| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 88,571 | G→A | V182M (GTG→ATG) | cra → | DNA‑binding transcriptional dual regulator Cra |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 88,571 | 0 | G | A | 96.4% | 166.2 / NA | 55 | V182M (GTG→ATG) | cra | DNA‑binding transcriptional dual regulator Cra |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (27/26); minor base C (2/0); total (29/26) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.92e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
AAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTC‑GCGCTGGACCGCGCCC‑TCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGTGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGATGATCCGCGCGAAGTGCATTTCCTGTATGCCAACAGCTATGAGCGGGAGGCGGCTGCCCAGTTATTCGAAAAATGGCTGGAAACGCATCCGATGCCGCAGGCGCTGTTCACAACGTCGTTTGCGTTGTTGCAAGGAGTGATGGATGTCACGCTGCGTCGCGACGGCA > NC_000913/88326‑88814 | aagaTCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTC‑GCGCTGGACCGCGCCC‑TCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGATGCtt > 1:324447/1‑251 (MQ=255) gaTCCGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGTGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTC‑GCGCTGGACCGCGCCC‑TCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGAGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGGGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGCCGATGCttt > 2:302356/1‑250 (MQ=255) aGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTC‑GCGCTGGACCGCGCCC‑TCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCtt > 1:11357/1‑251 (MQ=255) gAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTCCAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTC‑GCGCTGGACCGCGCCC‑TCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTAcc < 1:307919/251‑1 (MQ=255) tGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCTTTGCCTCCTGAGCATCTTTTTTATCACCGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTC‑GCGCGGGACCGCGCCC‑TCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTGGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCttt < 1:58457/250‑1 (MQ=255) gccatggggCACCTTTTAAGGCGCCATGTGGATGCCATTATTTTTCCGACGTCGTTGCCTCCTGACCCTCCGTTTTATCAACGCGGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGCC‑GCGCTGGCCGGCGCCC‑TCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTGGGTGCCGATCAGGATGATGCGGAAATGCTGCCGGAAGATTTACGTAAGTTCCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTc < 2:86018/243‑1 (MQ=255) gaccgcttttctccgcggcatgttgttGCCATTATTGTCTCGGCGTCTTTTCCTCCTGATCCTCTTTTTTATAACCGCTGGACTAATGCCCCTTCCCCGATTGTC‑GCGTGGGACCGCGCCC‑TCGCTCGTGACCTCTTCCCCACCGTGGTTGTTTTCGACCAGTATCATGCCAAACTCCTGGCGTATGATTTACTTAAGTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAg < 2:1853/230‑1 (MQ=255) gAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAAAGACCCGTTCCAGATTGTC‑GCGCTGGACCGCGCCC‑TCGATCGTGAACACTTCAACAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGACATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGATACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTc > 1:271588/1‑249 (MQ=255) cccTTTTCCAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGCCGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGCCCCGTTCCCGATTGTC‑GCGCTGGACCGCGCCC‑TCGATCGTGAACACTTCACCAGGGTGGTTGGTGCGGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTc < 1:30100/250‑1 (MQ=255) tttACAGCGTCTGTTTGATGCCATTATTGTTTCGAGGGCGTTGCCTCCTGATCATCCTTTTTACCACCGCGGGGCTAACGACCCTTTCCCGATTGTC‑GCGCTGGCCCGCGCCC‑TCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCGGGATGATGCCTAAATGCGGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTg < 2:320876/250‑1 (MQ=255) tttcAGCGTCAGGTTGATGCTATTATTGTTTCGGCGGCGTTGCCGCCTGATCACCCTTTTTATCAACGCGGGGCTAACGCCCCTTTCCCGATTGTC‑CCGCTGGACCGCCCCC‑TCGTTCGTGAACACTTCGCCAGTGTGGTTGGTGCCGATAAGGATGATGCCAAAAGGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGc < 1:324644/247‑1 (MQ=255) ttACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGACCACCCTTTTTAGCAACGCGGGGCTAACGACCCTTTCCCGATTGCC‑GCGCTGGCCCGCGCCC‑TCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGAAAGAGTTACTTAATTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGc < 1:240732/250‑1 (MQ=255) cGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCACCGCTGGGCTACCGACCCGTTCCCGATTGTC‑GCGCTGGACCGCGCCC‑TCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGACATGCTGGCGGAAGCGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGCTGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCGTTCTGTCAGCTTCCTGcttgcacc > 2:271262/1‑244 (MQ=255) aGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTC‑GCGCTGGACCGCGCCC‑TCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGt > 1:195678/1‑251 (MQ=255) gTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTC‑GCGCTGGACCGCGCCC‑TCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGttt > 2:145998/1‑251 (MQ=255) gATGCCATTATTGTTACGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTC‑GCGCTGGACCGCGCCC‑TCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCg > 1:299105/1‑251 (MQ=255) gCCATTTTTGTTGCGTCGTCTTTGCCTCCTGAGCGTCTTATTTATCAACGCTGGGCTACGGAACCGTTCCCGTTTGTC‑GCCCTGGCCCGCGCCT‑TGAATCGTGACCACTTCACCCGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGTTGATGCCGAAATGTTGGCGGAGGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGTAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTAc < 1:275799/251‑1 (MQ=255) tGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCATTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTC‑GCGCTGGACCGCGCCC‑TCGATCGTGCACACTTCACCAGCGTGGCTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGCATTACGTAAGTTTCCAGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTggc > 2:390181/1‑250 (MQ=255) ttCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTC‑GCGCTGGACCGCGCCC‑TCGATCGTGAACCCTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGaa > 1:162542/1‑249 (MQ=255) gACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTC‑GCGCTGGACCGCGCCC‑TCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAgatg > 1:141300/1‑251 (MQ=255) ccctcctGTGCTTCCTTTTTACCAGCGCTGGTCTAACGCCCCGTTCCCGATTGTC‑GCGCTGGACCGCGCCC‑TCGTCCGGTAACATTTCCCTAGTGTGGTGGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATTCGGGCGGAAGATTTACGTAATTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCGGGAAAGATGATCcgcgcg < 2:346274/250‑1 (MQ=255) aTCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTC‑GCGCTGGACCGCGCCC‑TCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATAAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGATGATCCGCGCGAAGTGCATTTc > 1:254999/1‑251 (MQ=255) ccttttgagcaactgtGGGCTAACGCCCCGTTCCCGTTTGGC‑GCGCGGGACCGCGCCC‑TCCATCGGGAACACTTGACCAGCTGGGTTGGTGCCGATCAGGATGAGGCCGAAAGCCTGGGGGAAGAGTTACGAAAGTTTCCCGCCGAGACGATGCTTGATCTTGGTGCGCTACCTGAGCTTTCGGGCAGCTGCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGATGATCCGCGCGAAGTGCATTTcc < 2:396058/235‑1 (MQ=255) tttttATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTC‑GCGCTGGACCGCGCCC‑TCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGCCGCTGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGCACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGATGGTCCGAGCGACGTGCATTTCCTGt > 1:804/1‑251 (MQ=255) ttATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTC‑GCGCTGGACCGCGCCC‑TCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGATGATCCGCGCGAGGTGCATTTACTGTATg > 2:10967/1‑251 (MQ=255) aTCACCGCGGGGCAAACGCCCCTTTCCCGATTGCC‑GCGTGGGCCCGCGCCC‑TGGATCGTGAACACTCCCCGAGGGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTGCGTAATTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTGCTGCCTGGAAAGATGATCCGCGCGAATTGCATTGCCTGTATGc < 2:141460/250‑1 (MQ=255) tCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTC‑GCGCTGGACCGCGCCC‑TCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGCTGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCt > 2:390248/1‑186 (MQ=255) ccAACGCGGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTC‑GCGCTGGCCCGCGCCC‑CCGATCGTAAACACTTCACCAGCGGGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAATTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCt < 1:390248/185‑1 (MQ=255) aaCGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTC‑GCGCTGGACCGCGCCC‑TCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGATGATCCGCGCGAAGTGCATTTCCTGTATGCCAAc > 1:30283/1‑251 (MQ=255) cTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGAC‑GCGCTGGACCGCGCCC‑TCGCTCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATAAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGGACTGCCTGGAAAGATGATCCGCGCGCAGTGCATTTCCTGTATGCCAACAGCt > 2:150125/1‑251 (MQ=255) tggCTAACGACCCGTTCCCGAT‑GTCTGTGCTGG‑CCGCCCCCATCGCGCGTAAACACTTGTCCTGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGTTGGCGGAAGATTTCCGTAAGTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCTCTACCGGAGATTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGATGATCCGCGCGAAGTGCATTTCCTGTATGCCCACAGCTa < 2:14865/249‑1 (MQ=255) gCTAACGACCCTTTCCCGATGGTC‑GCTGGGGACCGCTCCC‑TCGATCGTGAACACTTCCCCAGCTGGGTTGGGTCAGATCAGGATGAAGCCGAAAGGCTGGCGGAAGAGTTACGGAAGTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCATCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTTCCTGTAAAGATGATCCGCGCGAAGTGCATTGCCTGTATGCCAACAGCTATGa < 2:201985/251‑1 (MQ=255) gCTAACGACCCGTTCCCGATTGTC‑GCGCTGGACCGCGCCC‑TCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGACAGATGATCCGCGCGAAGTGCATTTCCTGTATGCCAACAGCTATgg > 2:401404/1‑250 (MQ=255) tAACGACCCGTTCCCGATTGTC‑GCGCTGGACCGCGCCC‑TCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGCAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTACCGCCGAGACGATGCTTTATATTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGCTTCCGTACTGCCTGGACAGATGATCCGCGCGAAGTGCATTTCCTGTATGCCAACAGCTATGAGc > 1:170629/1‑251 (MQ=255) gACCCGTTCCCGATTGTC‑GCGCTGGACCGCGCCC‑TCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGAGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGTTGATCCGCGCGAAGTGCATTTCCTGTATGCCAACAGCTATGAGCggg > 1:313676/1‑250 (MQ=255) gTTCCCGATTGGC‑GCGCTGGACCGCGCCT‑TCGATCGTGAACCCTTCCCCATCGTTGTTGTTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGTTGGCGGAAGAGTTACGTAATTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGATGATCCGCGCGAAGTGCATTTCCTGTATGCCAACAGCTATGAGCGGGAggcgg < 1:28635/251‑1 (MQ=255) ggacgggtcac‑TCGACCGTGAACTTTTCACCAGCGTGTGTGGTGCAGATCAGGAGGATGGAGAAATGCTGGCGGAAGGGTTACGGATGTTTCCCGCCGAGGCGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCATCTTCCTGCGTGAACAAGGTGTCCGTACTGCCTGGAAAGAGGATCCGCGCGAAGTGCATTTCCGGTAGGCCAACAGCTATGAGCGGGAGGCGTCTGCCCAGTTACTCGaaa < 2:152968/241‑1 (MQ=255) ggACCGCGCCC‑TCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGATGATCCGCGCGAAGTGCATTTCCTGTATGCCAACAGCTATGAGCGGGAGGCGGCTGCCCAGTTATTCGaa > 2:258881/1‑250 (MQ=255) gACCGCGCCC‑TCGATCGTGAACACTTCACCAGCGGGGTTGGGGCCGATCAGGAGGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGATGATCCGCGCGAAGTGCATTTCCTGTATGCCAACAGCTATGAGCGGGAGGCGGCTGCCCAGTTATTCGaaaa < 2:30283/251‑1 (MQ=255) ccGCGCCC‑TCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGATGATCCGCGCGAAGTGCATTTCCTGTATGCCAACAGCTATGAGCGGGAGGCGGCTGCCCAGTTATTCGAAAAAt > 1:147832/1‑251 (MQ=255) gacagtgaccccgtCACCAGGGGGGTGGGTGCCGATCAGGAGGATGCCGAAATGCTGGGGGAAGAGTTACTTAATTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGATGATCCGCGCGAAGTGCATTTCCTGTATGCCAACAGCTATGAGCGGGAGGCGGCTGCCCAGTTATTCGAAAAATGGCTGGAAAc < 2:277295/238‑1 (MQ=255) aTCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGATGATCCGCGCGAAGTGCATTTCCTGTATGCCAACAGCTATGAGCGGGAGGCGGCTGCCCAGTTATTCGAAAAATGGCTGGAAACg > 1:306341/1‑251 (MQ=255) gaacatttctccgtcGTGGTTGGGGCCGATCAGGATGATGCCGAAAGTCTGGCGGAAGAGGTACGTAATTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTGTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGATGATCCGCGCGAAGTGCATTTCCTGTATGCCAACAGCTATGAGCGGGAGGCGGCTGCCCAGTTATTCGAAAAATGGCTGGAAACGCATcc < 2:263216/237‑1 (MQ=255) gTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGATGATCCGCGCGAAGTGCATTTCCTGTATGCCAACAGCTATGAGCGGGAGGCGGCTGCCCAGTTATTCGAAAAATGGCTGGAAACGCATCCGATGCCGCAGGCGCt > 2:149848/1‑251 (MQ=255) gttggtGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAATTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGATGATCCGCGCGAAGTGCATTTCCTGTATGCCAACAGCTATGAGCGGGAGGCGGCTGCCCAGTTATTCGAAAAATGGCTGGAAACGCATCCGATGCCGCAGGCGCTGtt < 1:401404/251‑1 (MQ=255) gcGATCAGGATGATCCGGAAAGGCGGGGGGAGGAGTTACGAAAGCTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGGTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTGCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGATGATCCGCGCGAAGTGCATGTCCTGTAGGCCAACAGTTATGAGCGGGAGGCGGCTGCCCAGTTAGTCGAAAAATGGCTGGAAACGCATCCGATGCCGCAGGCGCTGTTCACAAcg < 1:266046/250‑1 (MQ=255) aTCAGGATGATGCCGAAATGCGGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGATGATCCGCGCGAAGTGCATTTCCTGTATGCCAACAGCTATGAGCGGGAGGCGGCTGCCCAGTTATTCGAAAAATGGCTGGAAACGCATCCGATGCCGCAGGCGCTGTTCACAAcgtcg < 2:141300/251‑1 (MQ=255) gatgatGCCGAAAGGCTGGCGGAAGATTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGATGATCCGCGCGAAGTGCATTTCCTGTATGCCAACAGCTATGAGCGGGAGGCGGCTGCCCAGTTATTCGAAAAATGGCTGGAAACGCATCCGATGCCGCAGGCGCTGTTCACAACGTCGTTTGc < 1:258881/251‑1 (MQ=255) cGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGATGATCCGCGCGAAGTGCATTTCCTGTATGCCAACAGCTATGAGCGGGAGGCGGCTGCCCAGTTATTCGAAAAATGGCTGGAAACGCATCCGATGCCGCAGGCGCTGTTCACAACGTCGTTTGCGTTGTTGc > 1:280079/1‑251 (MQ=255) aaaTGCTGGCGGCAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGATGATTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGATGATCCGCGCGAAGTGCATTTCCTGTATGCCAACAGCTATGAGCGGGAGGCGGCTGCCCAGTTATTCGAAAAATGGCTGGAAACGCATCCGATGCCGCAGGCGCTGTTCACAACGTCGTTTGCGTTGTTGCa > 2:351098/1‑250 (MQ=255) tGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGATGATCCGCGCGAAGTGCATTTCCTGTATGCCAACAGCTATGAGCGGGAGGCGGCTGCCCAGTTATTCGAAAAATGGCTGGAAACGCATCCGAt > 1:195960/1‑205 (MQ=255) gTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGATGATCCGCGCGAAGTGCATTTCCTGTATGCCAACAGCTATGAGCGGGAGGCGGCTGCCCAGTTATTCGAAAAATGGCTGGAAACGCATCCGATGCCGCAGGCGCTGTTCACAACGTCGTTTGCGTTGTTGCAAGGAGTGATGGATGTCACGCTGCGTc < 1:245737/251‑1 (MQ=255) cgccgAGACGATGCTTTATCTTGGTGCTCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGATGATCCGCGCGAAGTGCATTTCCTGTATGCCAACAGCTATGAGCGGGAGGCGGCTGCCCAGTTATTCGAAAAATGGCTGGAAACGCATCCGATGCCGCAGGCGCTGTTCACAACGTCGTTTGCGTTGTTGCAAGGAGTGATGGATGTCACGCTGCGTCGCGACg < 2:48169/251‑1 (MQ=255) ccgAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGATGATCCGCGCGAAGTGCATTTCCTGTATGCCAACAGCTATGAGCGGGAGGCGGCTGCCCAGTTATTCGAAAAATGGCTGGAAACGCATCCGATGCCGCAGGCGCTGTTCACAACGTCGTTTGCGTTGTTGCCAGGAGTGATGGATGTCACGCTGCGTCGCGACGGc > 2:300917/1‑251 (MQ=255) gagaCGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGATGATCCGCGCGAAGTGCATTTCCTGTATGCCAACAGCTATGAGCGGGAGGCGGCTGCCCAGTTATTCGAAAAATGGCTGGAAACGCATCCGATGCCGCAGGCGCTGTTCACAACGTCGTTTGCGTTGTTGCAAGGAGTGATGGATGTCCCGCTGCGTCGCGACGGCa > 2:87220/1‑250 (MQ=255) | AAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTC‑GCGCTGGACCGCGCCC‑TCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGTGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGATGATCCGCGCGAAGTGCATTTCCTGTATGCCAACAGCTATGAGCGGGAGGCGGCTGCCCAGTTATTCGAAAAATGGCTGGAAACGCATCCGATGCCGCAGGCGCTGTTCACAACGTCGTTTGCGTTGTTGCAAGGAGTGATGGATGTCACGCTGCGTCGCGACGGCA > NC_000913/88326‑88814 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |