| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | NC_000913 | 3,637,760 | Δ45 bp | coding (119‑163/1500 nt) | pitA → | metal phosphate:H(+) symporter PitA |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3637759 | 2 (0.040) | 53 (1.050) | 49/476 | 0.1 | 96.4% | coding (118/1500 nt) | pitA | metal phosphate:H(+) symporter PitA |
| ? | NC_000913 | 3637805 = | 2 (0.040) | coding (164/1500 nt) | pitA | metal phosphate:H(+) symporter PitA | |||||
TAAGATAATTATTTTTTGAGTGAAATCCATACAGGGGGCAAATCAAAAAAAGTCTATATTTCACTTTGCCCGCGCCGCGAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGGCTTTTGTGCTGTTCTACGAAGCCATCAATGGTTTCCATGACACAGCCAACGCCGTGGCAACCGTTATCTATACCCGCGCGATGCGTTCTCAGCTCGCCGTGGTTATGGCGGCGGTATTCAACTTTTTGGGTGTTTTGCTGGGTGGTCTGAGTGTTGCCTATGCCATTGTGCATATGCTGCCGACGGATCTGCTGCTTAATATGGGATCGTCTCATGGCCTTGCCATGGTGTTCTCTATGTTGCTGGCGGCGATTATCTGGAACCTGGGTACCTGGTACTTTGGTTTACCTGCATCCAGC > NC_000913/3637511‑3638001 | taAGATAATTATTTTTTGAGTGAAATCCATACAGGGGGCAAATCAAAAAAAGTCTATATTTCACTTTGCCCGCGCCGCGAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATATGCATCCCTGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGGCTTTTGTGCTGTTCTACGAAGCCATCACTGGTTTCCATGACACAGCCAACGCCGTGGtt > 2:527145‑M1/1‑249 (MQ=255) attattTTTTGAGTGAAATCCATACAGGCGGCAAATCAAAAAAAGTCTATATTTCACTTTGCCCGCGCCGCGAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGGCTTTTGTGCTGTTCTACGAAGCCATCAATGGTTTCAATGGCCCAGCCAACGCCGTGGttatggcgg > 2:457521‑M1/1‑242 (MQ=255) ttgatggaaatccATACAGGGGGAAAATCAAAAAAAGTCTATATTTCACTTTGCCCGCGCCGCGAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGGCTTTGGTGCTGTTCTACGAAGCCATCAATGGTTTCCATGACACAGCCAACGCCGTGGttatggcggcggtatt < 2:439077‑M1/244‑17 (MQ=255) gAAATCCATACAGGGGGCAATTCAAAAAAATTCTATATTTCACTTTGCCAGCGCCGCGAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCACAATGGCGTAACGTCCTATGCTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGGCTTTTGTGCTGTTCTACGACGCCATCAATGGTTTCCATGCCACAGCCACAGCCGGGGttatggcgttggggttccactgt > 2:474762‑M1/1‑228 (MQ=255) aaaTCCATACAGGGGGCAAATCAAAAAAAGTCTATATTTCACTTTGCCCGCGCCGCGAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGGCTTTTGTGCTGTTCTACGAAGCCATCAATGGTTTCCATGACACAGCCAACGCCGTGGttatggcggcgggattcaactttt > 1:143939‑M1/1‑227 (MQ=255) ccATACAGGGGGCAAATCAAAAAAAGTCTATATTTCACTTTGCCCGCGCCGCGAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTACGCTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGGCTTTTGTGCTGTTCTACGAAGCCATCAATGGTTTCCATGACACAGCCAACGCCGTGGttatggcggcggtattcaactttttggg > 1:108860‑M1/1‑223 (MQ=255) aCAGGGGGCAAATCAAACAAAGTCTATATTTCACTTTGCCCGCACCGCGAAAGTCACTGATACTGCGCCGCGTTCATGTCCTCACAATGGCGTAACGTCCTATGCTACCTTTGTTTGCTGGACTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGGCTTTTGTGCTGTTCTACGAAGCCATCCATGGTTTCCATGACACAGCCAACGCCGGGGttatggcggcgggattcaacttttttgggggt > 2:534020‑M1/1‑219 (MQ=255) cAGGGGGCAAATCAAAAAAAGTCTATATTTCACTTTGCCCGCGCCGCGAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATCATTGCTTGCACTGGCTTTTGTGCTGTTCTACGAAGCCATCAATGGTTTCCATGACACAGCCAACGCCGTGGttatggcggcgggattcaactttttgggggttt > 1:169993‑M1/1‑218 (MQ=255) aGGGGGCAAATCAAAAAAAGTCTATATTTCACTTTGCCCGCGCCGCGAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGGCTTTTGTGCTGTTCTACGAAGCCATCAATGGTTTCCATGACACAGCCAACGCCGTGGttatggcggcggttttcaccttttttggggtttt > 1:266258‑M1/1‑217 (MQ=255) ggggCAAATCAAAAAAAGTCTATATTTCACTTTGCCCGCGCCGCGAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGGCTTTTGTGCTGTTCTACGAAGCCATCAATGGTTTCCATGACACAGCCAACGCCGTGGttatggcggcgggattcaactttttgggggttttgc > 1:344986‑M1/1‑215 (MQ=255) ggCAAATCAAAAAAAGTCTATATTTCACTTTGCCCGCGCCGCGACAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGGCTTTTGTGCTGTTCTACGAAGCCATCAATGGTTTCCATGACACAGCCAACGCCGTGGttatggcggcgggttttcaattttttgggggttttgtt > 2:215088‑M1/1‑213 (MQ=255) ggCAAAACAAAAAAAGTCTATAGTTCACTTTGCCCGCGCCGCGAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCAGTTCCGCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTACATTTGTTTTCTGGTCTGGATTTGCATACCTGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGGCTTTTGTGCTGTTCTACGAAGCCATCAATGGTTTCCATGTCACAGCCAACGCCGTGGttatggcggcggtagccaactttttgggtgttttgctg < 2:233716‑M1/251‑39 (MQ=255) tCAAAAAAAGTCTATATTTCACTTTGCCCGCGCCGCGAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGGCTTTTGTGCTGTTCTACGAAGCCATCCATGGTTTCCATGACACAGCCAACGCCGTGGttatggcggcgggattcaagcttttggggggttttgtggggggg > 2:466900‑M1/1‑207 (MQ=255) atatTTCACTTTGCCCGCGCCGCGAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGGCTTTTGTGCTGTTCTACGAAGCCATCAATGGTTTCCATGACACAGCCAACGCCGTGGttatggcggcggtattcaacttttttggggttttttttggtgggtttgtgggttgct > 2:162245‑M1/1‑194 (MQ=255) ttCACTTTGCCCGCGCCGCGAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGGCTTTTGTGCTGTTCTACGAAGCCATCAATGGTTTCCATGACACAGCCAACGCCGTGGttatggcggcggtattcaaattttttggggttttgctgggtggtctgggtgtttcctatgc > 1:429519‑M1/1‑190 (MQ=255) cTTTGCCCGCGCCGCGAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGGCTTTTGTGCTGTTCTACGAAGCCATCAATGGTTTCCATGACACAGCCAACGCCGTGGttatggcggcgggattcaactttttgggtgttttgctggggggtctgagtgttgcctatgccatt > 1:438192‑M1/1‑186 (MQ=255) cagcgccgcgAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGACTTTTGTGCTGTTCTACAAAGCCATCAATGGTTTCCATGACACAGCCAACGCCGTGGCAACCGTTCTCTATACCCGCGCGCTGCGTTCTCAGCTCGCCGTGGTTATGGCGGCAGGATTCCACtttttt > 2:41420/3‑250 (MQ=255) gccgcgAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGGCTTTTGTGCTGTTCTACGAAGCCATCAATGGTTTCCATGACACAGCCAACGCCGTGGttatggcggcgggattccactttttggggggtttgctggggggtctgagtgttgcctatgccattttgcatatgc > 1:265834‑M1/1‑176 (MQ=255) cgcgAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTTATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGGCTTTTGTGCTGTTCTACGAAGCCATCAATGGTTTCCATGACACAGCCAACGCCGTGGttatggcggcggtattcaactttttgggtgttttgctgggtggtctgagtgttgcctatgccattgtgcatatgctg < 2:229008‑M1/251‑78 (MQ=255) cgAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGGCTTTTGTGCTGTTCTACGAAGCCATCAATGGTTTCCATGACACAGCCAACGCCGTGGttatggcggcggtattcaactttttgggtgttttgctgggtggtctgagtgttgcctatgccattgtgcatatgctgcc < 1:403338‑M1/251‑80 (MQ=255) ggcacTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGGCTTTTGTGCTGTTCTACGAAGCCATCAATGGTTTCCATGACACAGCCAACGCCGTGGttatggcggcggtattcaacttttttggggttttgctggggggtctggggggtgcctctgaccttgtgcattttgtgccgacgg > 2:387540‑M1/3‑167 (MQ=255) cTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTCTTATTGCTTGCACTGGCTTTTGTGCTGTTCTACGAAGCCATCAATGGTTTCCATGACACAGCCAACGCCGTGGttatggcggcggtattcaactttttgggtggtttgctggggggttttggtgttgcctatgccattgtgcatatgatgccgaagggtct > 1:256208‑M1/1‑163 (MQ=255) gATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGGCTTTTGTGCTGTTCTACAAAGCCAGCAATGGTTTCCATGACACAGCCAACGCCGTGGCAACCGTTATCTATACCCGCGCGATGCGTTCTCAGCTCGCCGTGGTTATGGCGGCGGTATTCAACTTTTTGGGTGTTTTGCTGggtggt < 1:41420/250‑1 (MQ=255) gATAAGGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGGCTTTTGTGCTGTTCTACGAAGCCATCAATGGTTTCCATGACACAGCCAACGCCGTGGttatggcggcggtattcaactttttgggtgttttgctgggtggtctgagtgttgcctatgccattgtgcatatgctgccgacggatctg < 2:265834‑M1/250‑90 (MQ=255) cgcctcGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTACATTTGTTTGCTGTCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGGCTTTTGTGCTGTTCTACGAAGCCATCAATGGTTTCCATGACACAGCCAACGCCGTGGttatggcggcggtattcaactttttgggtgttttgctgggtggtctgagtgttgcctatgccattgtgcatatgctgccgacggatctgctgcttaa < 2:32990‑M1/251‑98 (MQ=255) ttCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGGCTTTTGTGCTGTTCTACGAAGCCATCAATGGTTTCCATGACACAGCCAACGCCGTGGttatggcggcggtattctaatttttgggtgtttttctgggggggcttagtgtttcctatgcccttttgcatatgctgccgacgggtctgctggtttatatgggg > 1:157791‑M1/1‑147 (MQ=255) tCATGTCCTCAAAATGGCTTAACGTCCTATGCTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACGGGCTTTTGTGCTGTTCTACGAAGCCATCAATGGTTTCCATGACACAGCCAACGCCGTGGttatggcggcggtattcaactttttgggtgttttgctgggtggtctgagtgttgcctatgccattgtgcatatgctgccgacggatctgctgcttaatatggga < 2:429519‑M1/250‑105 (MQ=255) gTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGGCTTTTGTGCTGTTCTACGAAGCCATCAATGGTTTCCATGACACAGCCAACGCCGTGGttatggcggcggtattcaactttttgggtgttttgctgggtggtctgagtgttgcctatgccattgtgcatatgctgccgacggatctgctgcttaatatgggatcgtc < 1:162245‑M1/251‑110 (MQ=255) ccTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGGCTTTTGTGCTGTTCTACGAAGCCATCAATGGTTTCCATGACACAGCCAACGCCGTGGttatggcggcggtattcaactttttgggtgttttgctgggtggtctgagtgttgcctatgccattgtgcatatgctgccgacggatctgctgcttaatatgggatcgtctc < 1:507382‑M1/251‑112 (MQ=255) cTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGGCTTTTGTGCTGTTCTACGAAGCCATCAATGGTTTCCATGACACAGCCAACGCCGTGGttatggcggcggtattcaactttttgggggttttgctgggtgggctgagtgtttgctatgccattttgcatattctgccgacggatcttctgctttatattgggtcatctc > 1:138378‑M1/1‑139 (MQ=255) ggCGTAACGGCCTATGCTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGGCTTTTGTGCTGTTCTACGAAGCCATCAATGGTTTCCATGACACAGCCAACGCCGTGGttatggcggcggtattcaactttttgggtgttttgctgggtggtctgagtgttgcctatgccattgtgcatatgctgccgacggatctgctgcttaatatgggatcgtctcatggcctt < 1:11231‑M1/250‑120 (MQ=255) gTAACGTCCTATGCTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGGCTTTTGTGCTGTTCTACGAAGCCATCAATGGTTTCCATGACACAGCCAACGCCGTGGttatggcggcggtattcaactttttgggtgttttgctgggtggtctgagtgttgcctatgccattgtgcatatgctgccgacggatctgctgcttaa < 1:376467‑M1/225‑98 (MQ=255) cATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGGCTTTTGTGCTGTTCTACGAAGCCATCAATGGTTTCCATGACACAGCCAACGCCGTGGttatggcggcggtattccactttttgggggttttgctgggtgggctgagtgtttgctatgcccttgtgcatattctgccgacggatctgctgcttaatatgggatcgtctccaggccttgccatggtgtttcctatttt > 1:72855‑M1/1‑112 (MQ=255) ttgtgtgCTGGCCTGGAGTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTCGCACTGGCTTTTGTGCTGTTCTACGAAGCCAGCAATGGTTTCCATTACACAGCCAACGCCGTGGttatggcggcggtattcaactttttgggtgttttgctgggtggtctgagtgttgcctatgccattgtgcatatgctgccgacggatctgctgcttaatatgggatcgtctcatggccttgccatggtgttctctatgttgc < 2:205256‑M1/250‑142 (MQ=255) ggtctggATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTTGCTTTTGTGCTGTTCTACGAAGCCATCAATGGTTTCCATGACACAGCCAACGCCGTGGttatggcggcggtattcaactttttgggtgttttgctgggtggtctgagtgttgcctatgccattgtgcatatgctgcagacggatctgctgcttaatatgggatcgtctcatggccttgccatggtgttctctatgtttctggcggcga < 1:116174‑M1/247‑151 (MQ=255) gCCTGGATTTTCATACCGGGCTGTTAGTATTGCTTGCACTGGCTTTTGTGCTGTTCTACGAAGCCATCAATGGTTTCCATGACACAGCCAACGACGTGGttatggcggcggtattcaactttttgggtgttttgctgggtggtctgagtgttgcctatgccattgtgcatatgctgccgacggatctgctgcttaatatgggatcgtctcatggccttgccatggtgttctctatgttgctggcggcgatt < 1:304554‑M1/251‑153 (MQ=255) ggATTTGCATACCGGGCGGTTATTATTGCTTGCACTGGCTTTTGTGCTGTTCTACGAAGCCATCAATGGTTTCCATGACACAGCCAACGCCGTGGttatggcggcggtattcaactttttgggtgttttgctgggtggtctgagtgttgcctatgccattgtgcatatgctgccgacggagctgctgcttaatatgggatcgtctcatggccttgccatggtgttctctatgttgctggcggcgattatct < 1:353153‑M1/251‑157 (MQ=255) aTACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGGCTTTTGTGCTGTTCTACGAAGCCAGCAATGGTTTCCATGACACAGCCAACGCCGTGGttatggcggcggtattcaactttttgggtgttttgctgggtggtctgagtgttgcctatgccattgtgcatatgctgccgacggatctgctgcttaatatgggagcgtctcatggccttgccatggtgttctctatgttgctggcggcgattatctggaacctg < 1:334239‑M1/251‑165 (MQ=255) cTGTTATTATTGCTTGCACTGGCTTTTGTGCTGTTCTACGAAGCCATCAATTGTTTCCATGACACAGCCAACGCCGTGGttatggcggcggtattcaactttttgggtgttttgctgggtggtctgagtgttgcctatgccattgtgcatatgctgccgacggatctgctgcttaatatgggatcgtctcatggccttgccatggtgttctctatgttgct < 2:367625‑M1/221‑143 (MQ=255) attGCTTGCACTGGCTTTTGTGCTGTTCTACGAAGCCATCAATGGTTTCCATGACACAGCCAACGCCGTGGttatggcggcggtattcaactttttgggtgttttgctgggtggtctgagtgttgcctatgccattgtgcatatgctgccgacggatctgctgcttaatatgggatcgtctcatggccttgccatggtgttctctatgttgctggcggcgattatctggaacctgggtacctggtactttg < 1:425099‑M1/251‑181 (MQ=255) aCTGGGTTTTGGGCTGTTCTACGAATCCATCAATGGTTCCAAGGACACAGCCATCGCCGTGTgtatggcggcggtattcatctttttgggtgttttgctgggtggtctgagtgttgcctatgccattgtgcatatgctgccgacggatctgctgcttaatatgggatcgtctcatggccttgccatggtgttctctatgttgctggcggcgattatctggaacctgggtacctggtactttggtttacctg < 2:157791‑M1/251‑190 (MQ=255) ggCTTTTGTGCTGTTCTACGAAGCCATCTATGGTTTCCATGGCGCAGCCACCGCCGTGGttatgggggtggtagtcatctttgtgggggttttgttgggtggtctgagtgttgcctatgccattgtgcatatgctgccgacggatctgctgcttaatatgggatcgtctcatggccttgccatggtggtctctatgttgctggcggcgattatctggaacctgggtacctggttctttggtttacctgca < 2:328859‑M1/250‑192 (MQ=255) ggCTTTTGTGCTGTTCTACGAAGCCATCAATGGTTTCCATGACACAGCTAACGCCGTGGttatggcggcggtattcaactttttgggtgttttgctgggtggtctgagtgttgcctatgccattgtgcatatgctgccgacggatctgctgcttaatatgggatcgtctcatggccttgccatggtgttctctatgttgctggcggcgattatctggaacctgggtacctggtactttggtttacctgca < 1:474762‑M1/250‑192 (MQ=255) cTTTTGTGCTGTTCTACGAAGCCATCAATGGTTTCCATGACACAGCCAACGCCGTGGttatggcggcggtattcaactttttgggtgttttgctgggtggtctgagtgttgcctatgccattgtgcatatgctgccgacggatctgctgcttaatatgggatcgtctcatggccttgccatggtgttctctatgttgctggcggcgattatctggaacctgggtacctggtactttggtttac < 1:269713‑M1/243‑187 (MQ=255) cTTTTGTGCTGTTATACGAAGCCATCAATGGTTTCCATGACACAGCCAACGCCGTGGttatggcggcggtatttcactttttgggtgttttgatgggtggtttgagtgttgcctatgcccttgtgcatatgctgccgacggatctgctgctttatatgggatagtctcatggccttgacatggtgttctctatgtttctggcggcgattatctggaacctgggtaccttgtactttggtttacctgcatcc > 1:125382‑M1/1‑57 (MQ=255) ttGTGCTGTTCTACGAAGCCATCAATGGTTTCCATGACACAGCCAACGCCGTGGttatggcggcggtattcaactttttgggtgttttgctgggtggtctgagtgttgcctatgccattgtgcatatgctgccgacggatctgctgcttaatatgggatcgtctcatggccttgccatggtgttctctatgttgctggcggcgattatctggaacctgggtacctggtactttggtttacctgcatccag < 1:457521‑M1/250‑197 (MQ=255) tgtgCTGGTCTACGAAGCCATCAATGGTTTCCATGACACAGCCAACGCCGTGGtgatggcggcggtattcaacgttttgggtgttttgctgggtggtcttagtgttgcctatgccattgtgcatatgctgccgacggatctgctgcttaatatgggatcgtctcatggccttgccatggtgttctctatgttgctggcggcgattatctggaacctgggtacctggtactttggtttacctgcatccagc < 2:266258‑M1/250‑198 (MQ=255) gtgCTGTTCTACGAAGCCATCAATGGTATCCATGACACAGCCAACGCCGTGGttatggcggcggtatttcaattttttggtgttttggtggggggtctgagtgttgcctatgcccttgggcatatgctgccggcggatctgctgcttaatatggggtcgtctcctggccttgccatggggttctctatgttgctggcggcgcttatctggaacctgggtacctggtactttgggttaacttcatccagctc > 1:212771‑M1/1‑52 (MQ=255) gTTCTACGAAGCCATCAATGGTTTCCATGACACAGCCAACGCCGTGGttatggcggcggtattcaactttttgggtgttttgctgggtggtctgagtgttgcctatgccattgtgcatatgctgccgacggatctgctgcttaatatgggatcgtctcatggccttgccatggtgttctctatgttgctggcggcgattatctggaacctgggtacctggtactttggtttacctgcatccagctctcata < 1:215088‑M1/251‑205 (MQ=255) ccATCAATGGTTTCCATGACACAGCCAACGCCGTGGttatggtggcggtattcaactttttgggtgttttgctgggttgtctgagtgttgcctatgccattgtgcatatgctgccgacggatctgctgcttaatatgggatcgtctcatggccttgtcatggtgttatctatgttgctggcggcgattatctggaacctgtgtacctggtactttggtttacctgcatccagctctcatacgctgattggc < 1:527145‑M1/251‑216 (MQ=255) ccATGACACAGCCAACGCCGTGGttatggcggcggtattcaaatttttgggggttttgctgggtggtctgagtgtttcctatgcccttgtgcatatgctgccgccggatctgctgcttaatatgggatcgtctcatggccttgccctgggggtctctatgttgctggcggcgattatctggaacctggggacctgggactttggttttcctgcatccagctctcatacgctgatttgcgcggtcatcgggg > 1:506417‑M1/1‑23 (MQ=255) cATGACACAGCCAACGCCGTGGttatggcggcgggattcaacttttttggggtttttctggggggtctgagtgttgcctattccattttgcatatgctgccgacgggtctgccggttaatatgggatcgtctcatggcctttcaatggggttatctatgttgctggcggcgattatctgggacctgggaacctggtactttggtttacctgcatccagctctcatacgctgattggcgcgatcatcgggat > 1:5245‑M1/1‑22 (MQ=255) acaGCCAACGCCGTGGttatggcggcggtattcaactttttgggggttttgctggggggtctgagtgttgcctatgccattgtgcatatgctgccgacggatctgctgcttaatatgggatcgtctcatggccttgccatggtgttctctatgttgctggcggcgattatctggaacctgggtacctggtactttgggttacctgcatccagctctcataagctgattggcgcgatcatcgggattggttt > 1:176847‑M1/1‑16 (MQ=255) caGCCAACGTCGTGGgtatggcggcggtattcaactttttgggtgttttgctgggtggtctgagtgttgcctatgccattgtgcatatgctgccgacggatctgctgcttaatatgggatcgtctcatggccttgccatggtgttctctatgttgctggtggcgattatctggaacctgggtacctggtactttggtttacctgcatccagctctcatacgctgattggcgcgatcaacgggattggttta < 1:340246‑M1/251‑237 (MQ=255) aCGCCGTGGttatggcggcggtattcaactttttgggtgttttgctgggtggtctgagtgttgcctatgccattgtgcatatgctgccgacggatctgctgcttaatatgggatcgtctcatggccttgccatggtgttctctatgttgctggcggcgattatctggaacctgggtacctggtactttggtttacctgcatccagctctcatacgctgattggcgcgatcatcgggattggtttaaccaat < 1:99790‑M1/251‑243 (MQ=255) | TAAGATAATTATTTTTTGAGTGAAATCCATACAGGGGGCAAATCAAAAAAAGTCTATATTTCACTTTGCCCGCGCCGCGAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGGCTTTTGTGCTGTTCTACGAAGCCATCAATGGTTTCCATGACACAGCCAACGCCGTGGCAACCGTTATCTATACCCGCGCGATGCGTTCTCAGCTCGCCGTGGTTATGGCGGCGGTATTCAACTTTTTGGGTGTTTTGCTGGGTGGTCTGAGTGTTGCCTATGCCATTGTGCATATGCTGCCGACGGATCTGCTGCTTAATATGGGATCGTCTCATGGCCTTGCCATGGTGTTCTCTATGTTGCTGGCGGCGATTATCTGGAACCTGGGTACCTGGTACTTTGGTTTACCTGCATCCAGC > NC_000913/3637511‑3638001 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |