| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3137472 | 72 (1.380) | 3 (0.060) | 3/478 | 5.5 | 4.5% | coding (1051/1860 nt) | gss | fused glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase |
| ? | NC_000913 | 3137746 = | 57 (1.130) | coding (777/1860 nt) | gss | fused glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TATGACAGGAGGCGGAGTCGGCGTTGTACTCGTAAACCTTCAGGCCACGCTCATCCATGCAGAAATCCATACGACCAGTGATCATATGGTGACGGCGACGCTGCCAGGAGAGACGCAAACGTGGCCAGAGGATTTTCGGGATGTCGAACAGCGCCAGCAGGTTGTCATCTTTCAGCACCTTGTCGGTTGCGTGAAGATACATCAGGTGCAGCTCGTTGGTGGCTTTAATTAGCTCCTGCTCGGCACTCTCGGTAATGGTGTAGTAATGATAAGGATCCTGATTGATCACCTGACCGTTGGCCTGCACATAGGCGTTTTGCAGCGGATCTTTTTCATCCAGCCATTTACCGTCAAACTGGCCTTTGTTTTCCAGGCGCGCTCCGCTGATTTTCAGCAGCTCGCCTGCAATTTCCGGCTGCGGTAAGCTGTATTCAGTATCTTCCGTCTGGATCATCCAGCCCAGAATGGTGGTGTCATCAAAAGTGTCTTTC > NC_000913/3137505‑3137995 | tATGACAGGAGGCGGAGTCGGCGTTGTACTCGTAAACCTTCAGGCCACGCTCATCCATGCAGAAATCCATACGACCAGTGATCATATGGTGACGGCGACGCTGCCAGGAGAGACGCAAACGTGGCCAGAGGATTTTCGGGATGTCGAACAGAGCCAGCAGGTTGTCATCTTTCAGCACCTTGTCGGTTGCGTGAAGCTACATCAGGTGCAGCTCGTTGGTGGCTTTAATTAGCTCCTGCGCGGCACTCTCg > 2:184639/1‑251 (MQ=255) aTGACAGGAGGCGGAGTCGGCGTTGTACTCGTAAACCTTCAGGCCACGCTCATCCATGCAGAAATCCATACGACCAGTGATCATATGGTGACGGCGACGCTGCCAGGAGAGACGCAAACGTGGCCAGAGGATTTTCGGGATGTCGAAAAGCGCCAGCAGGTTGTCATCTTTCAGCACCTTGTCGGTTGCGTGAAGATACATCAGGTGCAGCTCGTTGGTGGCTTTAATTAGCTCCTGCTCGGCACTCTCgg > 1:504927/1‑251 (MQ=255) cAGGAGGCGGAGTCGGCGTTGTACTCGTAAACCTTCAGGCCACGCTCATCCATGCAGAAATCCATACGACCAGTGATCATATGGTGACGGCGACGCTGCCAGGAGAGACGCAAACGTGGCCAGAGGATTTTCGGGATGTCGAACAGCGCCAGCAGGTTGTCATCTTTCAGCACCTTGTCGGTTGCGTGAAGATACATCAGGTGCAGCTCGTTGGTGGCTTTAATTAGCTCCTGCTCGGCACTCTCGGTAAt < 1:439681/251‑1 (MQ=255) aggaggCGGAGTCGGCGTTGTACTCGTAAACCTTCAGGCCACGCTCATCCATGCAGAAATCCATACGACCAGTGATCATATGGTGACGGCGACGCTGCCAGGAGAGACGCAAACGTGGCCAGAGGATTTTCGGGATGTCGAACAGCGCCAGCAGGTTGTCATCTTTCAGCACCTTGTCGGTTGCGTGAAGATACATCAGGTGCAGCTCGTTGGTGGCTTTAATTAGCTCCTGCTCGGCACTCTCGGTAATg < 1:16468/251‑1 (MQ=255) cGGAGTCGGCGTTGTACTCGTAAACCTTCAGGCCACGCTCATCCATGCAGAAATCCATACGACCAGTGATCATATGGTGACGGCGACGCTGCCAGGAGAGACGCAAACGTGGCCAGAGGATTTTCGGGATGTCGAACAGCGCCAGCAGGTTGTCATCTTTCAGCACCTTGTCGGTTGCGTGAAGATACATCAGGTGCAGCTCGTTGGTGGCTTTAATTAGCTCCTGCTCGGCACTCTCGGTAATGGTgtag < 1:123084/251‑1 (MQ=255) cGGCGTTGTACTCGTAAACCTTCAGGCCACGCTCATCCATGCAGAAATCCATACGACCAGTGATCATATGGTGACGGCGACGCTGCCAGGAGAGACGCAAACGTGGCCAGAGGATTTTCGGGATGTCGAACAGCGCCAGCAGGTTGTCATCTTTCAGCACCTTGTCGGTTGCGTGAAGATACATCAGGTGCAGCTCGTTGGTGGCTTTAATTAGCTCCTGCTCGGCACTCTCGGTAATGGTGTAGTAATgt > 2:418440/1‑250 (MQ=255) cGGCGTTGTACTCGTAAACCTTCAGGCCACGCTCATCCATGCAGAAATCCATACGACCAGTGATCATATGGTGACGGCGACGCTGCCAGGAGAGACGCAAACGTGGCCAGAGGATTTTCGGGATGTCGAACAGCGCCAGCAGGTTGTCATCTTTCAGCACCTTGTCGGTTGCGTGAAGATACATCAGGTGCAGCTCGTTGGTGGCTTTAATTAGCTCCTGCTCGGCACTCTCGGTAATGGTGTAGTAATg > 1:233821/1‑250 (MQ=255) ggCGTTGTACTCGTAAACCTTCAGGCCACGCTCATCCATGCAGAAATCCATACGACCAGTGATCATATGGTAACGGCGACGCTGCCAGGAGAGACGCAAACGTGGCCAGAGGCTTTTAGGGATGTCGAACAGAGCCAGCAGGTTGTCATCTTTCAGCACCTTGTCGGTTGCGTGAAAATACATCAGGTGCAGCTCGTTGGTGGCTTTAATTAGCTCATGCTCGTCACTCTCGGTAATGGTGTGGTAATGAt > 2:542782/1‑251 (MQ=255) aCTCTTAAACCTTCAGGCCACGCTCATCCATGCAGAAAGCCATACGACCAGTGATCATATGGTGACGGCGACGCTGCCAGGAGAGACGCAAACGTGGCCAGAGGATTTTCGGGATGTCGAACAGCGCCGTCAGTTTGTCATCTTTCAGCACCTTGTCGGTTGCGTGAAGATACATCAGGTGCAGCTCGTGGGTGGCTTTAATTATCTCCTGCTCGGCACTCTCGGTAATGGTGTAGTAATGATAAGGaacc < 2:174925/251‑4 (MQ=255) gcGTAAACCTTCAGGCCACGCTCATCCATGCAGAAATCCATACGACCAGTGATCATATGGTGACGGCGACGCTGCCAGGAGAGACGCAAACGTGGCCAGAGGATTTTCGGGATGTCGAACAGCGCCAGCAGGTTGTCATCTTTCAGCACCTTGTCGGTTGCGTGAAGATACATCAGGTGCAGCTCGTTGGTGGCTTTAATTAGCTCCTGCTCGGCACTCTCGGTAATGGTGTAGTAATGATAAGGATCCtg < 1:14948/250‑1 (MQ=255) ccGTAAACCTTCAGGCCACGCTCATCCATGCAGAAATCCATACGACCAGTGATCATATGGTGACGGCGACGCTGCCAGGAGAGACGCAAACGTGGCCAGAGGATTTTCGGGATGTCGAACAGCGCCAGCAGGTTGTCATCTTTCAGCACCTTGTCGGTTGCGTGAAGATACATCAGGTGCAGCTCGTTGGTGGCTTTAATTAGCTCCTGCTCGGCACGCTCGGTAATGGTGTAGTAATGATAAGGATCCtg < 2:224710/250‑1 (MQ=255) cGTAACCCTTCAGGCCATGCTCATCCATGCAGAAAGCCATACGAACAGTGATCAGAGTGTGACGGCGACGCTGCCAGGAAAGACGCAAACGTGGCCAGAGGATTTTCGGGATGTCGAACAGCGCCAGCAGGTTGTCATCTTTCAGCTCCTTGTCGGTTGCGTGAAGATACATCAGGTGCAGCTCGTTGTTGGCTTTAATTAGCTCCTGCTCGGCACTCTCGGTAATGGTGTAGTAATGATAAGGATCCtga < 2:312832/251‑1 (MQ=255) cGTAAACCTTCAGGCCACGCTCATCCATGCAGAAATCCATACGACCAGTGATCATATGGTGACGGCGACGCTGCCAGGAGAGACGCAAACGTGGCCAGAGGATTTTCGGGATGTCGAACAGCGCCAGCAGGTTGTCATCTTTCAGCACCTTGTCGGTTGCGTGAAGATACATCAGGTGCAGCTCGTTGGTGGCTTTAATTAGCTCCTGCTCGGCACTCTCGGTAATGGTGTAGTAATGATAAGGATCCt < 1:486290/249‑1 (MQ=255) aaaCCTTCAGGCCACGCTCATCCATGCAGAAATCCATACGACCAGTGATCATATGGTGACGGCGACGCTGCCAGGAGAGACGCAAACGTGGCCAGAGGATTTTCGGGATGTCGAACAGCGCCAGCAGGTTGTCATCTTTCAGCACCTTGTCGGTTGCGTGAAGATACATCAGGTGCAGCTCGTTGGTGGCTTTAATTAGCTCCTGCTCGGCACTCTCGGTAATGGTGTAGTAATGATAAGGATCCtgattg < 1:471306/251‑1 (MQ=255) cACGCTCATCCATGCAGAAATCCATACGACCAGTGATCATATGGTGACGGCGACGCTGCCAGGAGAGACGCAAACGTGGCCAGAGGATTTTCGGGATGTCGAACAGCGCCAGCAGGTTGTCATCTTTCAGCACCTTGTCGGTTGCGTGAAGATACATCAGGTGCAGCTCGTTGGTGGCTTTAATTAGCTCCTGCTCGGCACTCTCGGTAATGGTGTAGTAATGATAAGGATCCTGATTGATCACCTGACCg < 1:15137/251‑1 (MQ=255) tcatccaatctgAAATCCATACGACCAGTGACCATATGGTGATGGCGACGCTGGCAGGAGAGACGCAAACGTGGCCAGAGGATGTTCTGGATGTATAACAGCGACAGCAGGTTGGTAGCTTGCTGCGCCCTGTCGGTTGCGTGAAGATACATCAGGTGCAGTTAGTTGGTGGCTTTAAAGAGGTCCTGCTCGGCCCTCGTGGTAATGGTGTAGCAATGTGAAGTATTCTGATTGATCCCCTGACCGTTg < 2:67820/238‑1 (MQ=255) cATCCATGCAGAAATCCATACGACCAGTGATCATATGGTGACGGCGACGCTGCCAGGAGAGACGCAAACGTGGCCAGAGGATTTTCGGGATGTCGAACAGCGCCAGCAGGTTGTCATCTTTCAGCACCTTGTCGGTTGCGTGAAGATACATCAGGTGCAGCTCGTTGGTGGCTTTAATTAGCTCCTGCTCGGCACTCTCGGTAATGGTGTAGTAATGATAAGGATCCTGATTGATCACCTGACCGTTGGcc > 1:449557/1‑251 (MQ=255) aTGCAGAAATCCATACGACCAGTGATCATATGGTGACGGCGACGCTGCCAGGAGAGACGCAAACGTGGCCAGAGGATTTTCGGGCTGTCGAACAGCGCCAGCAGGTTGTCATCTTTCAGCACCTTGTCGGTTGCGTGAAGATACATCAGGTGCAGCTCGTTGGTGGCTTTAATTCGCTCCTGCTCGGCACTCTCGGTAATGGTGTAGTAATGATAAGGATCCTGATTGATCACCTGACCGTTGGCCTGcac > 2:223518/1‑251 (MQ=255) aaTCCATACTACCAGTGAGCATATGGTGACGGCGACGCTGCCAGGAGAGACGCAAACGTGGCCAGAGGATTTTCGGGACGTCGAACAGCGCCAGCAGGTTGTCATCTTTCAGCACCTTGGCGTTTGCGTGAAGATACATCAGGTGCAGCTCGTTGGTGGCTTTAATTAGCTCCTGCTCGGCACTCTCGGTAATGGTGTAGTAATGATAAGGATCCTGATTGATCACCTGACCGTTGGCCTGCACATAGGCg < 1:323349/251‑1 (MQ=255) cGACCAGTGATCATATGGTGACGGCGACGCTGCCAGGAGAGACGCAAACGTGGCCAGAGGATTTTCGGGATGTCGAACAGCGCCAGCAGGTTGTCATCTTTCAGCACCTTGTCGGTTGCGTGAAGATACATCAGGGGCAGCCCGTTGGTGGCTTTAATTAGCTCCTGCTCGGCACTCTCGGTAATGGTGTAGTAATGATAAGGATCCTGTTTGATCACCTGACAGTGGGCCTGAACATAGGCGTTTTGc > 2:367508/1‑249 (MQ=255) cGACCAGTGATCATAGGGTGACGGCGACGCTGCCAGGAGAGACGCAAACGTGGCCAGAGGATTTTCGGGATGTCGAACAGCGCCAGCAGGTTGTCATCTTTCAGCACCTTGTCGGTTGCGTGAAGATACATCAGGTGCAGCTCGTTGGTGGCTTTAATTAGCTCCTGCTCGGCACTCTCGGTAATGGTGTAGTAATGATAAGGATCCTGATTGATCACCTGACCGTTGGCCTGCACATAGGCGTTTTGCAg < 2:107691/251‑1 (MQ=255) gACCAGTGATCATATGGTGACGGCGACGCTGCCAGGAGAGACGCAAACGTGGCCAGAGGATTTTCGGGATGTCGAACAGCGCCAGCAGGTTGTCATCTTTCAGCACCTTGTCGGTTGCGTGAAGATACATCAGGTGCAGCTCGTTGGTGGCTTTAATTAGCTCCTGCTCGGCACTCTCGGTAATGGTGTAGTAATGATAAGGATCCTGATTGATCACCTGACCGTTGGCCTGCACATAGGCGTTTTGCAGc < 1:345687/251‑1 (MQ=255) tGATCATATGGTGACGGCGACGCTGCCAGGAGAGACGCAAACGTGGCCAGAGGATTTTCGGGATGTCGAACAGCGCCAGCAGGTTGTCATCTTTCAGCACCTTGTCGGTTGCGTGAAGATACATCAGGTGCAGCTCGTTGGTGGCTTTAATTAGCTCCTGCTCGGCACTCTCGGTAATGGTGTAGTAATGATAAGGATCCTGATTGATCACCTGACCGTTGGCCTGCACATAgg > 2:44951/1‑234 (MQ=255) tGATCATATGGTGACGGCGACGCTGCCAGGAGAGACGCAAACGTGGCCAGAGGATTTTCGGGATGTCGAACAGCGCCAGCAGGTTGTCATCTTTCAGCACCTTGTCGGTTGCGTGAAGATACATCAGGTGCAGCTCGTTGGTGGCTTTAATTAGCTCCTGCTCGGCACTCTCGGTAATGGTGTAGTAATGATAAGGATCCTGATTGATCACCTGACCGTTGGCCTGCACATAgg < 1:44951/234‑1 (MQ=255) tGATCATATGGTGACGGCGACGCTGCCAGGAGAGACGCAAACGTGGCCAGAGGATTTTCGGGATGTCGAACAGCGCCAGCAGGTTGTCATCTTTCAGCACCTTGTCGGTTGCGTGAAGATACATCAGGTGCAGCTCGTTGGTGGCTTTAATTAGCTCCTGCTCGGCACTCTCGGTAATGGTGTAGTAATGATAAGGATCCTGATTGATCACCTGACCGTTGGCCTGCACATAGGCGTTTTGCAGCGGATCt > 1:15495/1‑251 (MQ=255) 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gtggCTTTAATTAGCTCCTGCTCGGCCCTCTCGGTAATGGTGTAGTAATGATAAGGATCCTGATTGATCACCTGACCGTTGGCCTGCACATAGGCGTTTTGCAGCGGATCTTTTTCATCCAGCCATTTACCGTCAAACTGGCCTTTGTTTTCCAGGCGCGCTCCGCTGATTTTCAGCAGCTCGCCTGCAATTTCCGGCTGCGGTAAGCTGTATTCAGTATCTTCCGTCTGGATCATCCAGCCCAGAAtggt < 1:183869/251‑1 (MQ=255) ggCTTTAATTAGCTCCTGCTCGGCACTCTCGGTAATGGTGTAGTAATGATAAGGATCCTGATTGATCACCTGACCGTTGGCCTGCACATAGGCGTTTTGCAGCGGATCTTTTTCATCCAGCCATTTACCGTCAAACTGGCCTTTGTTTTCCAGGCGCGCTCCGCTGATTTTCAGCAGCTCGCCTGCAATTTCCGGCTGCGGTAAGCTGTATTCAGTATCTTCCGTCTGGATCATCCAGCCCAGAAtggtgg < 1:189468/251‑1 (MQ=255) aaTTAGCTCCTGCTCGGCACTCTCGGTAATGGTGTAGTAATGATAAGGATCCTGATTGATCACCTGACCGTTGGCCTGCACATAGGCGTTTTGCAGCGGATCTTTTTCATCCAGCCATTTACCGTCAAACTGGCCTTTGTTTTCCAGGCGCGCTCCGCTGATTTTCAGCAGCTCGCCTGCAATTTCCGGCTGCGGTAAGCTGTATTCAGTATCTTCCGTCTGGATCATCCAGCCCAGAATGGTGGTGtcat > 2:274569/1‑251 (MQ=255) gCTCCTGCTCGGCACTCTCGGTAATGGTGTAGTAATGATAAGGATCCTGATTGATCACCTGACCGTTGGCCTGCACATAGGCGTTTTGCAGCGGATCTTTTTCATCCAGCCATTTACCGTCAAACTGGCCTTTGTTTTCCAGGCGCGCTCCGCTGATTTTCAGCAGCTCGCCTGCAATTTCCGGCTGCGGTAAGCTGTATTCAGTATCTTCCGTCTGGATCATCCAGCCCAGAATGGTGGTGTCATCaaa > 1:314699/1‑250 (MQ=255) cTCCTGCTCGGCACTCTCGGTAATGGTGTAGTAATGATAAGGATCCTGCTTGATCACCTGACCGTTGGCCTGCACATAGGCGTTTTGCAGCGGATCTTTTTCATCCAGCCATTTACCGTCAAACTGGCCTTTGTTTTCCAGGCGCGCTCCGCTGATTTTCAGCAGCTCGCCTGCAATTTCCGGCTGCGGTAAGCTGTATTCAGTATCTTCCGTCTGGATCATCCAGCCCAGAATGGTGGTGTCATCaaa > 1:205471/1‑249 (MQ=255) cccTGCTCGGCACGCTCGGTAATGGTGTAGTAATGATAAGGATCCTGATTGATCACCTGACCGTTGGCCTGCACATAGGCGTTTTGCAGCGGATCTTTTTCATCCAGCCATTTACCGTCAAACTGGCCTTTGTTTTCCAGGCGCGCTCAGCTGATTTTCAGCAGCTCGCCTGCAATTTCCGGCTGCGGTAAGCTGTATTCAGTATCTTCCGTCTGGATCATCCAGCCCAGAATGGTGGTGTCATCAAAAgt < 1:354077/250‑1 (MQ=255) cTGCTCGGCACTCTCGGTAATGGTGTAGTAATGATAAGGATCCTGATTGATCACCTGACCGTTGGCCTGCACATAGGCGTTTTGCAGCGGATCTTTTTCATCCAGCCATTTACCGTCAAACTGGCCTTTGTTTTCCAGGCGCGCTCCGCTGATTTTCAGCAGCTCGCCTGCAATTTCCGGCTGCGGTAAGCTGTATTc < 2:310318/198‑1 (MQ=255) cTGCTCGGCACTCTCGGTAATGGTGTAGTAATGATAAGGATCCTGATTGATCACCTGACCGTTGGCCTGCACATAGGCGTTTTGCAGCGGATCTTTTTCATCCAGCCATTTACCGTCAAACTGGCCTTTGTTTTCCAGGCGCGCTCCGCTGATTTTCAGCAGCTCGCCTGCAATTTCCGGCTGCGGTAAGCTGTATTc > 1:310318/1‑198 (MQ=255) gCTCGGCACTCTCGGTAATGGTGTAGTAATGATAAGGATCCTGATTGATCACCTGACCGTTGGCCTGCACATAGGCGTTTTGCAGCGGATCTTTTTCATCCAGCCATTTACCGTCAAACTGGCCTTTGTTTTCCAGGCGCGCTCCTCTGATGTTCAGCAGCTCGCCTGCAATTTCCGGCTGCGGTAAGCTGTATTCAGTATCTTCCGTCTGGATCATCCAGCCCAGAATGGTGGTGTCATCAAATgtgt < 1:224795/249‑1 (MQ=255) cTCGGCACTCTCGGTAATGGTGTAGTAATGATAAGGATCCTGATTGATCACCTGACCGTTGGCCTGCACATAGGCGTTTTGCAGCGGATCTTTTTCATCCAGCCATTTACCGTCAAACTGGCCTTTGTTTTCCAGGCGCGCTCCGCTGATTTTCAGCAGCTCGCCTGCAATTTCCGGCTGCGGTAAGCTGTATTCAGTATCTTCCGTCTGGATCATCCAGCCCAGAATGGGGGTGTCATCAAAAGTGTCtt > 2:148294/1‑251 (MQ=255) ggCACTCTCGGTAATGGTGAAGTAATGATAAGGATCCTGATTGATCACCTGACCGTTGGCCTGCACATAGGCGTTTTGCAGCGGATCTTTTTCATCCAGCCATTTACCGTCAAACTGGCCTTTGTTTTCCAGGCGCGCTCCGCTGATTTTCAGCAGCTCGCCTGCAATTTCCGGCTGCGGTAAGCTGTATTCAGTATCTTCCGTCTGGATCATCCAGCCCAGAATGGTGGTGTCATCAAAAATGTCTTTc > 2:271092/1‑250 (MQ=255) | TATGACAGGAGGCGGAGTCGGCGTTGTACTCGTAAACCTTCAGGCCACGCTCATCCATGCAGAAATCCATACGACCAGTGATCATATGGTGACGGCGACGCTGCCAGGAGAGACGCAAACGTGGCCAGAGGATTTTCGGGATGTCGAACAGCGCCAGCAGGTTGTCATCTTTCAGCACCTTGTCGGTTGCGTGAAGATACATCAGGTGCAGCTCGTTGGTGGCTTTAATTAGCTCCTGCTCGGCACTCTCGGTAATGGTGTAGTAATGATAAGGATCCTGATTGATCACCTGACCGTTGGCCTGCACATAGGCGTTTTGCAGCGGATCTTTTTCATCCAGCCATTTACCGTCAAACTGGCCTTTGTTTTCCAGGCGCGCTCCGCTGATTTTCAGCAGCTCGCCTGCAATTTCCGGCTGCGGTAAGCTGTATTCAGTATCTTCCGTCTGGATCATCCAGCCCAGAATGGTGGTGTCATCAAAAGTGTCTTTC > NC_000913/3137505‑3137995 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |