Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_000913 | 4,517,355 | C→T | Q121Q (CAG→CAA) | fecR ← | ferric citrate regulator FecR |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 4,517,355 | 0 | C | T | 97.5% | 411.1 / NA | 119 | Q121Q (CAG→CAA) | fecR | ferric citrate regulator FecR |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (43/73); minor base G (0/3); total (43/76) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.52e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
TCCACAGCGTGCTGCTGCACGTCAAGCTGCGTGAAATTATCCTGCTGGCGGACGGTAAATTCTGTCCCTAAAGCAGTGAGCTGGCCCTGACGGGTCAGGACACGGAAGGGGCGTTGCAGGGCATCTTTCGCGGTAGTAATGGCGATTTCACCGTACCAGAGCCGGACGGTGCGCTGATGCGCATCAAAACGCACATCCGCCGCGCTTTGGGTATTCAGCGTGAGCAGGGAGCCATCTTCCAGTTGCTGACGGCTGACTGTGCCTTTGGCGGTGCGGTAATCTGCCCGCAGACCTTCGCCGGTTTCCGACTGCCAGAGCTGCCAGCCTCCGCCAGCGCCGAGCAACAGCAGTAATCCTTTCATCACGTGACGGCGGGTGAGGCGGGTATCGTGCAACGCCCGGCTGGC‑AACGTCGCCA‑GGCACACCGCCAAGCTGGTTGCGCAGGTTTTCAACCTGCTGCCAGGCCC‑ACTGGTTATCCTGATCCTG > NC_000913/4517110‑4517594 | tCCACAGCTTGCTGCTGCACGTCAATCTGCGTGAAATTATCCTGCTGGCGGACGGTAAATTCTGTCTCTAAAGCAGTGAGCTGGCCCTGACGGGTCAGGACACGGAAGGGGCGTTGCAGGGCATCTTTCGCGGTAGTAATGGCGATTTCACCGTACCAGAGCCGGACGGTGCGCTGATGCGCATCAAAACGCACATCCGCCGCGCTTTGGGTATTCAGCGTGAGCAGGGAGCCATCTTCCAGTTGTTGAc < 1:358532/250‑1 (MQ=255) tCCACAGCGTGCTGCTGCACGTCAAGCTGCGTGAAATTATCCTGCTGGCGGACGGTAAATTCTGTCCCTAAAGCAGTGAGCTGGCCCTGACGGGTCAGGACACGGAAGGGGCGTTGCAGGGCATCTTTCGCGGTAGTAATGGCGATTTCACCGTACCAGAGCCGGACGGTGCGCTGATGCGCATCAAAACGCACATCCGCCGCGCTTTGGGTATTCAGCGTGAGCAGGGAGCCATCTTCCAGTTGTTGAc < 1:383813/250‑1 (MQ=255) acaGCGTGCTGCTGCACGTCAAGCTGCGTGAAATTATCCTGCTGGCGGACGGTAAATTCTGTCCCTAAAGCAGTGAGCTGGCCCTGACGGGTCAGGACACGGAAGGGGCGTTGCAGGGCATCTTTCGCGGTAGTAATGGCGATTTCACCGTACCAGAGCCGGACGGTGCGCTGATGCGCATCAAAACGCACATCCGCCGCGCTTTGGGTATTCAGCGTGAGCAGGGAGCCATCTTCCAGTTGTTGACGGCt < 2:74506/251‑1 (MQ=255) gctgctgcACGTCAAGCTGCGTGAAATTATCCTGCTGGCGGACGGTAAATTCTGTCCCTAAAGCAGTGAGCTGGCCCTGACGGGTCAGGACACGGAAGGGGCGTTGCAGGGCATCTTTCGCGGTAGTAATGGCGATTTCACCGTACCAGAGCCGGACGGTGCGCTGATGCGCATCAAAACGCACATCCGCCGCGCTTTGGGTATTCAGCGTGAGCAGGGAGCCATCTTCCAGTTGTTGACGGCTGACtgtg < 1:640804/251‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |