTCACTTTTTGGTCTTGCCAGTTTGCGTTTTCAGTGTGACCAACATTTGCTGGATAtt > 2:800917/1‑251 (MQ=255) tATTGATCCCCATAATTACCTTTTTATTCTTGTTTGCGCAAATAACGCATGGCAAAACATTCCTGCCGAGCGGCTTCGCTCATGGTTGGATAAAATGAATAAATGGAGCAGGTTAAACCATTGTTCGCTTTTGGTAATTAATCCCGGAaat < 1:19126/151‑1 (MQ=255) tATTGATCCCCATAATTACCTTTTTATTCTTGTTTGCGCAAATAACGCATGGCAAAACATTCCTGCCGAGCGGCTTCGCTCATGGTTGGATAAAATGAATAAATGGAGCAGGTTAAACCATTGTTCGCTTTTGGTAATTAATCCCGGAaat > 2:19126/1‑151 (MQ=255) ttgttCCCCATAATTTCCTTATTATTCTTGTTTGCGCAAATAACGCATGGCAAAACATTCCTGCCGAGCGGCTTCGCTCATGGTTGGATAAAATTAATAAATGGAGCAGGTTAATCCATTTTTCGCTTTTGGTATTGAATCTCGAAAATAATAACGATAAACAATTTTTATTGTTGCTTGGTGAAGACCGATCACTTTTTGGTCTGGCCAGTTTGCGTTTTCAGGGTGTCGAACATTTGCTGGATATTGc < 2:856381/246‑1 (MQ=255) gATCCCCATTATTACCTTTTTATTCGTGGTTTCGCATATAACGCATGTCCAAACAATCCTGCCGAGCTGCTTCGCTCATTGTTGGATAAAATGAATAAATGGAGCAGGATAAACCATTGGTCGCTTTTGGTAAGTAATCCCGAAAATAATAACGATAAACAATTTTCATTGTTGCTTGAGGAATACCGTTCATTTTTTGGTCTTGCCATTTTGCGTTTTCAGGGTGACCACCATTTGCTGGATATTGCCtt < 2:29090/251‑1 (MQ=255) gATCCCCATAATTACCTTTTTATTCTTGTTTGCGCAAATAACGCATGGCAAAACATTCCTGCCGAGCGGCTTCGCTCATGGTTGGATAAAATGAATAAATGGAGCAGGTTAAACCATTGTTCGCTTTTGGTAATTAATCCCGAAAATAATAACGATAAACAATTTTCATTGTTGCTTGAGGAATACCGTTCACTTTTTGGTCTTGCCAGTTTGCGTTTTCAGGGTGACCAACATTTGCTGGATATTGCCtt > 2:733570/1‑251 (MQ=255) tCCCCATAATTACCTTTTTATTCTTGTTTGCGCCAATAACGCATGACAAAACATTCCTGCCTAGCGGCTTCGCTCATGGTTGGATAACATGAATAACTGGAGCAGGTTAAACCATTGTTCGCTTTTGGTAATTAATCCCGAAAATAATAACGATCAACACTTTTAATTGTTGCTTGCGGATTACCGTTCACTTTTTGATCTTGCCAGTTTGCGTTTTCAGTGTGAACACGATTTGCAGGATATTGCCTTCt > 2:812828/1‑251 (MQ=255) ccccATAATTACCTTATTATTCTTGTTTGCGCAAATAACGCATGGCAAAACATTCCTGCCGAGCGGCTTCGCTCATGGTTGGATAAAATGAATAAATGGAGCAGGTTAAACCATTGTTCGCTTTTGGTAATTAATCCCGAAAATAATACCGCTAAACAATTTTCATTGTTGCTTGAGGAATACCGTTCACTTTTTGGTCTTGCCAGTTTGCGTTTTCAGGGTGACCAACATTTGCTGGATATTGCCTTCTg > 2:518591/1‑251 (MQ=255) ccttcccTTTTTATTCTTGTTTTCGCAAATAACGCATGGCAAAACATTCCTGCCGAGCGGCTTCGCTCATGGTTGGATAAAATGAATAAATGGAGCAGGTTAAACCATTGTTCGCTTTTGGTAATTAATCCCGAAAATAATAACGATAAACAATTTTCATTGTTGCTTGAGGAATACCGTTCACTTTTTGGTCTTGCCAGTTTGCGTTTTCAGGGTGACCGACATTTGCTGGATATTGCCTTCTGGTGCa > 1:778681/6‑250 (MQ=255) ttACCTTTTTATTCTTGTTTGCGCAAATAACGCATGGCAAAACATTCCTGCCGAGCGGCTTCGCTCATGGTTGGATAAAATGAATAAATGGAGCAGGTTAAACCATTGTTCGCTTTTGGTAATTAATCCCGAAAATAATAACGATAAACAATTTTCATTGTTGCTTGAGGAATACCGTTCACTTTTTGGTCTTGCCAGTTTGCGTTTTCAGGGTGACCAACATTTGCTGGATATTGCCTTCTGGTGCAACg > 1:759692/1‑251 (MQ=255) ttttATTCTTGTTTGCGCAAATAACGCATGGCAAAACATTCCTGCCGAGCGGCTTCGCTCATGGTTGGATAAAATGAATAAATGGAGCAGGTTAAACCATTGTTCGCTTTTGGTAATTAATCCCGAAAATAATAACGATAAACAATTTTCAttgttg > 1:750737/1‑157 (MQ=255) ttttATTCTTGTTTGCGCAAATAACGCATGGCAAAACATTCCTGCCGAGCGGCTTCGCTCATGGTTGGATAAAATGAATAAATGGAGCAGGTTAAACCATTGTTCGCTTTTGGTAATTAATCCCGAAAATAATAACGATAAACAATTTTCAttgttg < 2:750737/157‑1 (MQ=255) tATTCTTGTTTGCGCAAATAACGCATGGCAAAACATTCCTGCCGAGCGGCTTCGCTCATGGTTGGATAAAATGAATAAATGGAGCAGGTTAAACCATTGTTCGCTTTTGGTAATTAATCCCGAAAATAATAACGATAAACAATTTTCATTGTTGCTTGAGGAATACCGTTCACTTTTTGGTCTTGCCAGTTTGCGTTTTCAGGGTGACCAACATTTGCTGGATATTGCCTTCTGGTGCAACGAAAAAgggg > 1:352828/1‑251 (MQ=255) aTTCTTGTTTGCGCAAATAACGCATGGCAAAACATTCCTGCCGAGCGGCTTCGCTCATGGTTGGATAAAATGAATAAATGGAGCAGGTTAAACCATTGTTCGCTTTTGGTAATTAATCCCGAAAATAATAACGATAAACAATTTTCATTGTTGCTTGAGGAATACCGTTCACTTTTTGGTCTTGCCAGTTTGCGTTTTCAGGGTGACCAACATTTGCTGGATATTGCCTTCTGGTGCAACGAAAAAGGGGt < 1:124176/251‑1 (MQ=255) cTTGTTTGCGCAAATAACGCATGGCAAAACATTCCTGCCGAGCGGCTTCGCTCATGGTTGGATAAAATGAATAAATGGAGCAGGTTAAACCATTGTTCGCTTTTGGTAATTAATCCCGAAAATAATAACGATAAACAATTTTCATTGTTGCTTGAGGAATACCGTTCACTTTTTGGTCTTGCCAGTTTGCGTTTTCAGGGTGACCAACATTTGCTGGATTTTGCCTTCTGGTGCACCGAAAAAGGGGTc > 2:261972/1‑249 (MQ=255) cAAATAACGCATGGCAAAACATTCCTGACGAGCGGCTTCGCTCATGGTTGGATAAAATGAATAAATGGAGCAGGTTAAACCATTGTTCGCTTTTGGTAATTAATCCCGAAAATAATAACGATAAACAATTTTCATTGTTGCTTGAGGAATACCGTTCCCTTTTTGGTCTTGCCAGTTTGCGTTTTCAGGGTGACCAACATTTGCTGGATATTGCCTTCTGGTGCAACGAAAAAGGGGTCAGCGCCCGta > 2:858434/1‑248 (MQ=255) aaTAACGCATGGCAAAACATTCCTGCCGAGCGGCTTCGCTCATGGTTGGATAAAATGAATAAATGGAGCAGGTTAAACCATTGTTCGCTTTTGGTAATTAATCCCGAAAATAATAACGATAAACAATTTTCATTGTTGCTTGAGGAATACCGTTCACTTTTTGGTCTTGCCAGTTTGCGTTTTCAGGGTGACCAACATTTGCTGGATATTGCCTTCTGGTGCAACGAAAAAGGGGTAAGCGCCCGTcagc > 2:180187/1‑250 (MQ=255) aCGCATGGCAAAACATTCCTGCCGAGCGGCTTCGCTCATGGTTGGATAAAATGAATAAATGGAGCAGGTTAAACCATTGTTCGCTTTTGGTAATTAATCCCGAAAATAATAACGATAAACAATTTTCATTGTTGCTTGAGGAATACCGTTCACTTTTTGGTCTTGCCAGTTTGCGTTTTCAGGGTGACCAACATTTGCTGGATATTGCCTTCTGGTGCAACGAAAAAGGGGTCAGCGCCCGTCAGCAGCtt < 2:529130/251‑1 (MQ=255) aCGCATGGCAAAACATTCCTGCCGAGCGGCTTCGCTCATGGTTGGATAAAATGAATAAATGGAGCAGGTTAAACCATTGTTCGCTTTTGGTAATTAATCCCGAAAATAATAACGATAAACAATTTTCATTGTTGCTTGAGGAATACCGTTCACTTTTTGGTCTTGCCAGTTTGCGTTTTCAGGGTGACCAACATTTGCTGGATATTGCCTTCTGGTGCAACGAAAAAGGGGGCAGCGCCCGTCAGCAGCtt < 2:855246/251‑1 (MQ=255) cATGGCAAAACATTCCTGCCGAGCGGCTTCGCTCATGGTTGGATAAAATGAATAAATGGAGCAGGTTAAACCATTGTTCGCTTTTGGTAATTAATCCCGAAAATAATAACGATAAACAATTTTCATTGTTGCTTGAGGAATACCGTTCACTTTTTGGTCTTGCCAGTTTGCGTTTTCAGGGTGACCAACATTTGCTGGATATTGCCTTCTGGTGCAACGAAAAAGGGGTCAGCGCCCGTCAGCAGCTTAGc < 1:71657/251‑1 (MQ=255) tGGCAAAACATTCCTGCCGAGCGGCTTCGCTCATGGTTGGATAAAATGAATAAATGGAGCAGGTTAAACCATTGTTCGCTTTTGGTAATTAATCCCGAAAATAATAACGATAAACAATTTTCATTGTTGCTTGAGGAATACCGTTCACTTTTTGGTCTTGCCAGTTTGCGTTTTCAGGGTGACCAACATTTGCTGGATATTGCCTTCTGGTGCAACGAAAAAGGGGTCAGCGCCCGTCAGCAGCTTAGCGt > 1:723200/1‑251 (MQ=255) ccGAGCGGCTTCGCTCATGGTTGGATAAAATGAATAAATGGAGCAGGTTAAACCATTGTTCGCTTTTGGTAATTAATCCCGAAAATAATAACGATAAACAATTTTCATTGTTGCTTGAGGAATACCGTTCACTTTTTGGTCTTGCCAGTTTGCGTTTTCAGGGTGACCAACATTTGCTGGATATTGCCTTCTGGTGCAACGAAAAAGGGGTCAGCGCCCGTCAGCAGCTTAGCGTTCAGCAACAAAATgg > 2:554089/1‑250 (MQ=255) agcgtattCGCGCATGGTTGGATAAAATGAATAAATGGAGCAGGTTAAACCATTGTTCTCTTTTGGTAAGTAATCCCGAAAATAATAACGTTAAACAATTTTCATTGTTGCTTGAGGAATACCGTTCTCTTTTTGGTCTTGCCAGTTTGCGTTTTCAGGGTGACCAACATTTGCTGGATAGTGCCTTCTGGTGCAACGAAAAAGGGGTCAGCGCCCGTCAGCAGCTTAGCGTTCAGCAACAAAATGGTagc < 2:337762/245‑3 (MQ=255) cGCTCAAGGTTGGATAAAATGAATAAATGGGGCAGGTTAAACCATTGTTCGCTTTTGGTAATTAATCCCAAAAATAATAACGATAAACAATGTTCATTGTTGCTTTAGGAATACCGTTCTCTTTTTGGTCTGGCCAGTTTGCGTTTTCAGGGTGACCAACATTTGCTGGATATTGCCTGCTGGTGCAACGAAAAAGGGGTCAGCGCCCGTCAGCAGCTTAGCGTTCAGTAACAAAATGGTATCTGGACAt < 2:292969/250‑1 (MQ=255) tCATGGTTGGATAAAATGAATAAATGGAGCAGGTTAAACCATTGTTCGCTTTTGGTAATTAATCCCGAAAATAATAACGATAAACAATTTTCATTGTTGCTTGAGGAATACCGTTCACTTTTTGGTCTTGCCAGTTTGCGTTTTCAGGGAGACCAACATTTGCTGGATATTGCCTTCTGGTGCAACGAAAAAGGGGTCAGCGCCCGTCAGCAGCTTAGCGTTCAGCAACAAAATGGTATCTGGACATTAGt > 1:809574/1‑251 (MQ=255) ggTTGGAGAAAATGAATAAATGGAGCAGGTTAAACCATTGTTCGCTTTTGGTAATTAATCCCGAAAATAATAACGATAAACAATTTTCATTGTTGCTTGAGGAATACCGTTCACTTTTTGGTCTTGCCAGTTTGCGTTTTCAGGGTGACCAACATTTGCTGGATATTGCCTTCTGGTGCAACGAAAAAGGGGTCAGCGCCCGTCAGCAGCTTAGCGTTCAGCAACAAAATGGTATCTGGACATTAGTTCa < 2:222314/250‑1 (MQ=255) aaaTGAATAAATGGAGCAGGTTAAACCATTGTTCGCTTTTGGTAATTAATCCCGAAAATAATAACGATAAACAATTTTCATTGTTGCTTGAGGAATACCGTTCACTTTTTGGTCTTGCCAGTTTGCGTTTTCAGGGTGACCAACATTTGCTGGATATTGCCTTCTGGTGCAACGAAAAAGGGGTCAGCGCCCGTCAGCAGCTTAGCGTTCAGCCACAAAATGGTATCTGGACATTAGTTCAAAGCGAag > 1:626673/1‑249 (MQ=255) tGAATAAATGGAGCAGGTTAAACCATTGTTCGCTTTTGGTAATTAATCCCGAAAATAATAACGATAAACAATTTTCATTGTTGCTTGAGGAATACCGTTCACTTTTTGGTCTTGCCAGTTTGCGTTTTCAGGGTGACCAACATTTGCTGGATATTGCCTTCTGGTGCAACGAAAAAGGGGTCAGCGCCCGTCAGCAGCTTAGCGTTCAGCAACAAAATGGTATCTGGACATTAGTTCAAAGCGAAGAGGCg > 1:748220/1‑251 (MQ=255) gAATAAATGGAGCAGGTTAAACCATTGTTCGCTTTTGGTAATTAATCCCGATAATAATTACTATAAACAATTTTCATTGTTGCTTTAGGAATACCGTTCACTTTTTGTTCTTGCCAGTTTGCGTTTTCAGGGTGACCAACATTTGCTGGATATTGCCTTCTGGTGCACCGAAAAAGGGGTCAGCGCCCGTCAGCAGCTTAGCGTTCAGCAACAAAATGGTATCTGGACATTAGTTCAAAGCGAAGAggagg < 2:688214/251‑4 (MQ=255) gAATAAATGGAGCAGGTTAAACCATTGTTCGCTTTTGGTAATTAATCCCGAAAATAATAACGATAAACACTTTTCATTGTTGCTTGAGGAATACCGTTCACTTTTTGGACTTGCCAGTTTGCGTTTTCAGGGTGACCAACATTTGCTGGATATTGCATTCTGGTGCAACGAAAAAGGGGTCAGAGCCCGTCAGCAGCTTAGCGTTCAGAAACAAAATGGTATCTGGACATTAGTTCAAAGCGAAGAGGCgg > 2:42177/1‑251 (MQ=255) aTAAATGGAGCAGGTTAAACCATTGTTCGCTTTTGGTAATTAATCCCGAAAATAATAACGATAAACAATTTTCATTGTTGCTTGAGGAATACCGTTCACTTTTTGGTCTTGCCAGTTTGCGTTTTCAGGGTGACCAACATTTGCTGGATATTGCCTTCTGGTGCAACGAAAAAGGGGTCAGCGCCCGTCAGCAGCTTAGCGTTCAGCAACAAAATGGTATCTGGACATTAGTTCAAAGCGAAGAGGCgg > 1:696102/1‑249 (MQ=255) aaaTGGAGCAGGTTAAACCATTGTTCGCTTTTGGTAATTAATCCCGAAAATAATAACGATAAACAATTTTCATTGTTGCTTGAGGAATACCGTTCACTTTTTGGTCTTGCCAGTTTGCGTTTTCAGGGTGACCAACATTTGCTGGATATTGCCTTCTGGTGCAACGAAAAAGGGGTCAGCGCCCGTCAGCAGCTTAGCGTTCAGCAACAAAATGGTATCTGGACATTAGTTCAAAGCGAAGAGGCGGAGAt < 1:89621/251‑1 (MQ=255) gAGCAGGTTAAACCATTGTTCGCTTTTGGTAATTAATCCCGAAAATAATAACGATAAACAATTTTCATTGTTGCTTGCGGAATACCGTTCACTTTTTGGTCTTGCCAGTTTGCGTTTTCAGGGTGACCAACATTTGCTGGATATTGCCTTCTGGTGCAACGAAAAAGGGGTCAGCGCCCGTCAGCAGCTTAGCGTTCAGCAACAAAATGGGATCTGGCCATTAGTTCAAAGCGAAGAGGCGGAGATCAAAc > 2:598621/1‑251 (MQ=255) tgTTAAACCATTGTTCGCTTTTGGTAATTAATCCCGAAAATAATAACGATAAACAATTTTCATTGTTGCTTGAGGAATACCGTTCACTTTTTGGTCTTGCCAGTTTGCGTTTTCAGGGTGACCACCATTTGCTGGATATTGCCTTCTGGTGCAACGAAAAAGGGTTCAGCGCCCGTCAGCAGCTTAGCGTTCAGCAACAAAATGGTATCTGGCCTTTAGTTCAAAGCGAAGAGGCGGAGATCCAACAACGc > 2:656900/2‑251 (MQ=255) ggTTAAACCATTGTTCGCTTTTGGTAATTAATCCCGAAAATAATAACGATAAACAATTTTCATTGTTGCTTGAGGAATACCGTTCACTTTTTGGACTTGCCAGTTTGCTTTTTCGGGGGGACCACAATTTCCTGGATATTGCCTTCTGGTCCAACGAAAAAGGGGTCAGCGCCGGTCAGCAGCTTACCGTTCAGCAACAAAATGGTATCTGGCCTTTAGTTCAAAGCGAAGAGGCGGAAATCCAACCACGc > 2:429418/1‑251 (MQ=255) aaaCCATTGTTCGCTTTTGGTAATTAATCCCGAAAATAATAACGATAAACAATTTTCATTGTTGCTTGAGGAATACCGTTCACTTTTTGGTCTTGCCAGTTTGCGTTTTCAGGGTGACCAACATTTGCTGGATATTGCCTTCTGGTGCAACGAAAAAGGGGTCAGCGCCCGTCAGCAGCTTAGCGTTCAGCAACAAAATGGTATCTGGACATTAGTTCAAAGCGAAGAGGCGGAGATCCAACCACGCAGcg > 2:77351/1‑251 (MQ=255) cATTGTTCGCTTTTGGTAATTAATCCCGAAAATAATAACGATAAACAATTTTCATTGTTGCTTGAGGAATACCGTTCACTTTTTGGTCTTGCCAGTTTGCGTTTTCAGGGTGACCAACATTTGCTGGATATTGCCTTCTGGTGCAACGAAAAAGGGGTCAGCGCCCGTCAGCAGCTTAGCGTTCAGCAACAAAATGGTATCTGGACATTAGTTCAAAGCGAAGAGGCGGAGATCCAACCACGCAGcgacg > 1:609517/1‑250 (MQ=255) cGCTTTTGGTAATTAATCCCGAAAATAATAACGATAAACAATTTTCATTGTTGCTTGAGGAATACCGTTCACTTTTTGGTCTTGCCAGTTTGCGTTTTCAGGGTGACCAACATTTGCTGGATATTGCCTTCTGGTGCAACGAAAAAGGGGTCAGCGCCCGTCAGCAGCTTAGCGTTCAGCAACAAAGTGGTATCTGGCCATTAGTTCAAAGCGAAGAGGCGGAGATACAACCACGACGCGACGAAAAACGc > 2:201984/1‑251 (MQ=255) tttGGTAATTAATCCCGAAAATAATAACGATAAATAATTTTCATTGTTGCTTGAGGAATACCGTTCACTTTTTGGTCTTGCCAGTTTGCGTTTTCAGGGTGACCAACATTTGCTGGATATTGCCTTCTGGTGCAACGAAAAAGGGGTCAGCGCCCGTCAGCAGCTTAGCGTTCAGCAACAAAATGGTATCTGGACATTAGTTCAAAGCGAAGAGGCGGAGATCCAACCACGCAGCGACGAAAAACGCAt < 1:238698/249‑1 (MQ=255) gTAATTAATCCCGAAAATAATAACGATAAACAATTTTCATTGTTGCTTTAGGAATACCGTTCACTTTTTGGTCTTGCCAGTTTGCGTTTTCAGGGTGACCAACATTTGCTGGATATTGCCTTCTGGTGCAACGAAAAAGGGGTCAGCGCCCGTCAGCAGCTTAGCGTTCAGCAACAAAATGGTATCTGGACATTAGTTCAAAGCGAAGAGGCGGAGATCCAACCACGCAGCGACGAAAAACGCATTCTGAg < 1:589182/251‑1 (MQ=255) aattaatCCCGAAAATAATAACGATAAACAATTTTCATTGTTGCTTGAGGAATACCGTTCACTTTTTGGTCTTGCCAGTTTGCGTTTTCAGGGTGACCAACATTTGCTGGATATTGCCTTCTGGTGCAACGAAAAAGGGGTCAGCGCCCGTCAGCATCTTAGCGTTCAGCAACAAAATGGTATCTGGACATTAGTTCAAAGCGAAGAGGCGGAGATCCAACCACGCAGCGACGAAAAACGCATTCTGAga > 1:681841/1‑249 (MQ=255) | TAGATGATTCTCAAGGGCCGGAAAAAATAAAATTATTTTCAATGCTAAATCATGAAAAAGGTCTATACTATTTGACCCGTGATTTGCAGTGTTCTATTGATCCCCATAATTACCTTTTTATTCTTGTTTGCGCAAATAACGCATGGCAAAACATTCCTGCCGAGCGGCTTCGCTCATGGTTGGATAAAATGAATAAATGGAGCAGGTTAAACCATTGTTCGCTTTTGGTAATTAATCCCGGAAATAATAACGATAAACAATTTTCATTGTTGCTTGAGGAATACCGTTCACTTTTTGGTCTTGCCAGTTTGCGTTTTCAGGGTGACCAACATTTGCTGGATATTGCCTTCTGGTGCAACGAAAAAGGGGTCAGCGCCCGTCAGCAGCTTAGCGTTCAGCAACAAAATGGTATCTGGACATTAGTTCAAAGCGAAGAGGCGGAGATCCAACCACGCAGCGACGAAAAACGCATTCTGAGT > NC_000913/3696669‑3697147 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |