| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,541,261 | C→T | A102V (GCT→GTT) | fimB → | Type 1 fimbriae regulatory protein FimB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,541,261 | 0 | C | T | 98.3% | 200.3 / NA | 60 | A102V (GCT→GTT) | fimB | Type 1 fimbriae regulatory protein FimB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base T (28/31); total (29/31) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.83e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.91e-01 | |||||||||||
CAGCAAATACCGGGCCTCATGCAGCACGTAATTATTGTCTGACTTTGCTTTGTTTTATTCATGGTTTCCGGGCGAGTGAAATTTGTCGATTGAGGATTTCGGATATTGATCTTAAGGCAAAGTGTATATATATCCATCGATTAAAAAAAGGCTTTTCAACAACGCACCCGCTATTGAATAAAGAAGTTCAGGCTTTAAAAAACTGGTTGAGTATCCGTACTTCGTACCCGCATGCTGAGAGCGAGTGGGTATTTTTATCACGTAAGGGGAATCCGCTTTCTCGGCAACAGTTTTACCATATTATCTCGACTTCCGGTGGTAATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGACTTATCCAGGATTATCTTGGGCATCGCAATATTCGTCATACTGTCTGGTATACCGCCAGCAATGCAGGGCGT > NC_000913/4541027‑4541505 | cagcaAATACCGGGCCTCATGCAGCACGTAATTATTGTCTGACTTTGCTTTGTTTTATTCATGGTTTCCGGGCGAGTGAAATTTGTCGATTGAGGATTTCGGATATTGATCTTAAGGCAAAGTGTATATATATCCATCGATTAAAAAAAGGCTTTTCAACAACGCACCCGCTATTGAATAAAGAAGTTCAGGCTTTAAAAAACTGGTTGAGTATCCGTACTTCGTACCCGCATGTTGAGAGCGAGTGGGt > 2:638139/1‑250 (MQ=255) aTACCGGGCCTCATGCAGCACGTAATTATTATCTGACTTTGCTTTGTTTTATTCATGGTTTCCGGGCGAGTGAAATTTGTCGATTGAGGATTTCGGATATTGATCTTAAGGCAAAGTGTATATATATCCATCGATTAAAAAAAGGCTTTTCAACAACGCACCCGCTATTGAATAAAGAAGTTCAGGCTTTAAAAAACTGGTTGAGTATCCGTACTTCGTACCCGCATGTTGAGAGCGAGTGGGTAttttt > 1:681837/1‑250 (MQ=255) aCCGGGCCTCATGCAGCACGTAATTATTGTCTGACTTTGCTTTGTTTTATTCATGGTTTCCGGGCGAGTGAAATTTGTCGATTGAGGATTTCGGATATTGATCTTAAGGCAAAGTGTATATATATCCATCGATTAAAAAAAGGCTTTTCAACAACGCACCCGCTATTGAATAAAGAAGTTCAGGCTTTAAAAAACTGGTTGAGTATCCGTACTTCGTACCCGCATGTTGAGAGCGAGTGGGTATTTTTAt < 1:164680/250‑1 (MQ=255) cagcaCGTAATTATTGTCTGACTTTGCTTTGTTTTATTCATGGTTTCCGGGCGAGTGAAATTTGTCGATTGAGGATTTCGGATATTGATCTTACGGCAAAGTGTATATATATCCATCGATTAAAAAAAGGCTTTTCAACAACGCACCCGCTATTGAATAAAGAAGTTCAGGCTTTAAAAAACTGGTTGAGTATCCGTACTTCGTACCCGCATGTTGAGAGCGAGTGGGTATTTTTATCACGTAAGGGGAAt > 1:34244/1‑251 (MQ=255) tattGTCTGACTTTGCTTTGTTTTATTCATGGTTTCCGGGCGAGTGAAATTTGTCGATTGAGGATTTCGGATATTGATCTTAAGGCAAAGTGTATATATATCCATCGATTAAAAAAAGGCTTTTCAACAACGCACCCGCTATTGAATAAAGAAGTTCAGGCTTTAAAAAACTGGTTGAGTATCCGTACTTCGTACCCGCATGTTGAGAGCGAGTGGGTATTTTTATCACGTAAGGGGAATCCGCTTTCTCg > 1:434090/1‑251 (MQ=255) tattGTCTGACTTTGCTTGGTTTTATTCATGGTTTCCGGGCGAGTGAAATTTGTCGATTGAGGATTTCGGATATTGATCTTAAGGCAAAGTGTATATATATCCATCGAGTAAAAAAAGGCTTTTCAACAACGCACCCGCTATTGAATAAAGAAGTTCAGGCTTTAAAAAGCTGGTTGAGTATCCGTACTTCGTACCCGCATGTTGAGAGCGAGTGGGGATTTTTATCACGTAAGGGGAATCCGCTTtctc < 2:535517/250‑1 (MQ=255) ttGTCTGACTTTGCTTTGTTTTATTCATGGTTTCCGGGCGAGTGAAATTTGTCGATTGAGGATTTCGGATATTGATCTTAAGGCAAAGTGTATATATATCAATCGCTTAAAAAAAGGCTTTTCAACAACGCACCCGCTATTGAATAAAGAAGTTCAGGCTTTAAAAAACTGGTTGAGTATCCGTACTTCGTACCCGCATGTTGAGAGCGAGTGGGTATTTTTATCACGTAAGGGGCATCCGCTTTCTCGGc > 1:443260/1‑251 (MQ=255) ttgctttgTTTTATTCATGGTTTCCGGGCGAGTGAAATTTGTCGATTGAGGATTTCGGATATTGATCTTAAGGCAAAGTGTATATATATCCATCGATTAAAAAAAGGCTTTTCAACAACGCACCCGCTATTGAATAAAGAAGTTCAGGCTTTAAAAAACTGGTTGAGTATCCGTACTTCGTACCCGCATGTTGAGAGCGAGTGGGTATTTTTATCACGTAAGGGGAATCCGCTTTCTCGGCAACAGtttt < 1:47681/250‑1 (MQ=255) tttgTTTTATTCATGGTTTCCGGGCGAGTGAAATTTGTCGATTGAGGATTTCGGATATTGATCTTAAGGCAAAGTGTATATATATCCATCGATTAAAAAAAGGCTTTTCAACAACGCACCCGCTATTGAATAAAGAAGTTCAGGCTTTAAAAAACTGGTTGAGTATCCGTACTTCGTACCCGCATGTTGAGAGCGAGTGGGTATTTTTATCACGTAAGGGGAATCCGCTTTCTCGGCAACAGTTTTACCat > 2:591855/1‑251 (MQ=255) aTTCATGGTTTCCGGGCGAGTGAAATTTGTCGATTGAGGATTTCGGATATTGATCTTAAGGCAAAGTGTATATATATCCATCGATTAAAAAAAGGCTTTTCAACAACGCACCCGCTATTGAATAAAGAAGTTCAGGCTTTAAAAAACTGGTTGAGTATCCGTACTTCGTACCCGCATGTTGAGAGCGAGTGGGTATTTTTATCACGTAAGGGGAATCCGCTTTCTCGGCAACAGTTTTACCATATTAtctc < 1:638139/251‑1 (MQ=255) ggTTGCCGGGCGAGTGAAATTTGTCTATTGAAGATTTCGGATATTGATCTTAAGGCAAAGGGTATATATATCCATCGATTAAAAAAAGGCTTTGCAACAACGCACCCGCTATTGAATAAAGAAGTTCAGGCTTTAAAAAACTGGTTGAGTATCCGTACTTCGTACCCGCATGTTGAGAGCGAGTGGGTATTTTTATCACGTAAGGGGAATCCGCTTTCTCGGCAACAGTTTTACCATATTATCTCGACTTc < 2:409088/251‑1 (MQ=255) tttCCGGGCGAGTGAAATTTGTCGATTGAGGATTTCGGATATTGATCTTCAGGCAAAGTGTATATATATCCATCGATTAAACAAAGGCTTTTCAACAACGCACCCGCTATTGAATAAAGAAGTTCAGGCTTTAAAAAACTGGTTGAGTATCCGTACTTCGTACCCGCATGTTGAGAGCGAGTGGGTATTTTTATCACGTAAGGGGAATCCGCTTTCTCGGCAACAGTTTTACCATCTTATCTCGACTTCCg > 1:657858/1‑251 (MQ=255) cGGGCGAGGGAAATTTGTCGATTGAGGATTTCGGCTATTGATCTTAAGGCAAAGTGTATATATATCCATCGATTAAAAAAAGGCTTTTCAACAACGCAACCGCTATTGAATAAAGAAGTTCAGGCTTTAAAAAACTGGTTGAGTATCCGTACTTCGTACCCGCATGTTGAGAGCGAGTGGGTATTTTTATCACGTAAGGGGCATCCGCTTTCTCGGCACCAGTTTTACCATATTATCTCGACTTCCggtgg > 2:603022/1‑251 (MQ=255) aGTGAAATTTGTCGATTGAGGATTTCGGATATTGATCTTAAGGCAAAGTGTATATATATCCATCGATTAAAAAAAGGCTTTTCAACAACGCACCCGCTATTGAATAAAGAAGTTCAGGCTTTAAAAAACTGGTTGAGTATCCGTACTTCGTACCCGCATGTTGAGAGCGAGTGGGTATTTTTATCACGTAAGGGGAATCCGCTTTCTCGGCAACAGTTTTACCATATTATCTCGACTTCCGGTGGTAATGc < 1:399888/251‑1 (MQ=255) gTGAAATTTGTCGATTGAGGATTTCGGATATTGATCTTAAGGCAAAGTGTATATATATCCATCGATTAAAAAAAGGCTTTTCAACAACGCACCCGCTATTGAATAAAGAAGTTCAGGCTTTAAAAAACTGGTTGAGTATCCGTACTTCGTACCCTCATGTTGAGAGCGAGTGGGTATTTTTATCACGTAAGGGGAATCCGCTTTCTCGGCAACAGTTTTACCATATTAGCTCGACTTCCGGTGGTAATGcc < 2:651363/251‑1 (MQ=255) ttGAGGATTTCGGATATTGATCTTAAGGCAAAGTGTATATATATCCATCGATTAAAAAAAGGCTTTTCAACAACGCACCCGCTATTGAATAAAGAAGTTCAGGCTTTAAAAAACTGGTTGAGTATCCGTACTTCGTACCCGCATGTTGAGAGCGAGTGGGTATTTTTATCACGTAAGGGGAATCCGCTTTCTCGGCAACAGTTTTACCATATTATCTCGACTTCCGGTGGTAATGCCGGGTTGTCACTgg > 2:200833/1‑250 (MQ=255) tGAGGATTTCGGATATTGATCTTAAGGCAAAGTGTATATATATCAATCGATTCAAAAAAGGCTTTTAAACAACGCACCCGCTATTGAATAAAGAAGTTCAGGCTTTAACAAACTGGTTGAGTATCCGTACTTCGTACCAGCATGTTGAGAGCGAGTGGGTATTTTTATCACGTAAGGGGAATCCGCTTTCTCGGCAACAGTTTTACCATATTATCTCGACTTCCGGTGGTAATGCCGGGTTGTCACTgg > 1:77506/1‑249 (MQ=255) aGGATTTCGGATATTGATCTTAAGGCAAAGTGTATATATATCCATCGAGTAAAAAAAGGCTTTTCAACAACGCACCCGCTATTGAATAAAGAAGTTCAGGCTTTAAAAAACTGGTTGAGTATCCGTACTTCGTACCCGCATGTTGAGAGCGAGTGTGTATTTTTATCTCGTAAGGGGAATCCGCTTTCTCGGCAACAGTTTTACCATATTATCTCGACTTCCGGTGGTAATGCCGGGTTGTCACTGGAGAt < 2:153378/251‑1 (MQ=255) gATATTGATCTTAAGGCAAAGTGTATATATATCCATCGATTAAAAAAAGGCTTTTCAACAACGCACCCGCTATTGAATAAAGAAGTTCAGGCTTTAAAAAACTGGTTGAGTATCCGTACTTCGTACCCGCATGTTGAGAGCGAGTGGGTATTTTTATCACGTAAGGGGAATCCGCTTTCTCGGCAACAGTTTTACCATATTATCTCGACTTCCGGTGGTAATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATcc < 2:72727/248‑1 (MQ=255) gATATTGATCTTAAGGCAAAGTGTATATATATCCATCGATTAAAAAAAGGCTTTTCAACAACGCACCCGCTATTGAATAAAGAAGTTCAGGCTTTAAAAAACTGGTTGAGTATCCGTACTTCGTACCCGCATGTTGAGAGCGAGTGGGTATTTTTATCACGTAAGGGGAATCCGCTTTCTCGGCAACAGTTTTACCATATTATCTCGACTTCCGGTGGTAATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATcc > 1:72727/1‑248 (MQ=255) tCTTAAGGCAAAGTGTATATATATCCATCGATTAAAAAAAGGCTTTTCAACAACGCACCCGCTATTGAATAAAGAAGTTCAGGCTTTAAAAAACTGGTTGAGTATCCGTACTTCGTACCCGCATGTTGAGAGCGAGTGGGTATTTTTATCACGTAAGGGGAATCCGCTTTCTCGGCAACAGTTTTACCATATTATCTCGACTTCCGGTGGTAATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTAc > 2:20488/1‑251 (MQ=255) cTTAAGGCAAAGTGTATATATATCCATCGATTAAAAAAAGGCTTTTCAACAACGCACCCGCTATTGAATAAAGAAGTTCAGGCTTTAAAAAACTGGTTGAGTATCCGTACTTCGTACCCGCATGTTGAGAGCGAGTGGGTATTTTTATCACGTAAGGGGAATCCGCTTTCTCGGCAACAGTTTTACCATATTATCTCGACTTCCGGTGGTAATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACg > 1:374295/1‑251 (MQ=255) aaGGCAAAGTGTATATATAACCAGCGATTAAAAAAAGGCTTTTCAACAACGCACCCGCTATTGAATAAAGAAGTTCAGGCTTTAAAAAACTGGTTGAGTATCCGTACTTCGTACCCGGATGTTGAGAGCGAGTGGGTATTTTTATCACGTAAGGGGAATCCGCTTTCTCGGCAACAGTTTTACCATATTATCTCGACTTCCGGTGGTAATGCCGGGTTGTCACTGGAGAGTCATCCGCACATGTTACGcc < 2:508390/250‑1 (MQ=255) aaGGCAAAGTGGATATAAAACCATCGATTAAAAAAAAGCTTTTCAACAACGCATCCGCTATTGAATAAAGAAGTTCAGGCTATAAAAAACTGGTTGAGTATCCGTACTTCGTTCACGCATGTTGAGAGCGAGTGGGTATTTTTATCACGTAAGGGGAATCCGCTTTCTCGGCAACAGTTTTACCATATTATCTCGACTTCCGGTGGGAATGCCGGGGATTATCTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGcg < 2:217514/250‑2 (MQ=255) gCAAAGTGTATATATATCCATCGATTAAAAAAAGGCTTTTCAACAACGCACCCGCTATTGAATAAAGAAGTTCAGGCTTTAAAAAACTGGTTGAGTATCCGTACTTCGTACCCGCATGTTGAGAGCGAGTGGGTATTTTTATCACGTAAGTGGAAGCCGTTTTCTCGGCAACAGTTTTACCATGTTATCTCGACTTCCGGTTGTAATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTc < 1:61118/251‑1 (MQ=255) aaaGTGTATATATATCCATCGATTAAAAAAAGGCTTTTCAACAACGCACCCGCTATTGAATAAAGAAGTTCAGGCTTTAAAAAACTGGTTGAGTATCCGTACTTCGTACCCGCATGTTGAGAGCGAGTGGGTATTTTTATCACGTAAGGGGAATCCGCTTTCTCGGCAACAGTTTTACCATATTATCTCGACTTCCGGTGGTAATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCgt < 1:106528/251‑1 (MQ=255) aGTGTATATATATCCATCGATTAAAAAAAGGCTTTTCAACAACGCACCCGCTATTGAATAAAGAAGTTCAGGCTTTAAAAAACTGGTTGAGTATCCGTACTTCGTACCCGCATGTTGAGAGCGAGTGGGTATTTTTATCACGTAAGGGGAATCCGCTTTCTCGGCAACAGTGTTACCATATTATCTCGACTTCCGGTGGTAATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCgtgt < 1:275064/251‑1 (MQ=255) atatatCCATCGATTAAAAAAAGGCTTTTCAACAACGCACCCGCTATTGAATAAAGAAGTTCAGACTTTAAAAAACTGGTTGAGTATCCGTACTTCGTACCCGCATGTTGAGAGCGAGTGGGTATTTTTATCACGTAAGGGGAATCCGCTTTCTCGGCAACAGTTTTACCATATTATCTCGACTTCCGGTGGTAATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTg > 2:342931/1‑251 (MQ=255) atatCCATCGAGTAAAAAAAGGCTTTTCAACAACGCACCCGCTATTGAATAAAGAAGTTCAGGCTTTAAAAAACTGGTTGAGTATCCGTACTTCGTACCCGCATGTTGAGAGCGAGTGGGTATTTTTATCACGTAAGGGGAATCCGCTTTCTCTGCAACAGTTTTACCATATTATCTCGACTTCCGGTGGTAATGCCGGGTTGGCACTGGATAGTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGc < 2:459588/250‑1 (MQ=255) tatCCATCGATTAAAAAAAGGCTTTTCAACAACGCACCCGCTATTGAATAAAGAAGTTCAGGCTTTAAAAAACTGGTTGAGTATCCGTACTTCGTACCCGCATGTTGAGAGCGAGTGGGTATTTTTATCACGTACGGGGAACCCGCTTTCTCGGCAACAGTTTTACCTTATTATCTCGACTTCCGGTGGTATTGCCGGGTTGTCATTGGAGATTCTTCCGCACTTGTTCCGCCATTCGTGGGGtttggttt > 2:564149/1‑246 (MQ=255) atCCATCGATTAAAAAAAGGCTTTTCAACAACGCACCCGCTATTGAATAAAGAAGTTCAGGCTTTAAAAAACTGGTTGAGTATCCGTACTTCGTACCCGCATGTTGAGAGCGAGTGGGTATTTTTATCACGTAAGGGGAATCCGCTTTCTCGGCAACAGTTTTACCATATTATCTCGACTTCCGGTGGTCATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCttt > 2:218047/1‑251 (MQ=255) cATCGATTAAAAAAAGGCTTTTCAACAACGCACCCGCTATTGAATAAAGAAGTTCAGGCTTTAAAAAACTGGTTGAGTATCCGTACTTCGTACCCGCATGTTGAGAGCGAGTGGGTATTTTTATCACGTAAGGGGAATCCGCTTTCTCGGCAACAGTTTTACCATATTATCTCGACTTCCGGTGGTAATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGc > 2:177697/1‑251 (MQ=255) tAAAAAAAGGCTTTTCAACAACGCACCCGCTATTGAATAAAGAAGTTCAGGCTTTAAAAAACTGGTTGAGTATCCGTACTTCGTACCCGCATGTTGAGAGCGAGTGGGTATTTTTATCACGTAAGGGGAATCCGCTTTCTCGGCAACAGTTTTACCATATTATCTCGACTTCCGGTGGTAATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATg > 1:678756/1‑251 (MQ=255) aaaaaaGGCTTTTCAACAACGCACCCGCTATTGAATAAAGAAGTTCAGGCTTTAAAAAACTGGTTGAGTATCCGTACTTCGTACCCGCATGTTGAGAGCGAGTGGGTATTTTTATCACGTAAGGGGAATCCGCTTTCTCGGCAACAGTTTTACCATATTATCTCGACTTCCGGTGGTAATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATggg > 1:560093/1‑251 (MQ=255) aaaaGGCTTTTCAACAACGCACCCGCTATTGAATAAAGAAGTTCAGGCTTTAAAAAACTGGTTGAGTATCCGTACTTCGTACCCGCATGTTGAGAGCGAGTGGGTATTTTTATCACGTAAGGGGAATCCGCTTTCTCGGCAACAGTTTTACCATATTATCTCGACTTCCGGTGGTAATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTGGGCGAATATGGGaa < 2:85660/251‑1 (MQ=255) aaaGGCTTTTCAACAACGCACACGCTATTGAATAAAGAAGTTCAGGCTTTAAAAAACTGGTTGAGTATCAGTACTTCGTACCCGCATGTTGAGAGCGAGTGGGTATTTTTATCACGTAAGGGGAATCCGCTTTCTCGGCACCAGTTTTACCATATTATCTCGACTTCCGGTGGTAATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGTCGAATATGGGAAt > 1:626818/1‑251 (MQ=255) tttCAACAACGCACCCGCTATTGAATAAAGAAGTTCAGGCTTTAAAAAACTGGTTGAGTATCCGTACTTCGTACCCGCATGTTGAGAGCGAGTGGGTATTTTTATCACGTAAGGGGAATCCGCTTTCTCGGCAACAGTTTTACCATATTATCTCGACTTCCGGTGGTAATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATgg > 2:282044/1‑240 (MQ=255) tttCAACAACGCACCCGCTATTGAATAAAGAAGTTCAGGCTTTAAAAAACTGGTTGAGTATCCGTACTTCGTACCCGCATGTTGAGAGCGAGTGGGTATTTTTATCACGTAAGGGGAATCCGCTTTCTCGGCAACAGTTTTACCATATTATCTCGACTTCCGGTGGTAATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATgg < 1:282044/240‑1 (MQ=255) tttCAACAACGCACCCGCTATTGAATAAAGAAGTTCAGGCTTTAAAAAACTGGTTGAGTATCCGTACTTCGTACCCGCATGTTGAGAGCGAGTGGGTATTTTTATCACGTAAGGGGAATCCGCTTTCTCGGCAACAGTTTTACCATATTATCTCGACTTCCGGTGGTAATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAAGAGATa < 2:351720/249‑1 (MQ=255) acaacGCACCCGCTATTGAATAAAGAAGTTCAGGCTTTAAAAAACTGGTTGAGTATCCGTACTTCGTACCCGCATGTTGAGAGCGAGTGGGTATTTTTATCACGTAAGGGGAATCCGCTTTCTCGGCAAc > 1:307560/1‑130 (MQ=255) acaacGCACCCGCTATTGAATAAAGAAGTTCAGGCTTTAAAAAACTGGTTGAGTATCCGTACTTCGTACCCGCATGTTGAGAGCGAGTGGGTATTTTTATCACGTAAGGGGAATCCGCTTTCTCGGCAACAGTTTTACCATATTATCTCGACTTCCGGTGGTAATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGACt < 1:218047/251‑1 (MQ=255) acaacGCACCCGCTAGTGAATAAAGAAGTTCAGGCTTTAAAAAACTGGTTGAGTATCCGTACTTCGTACCCGCATGTTGAGAGCGAGTGGGTATTTTTATCACGTAAGGGGAATCCGCTTTCTCGGCAAc < 2:307560/130‑1 (MQ=255) cacacGCTATTGAATAAAGAAGTTCAGGCTGTAAAAAACTGGTTGAGTATTCGTCTTTCGTTCCCGCATGTTGAGAGCGAGTGGGTATTTTTATCACGTAAGGGGAATCCGCTTTCTCGGCAACAGTTTTACCATATTATCTCGACTTCCTGTGGTAATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGTTTTGGCGAATAGGGGAATAGATACGCGAcgtagcca < 2:681837/247‑8 (MQ=255) tATTGAATAAAGAAGTCCAGGATTCAAAAAACTGGTTGAGCATCAGTAATTCGTACACGCATGCTGAGAGCGAGTGGGTATTTTTCTCCCGTAAGGGGACTCCGCTTTCTCGGCAACAGTTTTACCATATTATCTCGACTTCCGGTGGTAATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGACTTATCCAGGATTAt > 2:47083/1‑251 (MQ=255) aTTGAATAAAGAAGTTCAGGCTTTAAAAAACTGGTTGAGTATCCGTACTTCGTACCCGCATGTTGAGAGCGAGTGGGTATTTTTATCACGTAAGGGGAATCCGCTTTCTCGGCAACAGTTTTACCATATTATCTCGACTTCCGGTGGTAATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGACTTATCCAGGATTAt < 1:200833/250‑1 (MQ=255) tgaataccgaagTTCAGGCTTCAAAAAACTGGTTGAGAATCTGTACTTCGTACCCGCATGTTGTGAGCGAGTGGGTATTTTTATCACGTAAGGGGAATCCGCTTTCTCGGCAACAGTTTTACCATATTATCTCGACTTCCGGTGGTATTGCCGGGTTGACACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATTTGGGAATAGATACGCGACTTATCCAGGATTATCtt > 2:308704/9‑251 (MQ=255) tAAAGAAGTTCAGGCTTTAAAAAACTGGTTGAGTATCCGTACTTCGTACCCGCATGTTGAGAGCGAGTGGGTATTTTTATCACGTAAGGGGAATCCGCTTTCTCGGCAACAGTTTTACCATATTATCTCGACTTCCGGTGGTAATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGAGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGACTTATCCAGGATTATCTTGGGc > 1:504555/1‑251 (MQ=255) agTTCAGGCTTTAAAAAACTGGTTGAGTATCCGTACTTCGTACCCGCATGTTGAGAGCGAGTGGGTATTTTTATCACGTAAGGGGAATCCGCTTTCTCGGCAACAGTTTTACCATATTATCTCGACTTCCGGTGGTAATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGACTTATCCAGGATTATCTTGGGCATCGc > 1:349063/1‑250 (MQ=255) tCAGGCTTTAAAAAACTGGTTGAGTATCCGTACTTCGTACCCGCATGTTGAGAGCGAGTGGGTATTTTTATCACGTAAGGGGAATCCGCTTTCTCGGCAACAGTTTTACCATATTATCTCGACTTCCGGTGGTAATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGACTTATCCAGGATTATCTTGGGCATCGCAat < 1:20488/250‑1 (MQ=255) ggCTTTAAAAAACTGGTTGAGTATCCGTACTTCGTACCCGCATGTTGAGAGCGAGTGGGTATTTTTATCACGTAAGGGGAATCCGCTTTCTCGGCAACAGTTTTACCATATTATCTCGACTTCCGGTGGTAATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGACTTATCCAGGATTATCTTGGGCATCGCAATATTc < 1:591855/251‑1 (MQ=255) gCTTTAAAAAACTGGTTGAGTATTCGTACTTCGTACCCGCATGTTGAGAGCGAGTCTGTATTTTTATCATGTAAGAGGAATCCTCTTTCTCGGCAACAGTTTTTCCATATTATCTCGACTTCCGGTGGTAATGCCGGGGTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTTGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGACTTATCCAGGATTATCTTGGGCAtggttatattcg < 1:723202/251‑12 (MQ=255) ttAAAAAACTGGTTGAGTATCCGTACTTCGTACCCGCATGTTGAGAGCGAGTGGGTATTTTTATAACGTAAGGGGAATCCGCTTTCTCGGCAACAGTTTTACCATATTATCTCGACTTCCGGTGGTAATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGACTTATCCAGGATTATCTTGGGCATCGCAATATTCGTc > 2:700719/1‑250 (MQ=255) ttAAAAAACTGGTTGAGTATCCGTAATTCGTACCTGCATGTTGAGAGCGCGTGGGTATTTTTATCACGTAAGGGGAATCCGCTTTCTCGGCAACCGTTTTACCATATTCTCTCGCCTTCCGGTGGTAATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCAATTTGCGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGAATTATCCAGGATTATCTTGGGCATCGCAATATTCGTc > 2:703975/1‑250 (MQ=255) tAAAAAACTGGTTGAGTATCCGTACTTCGTACCCGCATGTTGAGAGCGAGTGGGTATTTTTATCACGTAAGGGGAATCCGCTTTCTCGGCAACAGTTTTACCATATTATCTCGACTTCCGGTGGTAATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGTAATAGATACGCTACTTATCCAGGATGATCTGTGTCATCGCAATATTCGTCa < 2:374295/250‑1 (MQ=255) tAAAAAACTGGTTGAGTATCCGTACTTCGTACCCGCATGTTGAGAGCGAGTGGGTATTTTTATCACGTAAGGGGAATCCGCTGTCTCGGCAACAGTTTTACCATATTAACTCGACTTCCGGTGGTAATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGACTTATCCAGGATTATCTTGGGCATCGCAATATTCGTCa < 2:626818/250‑1 (MQ=255) ggTTGAGTATCCGTACTTCGTACCCGCATGTTGAGAGCGAGTGGGTATTTTTATCACGTAAGGGGAATCCGCTTTCTCGGCAACAGTTTTACCATATTATCTCGACTGCCGGTGGTAATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGGTTTGCTTTGGCGAATAGTGGAATAGATACGCGACTTATCCAGGATTATCTTGGGCATCGCAATATTCGTCATACTGTCTgg < 2:34244/251‑1 (MQ=255) aCTTCGTACCCGCATGTTGAGAGCGAGTGGGTATTTTTATCACTTAAGGGTAATCCGCTTTCTCGGCAACAGTTTTACCATATTATCTCGACTTCCGGTGTTAATGCGGTGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTGCGCCTTTCGTGTGGTTTGGCTTTGGCGAATATGGGAATAGAGACGCGACTTATCCAGGATTATCTTGGGCATCGCAATATTCGTCATACTGTCTGGTATACCGCCAGCaa < 1:703975/251‑1 (MQ=255) tCGTACCCGCATGTTGAGAGCGAGTGGGTATTTTTATCACGTAAGGGGAATCCGCTTTCTCGGCAACAGTTTTACCATATTATCTCGACTTCCGGTGGTAATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGACTTATCCAGGATTATCTTGGGCATCGCAATATTCGTCATACTGTCTGGTATACCGCCAGCAAt < 1:177697/249‑1 (MQ=255) gTACCCGCATGTTGAGAGCGAGTGGGTATTTTTATCACGTAAGGGGAATCCGCTTTCTCGGCAACAGTTTTACCATATTATCTCGACTTCCGGTGGTAATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGACTTATCCAGGATTATCTTGGGCATCGCAATATTCGTCATACTGTCTGGTATACCGCCAGCAATGc > 2:224033/1‑249 (MQ=255) cGCATGTTGAGAGCGAGTGGGTATTGTTATCACGTTAGGGGAATCCGCTTTCTCGGCAACAGTTTTACCATATTATCTCGACTTCTGGTGGTAATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATAGGGGAATAGATACGCGACTTATCCAGGATTATCTTGGGCATCGCAATATTCGTTATACTGTCTGGTATACCGCCAGCAATGCAGGGCGt < 1:64158/251‑1 (MQ=255) | CAGCAAATACCGGGCCTCATGCAGCACGTAATTATTGTCTGACTTTGCTTTGTTTTATTCATGGTTTCCGGGCGAGTGAAATTTGTCGATTGAGGATTTCGGATATTGATCTTAAGGCAAAGTGTATATATATCCATCGATTAAAAAAAGGCTTTTCAACAACGCACCCGCTATTGAATAAAGAAGTTCAGGCTTTAAAAAACTGGTTGAGTATCCGTACTTCGTACCCGCATGCTGAGAGCGAGTGGGTATTTTTATCACGTAAGGGGAATCCGCTTTCTCGGCAACAGTTTTACCATATTATCTCGACTTCCGGTGGTAATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGACTTATCCAGGATTATCTTGGGCATCGCAATATTCGTCATACTGTCTGGTATACCGCCAGCAATGCAGGGCGT > NC_000913/4541027‑4541505 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |