| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,996,049 | T→A | L156* (TTG→TAG) | yigA → | DUF484 domain‑containing protein YigA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,996,049 | 0 | T | A | 94.7% | 165.6 / 1.9 | 58 | L156* (TTG→TAG) | yigA | DUF484 domain‑containing protein YigA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/2); new base A (31/23); total (33/25) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.76e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.23e-01 | |||||||||||
TGATGGAACAGGCTATCGCCAACGAAGGCCTGTTTTATCGCCTACTCTACCTGCAGCGCAGTCTCACCGCCGCCAGCAGTCTCGACGATATGCTGATGCGCTTTCACCGCTGGGCGCGCGATCTCGGCCTGGCAGGTGCGAGTCTGCGCCTGTTTCCGGATCGCTGGCGCTTAGGTGCGCCGTCGAACCACACTCATCTGGCATTAAGCCGTCAGTCTTTCGAACCGCTGCGTATTCAGCGTTTGGGGCAGGAACAGCACTATCTTGGGCCGCTTAACGGACCAGAGCTGCTGGTGGTGCTACCGGAAGCGAAAGCGGTGGGATCGGTGGCGATGTCGATGCTGGGAAGCGATGCTGATTTGGGTGTCGTGCTGTTTACC‑AGTCGCGATGCCAGTCACTATCAACAAGGGCAAGGAACGCAGTTACTTCATGAAATTGCGCTGATGTTGCCGGAGCTTCTGGAGCGTTGGATTGAACGCGTATGACCGAT > NC_000913/3995806‑3996295 | tGATGGAACAGGCTATCGCCAACGAAGGCCTGTTTTATCGCCTACTCTACCTGCAGCGCAGTCTCACCGCCGCCAGCAGTCTCGACGATATGCTGATGCGCTTTCACCGCTGGGCGCGCGATCTCGGCCTGGCAGGTGCGAGTCTGCGCCTGTTTCCGGATCGCTGGCGCTTAGGTGCGCCGTCGAACCACACTCATCTGGCATTAAGCCGTCAGTCTTTCGAACCGCTGCGTATTCAGCGTTAGGGGCa < 1:310467/250‑1 (MQ=255) gATGGAACAGGCTATCGCCAACGAAGGCCTGTTTTATCGCCTACTCTACCTGCAGCGCAGTCTCACCGCCGCCAGCAGTCTCGACGATATGCTGATGCGCTTTCACCGCTGGGCGCGCGATCTCGGCCTGGCAGGGGCGAGTCTGCGCCTGTTTCCGGATCGCTGGCGCTTAGGTGCGCCGTCGAACCACACTCATCTGGCATTAAGCCGTCAGTCTTTCGAACCGCTGCGTATTCAGCGTTAGGGGCAgg > 2:222932/1‑251 (MQ=255) ggCCTGTTTTATCGCCTACTCTACCTGCAGCGCAGTCTCACCGCCGCCAGCAGTCTCGACGATATGCTGATGCGCTTTCACCGCTGGGCGCGCGATCTCGGCCTGGCAGGTGCGAGTCTGCGCCTGTTTCCGGATCGCTGGCGCTTAGGTGCGCCGTCGAACCACACTCATCTGGCATTAAGCCGTCAGTCTTTCGAACCGCTGCGTATTCAGCGTTAGGGGCAGGAACAGCACTATCTTGGGCCGCTTaa < 1:65302/251‑1 (MQ=255) gCCTGTTTTATCGCCTACTCTACCTGCAGCGCAGTCTAACCGCCGCCAGCAGTCTCGACGATATGCTGATGCGCTTTCACCGCTGGGCGCGCGATCTCGGCCTGGCAGGTGCGAGTCTGCGCCTGTTTCCGGATCGCTGGCGCTTAGGTGCGCCGTCGAACCACACTCATCTGGCATTCAGCCGTCAGTCTTTCGAACCGCTGCGTATTCAGCGTTAGGGGCAGGAACAGCACTATCTTGGGCCGCTTAAc > 1:142995/1‑251 (MQ=255) gCCTGGTTTATCGCCTACTCTACCTGCAGCGCAGTCTCCCCGCCGCCAGCAGTCTCGACGATATGCTGATGCGCTTTCACCGCTGGGCGCGCGATCTCGGCCTGGCAGGTGCGAGTCTGCGCCTGTTTCCGGATCGCTGGCGCTTAGGTGCGCCGTCGAACCACACTCATCTGGCATTAAGCCGTCAGTCTTTCGAACCGCTGCGTAGTCAGCGTTAGGGGCAGGAACAGCACTATCTTGGGCCGCTTAAc < 1:372215/251‑1 (MQ=255) gTTTTATCGCCTACTCTACCTGCAGCGCAGTCTCACCGCCGCCAGCAGTCTCGACGATATGCTGATGCGCTTTCACCGCTGGGCGCGCGATCTCGGCCTGGCAGGTGCGAGTCTGCGCCTGTTTCCGGATCGCTGGCGCTTAGGTGCGCCGTCGAACCACACTCATCTGGCATTAAGCCGTCAGTCTTTCGAACCGCTGCGTATTCAGCGTTAGGGGCAGGAACAGCACTATCTTGGGCCGCTTAACgg < 1:24385/249‑1 (MQ=255) ttATCGCCTACTCTACCTGCAGCGCAGTCTCACCGCCGCCAGCAGTCTCGACGATATGCTGATGCGCTTTCACCGCTGGGCGCGCGATCTCGGCCTGGCAGGTGCGAGTCTGCGCCTGTTTCCGGATCGCTGGCGCTTAGGTGCGCCGTCGAACCACACTCATCTGGCATTAAGCCGTCAGTCTTTCGAACCGCTGCGTATTCAGCGTTAGGGGCAGGAACAGCACTATCTTGGGCCGCTTAACGGAcc > 1:370334/1‑249 (MQ=255) gtctcttctACCTGCGGCGTTGTCTCCCCGCGGCCAGCAGGTGCGACGAGTTGCTGACGCGCGTTCTCCGCTGGGCGCGCGATGTCGGCCTAGAAGGTGCGAGTCTGCTCCTGTTTCCGGATCGCTGGCCCTTAGGTGCGCCGGCGAACCACACTCATCTGGCATTAAGCCGTCATTCTTTCGAACCGCCGCGTATTCAGCGTTAGGGTCAGGAACAGAAGTACCCTGGGCCGCTTAACGGAACCGAgctg < 2:167757/245‑1 (MQ=255) tACTCTACCTGCAGCGCAGTCTCACCGCCGCCAGCAGTCTCGCCGATATGCTGATGCGCTTTCACCGCTGGGCGCGCGATCTCGGCCTGGCAGGTGCGAGTCTGCGCCTGTTTCCGGATCGCTGGCGCTTAGGTGCGCCGTCGAACCACACTCATCTGGCATTAAGCCGTCAGTCTTTCGAACCGCTGCGTATTCAGCGTTAGGGGCAGGAACAGCACTCTCTTGGGCCGCTTAACGGACCAGAGctgctg > 2:180136/1‑251 (MQ=255) aCTCTACCTGCAGCGCAGTCTCACCGCCGCCAGCAGTCTCGACGATATGCTGATGCGCTTTCACCGCTGGGCGCGCGATCTCGGCCTGGCAGGTGCGAGTCTGCGCCTGTTTCCGGATCGCTGGCGCTTAGGTGCGCCGTCGAACCACACTCATCTGGCATTAAGCCGTCAGTCTGTCGAACCGCTGCGTATTCAGCGTTAGGGGCAGGAACAGCACTATCTTGGGCCGCTTAACGGACCAGAgctgct < 1:250270/249‑1 (MQ=255) ctACCTGCAGCGCAGTCTCACCGCCGCCAGCAGTCTCGACGATATGCTGATGCGCTTTCACCGCTGGGCGCGCGATCTCGGCCTGGCAGGTGCGAGTCTGCGCCTGTTTCCGGATCGCTGGCGCTTAGGTGCGCCGTCGAACCACACTCATCTGGCATTAAGCCGTCAGTCTTTCGAACCGCTGCGTATTCAGCGTTAGGGGCAGGAACAGCACTATCTTGGGCCGCTTAACGGACCAGAGCTGCtggggg > 1:344631/1‑248 (MQ=255) tGCAGCGCAGTCTCACCGCCGCCAGCAGTCTCGACGATATGCTGATGCGCTTTCACCGCTGGGCGCGCGATCTCGGCCTGGCAGGTGCGAGTCTGCGCCTGTTTCCGGATCGCTGGCGCTTAGGTGCGCCGTCGAACCACACTCATCTGGCATTAAGCCGTCAGTCTTTCGAACCGCTGCGTATTCAGCGTTAGGGGCAGGAACAGCACTATCTTGGGCCGCTTAACGGACCAGAGCTGCTGGTGGTGCt > 1:166668/1‑250 (MQ=255) gcaccgcAGTCTCCCCGCCGCCAGCAGTCTCGACGATATGCTGATGCGCTTTCACCGCTGGGCGCGCGATCTCGGCCTGGCAGGTGCGAGTCTGCGCCTGTTTCCGGATCGCTGGCGCTTAGGTGCGCCGTCGAACCACACTCATCTGGCATTAAGCCGTCAGTCTTTCGAACCGCTGCGTATTCAGCGTTAGGGGCAGGAACAGCACTATCTTGGGCCGCTTAACGGACCAGAGCTGCTGGTGGTGCTa < 2:166668/246‑1 (MQ=255) cAGCGCAGTCTCACCGCCGCCAGCAGTCTCGACGATATGCTGATGCGCTTTCACCGCTGGGCGCGCGATCTCGGCCTGGCAGGTGCGAGTCTGCGCCTGTTTCCGGATCGCTGGCGCTTAGGTGCGCCGTCGAACCACACTCATCTGGCATTAAGCCGTCAGTCTTTCGAACCGCTGCGTATTCAGCGTTAGGGGCAGGAACAGCACTATCTTGGGCCGCTTAACGGACCAGAGCTGCTGGTGGTGCTAcc < 1:100485/251‑1 (MQ=255) gcAGTCTCACCGCCGCCAGCAGTCTCGACGATATGCTGATGCGCTTTCACCGCTGGGCGCGCGATCTCGGCCTGGCAGGTGCGAGTCTGCGCCTGTTTCCGGATCGCTGGCGCTTAGGTGCGCCGTCGAACCACACTCATCTGGCATTAAGCCGTCAGTCTTTCGAACCGCTGCGTATTCAGCGTTAGGGGCAGGAACAGCACTATCTTGGGCCGCTTAACGGACCAGAGCTGCTGGTGGTGCTACCGGa > 1:12499/1‑250 (MQ=255) ctcACCGCCGCCAGCAGTCTCGACGATATGCTGATGCGCTTTCACCGCTGGGCGCGCGATCTCGGCCTGGCAGGTGCGAGTCTGCGCCTGTTTCCGGATCGCTGGCGCTTAGGTGCGCCGTCGAACCACACTCATCTGGCATTAAGCCGTCAGTCTTTCGAACCGCTGCGTATTCAGCGTTAGGGGCAGGAACAGCACTATCTTGGGCCGCTTAACGGACCAGAGCTGCTGGTGGTGCTACCGGAAGCGa > 1:263772/1‑250 (MQ=255) aCCGCCGCCAGCAGTCTCGACGATATGCTGATGCGCTTTCACCGCTGGGCGCGCGATCTCGGCCTGGCAGGTGCGAGTCTGCGCCTGTTTCCGGATCGCTGGCGCTTAGGTGCGCCGTCGAACCACACTCATCTGGCATTAAGCCGTCAGTCTTTCGAACCGCTGCGTATTCAGCGTTAGGGGCAGGAACAGCACTATCTTGGGCCGCTTAACGGACCAGAGCTGCTGGTGGTGCTACCGGAAGCGAAAGc > 1:345825/1‑251 (MQ=255) cgccAGCAGTCTCGACGATATGCTGATGCGCTTTCACCGCTGGGCGCGCGATCTAGGCCTGGCAGGTGCGAGTCTGCTCCTGTTTCCGGATCGCTGGCGCTTAGGTGCGCCGTCGAACCACACTCATCTGGCATTAAGCCGTCAGTCTTTCGAACCGCTGCGTATTCAGCGTTAGGGGCAGGAACAGCACTATCTTGGTCCGCTTAACGGACCAGAGCTGCTGGTGGTGATACCGGAAGCGAAAGCGGTgg > 1:141413/1‑251 (MQ=255) ccggccgtcccggcgaTATGCTGATGCGCTTTCACCGCTGTTCTCGCGTTCTCGGCCTGTCAGGTGCTAGTCTGCGCCTTTTTCCGGATCGCTGGCGCTTAGGTGCGCAGTCGAACCACACTCATCTGGCATTAAGCCGTCAGTCTTTCGAACCGCTGCGTATTCAGCGTTAGGGGCAGGAACATCACTATCTTGGGCCGCGTAAAGGACAAGAGCTGCTGGTGTTGCTACCTGAAGCGAAAGCGGTGGGa < 2:267377/238‑1 (MQ=255) tcGACGATATGCTGATGCGCTTTCACCGCTGGGCGCGCGATCTCGGCCTGGCAGGTGCGAGTCTGCGCCTGTTTCCGGATCGCTGGCGCTTAGGTGCGCCGTCGAACCACACTCATCTGGCATTAAGCCGTCAGTCTTTCGAACCGCTGCGTATTCAGCGTTAGGGGCAGGAACAGCACTATCTTGGGCCGCTTAACGGACCCGAGCTGCTGGGGGTGCTACCGGAAGCGAAAGCGGGGGGGTCGGGGGCg > 2:8345/1‑251 (MQ=255) tGATGCGCTTTCACCGCTGGGCGCGCGATCTCGGCCTGGCAGGTGCGAGTCTGCGCCTGTTTCCGGATCGCTGGCGCTTAGGTGCGCCGTCGAACCACACTCATCTGGCATTAAGCCGTCAGTCTTTCGAACCGCTGCGTATTCAGCGTTAGGGGCAGGAACAGCACTATCTTGGGCCGCTTAACGGACCAGAGCTGCTGGTGGTGCTACCGGAAGCGTAAGCGGTGGGATCGGTGGCGATGTCGATGCTg > 1:416115/1‑251 (MQ=255) aTGCGCTTTCACCGCTGGGCGCGCGATCTCGGCCTGGCAGGTGCGAGTCTGCGCCTGTTTCCGGATCGCTGGCGCTTAGGTGCGCCGTCGAACCACACTCATCTGGCATTAAGCCGTCAGTCTTTCGAACCGCTGCGTATTCAGCGTTAGGGGCAGGAACAGCACTATCTTGGGCCGCTTAACGGACCAGAGCTGCTGGTGGTGCTACCGGAAGCGAAAGCGGTGGGATCGGTGGCGATGTCGATGCTggg > 1:37782/1‑251 (MQ=255) tccccGCTGGGCGCGCGATCTCGGCCTGGCAGGTGCGAGTCTGCGCCTGTTTCCGGATCGCTGGCGCTTAGGTGCGCCGTCGAACCACACTCATCTGGCATTAAGCCGTCAGTCTTTCGAACCGCTGCGTATTCAGCGTTAGGGGCAGGAACAGCACTATCTTGGGCCGCTTAACGGACCAGAGCTGCTGGTGGTGCTACCGGAAGCGAAAGCGGTGGGATCGGTGGCGATGTCGATGCTGGGAAGCGAt < 2:301937/247‑1 (MQ=255) tCACCGCTGGGCGCGCGATCTCGGCCTGGCCGGTGCGAGTCTGCGCCTGTTTCCGGATCGCTGGCGCTTAGGTGCGCCGTCGAACCACACTCATCTGGCATTAAGCCGTCAGTCTTTCGAACCGCTGCGTATTCAGCGTTAGGGGCAGGAACAGCACTATCTTGGGCCGCTTAACGGACCAGAGCTGCTGGTGGTGCTACCGGAAGCGAAAGCGGTGGGATCGGTGGCGGTGTCGATGCTGGGAAGCGATg > 1:125845/1‑251 (MQ=255) cGCTGGGCGCGCGATCTCGGCCTGGCAGGTGCGAGTCTGCGCCTGTTTCCGGATCGCTGGCGCTTAGGTGCGCCGTCGAACCACACTCATCTGGCATTAAGCCGTCAGTCTTTCGAACCGCTGCGTATTCAGCGTTAGGGGCAGGAACAGCACTATCTTGGGCCGCTTAACGGACCAGAGCTGCTGGTGGTGCTACCGGAAGCGAAAGCGGTGGGATCGGTGGCGATGTCGATGCTGGGAAGCGATGCTGa < 1:383622/251‑1 (MQ=255) gggggattgcGGCCTGGCAGGTGCGAGGCTGCGCCTGTTTCCGGATCGCTGGCGCTTAGGTGCGCCGTCGAACCACACTCATCTGGCATTAAGCCGTCAGTCTTTCGAACCGCTGCGTAGTCAGCGTTAGGGGCAGGAACAGCACTATCTTGGGCCGCTTAACGGACCAGAGCTGCTGGTGGTGCTACCGGAAGCGAAAGCGGTGGGATCGGTGGCGATGTCGATGCGGGGAAGCTATGCGGATTTGGgtg < 2:60823/242‑1 (MQ=255) cGGCCTGGCAGGTGCGAGTCTGCGCCTGGTTCCGGAGCGCTGTCGCGTAGGTGCGCCGTCGAACCACACTCATCTGGCATTAAGCCGTCAGTCTTGCGAACCGCTGCGTATTCAGCGTTAGGGGCAGGAACAGCACTATCTTGGGCCGCTTAACTGACCAGAGCTGCTGGTGGTGCTACCGGAAGCGAAAGCGGTGGGATCGGTGGCGATGGCGATGCTGGGAAGCGATGCTGATTTGGGTGTCGTGCTg < 2:57209/250‑1 (MQ=255) ccTGGCAGGTGCGAGTCTGCGCCTGTTTCCGGATCGCTGGCGCTTAGGTGCGCCGTCGAACCACACTCATCTGGCATTAAGCCGTCAGTCTTTCGAACCGCTGCGTATTCAGCGTTAGGGGCAGGAACAGCACTATCTTGGGCCGCTTAACGGACCAGAGCTGCTGGTGGTGCAACCGGAAGCGAAAGCGGTGGGATCGGTGGCGCTGTCGGTGCTGGGAAGGGATGCTGATTTGGGGGACGGGCTGttt > 2:65181/1‑250 (MQ=255) ggTGGGAGTCCGCGCCGTTTTCCGGCGCGCTGGCGCTTAGGTGCGCCGTCGAACCACACTCACTTTGTATTAAGCCGTCAGTCTTTCGAACCGGTGCGTATTCAGCGTTAGGTGTAGGAACAGCCCTATCTTGGGCCGCTTAACGGACCAGAGCTGCTGGTGTGGCTTCCTGAAGCGAAAGCGGTGGGATCGGTGGCGATGTCGATGCTGGGAAGCGATGCTGATTTGGGTGTCGTGCTGGTTATC‑AGTc < 2:336044/250‑1 (MQ=255) tGCGCCTGTTGCCGGATCGCTGGCGCTGAGGTGCGCCGTCGAACCACACTCAGCTGGCATTAAGCCGTCATTCTTTCGAACCGCTGCGTATTCAGCGTTAGGGGCAGGAACAGCACTATCTTGGGCCGCTTAACGGACCAGAGCTGCTGGTGGTGCTACCGGAAGCGAAAGCGGTGGGAGCGGTGGCGATGTCGATGCTGGGAAGCGATGCTGATTTGGGTGTCGTGCTGTTTACC‑AGTCGCGATTCCAg < 1:247397/250‑1 (MQ=255) tGCGCCTGGTTCCGGCTCGCTGGCGCTTAGGTGCGCCGTCGAACCACACTCATCTGGCATTAAGCCGTCAGTCTTTCGAACCGCTGCGTATTCAGCGTTAGGGGCAGGAACAGCACTATCTTGGGCCGCTTAACGGACCAGAGCTGCTGGGGGTACTAACGGGAGCGAAAGAGGTGGGATCGAGGGCGATGTTGCTGCTGGGCAGCGATGATGATTTGGGGGTCGTGCTGTTTACCCAGT‑GCGATGcaaat > 2:348282/1‑247 (MQ=255) ccTGTTTCCGGATCGCTAGCGCTTAGGTGCGCCGTCGAACCACACTCATCTGGCATTAAGCCGTCAGTCTTTCGAACCGCTGCGTATTCAGCGTTAGGGGCAGGTACAGCACTATCTTGGCCCGCTTAACGGACCAGAGCTGCAGGTGGTGCTACCGGAAGCGAAAGCGGTGGGATCGGGGGCGATGTCGATGCTGGGCAGCGGTGATGATTTGGGTGTCGTGCTGTTTACC‑AGTCGCGATGACAGTCACt > 1:41158/1‑251 (MQ=255) cGCTGGCGCTTAGGTGCGCCGTCGAACCACACTCATCTGGCATTAAGCCGTCAGTCTTTCGAACCGCTGCGTATTCAGCGTTAGGGGCAGGAACAGAACTATCTTGGGCCGCTTAACGGACCAGAGCTGCTGGTGGTGCTACCGGAAGCGAAAGCGGTGGGATCGGTGGCGATGTCGATGCTGGGAAGCGATGCTGATTTGGGGGTCGTGCTGTTTACC‑AGTCGCGATGCCAGTCACTATCAACAAGGGc > 1:405649/1‑250 (MQ=255) ggCGCTTAGGTGCGCCGTCGAACCACACTCATCTGGCATTAAGCCGTCAGTCTTTCGAACCGCTGCGTATTCAGCGTTAGGGGCAGGAACAGCACTATCTTGGGCCGCTTAACGGACCAGAGCTGCTGGTGGTGCTACCGGAAGCGAAAGCGGTGGGATCGGTGGCGATGTCGATGCTGGGAAGCGATGCTGATTTGGGTGTCGTGCTGTTTACC‑AGTCGCGATGCCAGTCACTATCAACAAGGGCAAgg > 1:358710/1‑250 (MQ=255) gcTTAGGTGCGCCGTCGAACCACACTCATCTGGCATTAAGCCGTCAGTCTTTCGAACCGCTGCGTATTCAGCGTTAGGGGCAGGAACAGCACTATCTTGGGCCGCTTAACGGACCAGAGCTGCTGGTGGTGCTACCGGAAGCGAAAGCGGGGGGATCGGTGGCGATGTCGATGCTGGGAAGCGATGCTGATTTGGGTGTCGTGCTGTTTACC‑AATCGCGATGCCAGTCACTATCAACAAGGGCAAGGAACg > 1:111529/1‑251 (MQ=255) ccGAACCACACTCATCTGGCATTAAGCCGTCAGTCTTTCGAACCGCTGCGTATTCAGCGTTTGGGGCAGGAACAGCACTATCTTGGGCCGCTTAACGGACCAGAGCTGCTGGTGGTGCTACCGGAAGCGAAAGCGGTTGGATCGGTGGCGATGTCGATGCTGGGAAGCGATGCTGATTTGGGTGTCGTGCTGTTTACC‑AGTCGCGATGCCAGTCACTATCAACAAGGGCAAGGAACGCAGTTACTTCATGa < 2:366628/250‑1 (MQ=255) ccACACTCATCTGGCATTAAGCCGTCAGTCTTTCGAACCGCTGCGTATTCAGCGTTAGGGGCAGGAACAGCACTATCTTGGGCCGCTTAACGGACCAGAGCTGCTGGTGGTGCTACCGGAAGCGAAAGCGGTGGGATCGGTGGCGATGTCGATGCTGGGAAGCGATGCTGATTTGGGTGTCGTGCTGTTTACC‑AGTCGCGATGCCAGTCACTATCAACAAGGGCAAGGAACGCAGTTACTTCATGAAATTg > 1:166208/1‑251 (MQ=255) aTCTGGCATTAAGCCGTCAGTCTTTCGAACCGCTGCGTATTCAGCGTTAGGGGCAGGAACAGCACTATCTTGGGCCGCTTAACGGACCAGAGCTGCTGGTGGTGCTACCGGAAGCGAAAGCGGTGGGATCGGTGGCGATGTCGATGCTGGGAAGCGATGCTGATTTGGGTGTCGTGCTGTTTACC‑AGTCGCGATGCCAGTCACTATCAACAAGGGCAAGGAACGCAGTTACTTCATGAAATTGCGCTGATg > 1:207745/1‑251 (MQ=255) ggCATTAAGCCGTCAGTCTTTCGAACCGCTGCGTATTCAGCGTTAGGGGCAGGAACAGCACTATCTTGGGCCGCTTAACGGACCAGAGCTGCTGGTGGTGCTACCGGAAGCGAAAGCGGTGGGATCGGTGGCGATGTCGATGCTGGGAAGCGATGCTGATTTGGGTGTCGTGCTGTTTACC‑AGTCGCGATGCCAGTCACTATCAACAAGGGCAAGGAACGCAGTTACTTCATGAAATTGCGCTGATg < 1:205367/247‑1 (MQ=255) cATTAAGCCGTCAGTCTTTCGAACCGCTGCGTATTCAGCGTTAGGGGCAGGAACAGCACTATCTTGGGCCGCTTAACGGACCAGAGCTGCTGGTGGTGCTACCGGAAGCGAAAGCGGTGGGATCGGTGGCGATGTCGATGCTGGGAAGCGATGCTGATTTGGGTGTCGTGCTGTTTACC‑AGTCGCGATGCCAGTCACTATCAACAAGGGCAAGGAACGCAGTTACTTCATGAAATTGCGCTGATGTTGCCg < 2:161771/251‑1 (MQ=255) aTTAAGCCGTCAGTCTTTCGAACCGCTGCGTATTCAGCGTTATGGGCAGGAACAGCACTCTCTTGGGCCGCTTAACGGACCAGAGCTGCCGGTGGCGCTAACGGAAGCGAAAGCGGAGGGATCGGTGGCGATGTCGGCGCTGGGAAGCGATGCTGGTTTGGGGGTCGTGCTGTTTACC‑AGTCGCGATGCCAGTCACTATCAACAAGGGCAAGGAACGCAGTTACTTCATGAAATTGCACTGATGTTGCCgg > 2:114506/1‑251 (MQ=255) aGCCGTCAGTCTTTCGAACCGCTGCGTATTCAGCGTTAGGGGCAGGAACAGCACTATCTTGGGCCGCTTAACGGACCAGAGCTGCTGGTGGTGCTACCGGAAGCGAAAGCGGTGGGATCGGTGGCGATGTCGATGCTGGGAAGCGATGCTGATTTGGGTGTCGTGCTGTTTACC‑AGTCGCGATGCCAGTCACTATCAACAAGGGCAAGGAACGCAGTTACTTCATGAAATTGCGCTGATGTTGCCGGAGCt > 1:261164/1‑251 (MQ=255) cGTCAGTCTTTCGAACCGCTGCGTATTCAGCGTTTGGGGCAGGAACAGCACTATCTTGGGCCGCTTAACGGACCAGAGCTGCTGGTGGTGCTACCGGAAGCGAAAGCGGTGGGATCGGTGGCGATGTCGATGCTGGGAAGCGATGCTGATTTGGGTGTCGTGGTGTTTACC‑AGTCGCGATGCCAGTCACTATCAACAAGGGCAAGGAACGCAGTTACTTCATGAAATTGCGCTGATGTTGc < 1:6322/241‑1 (MQ=255) cGTCAGTCTTTCGAACCGCTGCGTATTCAGCGTTTGGGGCAGGAACAGCACTATCTTGGGCCGCTTAACGGACCAGAGCTGCTGGTGGTGCTACCGGAAGCGAAAGCGGTGGGATCGGTGGCGATGTCGATGCTGGGAAGCGATGCTGATTTGGGGGTCGTGGTGTTTACC‑AGTCGCGATGCCAGTCACTATCAACAAGGGCAAGGAACGCCGTTACTTCATGAAATTGCGCTGATGTTGc > 2:6322/1‑241 (MQ=255) gTCAGTCTTTCGAACCGCTGCGTATTCAGCGTTAGGGGCAGGAACAGCACTATCTTGGGCCGCTTAACGGACCAGAGCTGCTGGTGGTGCTACCGGAAGCGAAAGCGGTGGGATCGGTGGCGATGTCGATGCTGGGAAGCGATGCTGATTTGGGTGTCGTGCTGTTTACC‑AGTCGCGATGCCAGTCACTATCAACAAGGGCAAGGAACGCAGTTACTTCATGAAATTGCGCTGATGTTGCCGGAGCTTCTg < 1:129993/251‑1 (MQ=255) cAGTCTTTCGAACCGCTGCGTATTCAGCGTTAGGGGCAGGAAAAGCACTATCTTGGGCCGCTTAACGGACCAGAGCTGCTGGTGGTGCTACCGGAAGCGAACGCGGTGGGATCGGGGGCGATGTCGATGCTGGGAAGAGATGCTGATTTGGGTGTCGTGCTGTTTACC‑AGTCGCGATGCCAGTCACTATCAACAAGGGCAAGGAACGCAGTTACTTCATGAAATTGCGCTGATGTTGCCGGAGCTTCTggg > 2:177480/1‑250 (MQ=255) aGTCTTTCGAACCGCTGCGTATTCAGCGTTCGGGGCAGGAACAGCACTATCTTGGGCCGCTTAACGGCCCAGAGCTGCTGGTGGTGCTACCGGAAGCGAAAGCGGTGGGATCGGTGGCGATGTCGATGCTGGGAAGCGATGCTGATTTGGGTGTCGTGCTGTTTACC‑AGTCGCGCTGCCAGTCACTATCAACAAGGGCAAGGAACGCAGTTACTTCATGAAATTGCGCTGATGTTGCCGGGGCTTCTgg > 2:265586/1‑249 (MQ=255) aGTCTTTCGAACCGCTGCGTATTCAGCGTTAGGGGCAGGAACAGCACTATCTTGGGCCGCTTAACGGACCAGAGCTGCTGGTGGTGCTACCGGAAGCGAAAGCGGTGGGATCGGTGGCGATGTCGATGCTGGGAAGCGATGCTGATTTGGGTGTCGTGCTGTTTACC‑AGTCGCGATGCCAGTCACTATCAACAAGGGCAAGGAACGCCGTTACTTCATGAAATTGCGCTGATGTTGCCGGAGCTTCTgacg > 1:233719/1‑248 (MQ=255) aGTCTTTCGAACCGCTGCGTATTCAGCGTTAGGGGCAGGAACAGCACTATCTTGGGCCGCTTAACGGACCAGAGCTGCTGGTGGTGCTACCGGAAGCGAAAGCGGTGGGATCGGTGGCGATGTCGATGCTGGGAAGCGATGCTGATTTGGGTGTCGTGCTGTTTACC‑AGTCGCGATGCCAGTCACTATCAACAAGGGCAAGGAACGCAGTTACTTCATGAAATTGCGCTGATGTTGCCGGAGCTTCTGGAg < 2:37782/251‑1 (MQ=255) tCGAACCGCTGCGTATTCAGCGTTAGGGGCAGGAACAGCACTATCTTGGGCCTCTTAACGGACCAGAGCTGCTGGTGGTGCTACCGGAAGCGAAAGCGGTGGGATCGGTGGCGATGTCGATGCTGGGAAGCGATGCTGATTTGGGTGTCGTGCTGTTTACC‑AGTCGCGATGCCAGTCACTATCAACAAGGGCAAGGAACGCAGTTACTTCATGAAATTGCGCTGATGTTGCCGGAGCTTCTGGAGCGTTgg > 1:199002/1‑251 (MQ=255) cGAACCGCTGCGTATTCGGCGTTAGGGGCAGGAACAGCCCTATCTTGGGCCGCTTAACGGACCAGAGCTGCTGGTGGTGCTACCGGAAGCGAAAGCGGTGGGATCGGTGGCGATGTCGATGCTGGGAAGCGATGCTGATTTGGGTGTCGTGCTGTTTACC‑AGTCGCGATGCCAGTCACTATCAACAAGGGCAAGGAACGCAGTTACTTCATGAAATTGCGCTGATGTTGCCGGAGCTTCTGGAGCGTTggc < 2:324400/251‑2 (MQ=255) gAACCGCTGCGTATTCAGCGTTAGGGGCAGGAACAGCACTATCTTGGGCCGCTTAACGGACCAGAGCTGCTGGTGGTGCTACCGGAAGCGAAAGCGGTGGGATCGGTGGCGATGTCGATGCTGGGAAGCGATGCTGATTTGGGTGTCGTGCTGTTTACC‑AGTCGCGATGCCAGTCACTATCAACAAGGGCAAGGAACGCAGTTACTTCATGAAATTGCGCTGATGTTGCCGGAGCTTCTGGAGCGTTGGAt > 1:304659/1‑251 (MQ=255) acctcTGCGTATTCAGCGTTAGGGGCAGGAACAGCACTATCTTGGGCCGCTTAACGGACCAGAGCTGCTGGTGGTGCTACCGGAAGCGAAAGCGGTGGGATCGGTGGCGATGTCGATGCTGGGAAGCGATGCTGATTTGGGTGTCGTGCTGTTTACC‑AGTCGCGATGCCAGTCACTATCAACAAGGGCAAGGAACGCAGTTACTTCATGAAATTGCGCTGATGTTGCCGGAGCTTCTGGAGCGTTGGATTg < 1:328318/247‑1 (MQ=255) cGCTGCGTATTCAGCGTTAGGGGCAGGAACAGCACTATCTTGGGCCGCTTAACGGACCAGAGCTGCTGGTGGTGCTACCGGAAGCGAAAGCGGTGGGATCGGTGGCGATGTCGATGCTGGGAAGCGATGCTGATTTGGGTGTCGTGCTGTTTACC‑AGTCGCGATGCCAGTCACTATCAACAAGGGCAAGGAACGCAGTTACTTCATGAAATTGCGCTGATGTTGCCGGAGCTTCTGGAGCGTTGGATTGaa < 2:12499/251‑1 (MQ=255) cGCTGCGTATTCAGCGTTAGGGGCAGGAACAGCACTATCTTGGGCCGCTTAACGGACCAGAGCTGCTGGTGGGGCTACCGGAAGCGAAAGCGGTGGGATCGGTGGCGATGTCGATGCTGGGAAGCGATGCTGATTTGGGTGTCGTGCTGTTTACC‑AGTCGCGATGCCAGTACCTATCACAAAGGGCAAGGAACGCAGTTACTTCCTGAAATTGCTCTGATGTTGCCGGAGCTTCTGGAGAGTTGGATTGa > 2:237932/1‑250 (MQ=255) cGTATTCAGCGTTAGGGGCAGGAACAGCACTATCTTGGGCCGCTTAACGGACCAGAGCTGCTGGTGGTGCTACCGGAAGCGAAAGCGGTGGGATCGGTGGCGATGTCGATGCTGGGAAGCGATGCTGATTTGGGTGTCGTGCTGTTTACC‑AGTCGCGATGCCAGTCACTATCAACAAGGGCAAGGAACGCAGTTACTTCATGAAATTGCGCTGATGTTGCCGGAGCTTCTGGAGCGTTGGATTGACCGCGt > 1:276832/1‑251 (MQ=255) cGTATTCAGCGTTAGGGGCAGGAACAGCACTATCTTGGGCCGCTTAACGGACCAGAGCTGCTGGTGGTGCTACCGGAAGCGAAAGCGGTGGGATCGGTGGCGATGTCGATGCTGGGAAGCGATGCTGATTTGGGTGTCGTGCTGTTTACC‑AGTCGCGATGCCAGTCACTATCAACAAGGGCAAGGAACGCAGTTACTTCATGAAATTGCGCTGATGGTGCCGGAGCTTCTGGAGCGTTGGATTGAACGCGt < 2:125845/251‑1 (MQ=255) cGTTAGGGGCAGGGACAGCACTATCTTGGGCCGCTTAACGGACCAGAGCTGCTGGTGGTGCTACCGGAAGCGAAAGCGGTGGGATCGGTGGCGATGTCGATGCTGGGAAGCGATGCTGATTTGGGTGTCGTGCTGTTTACC‑AGTCGCGATGCCAGTCACTATCAACAAGGGCAAGGAACGCAGTTCCTTCATGAAATTGCGCTGTTGTTGCCGGAGCTTCTTGAGCGTTGGATTGAACGCGTAGGACCGAt > 2:32424/1‑251 (MQ=255) | TGATGGAACAGGCTATCGCCAACGAAGGCCTGTTTTATCGCCTACTCTACCTGCAGCGCAGTCTCACCGCCGCCAGCAGTCTCGACGATATGCTGATGCGCTTTCACCGCTGGGCGCGCGATCTCGGCCTGGCAGGTGCGAGTCTGCGCCTGTTTCCGGATCGCTGGCGCTTAGGTGCGCCGTCGAACCACACTCATCTGGCATTAAGCCGTCAGTCTTTCGAACCGCTGCGTATTCAGCGTTTGGGGCAGGAACAGCACTATCTTGGGCCGCTTAACGGACCAGAGCTGCTGGTGGTGCTACCGGAAGCGAAAGCGGTGGGATCGGTGGCGATGTCGATGCTGGGAAGCGATGCTGATTTGGGTGTCGTGCTGTTTACC‑AGTCGCGATGCCAGTCACTATCAACAAGGGCAAGGAACGCAGTTACTTCATGAAATTGCGCTGATGTTGCCGGAGCTTCTGGAGCGTTGGATTGAACGCGTATGACCGAT > NC_000913/3995806‑3996295 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |