| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,517,355 | C→T | Q121Q (CAG→CAA) | fecR ← | ferric citrate regulator FecR |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,517,355 | 0 | C | T | 98.1% | 152.5 / ‑3.7 | 53 | Q121Q (CAG→CAA) | fecR | ferric citrate regulator FecR |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base T (17/35); total (17/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.66e-01 | |||||||||||
TCCACAGCGTGCTGCTGCACGTCAAGCTGCGTGAAATTATCCTGCTGGCGGACGGTAAATTCTGTCCCTAAAGCAGTGAGCTGGCCCTGACGGGTCAGGACACGGAAGGGGCGTTGCAGGGCATCTTTCGCGGTAGTAATGGCGATTTCACCGTACCAGAGCCGGACGGTGCGCTGATGCGCATCAAAACGCACA‑TCCGCCGCGCTTTGGGTATTCAGCGTG‑AGCAGGGAGCCATCTTCCAGTTGCTGACGGCTGACTGTGCCTTTGGCGGTGCGGTAATCTGCCCGCAGACCTTCGCCGGTTTCCGACTGCCAGAGCTGCCAGCCTCCGCCAGCGCCGAGCAACAGCAGTAATCCTTTCATCACGTGACGGCGGGTGAGGCGGGTATCGTGCAACGCCCGGCTGGCAACGTCGCCAGGCACACCGCCAAGCTGGTTGCGCAGGTTTTCAACCTGCTGCCAGGCCCACTGGTTATCCTGATCCTGTTC > NC_000913/4517110‑4517597 | tccccagcggtctgctgcTCGTCAAGCTGCGTGAAATTATCCTGCTGGCGGACGGTAAATTCTGTCCCTAAAGCAGTGAGCTGGCCCTGACGGGTCAGGACACGGAAGGGGCGTTGCAGGGCATCTTTCGCGGTAGTAATGGCGATTTCACCGTCCCAGAGCCGGACGGTGCGCTGATGCGCATCAAAACGCACT‑TCCGCCGCGCTTTGGGTATTCAGCGTG‑AGCAGGGAGCCATCTTCCAGTTGTTGAc < 2:325300/239‑1 (MQ=255) cacaGCGTGCTGCTGCACGTCAAGCTGCGTGAAATTATCCTGCTGGCGGACGGTAAATTCTGTCCCTAAAGCAGTGAGCTGGCCCTGACGGGTCAGGACACGGAAGGGGCGTTGCAGGGCATCTTTCGCGGTAGTAATGGCGATTTCACCGTACCAGAGCCGGACGGTGCGCTGATGCGCATCAAAACGCACA‑TCCGCCGCGCTTTGGGTATTCAGCGTG‑AGCAGGGACCAATCTTCCAGTTGTTGACGGc > 2:125048/1‑251 (MQ=255) cGTGCTGCTGCACGTCAAGCTGCGTGAAATTATCCTGCTGGCGGACGGTAAATTCTGTCCCTAAAGCAGTGAGCTGGCCCTGACGGGTCAGGACACGGAAGGGGCGTTGCAGGGCATCTTTCGCGGTAGTAATGGCGATTTCACCGTACCAGAGCCGGACGGTGCGCTGATGCGCATCAAAACGCACA‑TCCGCCGCGCTTTGGGTATTCAGCGTG‑AGCAGGGAGCCATCTTCCCGTTGTTGACGGCTGACt > 2:398387/1‑251 (MQ=255) cGTGCTGCTGCACGTCAAGCTGCGTGAAATTATCCTGCTGGCGGACGGTAAATTCTGTCCCTAAAGCAGTGAGCTGGCCCTGACGGGTCAGGACACGGAAGGGGCGTTGCAGGGCATCTTTCGCGGTAGTAATGGCGATTTCACCGTACCAGAGCCGGACGGTGCGCTGATGCGCATCAAAACGCACA‑TCCGCCGCGCTTTGGGTATTCAGCGTG‑AGCAGGGAGCCATCTTCCAGTTGTTGACGGCTGACt > 1:356670/1‑251 (MQ=255) tgcACGTCAAGCTGCGTGAAATTATCCTGCTGGCGGACGGTAAATTCTGTCCCTAAAGCAGTGAGCTGGCCCTGACGGGTCAGGACACGGAAGGGGCGTTGCAGGGCATCTTTCGCGGTAGTAATGGCGATTTCACCGTACCAGAGCCGGACGGTGCGCTGATGCGCATCAAAACGCACA‑TCCGCCGCGCTTTGGGTATTCAGCGTG‑AGCAGGGAGCCATCTTCCAGTTGTTGACGGCTGACTGTGCCttt > 1:165388/1‑251 (MQ=255) cGTCAAGCGGCGTGAAATTATCCTGCTGGCGGACGGGAAATTCGTTCCCTAAAGCAGTGAGCTGTCCCGTACGGGTCAGGACACGGAAGGGGCGTGGCAGGGCATCTTTCGCGGTAGTAATGGCGATTTCACCGGACCAGAGCCGGACGGTGGGCGGAGGCGCATCAAAACGCACT‑TCCGCCGCGCTTTGGGTATTCAGCGTG‑AGCAGGGAGCCATCTTCCAGTTGTTGACGGCTGACGGTGCCTTTGgcg < 2:352567/251‑1 (MQ=255) aaGCTGCGTGAAATTATCCTGCTGGCGGACGGTAAATTCTGTCCCTAAAGCAGTGAGCTGGCCCTGACGGGTCAGGACACGGACGGGGCGTTGCAGGGCATCTTTCGCGGTAGTAATGGCGCTTTCACCGTACCAGAGCCGGACGGTGCGCTGATGCGCATCAAAACGCACA‑TCCGCCGCGCTTTGGGAATTCAGCGTG‑AGCAGGGAGCCATCTTCCAGTTGTTGACGGCTGACTGTGCCTTTGgcggtgc > 1:28051/1‑251 (MQ=255) aaGCTGCGTGAAATTATCCTGCTGGCGGACGGTAAATTCTGTCCCTAAAGCAGTGAGCTGGCCCTGACGGGTCAGGACACGGAAGGGGCGTTGCAGGGCATCTTTCGCGGTAGTAATGGCGATTTCACCGTACCAGAGCCGGACGGTGCGCTGATGCGCATCAAAACGCACA‑TCCGCCGCGCTTTGGGTATTCAGCGTT‑AGCAGGGAGCCATCTTCCAGTTGTTGACGGCTGACTGTGCCTTTGgcggtgc < 1:251594/251‑1 (MQ=255) aaaaTTACCCTGGTGGCGGGCGGTAAATTCTGTCCCTAAAGCAGTGAGCTGGCCCTGACGGGTCAGGACACGGAAGGGGCGTTGCAGGGCATCTTTCGCGGTAGTAATGGCGATTTCACCGTACCATAGCCGGACGGTGCGCGGATGCGCATCAAAACGAACA‑TCCGCCGCGCTTTGGGTATTCAGCGTG‑AGCAGGGAGCCATCTTCCAGTTGTTGACGGCTGACTGTGCCTTTGGCGGTTCGGTAATCTg < 2:51246/250‑1 (MQ=255) aaTTATCCTGCTGGCGGACGGTAAATTCTGTCCCTAAAGCAGTGAGCTGGCCCTGACGGGGCAGGACACGGAAGGGGCGTTGCAGGGCATCTTTCGCGGTAGTAATGGCGATTTCACCGTACCAGAGCCGGACGTTGCGCTGATGCGCATCAAAACGCACA‑TCCGCCGCGCTTTGGGTATTCAGCGTG‑AGCAGGGAGCCATCTTCCAGTTGTTGACGGCTGACTGTGCCTTTGGCGGTGCGGTAATCTGcc < 1:280288/251‑1 (MQ=255) ggACGGTAAATTCTGTCCCTAAAGCAGTGAGCTGGCCCTGACGGGTCAGGACACGGAAGGGGCGTTGCAGGGCATCTTTCGCGGTAGTAATGGCGATTTCACCGTACCAGAGCCGGACGGTGCGCTGATGCGCATCAAAACGCACA‑TCCGCCGCGCTTTGGGTATTCAGCGTG‑AGCAGGGAGCCATCTTCCAGTTGTTGACGGCTGACTGTGCCTTTGGCGGTGCGGTAATCTGCCCGCAGACCTTCGCCg > 2:104559/1‑251 (MQ=255) ggTAAATTCTGTCCCTAAAGCAGTGAGCTGGCCCTGACGGGTCAGGACACGGAAGGGGCGTTGCAGGGCATCTTTCGCGGTAGTAATGGCGATTTCACCGTACCAGAGCCGGACGGTGCGCTGATGCGCATCAAAACGCACA‑TCCGCCGCGCTTTGGGTATTCAGCGTG‑AGCAGGGAGCCATCTTCCAGTTGTTGACGGCTGACTGTGCCTTTGGCGGTGCGGTAATCTGCCCGCAGACCTTCGCCGGttt > 1:398748/1‑251 (MQ=255) gaaaTTCTGTCCCTAAAGCAGGGAGCTGGCCCTGACGGGTCAGGACACGGAAGGGGCGTTGCAGGGCATCTTTCGCGGTAGTAATGGCGATTTCACCGTACCAGAGCCGGACGGTGCGCTGATGCGCATCAAAACGCACA‑TCCGCCGCGCGTTGGGTATTCAGCGTG‑AGCAGGGAGCCATCTTCCAGTTGTTGACGGCTGACTGTGCCTTTGGCGGTGCGGTAATCTGCGCGCAGACCTTCGCCGGTTTcc < 1:274910/250‑1 (MQ=255) tGTCCCTAAAGCAGTGAGCTGGCCCTGACGGGTCAGGACACGGAAGGAGCGTTGCAGGGCATCTTTCGCGGTAGTAATGGCGATTTCACCGTACCAGAGCCGGACGGTGCGCTGATGCGCATCAAAACGCACA‑TCCGCCGCGCTTTGGGTATTCAGCGTG‑AGCAGGACGCCATCTTCCAGTTGTTGACGGCTGACTGTGCCTTTGGCGGTGCGGTTATCTGCCCTCAGACCTTCTCCGGTTTCCGACttcc > 1:240863/1‑248 (MQ=255) cTAAAGCAGTGAGCTAGCCCTGACGGGTCAGGACACGGAAGGGGCGTTGCAGGGCATCTTTCGCGGTAGTAATGGCGATTTCACCGTACCAGAGCCGGACGGTGCGCTGATGCGCATCAACACGCACA‑TCCGCCGCGCTTTGGGTATTCAGCGTG‑AGCAGGGAGCCATCTTCCAGTTGTTGACGGCTGACTGTGCCTTTGGCGGTGCGGTAATCTGCCCGCCGACCTTCGCCGGGTTCCGACTGCCCGAGc > 2:334873/1‑251 (MQ=255) atgCAGTGAGCTGGCCCTGCCGGGTCAGGACACCGTAGGGGCGTGGCAGGGCATCTTCCGCGGGAGTAATGTCGATGTCACCGTACCAGAGCCGGACGTTGCGCTGATGCCCATCAAAACGCACA‑TCCGCCGCGCTTTGGGTATTCAGCGTG‑AGCAGGGAGCCATCTTCCAGTTGTTGACGGCTGACTGTGCCTTTGGCGGTGCGGTAATCTGCCCGCAGACCTTCGCCGGTTTCCGACTGTCAGAGCTGc < 2:311351/249‑1 (MQ=255) aaGCAGTGAGCTGGCCCGGACGGGTCAGGACACGGAAGGGGGGTTGCAGGGCATCTTGCGCGGTAGTAATGGCGATTTCACCGTACCAGAGCCGGACGGTTCGCTGATGCGCATCAAAACGCACC‑TCCGCCGCGCTTTGGGTATTCAGCGTG‑AGCAGGGAGCCAGGTTCCAGTTGTTGACTGCTGACTGTGCCTTTGGCGGTGCGTTAATCTGCCCGCAGACCTTCGCCGGTTTCCGACTGCCAGAGCTGc < 1:356947/251‑1 (MQ=255) aGCAGTGAGCTGGCCCTGACGGGTCAGGACACGGAAGGGGCGTTGCAGGGCATCTTGCGCGGTAGTAATGGCGATTTCACCGTACCAGAGCCGGACGGTGCGCTGATGCGCATCAAAACGCACA‑TCCGCCGCGCTTTGGGTATTCAGCGTG‑AGCAGGGAGCCATCTTCCAGTTGTTGACGGCTGACTGTGCCTTTGGTGGTGCGGTAATCTGCCCGCAGACCTTCGCCGGTTTCCGACTGCCAGAGCTGcc < 1:30189/251‑1 (MQ=255) gggCCCTGACGGGTCAGGACACGGAAGGGGCGTTGCAGGGCATCTTTCGCGGTAGTAATGGCGATTTCACCGTACCAGAGCCGGACGGTGCGCTGATGCGCATCAAAACGCACA‑TCCGCCGCGCTTTGGGTATTCAGCGTG‑AGCAGGGAGCCATCTTCCAGTTGTTGACGGCTGACTGTGCCTTTGGCGGTGCGGTAATCTGCCCGCAGACCTTCGCCGGTTTCCGACTGCCAGAGCTGCCAGCCTCCGcc < 2:332385/250‑1 (MQ=255) ggCCCTGACGGGTCAGGACACGGAAGGGGCGTTGCAGGGCATCTTTCGCGGTAGTAATGGCGATTTCACCGTACCAGAGCCGGACGGTGCGCTGATGCGCATCAAAACGCACA‑TCCGCCGCGCTTTGGGTATTCAGCGTG‑AGCAGGGAGCCATCTTCCAGTTGTTGACGGCTGACTGTGCCTTTGGCGGTGCGGTAATCTGCCCGCAGACCTTCGCCGGTTTCCGACTGCCAGAGCTGCCAGCCTCCGcc > 1:207574/1‑250 (MQ=255) cccTGACGGGTCAGGACACGGAAGGGGCGTGGAAGGGCATCTTTCGCGGTAGTAATGGCGATTTCACCGTACCAGAGCCGGACGGTGCGCTGATGCGCATCAAAACGCACA‑TCCGCCGCGCTTTGGGTATTCAGCGTG‑AGCAGGGAGCCATCTTCCAGTTGTTGACGGCTGACTGTGCCTTTAGCGGTGCGGTAATCTGCCCGCAGACCTTCGCCGGTTTCCGACTGCCAGAGCTGCCAGCCTCCGCCAgc < 1:319182/251‑1 (MQ=255) aCGGGTCAGGACAAGGAAGGGGCGTTGAAGGGCATATTTAGCGGTAGTAAGAGCGATTTCACCGTACCAGAGCGGGACGGTGCGCTGATGCGCATCAAAACGCACA‑TCCGCCGCGCTTTGGGTATTCAGCGTG‑AGCAGGGAGCCATCTTCCAGTTGTTGACGGCTGACTGTGCCTTTGGCGGTGCGGTAATCTGTCCGCAGACCTTCGCCGGTTTCCGACTGCCAGAGCTGCCAGCGTCCGCCAGAGCCgg > 1:89823/1‑250 (MQ=255) gggTCAGGACACGGAAGGGGGGTGGCAGGGCACCTTGCGCGGTAGTAATGGCGATTGCCCCGTACCAGAGCCGGACGGTGCGCGGAGGCGCATCAAAACGCACA‑TCCGCCGCGCTTTGGGTATTCAGCGTG‑AGCAGGGAGCCATCTTCCAGTTGTTGACGGCTGACTGTGCCTTTGGCGGTGCGGTAATCTGCCCGCAGACCTTCGCCGGTTTCCGACGGCCAGAGCTGCCAGCCTCCGCCAGCGCCGAGc < 2:83105/251‑1 (MQ=255) tCAGGACACGGAAGGGGCGTTGCAGGGCATCTTTCGCGGTAGTAATGGCGATTTCACCGTACCAGAGCCGGACGGTGCGCTGATGCGCATCAAAACGCACA‑TCCGCCGCGCTTTGGGTATTCAGCGTG‑AGCAGGGAGCCATCTTCCAGTTGTTGACGGCTGACTGTGCCTTTGGCGGTGCGGTAATCTGCCCGCAGACCTTCGCCGGTTTCCGACTGCCAGAGCTGCCAGCCTCCGCCAGCGCCGAGCAAc > 1:71096/1‑251 (MQ=255) gcacGGAAGGGGCGTGGCAGGGCATCTTTCGCGGTAGTAATGGCGCTTGCCCCGTACCAGAGCCGGTCGGTGCGCTGATGCGCATCAAAACCCCCA‑TCCGCCGCGCTTTGGGTATTCAGCGTG‑AGCAGGGAGCCATCTTCCAGTTGTTGACGGCTGACTGTGCCTTTGGCGGTGCGGTAATCTGCCCGCAGACCTTCGCCGGTTTCCGACTGCCAGAGCTGCCAGCCTCCGCCAGCGCCGAGCAAcagcag < 2:76603/250‑1 (MQ=255) gggggCGTTGCAGGGCTGCTTCCGCGTTCGTAAGGGCGATTTCACCGTACCGGAGCCGGACGGTGCGATGGTGCCCATCAAAACTCCCA‑TCCGCCGCGCTTTGGGTATTCAGCGTG‑AGCAGGGAGCCATCTTCCAGTTGTTGACGGCTGACTGTGCCTGTGGCGGGGCGGTAATCTGCGCGCAGACCTGCGCCGGTTTCCGACTTCCAGAGCTGCCAGCCTCCGCCAGCGCCGAGCAACAGCAGTAATCCt < 2:271641/250‑1 (MQ=255) ggggCGTTGCAGGGCATCTTTCGCGGCAGTAATGGCGATTTCACCGTACCAGAGCCGGACGGTGCGCTGATGCGCATCAAAACGCACA‑TCCGCCGCGCTTTGGGTATTCAGCGTG‑AGCAGGGAGCCATCTTCCAGTTGTTGACGGCTGACTGTGCCTTTGGCGGAGCGGTAATCTGCCCGCAGACCTTCGCCGGTTTCCGCCTGCCAGAGCTGCCAGCCTCCGCCAGCGCCGAGCAACCGCAGTAATCCtt > 2:192221/1‑251 (MQ=255) ttGCAGGGCATCTTTCGCGGTAGTAATGGCGATTTCACCGTACCAGAGCCGGACGGTGCGCTGATGCGCATCAAAACGCACA‑TCCGCCGCGCTTTGGGTATTCAGCGTG‑AGCAGGGAGCCATCTTCCAGTTGTTGACGGCTGACTGTGCCTTTGGCGGTGCGGTAATCTGCCCGCAGACCTTCGCCGGTTTCCGACTGCCAGAGCTGCCAGCCTCCGCCAGCGCCGAGCAACAGCAGTAATCCTTtcatcc > 1:252550/1‑250 (MQ=255) tGCAGGGCATCTTTCGCGGTAGTAATGGCGATTTCACCGTACCAGAGCCGGACGGTGCGCTGATGCGCATCAAAACGCACA‑TCCGCCGCGCTTTGGGTATTCAGCGTG‑AGCAGGGAGCCATCTTCCAGTTGTTGACGGCTGACTGTGCCTTTGGCGGTGCGGTAATCTGCCCGCAGACCTTCGCCGGTTTCCGACTGCCAGAGCTGCCAGCCTCCGCCAGCGCCGAGCAACAGCAGTAATCCTTTCATCAc > 1:83205/1‑251 (MQ=255) ggCAGGGCACCTGTCGGGGTAGTAATGGCGATTTCCCCGTACCAGAGCCGGACGGTGCGCTGATGCGCATCAAAACGCACA‑TCCGCCTCGCTTTGGGTATTCAGCGTG‑AGCAGGGAGCCATCTTCCAGTTGTTGACGGCTGACTGTGCCTTTGGCGGTGCGGTAATCTGCCCGCAGTCCTTCGCCGGTTTCCGACTGCCATAGCGGCCAGCCTCCGCCAGCGCCGAGCAACAGCAGTAATCCTTTCATCAc < 2:369587/250‑1 (MQ=255) ggggCATCTTTCGCGGTAGTAATGGCGATTTCCCCGTCCCAGGGCCGGACGTTGCGCTGATGCGCATCAAAACGC‑CACTCCGCCGCTCTTTGGGTATTCAGCGTG‑AGCAGGGAGCCATCTTCCAGTTGTTGACGGCTGACTGTTCCTGTGGCGGTTCGGTAATCTGCCCGCAGACCTTCGCCGGTTTCCGACTGCCAGAGCTGCCAGCCTCCGCCAGCGCCGAGCAACAGCAGTAATCCTTTCATCACGTg < 2:51631/250‑1 (MQ=255) cactttccgcgGTAGTAAGGGCGTTTTCCCCTGACCAGAGTCGGACGTGGCGCTGATGCGCATCACAACTCACA‑TCCGCCGCGCTTTGGGGATTCAGCGTG‑AGCAGGGAGTCATCTTCCAGTTGTGGACGGCTGACTGTGCCTTTGGCGGTGCGGTAATCTGCCCGCAGACCTGCGCCGGTTTCCGACTGCCAGTGCTGCCATCCTCCGCCATCGCCGAGCAACAGCAGTAATCCTTTCATCGCGTGAcgg < 2:277247/244‑1 (MQ=255) ttCGCGGTAGTAATGGCGATTTCACCGTACCAGAGCCGGACGGTGCGCTGATGCGCATCAAAACGCACA‑TCCGCCGCGCTTTGGGTATTCAGCGTG‑AGCAGGGAGCCATCTTCCAGTTGTTGACGGCTGACTGTGCCTTTGGCGGTGCGGTAATCTGCCCGCAGACCTTCGCCGGTTTCCGACTGCCAGAGCTGCCAGCCTCCGCCAGCGCCGAGCAACAGCAGTAATCCTTTCATCACGTGAcggc < 1:398387/247‑1 (MQ=255) aaTGGCGATTTCACCGTACCAGAGCCGGACGGTGCGCTGATGCGCATCAAAACGCACA‑TCCGCCGCGCTTTGGGTATTCAGCGTG‑AGCAGGGAGCCATCTTCCAGTTGTTGACGGCTGACTGTGCCTTTGGCGGTGCGGTAATCTGCCCGCAGACCTTCGCCGGTTTCCGACTGCCAGAGCTGCCAGCCTCCGCCAGCGCCGAGCAACAGCAGTAATCCTTTCATCACGTGACGGCGGGTGAGGCGGGTa < 1:168171/250‑1 (MQ=255) aTGGCGATTTCACCGTACCAGAGCCGGACGGTGCGCTGATGCGCATCAAAACGCACA‑TCCGCCGCGCTTTGGGTATTCGGCGTG‑AGCAGGGAGCCATCTTCCAGTTGTTGACGGCTGACTGTGCCTTTGGCGGTGCGGTAATCTGCCCGCAGACCTTCGCCGGTTTCCGACTGCCAGAGCTGCCAGCCTCCGCCAGCGCCGAGCAACAGCAGTAATCCTTTCATCACGTGACGGCGGGTGAGGCGGGTATc < 1:5251/251‑1 (MQ=255) tGGCGATTTCACCGTACCAGAGACGGACTGGGCGCTGATGCGCATCAAAGCGCACA‑TCCGCCGAGCTTTGGGTATTCAGCGTG‑AGCAGGGAGCCATCTTACAGTTGTTGACGGCTGACTGTGCCTTTGGCGGGGCGGTAATCTGCCCGCAGACCTTCGCCGGATTCCGACTGCCAGAGCTGCCAGACTCCGCCAGCTCCGAGCACCAGCACGCATCCTTTCATCACGTggcggcacggtaggtcggggatg > 2:16972/1‑234 (MQ=255) gggCGATTTCACCGTACCAGAGCCGGACGGTGCGCTGATGCGCATCAAAACGCCCA‑TCCGCCGCGCTTTGGGTATTCAGCGTG‑AGCAGGGAGCCATCTTCCAGTTGTTGACGGCTGACTGTGCCTTTGGCGGTGCGGTAATCTGCCCGCAGACCTTCGCCGGTTTCCGACTGCCAGAGCTGCCAGCCTCCGCCAGCGCCGAGCAACAGCAGTAATCCTTTCATCACGTGACGGCGGGTGAGGCGGGTATCg < 2:207574/250‑1 (MQ=255) gATTTCACCGTACCAGGGCCGGACGGTGCGATGATGCGCATCAAAACGCACA‑TCCGCCGCGCTTTGGGTATTCAGCGTG‑AGCAGGGAGCCATCTTCCAGTTGTTGACGGCTGACTGTGCCTTTGGCGGTGCGGTAATCTGCCCGCAGACCTTCGCCGGTTTCCGACTGCCAGAGCTGCCAGCCTCCGCCAGCGCCGAGCAACAGCAGTAATCCTTTCATCACGTGACGGCGGGTGAGGCGGGTATCGTGCa < 1:246737/251‑1 (MQ=255) ccccGTACCAGAGCCGGACGGTGCGCTGATGCGCATCAAAACGCACA‑TCCGCCGCGCTTTGGGTATTCAGCGTG‑AGCAGGGAGCCATCTTCCAGTTGTTGACGGCTGACTGTGCCTTTGGCGGTGCGGTAATCTGCCCGCAGACCTTCGCCGGTTTCCGACTGCCAGAGCTGCCAGCCTCCGCCAGCGCCGAGCAACAGCAGTAATCCTTTCATCACGTGACGGCGGGTGAGGCGGGTATCGTGCAACGc < 1:261956/248‑1 (MQ=255) ccGTCCCAGCGCCGGACGGTGCGCTGATGCGCATCAAAACGCACA‑TCCGCCGCGCTTTGGGTATTCAGCGTG‑AGCAGGGAGCCATCTTCCAGTTGTTGACGGCTGACTGTGCCTTTGGCGGTGCGGTAATCTGCCCGCAGACCTTCGCCGGTTTCCGACTGCCAGAGCTGCCAGCCTCCGCCAGCGCCGAGCAACAGCAGTAATCCTTTCATCACGTTACGGCGGGTGAGGCGGGTATTGTGCAACGCCCg < 1:327005/251‑1 (MQ=255) ccaggCCGGACGGCGCCCTGATCCGAAGCAAACCGCACA‑CCCGCCGCGCTTTGTGTATTCAGCGTG‑ATCATGGAGCCATCTTCCAGTTGTTGACGGCTGACTGTGCCTTTGGCGGTGCGGTAATCTGCCCGCAGACCTTCGCCGGTTTCCGACTGCCAGAGCTTCCAGCCTCCGCCAGCGCCGAGCAACAGCAGTAATCCTTTCATCACGTCACGGCGGGTGAGGCGGGTATCGTGCAACGCCCGGCTGGc < 2:231834/247‑1 (MQ=255) agagCCGGACGGTGCGCTGATGCGCATCAAAACGCACA‑TCCGCCGCGCTTTGGGTATTCAGCGTG‑AGCAGGGAGCCATCTTCCAGTTGCTGACGGCTGACTGTGCCTTTGGCGGTGCGGTAATCTGCCCGCAGACCTTCGCCGGTTTCCGACTGCCAGAGCTGCCAGCCTCCGCCAGCGCCGAGCAACAGCAGTAATCCTTTCATCACGTGACGGCGGGTGAGGCGGGTATCGTGCAACGCCCGGCTGGCa < 1:256810/251‑1 (MQ=255) agagCCGAGCGGTGCGGTGAGGCGCAGCAAACCGCGCA‑TCCGCCGCGCTGTGGGTATTCAGCGGG‑AGCGGGGATCCATCTTCCAGGTGTTGACGGCGGACGTTGCCTTTGGCGGTGCGGTAATCTGCCCGCAGACCTTCGCCGGTTTCCGACTGCCAGAGCGGCCAGCCTCCGGCAGCGCCGAGCAACAGCAGTAATCCGTGCATCACATGACGGCGGGTGAGGCGGGTATCTTGCAACGCCCGGCTGGCa < 2:158627/251‑1 (MQ=255) agagCAGGACGGTGCGCTGATGCGCCTCAAAACGCACA‑TCCGCCGCGCTTTGGGTATTCAGCGTG‑AGCAGGGAGCCATCTTCCAGTTGTTGACGGCTGACTGTGCCTTTGGCGGTGCGGTAATCTGCCCGCAGACCTTCGCCGGTTTCCGACTGCCAGAGCTGCCAGCCTCCGCCAGCGCCGAGCAACAGCAGTAATCCTTTCATCACGTGACGGCGGGGGAGGCgggaagcgggggaccacacgccgggc > 2:66596/1‑228 (MQ=255) cGGACGGTGCGCTGATGCGCATCAAAACGCACA‑TCCGCCGCGCTTTGGGTATTCAGCGTG‑AGCAGGGAGCCATCTTCCAGTTGTTGACGGCTGACTGTGCCTTTGGCGGTGCGGTAATCTGCCCGCAGACCTTCGCCGGTTTCCGACTGCCAGAGCTGCCAGCCTCCGCCAGCGCCGAGCAACAGCAGTAATCCTTTCATCACGTGACGGCGGGTGAGGCGGGTATCGTGCAACGCCCGGCTGGCAACGTc < 1:364853/251‑1 (MQ=255) cgcTGATGCGCATCAAAACGCACA‑TCCGCCGCGCTTTGGGTATTCAGCGTG‑AGCAGGGAGCCATCTTCCAGTTGTTGACGGCTGACTGTGCCTTTGGCGGTGCGGTAATCTGCCCGCAGACCTTCGCCGGTTTCCGACTGCCAGAGCTGCCAGCCTCCGCCAGCGCCGAGCAACAGCAGTAATCCTTTCATCACGTGACGGCGGGTGAGGCGGGTATCGTGCAACGCCCGGCTGGCAACGTCGCCAGGcac < 1:20883/251‑1 (MQ=255) aaaccGCACA‑TCCGCCGCGCTTTGGGTATTCAGCGTG‑AGCAGGGAGCCATCTTCCAGTGGTTGACGGCTGACTGTGCCTTTGGCGGTGCGGTAATCTGCCCGCGGACCTTCGCCGGTTTCCGACTGCCAGAGCTGCCAGCCTCCGCCAGCGCCGAGCAACAGCAGTAATCCTTTCATCACGTGACGGCGGGTGAGGCGGGTAGCGTGCAACGCCCGGCTGGCAACCTCGCCAGGCTCACCGCCAAGCTGGt < 2:398748/247‑1 (MQ=255) gcTTGGGGTATTCAGCGTG‑AGCAGGGAGCCATCTTCCAGTTGTTGACGGCTGACTGTGCCTTTGGCGGTGCGGTAATCTGCCCGCAGACCTTCGCCGGTTTCCGACTGCCAGAGCTGCCAGCCTCCGCCAGCGCCGAGCAACAGCAGTAATCCTTTCATCACGTGACGGCGGGTGAGGCGGGTATCGTGCAACGCCCGGCTGGCAACGTCGCCAGGCACACCGCCAAGCTGGTTGCGCAGGTTTTCAACct < 2:239065/251‑1 (MQ=255) tGGGTATTCAGC‑TGTAGCTGTGAGCCAGTTTCCAGTTTTTGACGGCGGACTGTGCCCTTGGCGGGGCGGTAACCTGCCCGCAGACCTTCGCCGGTTGCCGACTGCCAGAGCGGCTAGCCTCCGCCAGCGCCGAGCAACAGCAGTAATCCTTTTATCACGTGACGGCGGGGGAGTCGGGTATCGTGCAACGCCCGGCTGGCAACGTCGCCAGGCACACGGCCAAGCTGGTTTCGCAGGTTTTccacaggct < 2:129898/250‑9 (MQ=255) gggTATTCAGCGTG‑AGCAGGGAGCCATCTTCCAGTTGTTGACGGCTGACTGTGCCTTTGGCGGTGCGGTAATCTGCCCGCAGACCTTCGCCGGTTTCCGACTGCCAGAGCTGCCAGCCTCCGCCAGCGCCGAGCAACAGCAGTAATCCTTTCATCACGTGACGGCGGGTGAGGCGGGTATCGTGCAACGCCCGGCTGGCAACGTCGCCAGGCACACCGCCAAGCTGGTTGCGCAGGTTTTCAACctgctg < 1:139596/250‑1 (MQ=255) gggTATTCAGCGTG‑AGCAGGGAGCCATCTTCCAGTTGTTGACGGCTGACTGTGCCTTTGGCGGTGCGGTAATCTGCCCGCAGACCTTCGCCGGTTTCCGACTGCCAGAGCTGCCAGCCTCCGCCAGCGCCGAGCAACAGCAGTAATCCTTTCATCACGTGACGGCGGGTGAGGCGGGTATCGTGCAACGCCCGGCTGGCAACGTCGCCAGGCACACCGCCAAGCTGGTTGCGCAGGTTTTCAACctgctg < 1:104559/250‑1 (MQ=255) ccTTCCAGTTGTTGTCGGCTGACTGTGCCGTTGGCGGTGCGGTATGCTGCCCGCCGTCCTTCGCCGGTTTCCGACTGCCAGAGTTGCCAGTCCCGGCCAGCGTCGAGCAACAGCAGTAATCCTTTCATCACGTGACGGCGGGTGAGGCGGGTATCGTGCAACGCCCGGCTTGCAACGTGCCCAGGCACTCCGCCAATCTGTTTGCTCATGTTTTCAACCTGCTGCCTGTCCCTCTGGTTatcctgatcct < 2:227471/249‑1 (MQ=255) acAGTTGTTGGCGGCTGTCTGTGCCGTTGGCGGTGCGGTAATCTGCCCCGAGTCCTTCGCCTGTTTCCGTCTGCCCGAGCTGCCAGCCCCCGCCAGCGCAGCGCAACAGCAGTAATCCTTTCATCACGTGACGGCGGGTGAGGCGGTTATCGGGCAACGCCCGGCTGGCAACTTCGCCAGGCTCACCGTTTAGTTGGTTGCGCAGGTTTTCAGCCTGCTGCCAGGCCCACTGGTTATTTTGATCCTGTTc < 2:388427/249‑1 (MQ=255) | TCCACAGCGTGCTGCTGCACGTCAAGCTGCGTGAAATTATCCTGCTGGCGGACGGTAAATTCTGTCCCTAAAGCAGTGAGCTGGCCCTGACGGGTCAGGACACGGAAGGGGCGTTGCAGGGCATCTTTCGCGGTAGTAATGGCGATTTCACCGTACCAGAGCCGGACGGTGCGCTGATGCGCATCAAAACGCACA‑TCCGCCGCGCTTTGGGTATTCAGCGTG‑AGCAGGGAGCCATCTTCCAGTTGCTGACGGCTGACTGTGCCTTTGGCGGTGCGGTAATCTGCCCGCAGACCTTCGCCGGTTTCCGACTGCCAGAGCTGCCAGCCTCCGCCAGCGCCGAGCAACAGCAGTAATCCTTTCATCACGTGACGGCGGGTGAGGCGGGTATCGTGCAACGCCCGGCTGGCAACGTCGCCAGGCACACCGCCAAGCTGGTTGCGCAGGTTTTCAACCTGCTGCCAGGCCCACTGGTTATCCTGATCCTGTTC > NC_000913/4517110‑4517597 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |