| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 469,271 | G→A | G134E (GGG→GAG) | mdlA → | ABC transporter family protein MdlA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 469,271 | 0 | G | A | 97.8% | 278.0 / NA | 91 | G134E (GGG→GAG) | mdlA | ABC transporter family protein MdlA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/1); new base A (39/48); total (42/49) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CCGGGCAGATCCTGATGTGGATCGCCACCATGGTGCTGATTGCCGTTGTGGTTTATCTCCTGCGTTACGTCTGGCGGGTATTGCTGTTTGGTGCGTCTTATCAACTGGCTGTTGAACTGCGTGAAGATTATTACCGTCAGCTAAGCCGGCAGCATCCTGAGTTTTACCTGCGTCATCGCACCGGTGACCTCATGGCTCGTGCGACCAATGACGTCGATCGCGTCGTGTTTGCCGCCGGAGAAGGGGTGCTGACGCTGGTGGATTCACTGGTGATGGGCTGCGCTGTGTTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAGCCTCACCAGTATCCGCATGATCAAAGCCTTTGGT > NC_000913/469028‑469512 | ccGGGCAGATCCTGATGTGGATCGCCACCATGGTGCTGATTGCCGTTGTGGTTTAGCTCCTGCGTTACGTCTGGCGGGTATTGCTGTTTGGTGCGTCTTATCAACTGGCTGTTGAACTGCGTGAAGATTATTACCGTCAGCTAAGCCGGCAGCATCCTGAGTTTTACCTGCGTCATCGCGCCGGTGACCTCATGGCTCGTGCGACCAATGACGTCGATCGCGTCGTGTTTGCCGCCGGAGAAGAGGTGCt < 1:480897/250‑1 (MQ=255) cAGATCCTGATGTGGATCGCCTACATGGTGCTGATTGCCGTTGTGGTTTATCTCCTGCGTTACGTCGGGCGGGTATTGCTGTTTGGTGCGTCTTATCAACTGGCTGTTGAACTGCGTGAAGATTATTACCGTCAGCTAAGCCGGCAGCATCCTGAGGTTTACCTGCGTCATCGCACCGGTGACCTCATTGCTCGTGCGACCAATGACGTCGATCGCGTCGTGTTTGCCGCCGGAGAAGAGGTGCTGACGCt < 2:628284/251‑1 (MQ=255) cAGATCCTGATGTGGATCGCCACCATGGTGCTGATTGCCGTTGTGGTTTATCTCCTGCGTTACGTCTGGCGGGTATTGCTGTTTGGTGCGTCTTATCAACTGGCTGTTGAACTGCGTGAAGATTATTACCGTCAGCTAAGCCGGCAGCATCCTGCGTTTTACCTGCGTCATCGCACCGGTGACCTCATGGCTCGTGCGCCCAATGACGTCGATCGCGTCGTGTTTTCCGCCGGGGAAGGGGTGCTGACGCt > 2:679913/1‑251 (MQ=255) aGATCCTTATGTGGAGCGCGCCCATGGAGCTGTTTGCCGGTGTGGTTTATCTCCTGCGTTACGTCTGGCGGGTATTGCTGTGTGGTGCGTCTTATCAACTGGCTGTTGAACTGCGTGAAGATTATTACCGACAGCTAAGCCGGCAGCATCCTGAGTTGTACCTGCGTCATCGCTGCGGTGACCTCATGGGGCGTTCGGCGAATGACGTCTATCGCGTCGTGTTGGGCTCCGGAGAAGATGTGCTGACGCtt < 2:377199/251‑2 (MQ=255) aGATCCTGATGTGGATCGCCACCATGGTGCTGATTGCCGTTGTGGTTTATCTCCTGCGTTACGTCTGGCGGGTATTGCTGTTTGGTGCGTCTTATCAACTGGCTGTTGAACTGCGTGAAGATTATTACCGTCAGCTAAGCCGGCAGCATCCTGAGTTTTACCTGCGTCATCGCACCGGTGACCTCATGGCTCGTGCGACCAATGACGTCGATCGCGTCGTGTTTGCCGCCGGAGAAGAGGTGCTGACGCtg < 1:569568/251‑1 (MQ=255) aTCCTGATGTGGATCGCCTCCATGGTGCTGATTGCCGTTGTGGTTTATCGCCTGCGTTACGTCTGGCGGGTATTGCTGTTTGGTTCGTCTTATCAACTGGCTGTTGAACTGCGGGAAGATTATTACCGTCAGCTAAGCCGTCAGCATCCTGAGTTTTACCTGCGTCATCGCATCGGGGACCTCATGGCTCGTGCGACCAATGACGTCGAGCGCGTCGTGTTTGCCGCCGGAGAAGAGGTGCTGACGAtggt < 1:676973/251‑1 (MQ=255) aTCCTGATGTGGATCGCCACCATGGTGCTGATTGCCGTTGTGGTTTATCTCCTGCGTTACGTCTGGCGGGTATTGCTGTTTGGTGCGTCTTATCAACTGGCTGTTGAACTGCGTGAAGATTATTACCGTCAGCTAAGCCGGCAGCATCCTGAGTTTTACCTGCGTCATCGCACCGGTGACCTCATGGCTCGTGCGACCAATGACGTCGATCGCGTCGTGTTTGCCGCCGGAGAAGAGGTGCTGACGCtggt < 2:648109/251‑1 (MQ=255) cGCCACCATGGTGCTGATTGACGTTGTGGTTTATCTCCTGCGTTACGTCTGGCGGGTATTGCTGTTTGGTGCGTCTTATCAACTGGCTGTTGAACTGCGTGAAGATTATTACCGTCAGCTAAGCCGGCAGCATCCTGAGTTTTACCTGCGTCATCGCACCGGTGACCTCATGGCTCGTGCGACCAATGACGTCGATCGCGTCGTGTTTGCCGCCGGAGAAGAGGTGCTGACGCTGGTGGATTCACTGGTGa < 1:386022/251‑1 (MQ=255) gCCACCATGGTGCTGATTGCCGTTGTGGTTTATCTCCTGCGTTACGTCTGGCGGGTATTGCTGTTTGGTGCGTCTTATCAACTGGCTGTTGAACTGCGTGAAGATTATTACCGTCAGCTAAGCCGGCAGCATCCTGAGTTTTACCTGCGTCATCGCACCGGTGACCTCATGGCTCGTGCGACCAATGACGTCGGTCGCGTCGTGTTTGCCGCCGGAGGAGAGGTTCTGCCGCTGGTGGATTCCCTGGTGAt > 1:288950/1‑251 (MQ=255) caccaTGGTGCTGATTGCCGTTGTGGTTTATCTCCTGCGTTACGTCTGGCGGGTATTGCTGTTTGGTGCGTCTTATCAACTGGCTGTTGAACTGCGTGAAGATTATTACCGTCAGCTAAGCCGGCAGCATCCTGAGTTTTACCTGCGTCATCGCACCGGTGACCTCATGGCTCGTGCGACCAATGACGTCGATCGCGTCGTGTTTGCCGCCGGAGAAGAGGTGCTGACGCTGGTGGATTCACTGGTGATgg < 1:127579/251‑1 (MQ=255) 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ccttcggtACGTCTGGCGGGTATTGCTGTTTGGTGCGTCTTATCAACTGGCTGTTGAACTGCGTGAATATTATTACCGTCAGCTAAGCCGGCAGCATCCTGAGTTTTACCTGCGTCATCGCACCGGTGACCTCATGGCTCGTGCGACCAATGACGTCGATCGCGTCGTGTTTGCCGCCGGAGAAGAGGTGCTGACGCTGGTTGATTCACTGGTGATGTGCTGCGCTGTGTTGATTATGATGTCTTCGCa < 2:731571/242‑1 (MQ=255) ccTGCGTTACGTCTGGCGGGTATTGCTGTTTGGTGCGTCTTATCAACTGGCTGTTGAACTGCGTGAAGATTATTACCGTCAGCTAAGCCGGCAGCATCCTGAGTTTTACCTGCGTCATCGCACCGGTGACCTCATGGCTCGTGCGACCAATGGCGTCGATCGCGTCGTGTTTGCCGCCGGAGAAGAGGTGCTGACGCTTGTGGATTCACTGGTGATGGGCTGCGCTGTGTTGATTATGATGTCTACGCaa < 1:377262/250‑1 (MQ=255) cGTCTGGCGGGTATTGCTGTTTGGTGCGTCTTATCAACTGGCTGTTGAACTGCGTGAAGATTATTACCGTCAGCTAAGCCGGCAGCATCCTGAGTTTTACCTGCGTCATCGCACCGGTGACCTCATGGCTCGTGCGACCAATGACGTCGGTCGCGTCGTGTTTGCCGCCGGAGAAGAGGTGCTGACGCTGGGGGATTCACTGGAGGTGGGCTGCGCTGTGTTGATTATGATGTTTACGCAAATTAGCTGGc > 2:100064/1‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |