Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_000913 | 3,996,049 | T→A | L156* (TTG→TAG) | yigA → | DUF484 domain‑containing protein YigA |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,996,049 | 0 | T | A | 98.7% | 261.4 / NA | 77 | L156* (TTG→TAG) | yigA | DUF484 domain‑containing protein YigA |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base A (44/32); total (44/33) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.29e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.88e-01 |
GTTGATGGAACAGGCTATCGCCAACGAAGGCCTGTTTTATCGCCTACTCTACCTGCAGCGCAGTCTCACCGCCGCCAGCAGTCTCGACGATATGCTGATGCGCTTTCACCGCTGGGCGCGCGATCTCGGCCTGGCAGGTGCGAGTCTGCGCCTGTTTCCGGATCGCTGGCGCTTAGGTGCGCCGTCGAACCACACTCATCTGGCATTAAGCCGTCAGTCTTTCGAACCGCTGCGTATTCAGCGTTTGGGGCAGGAACAGCACTATCTTGGGCCGCTTAACGGACCAGAGCTGCTGGTGGTGCTACCGGAAGCGAAAGCGGTGGGATCGGTGGCGATGTCGATGCTGGGAAGCGATGCTGATTTGGGTGTCGTGCTGTTTACCAGTCGCGATGCCAGTCACTATCAACAAGGGCAAGGAACGCAGTTACTTCATGAAATTGCGCTGATGTTGCCGGAGCTTCTGGAGCGTTGGATTGAACGCGTATGACCGA > NC_000913/3995804‑3996294 | gTTGATGGAACAGGCTATCGCCAACGAAGGCCTGTTTTATCGCCTACTCTACCTGCAGCGCAGTCTCACCGCCGCCAGCAGTCTCGACGATATGCTGATGCGCTTTCACCGCTGGGCGCGCGATCTCGGCCTGGCAGGTGCGAGTCTGCGCCTGTTTCCGGATCGCTTGCGCTTAGGTGCGCCGTCGAACCACACTCATCTGGCATTAAGCCGTCAGTCTTTCGAACCGCTGCGTATTCAGCGTTAGGGGc > 2:334511/1‑251 (MQ=255) 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gAAGGCCTGTTTTATCGCCTACTCTACCTGCAGCGCAGTCTCACCGCCGCCAGCAGTCTCGACGATATGCTGATGCGCTTTCACCGCTGGGCGCGCGATCTCGGCCTGGCAGGTGCGAGTCTGCGCCTGTTTCCGGATCGCTGGCGCTTAGGTGCGCCGTCGAACCACACTCATCTGGCATTAAGCCGTCAGTCTTTCGAACCGCTGCGTATTCAGCGTTAGGGGCAGGAACAGCACTATCTTGGGCCGCt > 2:75873/1‑251 (MQ=255) cTGTTTTATCGCCTACTCTACCTGCAGCGCAGTCTCACCGCCGCCAGCAGTCTCGACGATATGCTGATGCGCTTTCACCGCTGGGCGCGCGATCTCGGACTGGCAGGTGCGCGTCTGCGCCTGTTTCCGGATCGCTGGCGCTTAGGTGCGCCGTCGACCCACACTCATCTGGCATTAAGCCGTCAGTCTTTCGAACCGCTGCGTATTCAGCGTTAGGGGCAGGAAAAGCACTATCTTGGGCCGCTTAACgg > 1:408012/1‑251 (MQ=255) gTTTTATCGCCTACTCTACCTGCAGCGCAGTCTCACCGCCGCCAGCAGTCTCGACGATATGCTGATGCGCTTTCACCGCTGGGCGCGCGATCTCGGCCTGGCAGGTGCGAGTCTGCGCCTGTTTCCGGATCGCTGGCGCTTAGGTGCGCCGTCGAACCACACTCATCTGGCATTAAGCCGTCAGTCTTTCGAACCGCTGCGTATTCAGCGTTAGGGGCAGGAACAGCACTATCTTGGGCCGCTTAACGGAc > 1:78382/1‑251 (MQ=255) 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GTTGATGGAACAGGCTATCGCCAACGAAGGCCTGTTTTATCGCCTACTCTACCTGCAGCGCAGTCTCACCGCCGCCAGCAGTCTCGACGATATGCTGATGCGCTTTCACCGCTGGGCGCGCGATCTCGGCCTGGCAGGTGCGAGTCTGCGCCTGTTTCCGGATCGCTGGCGCTTAGGTGCGCCGTCGAACCACACTCATCTGGCATTAAGCCGTCAGTCTTTCGAACCGCTGCGTATTCAGCGTTTGGGGCAGGAACAGCACTATCTTGGGCCGCTTAACGGACCAGAGCTGCTGGTGGTGCTACCGGAAGCGAAAGCGGTGGGATCGGTGGCGATGTCGATGCTGGGAAGCGATGCTGATTTGGGTGTCGTGCTGTTTACCAGTCGCGATGCCAGTCACTATCAACAAGGGCAAGGAACGCAGTTACTTCATGAAATTGCGCTGATGTTGCCGGAGCTTCTGGAGCGTTGGATTGAACGCGTATGACCGA > NC_000913/3995804‑3996294 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |