Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,436,697 | G→A | E60E (GAG→GAA) | trkA → | NAD‑binding component of Trk potassium transporters |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,436,697 | 0 | G | A | 100.0% | 135.9 / NA | 40 | E60E (GAG→GAA) | trkA | NAD‑binding component of Trk potassium transporters |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (17/23); total (17/23) |
CCGAAGAGGGCGACGGCTTCTTTTACGCTAAGCTAATCAAAAAGTGATGAGATAACGGGTCGCGACTGATGAAAATTATCATTCTGGGTGCCGGCCAGGTTGGCGGCACACTGGCGGAAAACCTGGTTGGCGAGAACAACGATATTACTGTTGTCGATACCAACGGTGAGCGTCTGCGGACCTTACAGGATAAATTTGACCTGCGGGTCGTGCAGGGGCATGGCTCTCATCCACGCGTATTGCGGGAGGCAGGTGCCGACGACGCCGATATGCTGGTTGCTGTAACCAGTTCAGATGAAACCAATATGGTTGCCTGCCAGGTAGCCTACTCACTTTTCAACACCCCTAATCGCATCGCTCGTATCCGCTCACCAGACTACGTGCGCGATGCCGATAAGCTATTTCATTCAGATGCTGTGCCGATTGATCATCTGATCGCACCAGAGCAGTTGGTTATCGATAATATTTACCGACTGATTGAGTATCCCGGCGCA > NC_000913/3436450‑3436943 | ccGAAGAGGGCGACGGCTTCTTTTACGCTAAGCTAATCAAAAAGTGATGAGATAACGGGTCGCGACTGATGAAAATTATCATTCTGGGTGCCGGCCAGGTTGGCGGCACACTGGCGGAAAACCTGGTTGGCGAGAACAACGATATTACTGTTGTCGATACCAACGGTGAGCGTGTGCGGACCTTACAGGATAAATTTGACCTGCGGGTCGTGCAGGGGCATGGCTCTCATCCACGCGTATTGCGGGAAGCa < 1:291232/251‑1 (MQ=255) 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aTAACGGGTCGCGACTGATGAAAATTATCATTCTGGGTGCCGGCCAGGTTGGCGGCACACTGGCGGAAAACCTGGTTGGCGAGAACAACGATATTACTGTTGTCGATACCAACGGTGAGCGTCTGCGGACCTTACAGGATAAATTTGACCTGCGGGTCGTGCAGGGGCATGGCTCTCATCCACGCGTATTGCAGGAAGCAGGGGCCGACGACGCCGATATTCTGGTTGCTGTAACCCGTTCAGATGAAAcc > 2:238568/1‑251 (MQ=255) gcgACTGATGAAAATTATCATTCTGGGTGCCGGCCAGGTTGGCGGCACACTGGCGGAAAACCTGGTTGGCGAGAACAACGATATTACTGTTGTCGATACCAACGGTGAGCGTCTGCGGACCTTACAGGATAAATTTGTCCTGCGGGTCGTGCAGGGGCATGGCTCTCATCCACGCGTATTGCGGGAAGCAGGTGCCGACGACGCCGAGATGCTGGTTGTTGTAACCAGTTCAGATGAAACCAATATGGTtg < 1:337667/251‑1 (MQ=255) aTTCTGGGTGCCGGCCAGGTTGGCGGCACACTGGCGGAAAACCTGGTTGGCGAGAACAACGATATTACTGTTGTCGATACCAACGGTGAGCGTCTGCGGACCTTACAGGATAAATTTGACCTGCGGGTCGTGCAGGGGCATGGCTCTCCTCCATGCGTATTGCGGGAAGCAGGTGCCGCCGACGCCGATCTGCTGGTTGCTGTAACCAGTTCAGATGCAACCCATATGGTTGCCTGCCAGGTCGCCTAc > 2:82093/1‑249 (MQ=255) aTTCTGGGTGCCGGCCAGGTTGGCGGCACACTGGCGGAAAACCTGGTTGGCGAGAACAACGATATTACTGTTGTCGATACCAACGGTGAGCGTCTGCGGACCTTACAGGATAAATTTGACCTGCGGGTCGTGCAGGGGCATGGCTCTCATCCATGCGTATTGCGGGAAGCAGGTGCCGACGACGCCGATATGCTGGTTGCTGTAACCAGTTCAGATGAAACCAATATGGTTGCCTGCCAGGTAGCCTAc < 1:82093/249‑1 (MQ=255) ggTGCCGGCCAGGGTGGCGGCACACTGGCGGAAAACCTGGTTGGCGAGAACAACGATATTACTGTTGTCGATACCAACGGTGAGCGTCTGCGGACCTTACAGGATAAATTTGACCTGCGGGTCGTGCAGGGGCATGGCTCTCATCCACGCGTATTGCGGGAAGCAGGTGCCGACGACGCCGATATGCTGGTTGCTGTAACCAGTTCAGATGAAACCAATATGGTTGCCTGCCAGGTAGCCTACTCACtttt < 2:186109/251‑1 (MQ=255) ggCCAGGTTGGCGGCCCACTGGCGGAAAACCTGGTTGGCGAGAACAACGATATTACTGTTGTCGATACCAACGGTGAGCGTCCGCGGACCTTACAGGATAAATTTGACCTGCGGGTCGTGCAGGGGCATGGCTCTCATCCACGCGTATTGCGGGAAGCAGGTGCCGACGACGCCGATATGCTGGTTGCTGTAACCAGTTCAGATGAAACCAATATGGTTGCCTGCCAGTTAGCCTCCTCACTTGTCAacac < 2:391144/251‑1 (MQ=255) 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atatTACTGTTGTCGATACCAACGGTGAGCGTCTGCCGACCTTACAGGATAAATTTGACCTGCGGGTCGTGCAGGGGCATGGCTCTCATCCACGCGTATTGCGGGAAGCAGGTGCCGACGACGCCGATATGCTGGTTGCTGTAACCAGTCCAGATGAAACCAATATGGTTGCCTGCCAGGTAGCCTACTCACTTTTCAACACCCCTAATCGCATCGCTCGTATCCGCTCACCAGACTACGTGCGCGATGcc < 2:347247/251‑1 (MQ=255) tatTACTGTTGTCGATACCACCGGTGAGCGTCTGCGGACCTTACAGGATAAATTTGACCTGCGGGTCGTGCAGGGGCATGGCTCTCATCCACGCGTATTGCGGGAAGCAGGTGCCGACGACGCCGATATGCTGGTTGCTGTAACCAGTTCAGATGAAACCAATATGGTTGCCTGCCAGGTAGCCTACTCACTTTTCAACCCCCCTAATCGCATCGCTCGTATCCGCTCACCAGACTACGTGCGCGATGCCg > 1:171887/1‑251 (MQ=255) gttgtCGATACCAACGGTGAGCGTCTGCGGACCTTACAGGATAAATTTGACCTGCGGGTCGTGCAGGGGCATGGCTCTCATCCACGCGTATTGCGGGAAGCAGGTGCCGACGACGCCGATATGCTGGTTGCTGTAACCAGTTCAGATGAAACCAATATGGTTGCCTGCCAGGTAGCCTACTCACTTTTCAACACCCCTAATCGCATCGCTCGTATCCGCTCACCAGACTACGTGCGCGATGCCGATAAGCt > 2:306721/1‑251 (MQ=255) cGATACCAACGGTGAGCGTCTGCGGACCTTACAGGATAAATTTGACCTGCGGGTCGTGCAGGGGCATGGCTCTCATCCACGCGTATTGCGGGAAGCAGGTGCCGGCGACGCCGATATGCTGGTTGCTGGAACCAGTTCAGATGAAACCAATATGGTTGCCTGCCAGGTAGCCTACTCACTTTTCAACACCCCTAatcgcatcg < 1:189211/203‑1 (MQ=255) gATACCAACGGTGAGCGTCTGCGGACCTTACAGGATAAATTTGACCTGCGGGTCGTGCAGGGGCATGGCTCTCATCCAAGCGTATTGCGGGAAGCAGGTGCCGACGACGCCGATATGCTGGTTGCTGTAACCAGTTCAGATGAAACCAATATGGTTGCCTGCCAGGTAGCCTACTCACTTTTCAACACCCCTAATCGCATCGCTCGTATCCGCTCACCAGACTACGTGCGCGAGGCCGATACACTATttc > 1:280291/1‑250 (MQ=255) aCCAACGGTGAGCGTCTGCGGACCTTACAGGATAAATTTGACCTGCGGGTCGTGCAGGGGCATGGCTCTCATCCACGCGTATTGCGGGAAGCAGGTGCCGACGACGCCGATATGCTGGTTGCTGTAACCAGTTCAGATGAAACCAATATGGTTGCCTGCCAGGTAGCCTACTCACTTTTCAACACCCCTAATCGCATCGCTCGTATCCGCTCACCAGACTACGTGCGCGATGCCGATAAGCTATttcatt < 2:187271/250‑1 (MQ=255) 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ggACCTTACAGGATAAATGTGACCTGCGTGTCGTGCAGGGGCATGGCTCTCATCCACGCGTATTGCGTGAAGCAGGTGCCGACGACGCCGATATGCTGGTTGCTGTAACCAGTTCAGATGAAACCAATATGGTTGCCTTCCAGTTAGCCTACTCACTGTTCAACACCCCCAAGCGCATCTCTCGTATCCGCTCACCAGACCACGTGCACGATGCCGATAAGCTATTTCATTCATATGCTGTGCCTATTGat < 2:403788/251‑1 (MQ=255) aCCTTACAGGATAAATTTGACCTGCGGGTCGTGCAGGGGCATGGCTCTCATCCACGCGTATTGCGGGAAGCAGGTGCCGACGACGCCGATATg < 1:12081/93‑1 (MQ=255) aCCTTACAGGATAAATTTGACCTGCGGGTCGTGCAGGGGCATGGCTCTCATCCACGCGTATTGCGGGAAGCAGGTGCCGACGACGCCGATATg > 2:12081/1‑93 (MQ=255) aCAGGAGAAATTTGACCTGCGGGTCGTGCAGGGGCATGGCTCTCATCCGCGCGTATTGCGGGAAGCAGGTGCCGTCGTCGACGATATGCTGGTTGCGGTAACCAGGTCAGATGAAACCAATATGGTTGCCTGCCAGGTAGCCGACTCTCTTTTCAACACCCCTAATCGCATCGCTCGTATCCGCTCACCAGACTACGTGCGCGAGGCCGATAAGCTATTTCATTCAGATGCTGTGCCGATTGATCATCtta < 2:201483/251‑3 (MQ=255) 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tGGCTCTCATCCACGCGTATTGCGGGAAGCAGGTGCCGACGACGCCGATATGCTGGTTGCTGTAACCAGTTCAGATGAAACCAATATGGTTGCCTGCCAGGTAGCCTACTCACTTTTCAACACCCCTAATCGCATCGCTCGTATCCGCTCACCAGACTACGTGCGCGATGCCGATAAGCTATTTCATTCAGATGCTGTGCCGATTGATCATCTGATCGCACCAGAGCAGTTGGTTATCGATAATATTTAcc > 2:155513/1‑251 (MQ=255) tcATCCACGCGTATTGCGGGAAGCAGGTGCCGACGACGCCGATATGCTGGTTGCTGTAACCAGTTCAGATGAAACCAATATGGTTGCCTGCCAGGTAGCCTACTCACTTTTCAACACCCCTAATCGCATCGCTCGTATCCGCTCACCAGACTACGTGCGCGATGCCGATAAGCTATTTCATTCAGATGCTGTGCCGATTGATCATCTGATCGCACCAGAGCAGTTGGTTATCGATACTATTTCCCGACTg > 2:302041/1‑250 (MQ=255) cccgcgTATTTCGGGAAGCAGGTGCCGACGACGCCGATATGCTGGTTGCTGTACCCAGTTCAGATGAAACCAATATGGTTGCCTGCCAGGTAGCCTACTCACTTTTCAACACCCCTAATCGCATCGCTCGTATCCGCTCACCAGACTACGTGCGCGATGCCGATAAGCTATTTCATTCATATGCTGTGCCGATTGATCATCTGATCGCACCAGAGCAGTTGGTTATCGATAATATTTACCGACTGATTGAg < 2:283439/249‑1 (MQ=255) gggAAGCAGGTGCCGACGACGCCGATATGCTGGTTGCTGTAACCAGTTCAGATGAAACCAATATGGTTGCCTGCCAGGTAGCCTACTCACTTTTCAACACCCCTAATCGCATCGCTCGTATCCGCTCACCAGACTACGTGCGCGATGCCGATAAGCTATTTCATTCAGATGCTGTGCCGATTGATCATCTGATCGCACCAGAGCAGTTGGTTATCGATAATATTTACCGACTGATTGAGTATCCCGgcgc > 1:136801/1‑250 (MQ=255) gggAAGCAGGTGCCGACGACGCCGATATGCTGGTTGCTGTAACCAGGTCAGATGAAACCAATATGGTTGCCTGTCAGGTAGCCTACTCACTTTTCAACACCCCTAATCTCATCTCTCGTATCCGCTCACCAGACTACGTGCGCGATGCCGATAAGCTATTTCATTCAGATGCTGTGCCGATTGATCATCTGAGCGCACCAGAGCAGTTGGTTATCGATAATAGTTACCGACTGATTGAGTATCCCTGCGCa < 2:415771/251‑1 (MQ=255) | CCGAAGAGGGCGACGGCTTCTTTTACGCTAAGCTAATCAAAAAGTGATGAGATAACGGGTCGCGACTGATGAAAATTATCATTCTGGGTGCCGGCCAGGTTGGCGGCACACTGGCGGAAAACCTGGTTGGCGAGAACAACGATATTACTGTTGTCGATACCAACGGTGAGCGTCTGCGGACCTTACAGGATAAATTTGACCTGCGGGTCGTGCAGGGGCATGGCTCTCATCCACGCGTATTGCGGGAGGCAGGTGCCGACGACGCCGATATGCTGGTTGCTGTAACCAGTTCAGATGAAACCAATATGGTTGCCTGCCAGGTAGCCTACTCACTTTTCAACACCCCTAATCGCATCGCTCGTATCCGCTCACCAGACTACGTGCGCGATGCCGATAAGCTATTTCATTCAGATGCTGTGCCGATTGATCATCTGATCGCACCAGAGCAGTTGGTTATCGATAATATTTACCGACTGATTGAGTATCCCGGCGCA > NC_000913/3436450‑3436943 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |