| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 536,576 | IS1 (+) +9 bp | intergenic (+90/‑2) | hyi → / → glxR | hydroxypyruvate isomerase/tartronate semialdehyde reductase 2 |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 257908 = | NA (NA) | 53 (1.230) | 46/486 | 0.1 | 96.2% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 536576 = | 2 (0.050) | intergenic (+90/‑10) | hyi/glxR | hydroxypyruvate isomerase/tartronate semialdehyde reductase 2 | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 258675 | NA (NA) | 36 (0.830) | 33/486 | 0.3 | 94.5% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 536584 | 2 (0.050) | intergenic (+98/‑2) | hyi/glxR | hydroxypyruvate isomerase/tartronate semialdehyde reductase 2 | |||||
GATAATCCGCATCGCGGCGAACCGGGAACCGGAGAAATTAATTATGATTATCTCTTTAAGGTAATCGAAAATTCTGACTACAACGGTTGGGTTGGGTGTGAATATAAACCCCAAACCACCACGGAAGCCGGTTTACGCTGGATGGATCCGTACCGTTAAAACGTAACGCTATTCAGACAATGCTTTTTTAGGCCGCTAAGTTGGCAGGGGATCGTGTTGTCTGAATTCAGGAAAAGCGAAATTTAAAAGAGGTTAATTATGAAACTGGGATTTATTGGCTTAGGCATTATGGGTACACCGATGGCCATTAATCTGGCGCGTGCCGGTCATCAATTACATGTCACGACCATTGGACCGGTTGCTGATGAATTACTGTCACTGGGTGCCGTCAGTGTTGAAACTGCTCGCCAGGTAACGGAAGCATCGGACATCATTTTTATTATGGTGCCGGACACACCTCAGGTTGAAGAAGTTCTGTTCGGTGAAAATGGTTGTAC > NC_000913/536328‑536824 | caccctttgacgtggtgatatggatgacggatggctggccgctgtatgaatcccgcctgaagggaaagctgcacgtaatcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccGAg < 1:56445‑M2/3‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |