Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_000913 | 4,414,625 | C→T | R117R (CGC→CGT) | aidB → | putative acyl‑CoA dehydrogenase AidB |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 4,414,625 | 0 | C | T | 99.1% | 348.0 / NA | 110 | R117R (CGC→CGT) | aidB | putative acyl‑CoA dehydrogenase AidB |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (51/57); minor base G (0/1); total (52/58) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.34e-01 |
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
GTGCTGGCTGGGATAGCGATTTTCTAGCCAGTATTGGTCAGCAGTTAGGAACGGCTGAATCCCTTGAACTGGGGCGGCTGGCGAATGTGAATCCGCCTGAATTATTGCGCTACGATGCGCAAGGACGCCGTCTGGACGATGTGCGTTTTCACCCCGCCTGGCACCTGCTGATGCAGGCGCTATGTACCAATCGGGTGCACAATCTTGCCTGGGAAGAAGACGCTCGCTCCGGCGCATTTGTGGCGCGCGCGGCGCGTTTTATGTTACATGCGCAGGTTGAGGCAGGGTCGTTATGTCCGATAACCATGACCTTTGCCGCCACGCCATTGTTGTTACAGATGTTACCCGCGCCGTTTCAGGACTGGACCACGCCGCTATTGAGCGATCGCTACGATTCTCACTTATTGCCAGGTGGGCAAAAACGCGGTTTGTTGATTGGCATGGGAATGACGGAAAAGCAGGGCGGTTCCGATGTTATGAGCAAC > NC_000913/4414378‑4414862 | gggctggctgGGATAGCTATTTTCTAGCCAGTATTGCTCAGCAGTTAGGAACGGCTGAATCCCGTGAACTGGGGCGGCTGGCGAATGTGAATCCGCCTGAATTATTGCGCTACGATGCGCAAGGACGCCGTCTGGACGATGTGCGTTTTCACCCCGCCTGGCACCTGCTGATGCAGGCGCTATGTACCAATCGGGTGCACAATCTTGCCTGGGAAGAAGACGCTCGCTCCGGCGCATTTGTTGcgcgtgcg < 1:5854/249‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |