| Predicted mutation | ||||||
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| JC JC | NC_000913 | 1,651,851 | IS2 (–) +5 bp | intergenic (+1866/+873) | ydfD → / ← ynfP | lysis protein/protein YnfP |
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| * | ? | NC_000913 | 1651851 = | 0 (0.000) | 63 (0.780) | 58/490 | 0.4 | 100% | intergenic (+1866/+877) | ydfD/ynfP | lysis protein/protein YnfP |
| ? | NC_000913 | = 2070271 | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
ACGCCAGAGAAATAACTGGCTGGCTGCTACACCATGTTGCCGGGCAACGAGGGAGACCGTCATCCCCGGTTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGG‑CGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTATGGTG‑TGGGACTGTTGATAGATGAGTCTGCGCTGGAGCGTGTTGAGGTAGTGAAAGGTCCATATTCCGTACTGTACGGTTCACAGGCAATTGGCGGTATTGTTAACTTCATCAC‑C‑AAAAAGGGTGAATCTCCGGACTCCCTATATCACTTAAATTGATACAACTTTTTAG > NC_000913/2070031‑2070517 | aCGCCAGAGAAATAACTGGCTGGCTGCTACACCATGTTGCCGGGCAACGAGGGAGACCGTCATCCCCGGTTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGG‑CGAAg < 1:453546/250‑1 (MQ=32) tccAGAGAAATAAATGGCTGGCTACTACACCATGTTGCCGGGCCACGCGGGAGACCGTCATCACAGGATCAAAGCTATGATGAACACTTGCGATCTTTTCCTGGGTGGTAAGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTCGGATAAAAACTAGTATTAAGGCTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGTGCTTCAGGGTGACTGTCTATTGG‑CGAAgac > 2:318090/2‑248 (MQ=11) cccAGATAAATAACTGGCTGGTTGCTACACCATGTTGCCGGGCAACGAGGGAGACCGTCATCCCCGGTTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGAGTCAGGGGGCCAGTCTAGTGG‑CGAAGCAt < 2:806959/250‑1 (MQ=16) ccAGAGAAATACCTGGCTGGCTGCTACACCATGTTGCCGGGCAACGAGGGAGACCGTCATCCCCGGTTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGGACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTCTTTAAGTGATATTGGTTGTGTTGAGCTTAAGGGTGCCAGTCTGGTGG‑CGAAGCAt > 2:67972/1‑250 (MQ=11) 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cATGTTGCCGGGCAACGAGGGATACCGTCATCCCCGGTTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGG‑CGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTc < 2:669338/251‑1 (MQ=255) tGCCGGGCAACGAGGGAGACCGTCATCCCCGTTTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGACGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGG‑CGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCagga < 1:851372/250‑1 (MQ=255) gCCGGGCAACGAGGGAGACCGTCATCCCCGGTTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGG‑CGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCaggagg < 2:631672/251‑1 (MQ=255) 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gTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGG‑CGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTATGGTG‑TGGGACTGTTGATAGATGAGTCTGCGCTGGAGCGTGTTGAGGTAGTGAAAGGTCCATATTCCGTACTGTACGGTTCACAGGCAATTGGCGGTATTGTTAACTTCATCAC‑C‑AAAAAGGGTGAATCTCCGGACTCCCTATATc > 1:432935/1‑251 (MQ=255) tGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGG‑CGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTATGGTG‑TGGGACTGTTGATAGATGAGTCTGCGCTGGAGCGTGTTGAGGTAGTGAAAGGTCCATATTCCGTACTGTACGGTTCACAGGCAATTGGCGGTATTGTTAACTTCATCAC‑C‑AAAAAGGGGGAATCTCCGGACTCCCTATATCAc > 1:477276/1‑251 (MQ=255) gTCTGGAGATTCAGGGGGCTAGTCTAGTGG‑CGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTATGGTG‑TGGGACTGTTGATAGATGAGTCTGCGCTGGAGCGTGTTGAGGTAGTGAAAGGTCCATATTCCGTACTGTACGGTTCACAGGCAATTGGCGGTATTGTTAACTTCATCAC‑C‑AAAAAGGGTGAATCTCCGGACTCCCTATATCAc < 1:160805/250‑1 (MQ=255) 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cAGTCTAGTGG‑CGAAGCATCCTCCCGTGTGTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTATGGTG‑TGGGACTGTTGATAGATGAGTCTGCGCTGGAGCGTGTTGAGGTAGTGAAAGGTCCATATTCCGTACTGTACGGTTCACAGGCAATTGGCGGTATTGTTAACTTCATCAC‑C‑AAAAAGGGTGAATCTCCGGACTCCCTATATCACTTAAATTGATACAACttttt < 1:125160/251‑1 (MQ=255) gTCTAGTGG‑CGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTATCTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTATGGTG‑TGGGACTGTTGATAGATGAGTCTGCGCTGGAGCGTGTTGAGGTAGTGAAAGGTCCATATTCCGTACTGTACGGTTCACAGGCAATTGGCGGTATTGTTAACTTCATCAC‑C‑AAAAAGGGTGAATCTCCGGACTCCCTATATCACTTAAAGTGATACAACTTTTTag < 1:723931/251‑1 (MQ=255) gTCTAGTGG‑CGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTATGGTG‑TGGGACTGTTGATAGATGAGTCTGCGCTGGAGCGTGTTGAGGTAGTGAAAGGTCCATATTCCGTACTGTACGGTTCACAGGCAATTGGCGGTATTGTTAACTTCATCAC‑C‑AAAAAGGGTGAATCTCCGGACTCCCTATATCACTTAAATTGATACAACTTTTTag < 1:646165/251‑1 (MQ=255) | ACGCCAGAGAAATAACTGGCTGGCTGCTACACCATGTTGCCGGGCAACGAGGGAGACCGTCATCCCCGGTTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGG‑CGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTATGGTG‑TGGGACTGTTGATAGATGAGTCTGCGCTGGAGCGTGTTGAGGTAGTGAAAGGTCCATATTCCGTACTGTACGGTTCACAGGCAATTGGCGGTATTGTTAACTTCATCAC‑C‑AAAAAGGGTGAATCTCCGGACTCCCTATATCACTTAAATTGATACAACTTTTTAG > NC_000913/2070031‑2070517 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |