| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC JC | NC_000913 | 16,974 | IS150 (–) +3 bp | noncoding (23‑25/59 nt) | sokC → | small regulatory RNA antitoxin SokC |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 16974 = | 1 (0.010) | 28 (0.390) | 26/492 | 1.2 | 96.5% | noncoding (23/59 nt) | sokC | small regulatory RNA antitoxin SokC |
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| * | ? | NC_000913 | = 16976 | 0 (0.000) | 55 (0.770) | 51/486 | 0.4 | 100% | noncoding (25/59 nt) | sokC | small regulatory RNA antitoxin SokC |
| ? | NC_000913 | = 3722075 | NA (NA) | noncoding (1443/1443 nt) | IS150 | repeat region | |||||
TATGGGATCACTCCCCGCCGTTGCTCTTACTCGGATTCGTAAGCCGTGAAAACAGCAACCTCCGTCTGGCC‑AGTTCGGATGTGAACCTCAC‑AGAGGTCTTTTCTCGTTACCAGCGCCGCCACTACGGCGGTGATACAGATGACGATCAGGGCGACAATCATCGCCTTATGCTGCTTCATTGCTCTCTTCTCCTTGACCTTACGGTCAGTAAGAGGCACTCTACATGTGTTCAGCATATAGGAGGCCTCGGGTTGATGGTAAAATATCACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATGCCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTCATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGGCCT > NC_000913/16725‑17222 | gttggaatccccccccGCCTTTGCTCTTACTCGGATCCGTAAGCCGTGAAAACAGCAACCTCCGTCTGTCC‑AGTTCGGATTTGAACCTCAC‑AGAGGTCTTTTCTCGTTACCAGCGCCGCCACTACGGCGGTGATACAGATGACGATCAGGGCGACAATCATCGCCTTATGCTGCGTCAGTGCTCTCTTCTCCTTGACCTTACGGTCAGTAAGAGGCACTCTACATGTGTTCAGCATATAGGAGGCCTCgg < 1:680092/238‑1 (MQ=255) tGGGATCACTCCCCGCCGTTGCTCTTACTCGGATTCGTAAGCCGTGAAAACAGCAACCTCCGTCTGGCC‑AGTTCGGATGTGAACCTCAC‑AGAGGTCTTTTCTCGTTACCAGCGCCGCCACTACGGCGGTGATACAGATGACGATCAGGGCGACAATCAACGCCTTATGCTGCTTCATTGCTCTCTTCTCCTTGACCTTACGGTCCGTAAGAGGCCCTCTTCATTGGTTCAGCATATAGGAGGCCTCGGGtt > 2:377526/1‑251 (MQ=255) ggtcccccccccgccgttgcTCTTACTCGGATTCGTAAGCCGTGAAAACAGCAACCTCCGTCTGGCC‑AGTTCGGATGTGAACCTCAC‑AGAGGTCTTTTCTCGTTACCAGCGCCGCCACTACGGCGGTGATACAGATGACGATCAGGGCGACAATCATCGCCTTATGCTGCTTCATTGCTCTCTTCTCCTTGACCTTACGGTCAGTAAGAGGCACTCTACATGTGTTCAGCATATAGGAGGCCTCGGGTtgt < 1:152825‑M1/243‑4 (MQ=255) ccctcCCCGCCGTTGCTCTTACTCGGTTTCTTAACCCGTAAAAACAGCACCCTCCGCCTGGCT‑GGTGGGAATGTGAACCGCAC‑AGGGGTCTTTTCTCGTACCCAGCGCCGCCACTACGGCGGTGATACAGATGACGATCAGGGCGACAATCATCGCCTTATGCTGCTTCATTGCTCTCTTCTCCTTGACCTTACGGTCAGTAAGAGGCACTCTACATGTGTTCAGCATATAGGAGGCCTCGGGTtgtactg < 2:178715‑M1/249‑8 (MQ=255) ccccGCCGTTGCTCTTACTCGGATTCGTAAGCCGTGAAAACAGCAACCTCCGTCTGGCC‑AGTTCGGATGTGAACCTCAC‑AGAGGTCTTTTCTCGTTACCCGCGCCGCCACTACGGCGGCGATACAGATTACGATCAGGGCGACAATCATCGACTTATGCTGCTTCATTGCTCTCTTCTTCTTGACCTTACGGTCCATAAGAGGCACTCTACATGTGTTCAGCATATAGGAGGCCTCCGGTtttactgaccc > 1:316984‑M1/1‑240 (MQ=255) cccGCCGTTGCTCTTACGCGGATGCGGAAGCCGTGAAAACCGCAACTGTCGTTGGGCC‑AGTTGGGATGTGAACCTAAC‑AGAGGTCTTTTCTCTTGACCAGCGCCGCCACTACGGCGGTGATACAGATGACGATCAGGGCTACAATCATCGCCTTATGCTGCTTCATTGCTCTCGTCCCCTTGACCTTACGGTCAGTAAGAGGCACTCTACATGTGTTCAGCATATAGGAGGCCTCGGGTtgtactgacccc < 1:325907‑M1/251‑13 (MQ=255) ccgccgTTGCTCTTACTCGGATTCGTAAGCCGTGAAAACAGCAACCTCCGTCTGGCC‑AGTTCGGATGTGAACCTCAC‑AGAGGTCTTTTCTCGTTACCAGCGCCGCCACTACGGCGGTGATACAGATGACGATCAGGGCGACAATCATCGCCTTATGCTGCTTCATTGCTCTCTTCTCCTTGACCTTACGGTCAGTAAGAGGCACTCTACATGTGTTCAGCATATAGGAGGCCTCGGGTtgtactgaccccc > 1:43113‑M1/1‑238 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |