| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 249545 | 47 (1.240) | 33 (0.890) | 32/474 | 0.2 | 38.5% | intergenic (+1411/‑1353) | rayT/dinB | REP‑associated tyrosine transposase/DNA polymerase IV |
| ? | NC_000913 | 373870 = | 60 (1.630) | coding (950/951 nt) coding (3/1014 nt) |
mhpF mhpE |
acetaldehyde dehydrogenase (acetylating) MhpF 4‑hydroxy‑2‑oxovalerate aldolase |
|||||
GCTGGGTGAGCGGGTTACCCTGTGCTTTGTCCACCAGCGCCACCAGTTTG‑TAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGG‑CATTCCCGGTACCACCGCCAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCAC‑CGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTACGCACGTCATGGGCGATATCGCCGTTGTCGCTGACGCG‑GGTGACGATAATCGCCGCCGCGGTGGAGAGCAGCAGGGAAGGGATCTGCGCCACCAGGCCGTCGCCGATGGTCATCAGCACATACTGCTGGAAGGCAGCATCGGCGCTCAGGTTGTATTTGAAGATCCCGATAC > NC_000913/249299‑249793 | gcggggttaGCGGTTTACCCTGTGCTGTGCCCCCCAGCGCCACCA‑TTTGTTAACCGAGGTTTAAACTGATAGGCGCGATCGGCGTAATGGTTTCCCAACTACCCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGGTGGTGCGGTTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCGGCCTGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGG‑CATgaac < 2:283312‑M1/248‑5 (MQ=255) tGAGCGGGTTACCCTGTGCTTTGTCCACCAGCGCCACCAGTTTG‑TAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGG‑CATTCCCGGTacc > 1:116077/1‑251 (MQ=255) gAGCGGGTTACCCTGTGCTTTGTCCACCAGCGCCACCAGTTTG‑TAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGG‑GATTCCCGGTacc > 2:288031/1‑250 (MQ=255) cGGGTTACCCTGTGCTTTGTCCACCAGCGCCACCAGTTTG‑TAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGGGCGG‑CATTCCCGGTACCACCg > 1:374970/1‑251 (MQ=255) cGGGTTACCCTGTGCTTTGTCCAACAGCGCCACCAGTTTG‑TAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGGGCGG‑CATgaacgggaaaaaac > 1:109257‑M1/1‑237 (MQ=255) aCCCTGTGCTTTGTCCACCAGCGCCACCAGTTTG‑TAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGG‑CATgaacggtaaaaaactttata < 1:224874‑M1/251‑21 (MQ=255) gTCCACCAGCGCCACCAGTTTG‑TAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGGGCGG‑GATgaacgggtaaaaaattttaatctcgcacgttc > 2:76879‑M1/1‑219 (MQ=255) accaGCGCCACCAGTTTG‑TAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGG‑CATgaacggtaaaaaactttatatctcggacgtcacatt < 1:372978‑M1/251‑37 (MQ=255) accaGCGCCACCAGTTTG‑TAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGG‑CATTCCCGGTACCCCCGCCAGCACGAACATAATCCCggg > 1:45355/1‑250 (MQ=255) accaGCGCCACCAGTTTG‑TAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGGGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCCAAAACGGCAGGTGCGG‑CAGgaagcggaaaaaaatttatatcccggacgtaacatt > 2:252256‑M1/1‑215 (MQ=255) 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cGGCAGGTGCGG‑CATTCCCGGTAACACCGCCAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCAC‑CGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTACGCACGTCATGGGCGATATCGCCGTTGTCGCTGACGCG‑GGTGACGATAATCGCCGCCGCGGTGGAGAGCAGCAGGGAAGGGATCTGCGCCACCAGGCCGTCGCCGATGGTCATCAGCACATACTGCTGGAAGGCAGCATCGGCGCTCAGGTTGTATTTg > 1:115970/1‑250 (MQ=255) gCAGGTGCGG‑CATgaacggtaaaaaactttatatctcggacgtcacattgcgtgacggtatgcacgccattcgtcatcagtattcgctggaaaacgttcgccagattgccaaagcactggacgatgcccgcgtggattcgattgaagtggcccacggcgacggtttgcaaggttccagctttaactatggtttcggcgcacatagcgaccttgaatggattgaagcggcggcggatgtggtgaagcacgcc < 2:295347‑M1/251‑239 (MQ=255) aTTCCCGGAACAACCGCCAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCAC‑CGACGGGCTTGCAAGCAGCTGGTTACGAACGTCATCGGCGATATCGCCGTTGTCGCTGACGCC‑GGTGACGATAATCGCCGCCGCGGTGGAGAGCAGCAGGGAAGGGATATGCGCCACCAGGCCGTCGCCGAAGGTCATCAGCACATACTGCTGGCAGGCAGCATCGGCGCTCAGGTTGTATTTGAAGATCCCGATAc > 2:201021/1‑250 (MQ=255) | GCTGGGTGAGCGGGTTACCCTGTGCTTTGTCCACCAGCGCCACCAGTTTG‑TAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGG‑CATTCCCGGTACCACCGCCAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCAC‑CGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTACGCACGTCATGGGCGATATCGCCGTTGTCGCTGACGCG‑GGTGACGATAATCGCCGCCGCGGTGGAGAGCAGCAGGGAAGGGATCTGCGCCACCAGGCCGTCGCCGATGGTCATCAGCACATACTGCTGGAAGGCAGCATCGGCGCTCAGGTTGTATTTGAAGATCCCGATAC > NC_000913/249299‑249793 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |