| Predicted mutation | ||||||
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| JC JC | NC_000913 | 4,437,485 | IS2 (–) +5 bp | coding (731‑735/741 nt) | cysQ → | 3'(2'),5'‑bisphosphate nucleotidase |
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| * | ? | NC_000913 | = 4437489 | 0 (0.000) | 51 (1.310) | 46/480 | 0.1 | 100% | coding (735/741 nt) | cysQ | 3'(2'),5'‑bisphosphate nucleotidase |
| ? | NC_000913 | = 4499511 | NA (NA) | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
AGCTGAAAGAGTATCTGCAACAGCTTGGCGAACATCAGACCACGTCCATCGGCTCTTCGCTGAAATTCTGCCTGGTGGCGGAAGGACAGGCGCAGCTGTACCCGCGCTTCGGACCAACGAATATTTGGGACACCGCCGCTGGACATGCTGTAGCTGCAGCTGCCGGAGCGCACGTTCACGACTGGCAGGGTAAACCGCTGGATTACACTCCGCGTGAGTCGTTCCTGAATCCGGGGTTCAGAGTGTCTATTTACTAAATTCAGATGGCAGAAACAGTGTATTTCCTGATTCTGCCATCCTGATTTCTCCCAACCTAAAAAGTTATAAATAAAAAGAGATTGTATTTAAAGTGCAAAAATTCAATTGCTAATAAGTTACATTTTAATAATGAGCGTTTTTTGATAGTTTACTTCTATAGTGAGATATTTAATGGCGACATAAAGTAACCAAATAAAATAAGGTTGTCATATGTTACCCAGGATCAGA > NC_000913/4437239‑4437724 | tgcttacgccagagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCTAtt > 1:413864‑M2/247‑251 (MQ=255) 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gAGTCGTTCCTGAATCCGGGGTTCAGAGTGACTATTtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatacaattcgttataatgctcgaaaccctctgcaaggttcttggctgcctttaacccgcctggtttgggcagtatactgatgtagtaccgttttatcgttttcacgaagct > 2:396942‑M1/1‑36 (MQ=255) cGTTCCTGAATCCGGGGTTCAGAGTGTCTATTtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctc < 1:46731‑M1/250‑219 (MQ=255) gTTCCTGAATCCGGGGTTCAGAGTGTCTATTtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctg > 1:407221‑M1/1‑31 (MQ=255) 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NC_000913/4437239‑4437724 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |