| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 249545 | 120 (1.660) | 88 (1.250) | 80/478 | 0.1 | 45.5% | intergenic (+1411/‑1353) | rayT/dinB | REP‑associated tyrosine transposase/DNA polymerase IV |
| ? | NC_000913 | 373870 = | 94 (1.340) | coding (950/951 nt) coding (3/1014 nt) |
mhpF mhpE |
acetaldehyde dehydrogenase (acetylating) MhpF 4‑hydroxy‑2‑oxovalerate aldolase |
|||||
Only 100 of 208 total aligned reads displayed.
TCCGCTGGGTGAGCGGGT‑TACCCTGTGCTTTGTCCACCAGCGCCACCAGTTTGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATTCCCGGTACCACCGCCAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTACGCACGTCATGGGCGATATCGCCGTTGTCGCTGACGCGGGTGACGATAATCGCCGCCGCGGTGGAGAGCAGCAGGGAAGGGATCTGCGCCACCAGGCCGTCGCCGATGGTCATCAGCACATACTGCTGGAAGGCAGCATCGGCGCTCAGGTTGTATTTGAAGATCCCGATACA > NC_000913/249296‑249794 | cccGCTGGGTGAGCGGGT‑TACCCTGTGCTTTGTCCACCAGCGCCACCAGTTTGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTTCTCGCGGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCAtt < 2:344596/250‑1 (MQ=255) cGCTGGGTGGGCGGGT‑TACCCTGTGCTTTGCCCACCAGCGCCACCAGTTTGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATTcc < 2:386492/251‑1 (MQ=255) gcggggtgaGCGGGTGTA‑CCTGTGCTTTGTCCACCAGCGCCACCAGTTTGTACCCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCGGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATgaac < 2:291904‑M1/248‑5 (MQ=255) cTGGGTGAGCGGGT‑TACCCTGTGCTTTGTCCACCAGCGCCACCAGTTTGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGACGCTGAACCGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATgaacg > 1:547239‑M1/1‑246 (MQ=255) gggTGAGCGGTT‑TACCCTGTGCTTTGTCCCCCAGCGCCACCAGTTTGTACACGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATgaacggt < 2:602310‑M1/251‑8 (MQ=255) gggTGAGCGGGT‑TACCCTGTGCTTTGTCCACCAGCGCCACCAGTTTGTAACCGAGTCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTTCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATTCCCg < 1:417407/249‑1 (MQ=255) gggTGAGCGGGT‑TACCCTGTGCTTTGTCCACCAGCGCCACCAGTTTGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGATGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATgaacggt < 1:207356‑M1/251‑8 (MQ=255) ggggAGCGGGT‑TACCCTGTGCTTTGTCCACCAGCGCCACCAGTTTGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCGCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATTCCCGGTa < 1:121717/248‑1 (MQ=255) gTGAGCGGGT‑TACCCTGTGCTTTGTCCACCAGCGCCACCAGTTTGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGCTCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGCCCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGCGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCCGGGGAGGCCTTCCCgggac > 2:147019/1‑248 (MQ=255) gAGCGGGT‑TACCCTGTGCTTTGTCCACCAGCGCCACCAGTTTGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATgaaccggaaa > 2:252095‑M1/1‑240 (MQ=255) gtgCTTTGTCCACCAGCGCCACCAGTTTGTAACCGAGGCTTAACCTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGCCCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATTCCCGGTACCACCGCCAGCACGaa < 1:537661/250‑1 (MQ=255) cTTTGTCCACCAGCGCCACCAGTTTGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATgaacgggaaaaaaatttatatctcggac > 1:178354‑M1/1‑223 (MQ=255) tttGTCCACCAGCGCCACCAGTTTGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGAGCGGCATgaacggtaaaaaactttttatatcggacg > 1:96129‑M1/1‑222 (MQ=255) cccccagcgCCCCCAGTTTTTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATgaacggtaaaaaactttatatctcggacgtcac < 1:269757‑M1/247‑34 (MQ=255) caGCGCCACCAGTTTGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATTCCCGGTACCACCGCCAGCACGAACATAATCCCGGTgg > 1:642666/1‑251 (MQ=255) aGCGCCACCAGTTTGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGTAATGGTTTCCCAACTGCCCTGCTGCCCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTCCCGCCGCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATTCCCGGTACCACCGCCAGCACGAACATAATCCCGGTGGc < 1:54151/251‑1 (MQ=255) aGCGCCACCAGTTTGTAACCGAGGCTAAAACTGATAGGCTCGAGCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGCCCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGGGTTTCGAGGCTTTCCTCCTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCCCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATTCCCGGTACCACCGCCAGCACGAACATAATCCCGGTGGc < 2:461697/251‑1 (MQ=255) ccaccaGTGTGTAACCGAGTCTTAAACTGATAGGCTCGACCAGCGAAATGGTTTCCCAACTTACCTGCTGCTCGCTGTTTTCGGTGATGGTGCGGTTCAGCGTTTCGGGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCCCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGTTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCTGCATgaacggtaaaaaacttgatatctcgtacgtcacattgcgtgac < 2:114877‑M1/251‑44 (MQ=255) caccaGTTTGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATgaacggtaaaaaactttatatctcggacgtcacattgcgtgacg < 1:249134‑M1/251‑45 (MQ=255) caccaGTTGGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTGGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATgaacggtaaaaaactttatatctcggacgtcacattgcgtgacg < 1:157069‑M1/251‑45 (MQ=255) attttgtAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCTATCAGCGGAAGGGTTTCCCAACTGACCTTCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATtgaccgtaaaaaactttatatctcggacgtcacattgcgtgacggtat < 1:470783‑M1/249‑49 (MQ=255) aGTTTGTAACCGAGGCTAAAACGGAGAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCACCTGCCCTGCTGCTCCCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCTTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCCCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGGGCGGCATTCCCGGTACCACCGCCAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTagag < 2:305087/251‑1 (MQ=255) gTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATgaacggtaaaaaactttatatctcggacgtcacattgcgtgacggtatgcacg < 1:158694‑M1/251‑54 (MQ=255) gTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATTCCCGGTACCACCGCCAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCAccc > 1:658797/1‑250 (MQ=255) aaCCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTCCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATTCCCGGTACCACCGCCAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGAc < 1:227038/251‑1 (MQ=255) 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aTAGGCTCGATCAGCGGGATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCCGCCGGTAAAACCAAGCCGGGCGCTGGACAGCAAAAACGGCCGGGGCGGGCTTCCCGGTACCACCGCCAGCACGAACATAAGTCCGGGGGCGGGGGAGAGAACCGACGGGCtttccccgagccg > 2:195998/1‑240 (MQ=255) aTAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCCGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGGGCGGCATTCCCGGTACCACCGCCAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGGGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTg > 1:76220/1‑251 (MQ=255) aTCAGCGGAATGGTTTCCCAACGGACCTGCTTCTCGCTGGTTTCGGGGATGTGGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCCCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCATGTGCGGCATgaacggtaaaaaactttatatcgcggacgtcacattgcgtggcggtatgcacgccattcggcatcagtattcgctggaaaa < 2:289406‑M1/251‑82 (MQ=255) gAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATgaacggtaaaaaactttatatctcggacgtcacattgcgtgacggtatgcacgccattcgtcatcagtattcgctggaaaacgttcgc > 1:196314‑M1/1‑163 (MQ=255) aTGGTATCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATTCCCGGTACCACCGCCAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTACGCACGTCCTGGGc > 2:729421/1‑251 (MQ=255) ggTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATgaacggtaaaaaactttatatctcggacgtcacattgcgtgacggtatgcacgccattcgttctcagtattcgctggaaaacgttcgccagg > 1:345453‑M1/1‑159 (MQ=255) 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TCCGCTGGGTGAGCGGGT‑TACCCTGTGCTTTGTCCACCAGCGCCACCAGTTTGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATTCCCGGTACCACCGCCAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTACGCACGTCATGGGCGATATCGCCGTTGTCGCTGACGCGGGTGACGATAATCGCCGCCGCGGTGGAGAGCAGCAGGGAAGGGATCTGCGCCACCAGGCCGTCGCCGATGGTCATCAGCACATACTGCTGGAAGGCAGCATCGGCGCTCAGGTTGTATTTGAAGATCCCGATACA > NC_000913/249296‑249794 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |