Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC JC | NC_000913 | 3,707,842 | IS30 (–) +2 bp | intergenic (‑137/+773) | dppA ← / ← proK | dipeptide ABC transporter periplasmic binding protein/tRNA‑Pro |
New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 1469296 = | NA (NA) | 44 (0.610) | 41/486 | 0.6 | 100% | noncoding (1/1221 nt) | IS30 | repeat region |
? | NC_000913 | 3707842 = | 0 (0.000) | intergenic (‑137/+774) | dppA/proK | dipeptide ABC transporter periplasmic binding protein/tRNA‑Pro | |||||
* | ? | NC_000913 | = 3707843 | 1 (0.010) | 71 (0.980) | 63/492 | 0.2 | 98.6% | intergenic (‑138/+773) | dppA/proK | dipeptide ABC transporter periplasmic binding protein/tRNA‑Pro |
? | NC_000913 | 4507459 = | NA (NA) | noncoding (1221/1221 nt) | IS30 | repeat region |
TCCTTCTGAGCAATAAACCAGAGTTTTAGCCTGAACACTTGCTGCGACGGTCATAGCCACCAGGCTGAGACCAAGCTTCAGCATCCCTGACTTTTTCAAGGAAATACGCATTATTCTGCTCCAATTGTGATGTTTGTTGTTTTAACCCTTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3707595‑3707843 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGTAGATTCAATCTGTCAATGCAACACCCCTTTCAATTATCTCTTTCGGTGTTTTGAACTTCAGTGTCTTTCTCGGTCTGTTGTTTAGCTGAGCAGCAACCAGATCTAGTTCATGTTGAGTATATTGGGCAAGACATGTCTTTTTAGGAAAGTACTGCCGAATTAGCCCATTTGTGTTCTCATTTGTTCCCCGCTGCCAAGGACTCTGAGGATCGCAGAAGTAAACTTTAACGCCGGTGCTGAC > NC_000913/4507459‑4507702 TCCTTCTGAGCAATAAACCAGAGTTTTAGCCTGAACACTTGCTGCGACGGTCATAGCCACCAGGCTGAGACCAAGCTTCAGCATCCCTGACTTTTTCAAGGAAATACGCATTATTCTGCTCCAATTGTGATGTTTGTTGTTTTAACCCTTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTTG > 1:149841/1‑251 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TCATAGCCACCAGGCTGAGACCAAGCTTCAGCATCCCTGACTTTTTCAAGGAAATACGCATTATTCTGCTCCAATTGTGATGTTTGTTGTTTTAACCCTTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTTGTAGATTCAATCTGTCAATGCAACACCCCTTTCAATTATCTCTTTCGGTGT > 2:553997/1‑251 AGCCACCAGGCTGAGACCAAGCTTCAGCATCCCTGACTTTTTCAAGGAAATACGCATTATTCTGCTCCAATTGTGATGTTTGTTGTTTTAACCCTTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTTGTAGATTCAATCTGTCAATGCAACACCCCTTTCAATTATCTCTGTCGGTGTTTT < 2:589027/250‑1 AGCCACCAGGCAGAGACCAAGCTTCAGCATCCCTGACTTTTTCAAGGAAATACGCCTTATTCTGCTCAAATTGTGATGTTTGTTGTTTTAACCCTTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTTGTAGATTCAATCTGTCAATGCAACACCCCTTTCAATTATCTCTTTCGGTGTTTTG > 2:300126/1‑251 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ATTCTGCTCCAATTGTGATGTTTGTTGTTTTAACCCTTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTTGTAGATTCAATCTGTCAATGCAACACCCCTTTCAATTATCTCTTTCGGTGTTTTGAACTTCAGTGTCTTTCTCGGTCTGTTGTTTAGCTGAGCAGCAACCAGATCTAGTTCAT < 1:228730/251‑1 TGCTCCACTTGTGATGTATGATGTTTTACCCCTCTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTTGTAGATTCAATCTGTCAATGCAACACCCCTTTCAATTATCTCTTTCGGTGTTTTGAACTTCAGTGTCTTTCTCGGTCTGTTGTTTAGCTGAGCAGCAACCAGATCTAGTTCATGTTG > 2:54853/1‑251 GCTCCAATTGTGATGTTTGTTGTTTTAACCCTTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTTGTAGATTCAATCTGTCAATGCAACACCCCTTTCAATTATCTCTTTCGGTGTTTTGAACTTCAGTGTCTTTCTCGGTCTGTTGTTTAGCTGAGCAGCAACCAGATCTAGTTCATGTT < 1:513630/249‑1 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GCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGGTAGATTCAATCTGTCAATGCAACACCCCTTTCAATTATCTCTTTCGGTGTTTTGAACTTCAGTGTCTTTCTCGGTCTGTTGTTTAGCTGAGCAGCAACCAGATCTAGTTCATGTTGAGTATATTGGGCAAGACATGTCTTTTTAGGAAAGTACTGCCGAATTAGC < 1:96563/249‑1 TTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGCTGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTTGTAGATTCAATCTGTCAATGCAACACCCCTTTCAATTATCTCTTTCGGTGTTTTGAACTTCAGTGTCTTTCTCGGTCTGTTGTTTAGCTGAGCAGCAACCAGATCTAGTTCATGTTGAGTATATTGGGCAAGACATGTCTTTTTAGGAAAGTACTGCCGAATTAGCCCATTTGTGTT > 2:338521/1‑251 TTTTTGTTTTTTGCCAGTTCGGGTCAAAGTTATGAGGTGGGGATGCCTTCATATTTAACATAAGTGTAACAGTTGTAGATTCAATCTGTCACTGCAACACCCCTTTCAATTATCTCTTTCGGTGTTTTGAACTTCAGTGTCTTTCTCGGTCTGTTGTTTAGCTGAGCAGCAACCAGATCTAGTTCATGTTGCGTATATTGGGCAAGACATGTCTTTTTAGGAAAGTACTGCCGAATTAGCCCATTTGTGTT > 2:307612/1‑251 TTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCTTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTTGTAGATTCAATCTGTCAATGCAACACCCCTTTCAATTATCTCTTTCGGTGTTTGGAACTTCAGTGTCTTTCTCGGTCTGTTGTTTAGCTGAGCAGCAACCAGATCTAGTTCATGTTGAGTATATTGGGCAAGACATGTCTGTTTAGGAAAGTACTGCCGAATTAGCCCATTTGTGTTCT < 2:309306/250‑1 TTTTGCACGGTCGGGTCACCGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTTGTAGATTCAATCTGTCAATGCAACACACCTTTCAATTATCTCTTTCGGTGTTTTGAACTTCAGTGTCTTTCTCGGTCTGTTGTTTAGCTGAGCAGCAACCAGATCTAGTTCATGTTGAGTATATTGGGCAAGACATGTCTTTTTAGGAAAGTACTGCCGAATTAGCCCATTTGTGTTCTCATTTG > 1:516995/1‑251 GCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTTGTAGATTCAATCTGTCAATGCAACACCCCTTTCAATTATCTCTTTCGGTGTTTTGAACTTCAGTGTCTTTCTCGGTCTGTTGTTTAGCTGAGCAGCAACCAGATCTAGTTCATGTTGAGTATATTGGGCAAGACATGTCTTTTTAGGAAAGTACTGCCGAATTAGCCCATTTGTGTTCTCATTTGTTCC < 2:536040/251‑1 GCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTTGTAGATTCAATCTGTCAATGCAACACCCCTTTCAATTATCTCTTTCGGTGTTTTGAACTTCAGTGTCTTTCTCGGTCTGTTGGTTAGCTGAGCAGCAACCAGATCTAGTTCATGTTGAGTATATTGGGCAAGACATGTCTTTTTAGGAAAGTACTGCCGAATTAGCCCATTTGTGTTCTCATTTGTTCC < 1:680905/251‑1 CCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTTGTAGATTCAATCTGTCAATGCAACACCCCTTTCAATTATCTCTTTCGGTGTTTTGAACTTCAGTGTCTTTCTCGGTCTGTTGTTTAGCTGAGCAGCAACCAGATCTAGTTCATGTTGAGTATATTGGGCAAGACATGTCTTTTTAGGAAAGTACTGCCGAATTAGCCCATTTGTGTTCTCATTTGTTCCC > 1:156206/1‑251 GGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTTGTAGATTCAATCTGTCAATGCAACACCCCTTTCAATTATCTCTTTCGGTGTTTTGAACTTCAGTGTCTTTCTCGGTCTGTTGTTTAGCTGAGCAGCAACCAGATCTAGTTCATGTTGAGTATATTGGGCAAGACATGTCTTTTTAGGAAAGTACTGCCGAATTAGCCCATTTGTGTTCTCATTTGTTCCCCGC > 1:1117/1‑251 TGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTTGTAGATTCAATCTGTCAATGCAACACCCCTTTCAATTATCTCTTTCGGTGTTTTGAACTTCAGTGTCTTTCTCGGTCTGTTGTTTAGCTGAGCAGCAACCAGATCTAGTTCATGTTGAGTATATTGGGCAAGACATGTCTTTTTAGGAAAGTACTGCCGAATTAGCCCATTTGTGTTCTCATTTGTTCCCCGCTGCCAAGGACTCTG > 1:105723/1‑249 TGAGGCGGGGATGCCTTACTAATTAACATCAGTATAACAGTTGTAGATTCAATCTGTCAATGCAAAACCCCTTTCAATTATCTCTTTCGGTGTTTTTAACTTCAGTGTCTTTCTCGGTCTGTTGTTTAGCTGAGCAGCAACCAGATCTAGTTCATGTTGAGTATATTTGGCAAGACATGTCTTTTTAGGAAAGTACTGCCGAATTAGCCCATTTGTGTTCTCATTTGTTCACCGCTGCCAAGGACTCTG > 2:676524/1‑249 AGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTTGTAGATTCAATCTGTCAATGCAACACCCCTTTCAATTATCTCTTTCGGTGTTTTGAACTTCAGTGTCTTTCTCGGTCTGTTGTTTAGCTGAGCAGCAACCAGATCTAGTTCATGTTGAGTATATTGGGCAAGACATGTCTTTTTAGGAAAGTACTGCCGAATTAGCCCATTTGTGTTCTCATTTGTTCCCCGCTGCCAAGGACTCTGAGG > 2:199715/1‑250 GGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTTGTATATTCAATCTGTCAATGCAACACCCCTTTCAATTATCTCTTTCGGTGTTTTGAACTTCAGTGTCTTTCTCGGTCTGTTGTTTAGCTGAGCAGCAACCAGATCTAGTTCATGTTGAGTATATTGGGCAAGACATGTCTTTTTAGGAAAGTACTGCCGAATTAGCCCATTTGTGTTCTCATTTGTTCCCCGCTGCCAAGGACTCTGAGGATCGC > 1:77328/1‑251 ATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTTGTAGATTCAATCTTTCAATGCAACACCCCTTTCAATTATCTCTTTCGGTGTTTTGAACTTCAGTGTCTTTCTCGGTCTGTTGTTTAGCTGAGCAGCAACCAGATCTAGTTCATGTTGAGTATATTGGGCAAGACATGTCTTTTTAGGAAAGTACTGCCGAATTAGCCCATTTGTGTTCTCATTTGTTCCCCGCTGCCAAGGACTCTGAGTATCGCAGAA < 2:666881/251‑1 GCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTTGTAGATTCAATCTGTCAATGCAACACCCCTTTCAATTATCTCTTTCGGTGTTTTGAACTTCAGTGTCTTTCTCGGTCTGTTGTTTAGCTGAGCAGCAACCAGATCTAGTTCATGTTGAGTATATTGGGCAAGACATGTCTTTTTAGGAAAGTACTGCCGAATTAGCCCATTTGTGTTCTCATTTGTTCCCCGCTGCCAAGGACTCTGAGGATCGCAGAAG < 1:553997/250‑1 AACATCAGTGTAACAGTTGTAGATTCAATCTGTCAATGCAACACCCCTTTCAATTATCTCTTTCGGTGTTTTGAACTTCAGTGTCTTTCTCGGTCTGTTGTTTAGCTGAGCAGCAACCAGATCTAGTTCATGTTGAGTATATTGGGCAAGACATGTCTTTTTAGGAAAGTACTGCCGAATTAGCCCATTTGTGTTCTCATTTGTTCCCCGCTGCCAAGGACTCTGAGGATCGCAGAAGTAAACTTTAACGC > 2:443575/1‑251 AACATCAGTGTAACAGTTGTAGATTCAATCTGTCAATGCAACACCCCTTTCAATTATCTCTTTCGGTGTTTTGAACTTAAGTGTCTTTCTCGGTCTGTTGTTTAGCTGAGCAGCAACCAGATCTAGTTCATGTTGAGTATATTGGGCAAGACATGTCTTTTTAGGAAAGTACTGCCGAATTAGCCCATTTGTGTTCTCATTTGTTCCCCGCTGCCAAGGACTCTGAGGATCGCAGAAGTAAACTTTAACG > 1:659561/1‑250 AACATCAGTGTAACAGTTGTAGATTCAATCTGTCAATGCAACACCCCTTTCAATTATCTCTTTCGGTGTTGTGAACTTCAGTGTCTTTCTCGGTCTGTTGTTTAGCTGAGCAGCAACCAGATCTAGTTCATGTTGAGTATATTGGGCAAGACATGTCTTTTTAGTAAAGTACTGCCGAAGTAGCCCATGTGTGTTCTCATTTGTTCCCCGCTGCCAAGGACTCTTAGGATCGCAGAAGTAAACTTTAACG < 2:659561/250‑1 ATCAGTGTAACAGTTGTAGATTCAATCTGTCAATGCAACACCCCTTTCAATTATCTCTTTCGGTGTTTTGAACTTCAGTGTCTTTCTCGGTCTGTTGTTTAGCTGAGCAGCAACCAGATCTAGTTCATGTTGAGTATATTGGGCAAGACATGTCTTTTTAGGAAAGTACTGCCGAATTAGCCCATTTGTGTTCTCATTTGTTCCCCGCTGCCAAGGACTCTGAGGATCGCAGAAGTAAACTTTAACGCCGG > 2:206460/1‑251 GTAACAGTTGTAGATTCAATCTGTCAATGCAACACCCCTTTCAATTATCTCTTTCGGTGTTTTGAACTTCAGTGTCTTTCTCGGTCTGTTGTTTAGCTGAGCAGCAACCAGATCTAGTTCATGTTGAGTATATTGGGCAAGACATGTCTTTTTAGGAAAGTACTGCCGAATTAGCCCATTTGTGTTCTCATTTGTTCCCCGCTGCCAAGGACTCTGAGGATCGCAGAAGTAAACTTTAACGCCGGTGCTG > 1:119262/1‑250 TAACAGTTGTAGATTCAATCTGTCTATGCAACACCCCTTTCAATTATCTCTTTCGGTGTTTTGAACTTCAGTGTCTTTCTCGGTCTGTTGTTTAGCTGAGCAGCAACCAGATCTAGTTCATGTTGAGTATATTGGGCAAGACATGTCTTTTTAGGAAAGTACTGCCGAATTAGCCCATTTGTGTTCTCATTTGTTCCCCGCTGCCAAGGACTCTGAGGATCGCAGAAGTAAACTTTAACGCCGGTGCTGAC > 1:286090/1‑251 TCCTTCTGAGCAATAAACCAGAGTTTTAGCCTGAACACTTGCTGCGACGGTCATAGCCACCAGGCTGAGACCAAGCTTCAGCATCCCTGACTTTTTCAAGGAAATACGCATTATTCTGCTCCAATTGTGATGTTTGTTGTTTTAACCCTTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3707595‑3707843 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGTAGATTCAATCTGTCAATGCAACACCCCTTTCAATTATCTCTTTCGGTGTTTTGAACTTCAGTGTCTTTCTCGGTCTGTTGTTTAGCTGAGCAGCAACCAGATCTAGTTCATGTTGAGTATATTGGGCAAGACATGTCTTTTTAGGAAAGTACTGCCGAATTAGCCCATTTGTGTTCTCATTTGTTCCCCGCTGCCAAGGACTCTGAGGATCGCAGAAGTAAACTTTAACGCCGGTGCTGAC > NC_000913/4507459‑4507702 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |