| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 92,327 | G→T | P305P (CCG→CCT) | ftsI → | peptidoglycan DD‑transpeptidase FtsI |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 92,327 | 0 | G | T | 90.9% | 109.9 / 2.4 | 44 | P305P (CCG→CCT) | ftsI | peptidoglycan DD‑transpeptidase FtsI |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (2/2); new base T (22/18); total (24/20) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.60e-01 | |||||||||||
CAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACAACCCTAACAATCTGAGCGGCACGCCGAAAGAGGCGATGCGTAACCGTACCATCACCGACGTGTTTGAACCGGGCTCAACGGTTAAACCGATGGTGGTAATGACCGCGTTGCAACGTGGCGTGGTGCGGGAAAACTCGGTACTCAATACCATTCCTTATCGAATTAACGGCCACGAAATCAAAGACGTGGCACGCTACAGCGAATTAACCCTGACCGGGGTATTACAGAAGTCGAGTAACGTCGGTGTTTCCAAGCTGGCGTTAGCGATGCCGTCCTCAGCGTTAGTAGATACTTACTCACGTTTTGGACTGG > NC_000913/92087‑92568 | cAGCCAGGCTGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAATGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACAACCCTAACAATCTGAGCGGCACGCCGAAAAAGGCGATGCGTAACCGTACCATCACCGACGTGTTTGAACCTGGCTCACCgg > 2:104005/1‑251 (MQ=255) 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gAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACAACCCTAACAAGCTGAGCGGCACGCCGAAAGAGGCGATGCGTAACCGTACCATCACCGACGTGTTTGAACCTGGCTCAACGGTTAAACCGATGGTGGTGATGACCGCGTTGCAACGTGGCGTGGTGCGGGAAAACTCGGTACTCAATACCATTCCTTATCGAATTAACGGCCACGAAATCAAAGACGTGGCACGCTACAGCGAATTAACCCTGACCgg < 2:73602/251‑1 (MQ=255) cTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACAACCCTAACAATCTGAGCGGCACGCCGAAAGAGGCGATGCGAAACCGTACCATCACCGACGTGTTTGAACCTGGCTCAACGGTTAAACCGATGGTGGTGATGACAGCGTTGCAACGTGGCGTGGTGAGGGAACACTCGGTACTCAATACAATTCCTTATCGAATTAACGGCCACGAAATCAAAGACGTGGCACGCTACAGCGAATTAACCCTGACCGGGGGAtt > 1:118260/1‑251 (MQ=255) ggCGATGGCTAACAGCCCGGCAGACACCCCTAACAATCTGAGCCGCACGCAGAAATAGGCGAGGCGTAACCGTACCATCACCGACGTGTTTGAACCGGGCTCACCGGTTAAACCGATGGTGGTGATGACCGCGTTGCACCGTGGCGTGGTGCGGGAAAACTCGGTACTCAATACCATTCCTTATCGAATTAACGGCCACGAAATCAAAGACGTGGCTCGCTACAGCGAATTAACCCGGAGCGGTGTAtgac < 2:434344/251‑4 (MQ=255) 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1:143328/1‑251 (MQ=255) cccTAACAATCTGAGCGGCACGACGAAAGAGGCGATGCGTAACCGTCTCATCACCGACGTGTTTGAACCTGGCTCAACGGTTAAACTGATGGTGGTGATGACCACGTTGCAACGTGGCGTGGTGCGGGAAAACTCGGTACTCAATACCATTCCTTATCGAATTAACTGCCACGAAATCAAAGACGTGGCACGCGACCGCGAATTAACCCTGACCGGGGTATTACAGAAGTCGAGTAACGTCGGTGTTTCCa < 1:316859/251‑1 (MQ=255) aaCAATCTGAGCGGCACGCCGAAAGAGGCGATGCGTAACCGTACCATCACCGACGTGTTTGAACCTGGCTCAACGGTTAAACCGATGGTGGTGATGACCGCGTTGCAACGTGGCGTGGTGCGGGAAAACTCGGTACTCAATACCATTCCTTATCGAATTAACGGCCACGAAATCAAAGACGTGGCACGCTACAGCGAATTAACCCTGACCGGGGTATTACAGAAGTCGAGTAACGTCGGTGTTTCCAAGCt > 1:262076/1‑251 (MQ=255) ccGAAAGCGGCGATGCGTAACCGTACCATCACCGACGTGTTTGAACCTGGCTCAACGGTTAAACCGATGGTGGTGATGACCGCGTTGCAAAGTGGCGTGGTGCGGGAAAACTCGGTACTCAATACCATTCCTTATCGAATTAACGACAACGAAATCAAAGACATGGCAAGACACAGCGAATTAACCCTGACCGGGGTATTACAGACGTCGGGTAACGTCGGAGTTTACAAGCTGGCGtttgagaagccttc > 2:198396/1‑239 (MQ=255) 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CAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACAACCCTAACAATCTGAGCGGCACGCCGAAAGAGGCGATGCGTAACCGTACCATCACCGACGTGTTTGAACCGGGCTCAACGGTTAAACCGATGGTGGTAATGACCGCGTTGCAACGTGGCGTGGTGCGGGAAAACTCGGTACTCAATACCATTCCTTATCGAATTAACGGCCACGAAATCAAAGACGTGGCACGCTACAGCGAATTAACCCTGACCGGGGTATTACAGAAGTCGAGTAACGTCGGTGTTTCCAAGCTGGCGTTAGCGATGCCGTCCTCAGCGTTAGTAGATACTTACTCACGTTTTGGACTGG > NC_000913/92087‑92568 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |