| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 4,553,671 | C→T | F257F (TTC→TTT) | uxuB → | D‑mannonate oxidoreductase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 4,553,671 | 0 | C | T | 98.5% | 472.6 / NA | 134 | F257F (TTC→TTT) | uxuB | D‑mannonate oxidoreductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (70/61); minor base G (0/2); total (71/63) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.22e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 134 total aligned reads displayed.
AGGGTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTACTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGCACCATGGTTGACCGCATCGTTCCGGCGGCGACGCCAGAAACCTTACAGGAAATTGCTGACCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTCCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGATTGGGATAAAGTGGGCGCACAGTTCGTTGCAGACGTTGTGCCGTTCGAAATGATGAAGCTGCGTATGCTGAACGGCAGCCACTCTTTTCTGGCGTACCTCGGTTACCTCGGCGGCTATGAAACCATTGCCGACACCGTGACTAACCCGGCTTATCGCAAAGCGGCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTG > NC_000913/4553425‑4553917 | aGGGTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTACTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGCACCATGGTTGACCGCATCGTTCCGGCGGCGACGCCAGAAACCTTACAGGAAATTGCTGACCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTc > 1:479478/1‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |