| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC | NC_000913 | 1,679,563 | (TATCACGTTTTAATCACTGGATATCGATGGAAA)1→2 | coding (7/1383 nt) | ydgI → | putative arginine:ornithine antiporter |
| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | = 1679563 | 10 (0.140) | coding (7/1383 nt) | ydgI | putative arginine:ornithine antiporter | |||||
AGTGGCAGGAACGTGGTAATAACCTGACCGTCAGCGCAGATCTGTATAAATAACTATTCAGTTACTCCTATAAGGCGGCTTGATGCCGCCTTTCGCATTTTTAGTCACAAATTTCCCCGCGACCATTGCATGCAGACACATCTCTTCGTAAAATCCCGCGCTTCAGTGGCAAACTCCATTTTTATGCGTTTTGCCCTAATATTTATTCTTCTTATCACGTTTTAATCACTGGATATCGATGGAAAAGAAACTGGGACTGAGCGCACTCACCGCGCTGGTATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGGCGCTGGCATTTTATTGCTGGCCTTTGCCATGCTGATCCTCACGCGCATTCGTCCCGAACTTGACGGCGGTATCTTTACCTATGCCCGCGAAGGGTTTGGCGAGCTAATCGGCTTTT > NC_000913/1679319‑1679812 | aGTGGCAGGAACGTGGTAATAACCTGACCGTCAGCCCAGATCTGTCTAAATAACTATTCAGATACCCCTCTAAAGCGGCTTGATGCCGCCTTTCGCATTTTTAGTCACAAATTTCCCCGCGCCCAATGCATGCCGCCACATCTCTTCCTAAAATCCCGCCCTTCAGGGGCCAACCACCTTTTTTTGCTTTTTGCCCTAATATTTATTCTTCTTATCCCGTTTTAATCACCGGATATCGGTGGaaatatacc > 2:311307/1‑245 (MQ=255) 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2:704001/251‑1 (MQ=255) tatCGATGGAAAAGAAACTGGGACTGAGCGCACTCACCGCGCTGGTATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGGCGCTGGCATTTTATTGCTGGCCTTTGCCATGCTGATCCTCACGCGCATTCGTCCCGAACTTGACGGCGGTATCTTTACCTATGCCCGCGAAGGGTTTGGCGAGCt > 1:502446/1‑250 (MQ=255) atCGATGGAAAtatcacgttttaatcactggatatcgatggacaagaaactgggactgagcgcactcaccgcgctggtattaagctcactgctgggcgcgggtgttttcagtctgccgcaaaatatggcggcagttgccagcccggcagcactgctcatcggctgggggattactggcgctggcattttattgctggcctttgccatgctgatcctcacgcgcattcgtcccgaacttgacggcggtatct < 1:281779‑M2/251‑241 (MQ=255) tGGAAAtatcacgttttaatcactggatatcgatggaaaagaaactgggactgagcgcactcaccgcgctggtattaagctcaatgctgggcgcgggtgttttcagtctgccgcaaaatatggcggcagttgccagcccggcagcactgctcatcggctggggtattactggcgctggcattttattgctggcctttgccatgctgatcctcacgcgcattcgtcccgaacttgacggcgggatctttacc < 1:189369‑M2/251‑246 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |