| Predicted mutation | ||||||
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| JC JC | NC_000913 | 4,640,418 | IS30 (+) +2 bp | coding (17‑18/141 nt) | yjjY → | uncharacterized protein YjjY |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 4508679 | NA (NA) | 42 (0.580) | 38/488 | 0.7 | 100% | noncoding (1/1221 nt) | IS30 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 4640419 | 0 (0.000) | coding (18/141 nt) | yjjY | uncharacterized protein YjjY | |||||
GACAGTGTCAGGTGAGCTACAGCCCGCTTACGCTCATGGGGTTTTATGCCGCCAGTATCCCTTAACATAGTGAAGATCGTTCCGGGTTTTGAACCCAGGATATTCGCTATTTCACTGAAGCCTGTTCCGTTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAGTTGCTTTTTTTAATATATCTCGCTCAAGGCGAGCTTCATTTAACGCCTTACGCAGTTGCAGAATTTCAGATTCCAGTTCAGCCACCGTGCGGGAACCAGGAGTACCGAGCCCTTTTCTGGCGGCGGTAACCCATTGTCCTAAAGTGCCTTCAGGAAGAGATAATCGGGAAGCGCCTTCACTGATCGAAAGTTGATTTTCAAGAACCGTTCTGACAGCTTCGGCTTTGAACTTTTTAGAGTAACGT > NC_000913/4508433‑4508925 | gACAGTGTCAGGTGAGCTACAGCCCGCTTACGCTCATGGGGTTTTATGCCGCCAGTATCCCTTAACATAGTGAAGATCGTTCCGGGTTTTGAACCCAGGATATTCGCTATTTCACTGAAGCCTGTTCCGTTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAGTTg > 2:592323/1‑251 (MQ=11) 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tCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAGTTGCTTTTTTTAATATATCTCGCTCAAGGCGAGCTTCATTTAACGCCTTACGCAGTTGCAGAATTTCAGATTCCAGTTCAGCCACCGTGCGGGAACCAGGAGTACCGAGCCCTTTTCTGGCGGCGGTAACCCATTGTCCTAAAGTGCCTTCAGGAAGAGATAATCGGGAAGCGCCTTCACTGATCGAAAGTTGATTTTCAAGAACCGTTCTGAc > 2:210322/1‑250 (MQ=255) aaCTGGTGCGTTGACCAATTGAAGCTACAGTTGCTTTTTTTAATATATCTCGCTCAAGGAGAGCTTCATTTAACGCCTTACGCAGTTGCAGAATTTCAGATTCCAGTTCAGCCACCGTGCGGGAACCAGGAGTACCGAGCCCTTTTCTGGCGGCGGTAACCCATTGTCCTAAAGTGCCTTCAGGAAGAGATAATCGGGAAGCGCCTTCACTGATCGAAAGTTGATTTTCAAGAACCGTTCTGACAGCTTCg < 2:325000/251‑1 (MQ=255) ggTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAGTTGCTTTTTTTAATATATCGCGCTCAATGCGATCTTCATTTAACGCCTTACGCAGTTGCAGAATTTCAGATTCCAGTTCAGCCACCGTGCGGGAACCAGGAGTACCGAGCCCTTTTCTGGCGGCGGTAACCCATTGTCCTAAAGTGCCTTCAGGAAGAGATAATCGGGAAGCGCCTTCACTGATCGAAAGTTGATTTTCAAGAACCGTTCTGACAGCTTCGGCt < 2:294321/250‑1 (MQ=255) gTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAGTTGCTTTTTTTAATATATCTCGCTCAAGGCGAGCTTCATTTAACGCCTTACGCAGTTGCAGAATTTCAGATTCCAGTTCAGCCACCGTGCGGGAACCAGGAGTACCGAGCCCTTTTCTGGCGGCGGTAACCCATTGTCCTAAAGTGCCTTCAGGAAGAGATAATCGGGAAGCGCCTTCACTGATCGAAAGTTGATTTTCAAGAACCGTTCTGACAGCTTCGGCtt < 1:640359/251‑1 (MQ=255) aCCAATTGAATCTACAGTTGCTTTTTTTAATATATCTCGCTCAAGGCGAGCTTCATTTAACGCCTTACGCAGTTGCAGAATTTCAGATTCCAGTTCAGCCACCGTGCGGGAACCAGGAGTACCGAGCCCTTTTCTGGCGGCGGTAACCCATTGTCCTAAAGTGCCTTCAGGAAGAGATAAt < 1:583440/181‑1 (MQ=255) aCCAATTGAATCTACAGTTGCTTTTTTTAATATATCTCGCTCAAGGCGAGCTTCATTTAACGCCTTACGCAGTTGCAGAATTTCAGATTCCAGTTCAGCCACCGTGCGGGAACCAGGAGTACCGAGCCCTTTTCTGGCGGCGGTAACCCATTGTCCTAAAGTGCCTTCAGGAAGAGATAAt > 2:583440/1‑181 (MQ=255) aCCAATTGAATCTACAGTTGCTTTTTTTAATATATCTCGCTCAAGGCGAGCTTCATTTAACGCCTTACGCAGTTGCAGAATTTCAGATTCCAGTTCAGCCACCGTGCGGGAACCAGGAGTACCGAGCCCTTTTCTGGCGGCGGTAACCCATTGTCCTAAAGTGCCTTCAGGAAGAGATAATCGGGAAGCGCCTTCACTGATCTAAAGTTGATTTTCAAGAACCGTTCTGACAGCTTCGGCTTTGAACtttt < 1:442763/251‑1 (MQ=255) aaTTGAATCTACAGTTGCTTTTTTTAATATATCTCGCTCAAGGCGAGCTTCATTTAACGCCTTACGCAGTTGCAGAATTTCAGATTCCAGTTCAGCCACCGTGCGGGAACCAGGAGTACCGAGCCCTTTTCTGGCGGCGGTAACCCATTGTCCTAAAGTGCCTTCAGGAAGAGATAATCGGGAAGCGCCTTCACTGATCGAAAGTTGATTTTCAAGAACCGTTCTGACAGCTTCGGCTTTGAACTTTTTag < 2:183589/251‑1 (MQ=255) aCAGTTGCTTTTTTTAATATATCTCGCTCAAGGCGAGCGTCATTTAACGCCTTACGCAGTTGCAGAATTTCAGATCCCAGTTCAGCCACCGTGCGGGAACCAGGAGTACCGAGCCCTTTTCTGGCGGCGGTAACCCATTGTCCTAAAGTGCCTTCAGGAAGAGATAATCGGGAAGCGCCTTCACTGATCGAAAGTTGATTTTCAAGAACCGTTCTGACAGCTTCGGCTTTGAACTTTTTAGAGTAACGt < 1:565852/249‑1 (MQ=255) | GACAGTGTCAGGTGAGCTACAGCCCGCTTACGCTCATGGGGTTTTATGCCGCCAGTATCCCTTAACATAGTGAAGATCGTTCCGGGTTTTGAACCCAGGATATTCGCTATTTCACTGAAGCCTGTTCCGTTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAGTTGCTTTTTTTAATATATCTCGCTCAAGGCGAGCTTCATTTAACGCCTTACGCAGTTGCAGAATTTCAGATTCCAGTTCAGCCACCGTGCGGGAACCAGGAGTACCGAGCCCTTTTCTGGCGGCGGTAACCCATTGTCCTAAAGTGCCTTCAGGAAGAGATAATCGGGAAGCGCCTTCACTGATCGAAAGTTGATTTTCAAGAACCGTTCTGACAGCTTCGGCTTTGAACTTTTTAGAGTAACGT > NC_000913/4508433‑4508925 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |