| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 92,354 | A→G | V314V (GTA→GTG) | ftsI → | peptidoglycan DD‑transpeptidase FtsI |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 92,354 | 0 | A | G | 93.3% | 128.8 / 1.1 | 45 | V314V (GTA→GTG) | ftsI | peptidoglycan DD‑transpeptidase FtsI |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (2/1); new base G (22/20); total (24/21) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.30e-02 | |||||||||||
CGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACAACCCTAACAATCTGAGCGGCACGCCGAAAGAGGCGATGCGTAACCGTACCATCACCGACGTGTTTGAACCGGGCTCAACGGTTAAACCGATGGTGGTAATGACCGCGTTGCAACGTGGCGTGGTGCGGGAAAACTCGGTACTCAATACCATTCCTTATCGAATTAACGGCCACGAAATCAAAGACGTGGCACGCTACAGCGAATTAACCCTGACCGGGGTATTACAGAAGTCGAGTAACGTCGGTGTTTCCAAGCTGGCGTTAGCGATGCCGTCCTCAGCGTTAGTAGATACTTACTC‑ACGTTTTGGACTGGGAAAAGCGACCAATTTGGGGTTGGTCG > NC_000913/92110‑92595 | cgcTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAATGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACAACCCTAACAATCTGAGCGGCACGCCGAAAGAGGCGATGCGTAACCGTACCATCACCGACGTGTTTGAACCTGGCTCAACGGTTAAACCGATGGTGGTGATGAcc > 1:443005/1‑251 (MQ=255) ccTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAATGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACAACCCTAACAATCTGAGCGGCACGCCGAAAGAGGCGATGCGTAACCGTACCATCACCGACGTGTTTGAACCTGGCTCAACGGTTAAACCGATGGTGGTGATGACCGCGTTGCAAcgtggcgtgg > 1:190779/1‑251 (MQ=255) gaagatgcttgTTTATCGCGATCTGAACAATGCGGGGGGCTGTAACAAGGCTGAATCTGGGAGCGCCGGTCGGGTGTATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGAGGGCTAACAGCCCGTCATACAACCCTAACAATCTGAGCGGCACGCCGAAAGAGGCGATGCGTAACCGTACCATCACCGACGTGTTTTAACCTGGCTCAACGGTTAAACCGATGGTGGTGATGACCGCGTTGCAACGTGGCgtggtg < 2:1269/240‑1 (MQ=255) ggCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAATGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGGGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACAACCCTAACAATCTGAGCGGCACGCCGAAAGAGGCGATGCGTAACCGTACCATCACCGACGTGTGTGAACCTGGCTCAACGGTTAAACCGATGGTGGTGATGACCGCGTTGCAACGTGGCGTGGTGCggg < 2:199488/251‑1 (MQ=255) 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2:183243/1‑251 (MQ=255) aaCCCTAACAATCTGAGCGGCACGCCGAAAGAGGCGATGCGTAACCGTACCATCACCGACGTGTTTGAACCTGGCTCAACGGTTAAACCGATGGTGGTGATGACCGCGTTGCAACGTGGCGTGGTGCGGGAAAACTCGGTACTCAATACCATTCCTTATCGAATTAACGGCCACGAAATCAAAGACGTGGCACGCTACAGCGAATTAACCCTGACCGGGGTATTACAGAAGTCGAGTAACGTCGGTGTTTc > 1:143328/1‑251 (MQ=255) cccTAACAATCTGAGCGGCACGACGAAAGAGGCGATGCGTAACCGTCTCATCACCGACGTGTTTGAACCTGGCTCAACGGTTAAACTGATGGTGGTGATGACCACGTTGCAACGTGGCGTGGTGCGGGAAAACTCGGTACTCAATACCATTCCTTATCGAATTAACTGCCACGAAATCAAAGACGTGGCACGCGACCGCGAATTAACCCTGACCGGGGTATTACAGAAGTCGAGTAACGTCGGTGTTTCCa < 1:316859/251‑1 (MQ=255) aaCAATCTGAGCGGCACGCCGAAAGAGGCGATGCGTAACCGTACCATCACCGACGTGTTTGAACCTGGCTCAACGGTTAAACCGATGGTGGTGATGACCGCGTTGCAACGTGGCGTGGTGCGGGAAAACTCGGTACTCAATACCATTCCTTATCGAATTAACGGCCACGAAATCAAAGACGTGGCACGCTACAGCGAATTAACCCTGACCGGGGTATTACAGAAGTCGAGTAACGTCGGTGTTTCCAAGCt > 1:262076/1‑251 (MQ=255) 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cAACGTTTAAATCGATGTTGGTGATGACCGCGTGGCAAGGTGGCGTGGTGCGGGAAATCTCTGTACCCAATACCGTTCCTTAGCGAATTAACGGCCTCGAAATCAAAGACGTGGCACGCTACAGCGAATTAACCCTGACCGGGGGATTACAGAAGTCGAGTAACGGTGGTGTTTCCAAGCTGGCGTTAGCGATGCCGTCCTCAGCGTTAGTAGATACTTTCTC‑ACGTTTTGGACTGGGAAAATCGAcc < 2:101588/248‑1 (MQ=255) acagTTAAACCGATGGTGGTGATGACCGCGTTGCAACGTGGCGTGGTGCGGGAAAACTCGGTACTCAAGACCATTCCTTATCGAATTAACGGCCACGAAATCAAAGACGTGGCACGCTACAGCGAATTAACCCTGACCGGGGAATTACAGAAGTCGAGTAACGTAGGTGTTTCCAAGCTGGCGTTAGCGATGCCGTCCTCAGCGTTAGTAGATACTTACTC‑ACGTTTTGGACGGGGAAAAGCGACCAAttt > 2:363148/4‑251 (MQ=255) aaCCGATGGTGGTGATGACCGCGATGCAAAGTGGCGAGGTGAGGGAAAACTCGGTACTCCATACCATTCCTTATCGAATTAACGGCCACGAAATCAAAGCCGTGGCACGCTACAGCGAATTAAACCTGACCGGGGCATTACAGGAGTCGAGTAACGTCGGTGATTCCAAGCTGGCGTTAGCGATGCCGTCCTCAGCGTTAGTAGACACTTAATCCAGGTTTGGGA‑TGGGAAAAGCGCCCAATTTGGGGTTg > 2:20035/1‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |