| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,827,026 | C→T | A606V (GCG→GTG) | recG → | ATP‑dependent DNA helicase RecG |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,827,026 | 0 | C | T | 97.4% | 370.7 / NA | 114 | A606V (GCG→GTG) | recG | ATP‑dependent DNA helicase RecG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); major base T (51/59); minor base G (2/1); total (54/60) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.99e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
GGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCTACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCCGGAGCGTCTGGGTCTGGCGCAGTTACACCAGCTGCGCGGGCGCGTAGGTCGTGGCGCGGTGGCTTCTCACTGCGTGCTGCTCTACA‑AAACGCCGCTTTCTAAAACGGCGCAAATTCGCCTGCAAGTGCTGCGCGACAGTAACGACGGTTTTGTGATTGCGCAAAAAGATCTGGAGATTCGCGGCCCTGGCGAATTGTTAGGCACGCGTCAGACGGGTAATGCTGAATTTAAAGTGGCGGATTTACTGCGCGATCAGGCGATGATCCCGGAAGTTCAGCGCCTGGCACGCCATATTCACGAACGTTACCCACAACAGGCAAAAGCCCTGATAGAACGCTGGATGCCGG > NC_000913/3826782‑3827265 | gggCGGATGAAACCTGCCGAGAACCAGGAGGAGATGGCGCCGTTTAAACAAGGTGAGCTACACCTGCTGGTTACCACCGCCGCTATTGCAGACGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGCTTATCGAAAAACCGGAGCGTATGGGTCTGGCGCAGTTACACCAGCTGCGCGGGCGCGGAGGGCGTGGCGCGGGGGGATCTTACTGCGTGCTGGTCTCAA‑AAACGCCGCTTTCTACAACGGTGCaaa > 2:467496/1‑250 (MQ=255)gggCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCTACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCCGGAGCGTCTGGGTCTGGCGCAGTTACACCAGCTGCGCGGGCGCGTAGGTCGTGGCGCGGTGGCTTCTCACTGCGTGCTGCTCTACA‑AAACGCCGCTTTCTAAAACGGTGCAAAt < 1:731102/251‑1 (MQ=255) cGGAGGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCTACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCCGGAGCGTCTGGGTCTGGCGCAGTTACACCAGCTGCGCGGGCGCGTAGGTCGTGGCGCGGTGGCGTCTCACTGCGTGCTGCTCTACA‑AAACGCCGCTTTCTTAAACGGTGCAAATTCg < 2:357382/251‑1 (MQ=255) ggATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCTACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCCGGAGCGTCTGGGTCTGGCGCAGTTACACCAGCTGCGCGGGCGCGTAGGTCGTGGCGCGGTGGCTTCTCACTGCGTGCTGCTCTACA‑AAACGCCGCTTTCTAAAACGGTGCAAATTCGc < 2:561729/251‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |