| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,487,022 | C→T | R269C (CGT→TGT) | lptF → | lipopolysaccharide transport system protein LptF |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,487,022 | 0 | C | T | 98.8% | 257.4 / ‑5.2 | 82 | R269C (CGT→TGT) | lptF | lipopolysaccharide transport system protein LptF |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base T (35/46); total (35/47) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.03e-01 | |||||||||||
GTGGTGGCCGATTCCGGACATTTAACCCAGCTGCGCGACGGCTCCCAGGTCGTCACTCTCAACCAGGGAACGCGCTTCGAAGGCACTGCATTGTTACGTGATTTCCGCATTACGGACTTCCAGGATTATCAGGCGATCATTGGTCACCAGGCGGTGGCGCTCGACCCGAACGATACCGACCAGATGGACATGCGCACATTGTGGAACACTGACACCGATCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGCGTATCACGTTGGTATTCACCGTGTTTATGATGGCACTTATGGTCGTACCGCTGAGCGTGGTTAACCCACGTCAGGGACGCGTACTGTCGATGCTGCCAGCCATGCTGCTGTATCTACTTTTCTTCCTGATCCAGACCTCCCTGAAATCGAACGGCGGTAAAGGTAAGCTGGACCCGACGCTGTGGATGTGGACCGTTAACCTGATTTATCTGGCTTTAGCGATTGTTCTCAACCTT > NC_000913/4486779‑4487258 | gtggtggCCGATTCCGGACATTTAACCCAGCTGCGCGACGGCTCCCAGGTCGTCACTCTCAACCAGGGAACGCGCTTCGAAGGCACTGCAATGTTACGTGATTTCCGCATTACGGACTTCCAGGATTATCAGGCGATCATTGGTCACCAGGCGGTGGCGCTCGACCCGAACGATACCGACCAGATGGACATGCGCACATTGTGGAACACTGACACCGATCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGTGTATCAc < 1:363579/251‑1 (MQ=255) gATTCCGGACATTTAACCCAGCTGCGCGACGGCTCCCAGGTCGTCACTCTCAACCAGGGAACGCGCTTCGAAGGCACTGCAATGTTACGTGATTTCCGCATTACGGACTTCCAGGATTATCAGGCGATCATTGGTCACCAGGCGGTGGCGCTCGACCCGAACGATACCGACCATATGGACATGCGCACATTGTGGAACACTGACACCGATCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGTGTATCACGTTGGTAtt < 1:427104/251‑1 (MQ=255) tCCGGACATTTAACCCAGCTGCGCGACGGCTCCCAGGTCGTCACTCTCAACCAGGGAACGCGCTTCGAAGGCACTGCAATGTTACGTGATTTCCGCATTACGGACTTCCAGGATTATCAGGCGATCATTGGTCACCAGGCGGTGGCGCTCGACCCGAACGATACCGACCAGATGGACATGCGCACATTGTGGAACACTGACACCGATCGTGCTCGCGCAGCACTGAACTGGTGTATCACGTTGGTATTCAc > 2:2412/1‑251 (MQ=255) cATTTAACCCAGCTTCGCGACGGCGCCCAGGTCGTCACTCTCAACCAGGGAACGCGCTTCGAAGGCACTGCAATGTTACGTGATTTCCGCATTACGGACTTCCAGGATTATCAGGCGATCATTGGTCACCAGGCGGTGGCGCTCGACCCGAACGATACCGACCAGATGGACATGCGCACATTGTGGAACACTGACACCGATCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGTTTATGAGGTTGGTATTGACCGTGtt < 2:324338/251‑1 (MQ=255) cATTTAACCCAGCTGCGCGACGGCTCCCAGGTCGTCACTCTCAACCAGGGAACGCGCTTCGAAGGCACTGCAATGTTACGTGATTTCCGCATTACGGACTTCCAGGATTATCAGGCGATCATTGGTCACCAGGCGGTGGCGCTCGACCCGAACGATACCGACCAGATGGACATGCGCACATTGTGGAACACTGACACCGATCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGTGTATCACGTTGGTATTCACCGTGtt < 2:132408/251‑1 (MQ=255) cAGCTGAGCGACGGCTCCCAGGTCGGCACTCTCAAACAGGGAACGCGCTGCGAAGGCACTGCAATGTTACGTGATTTCCGCATTACGGACTTCCAGGATTATCAGGCGATCATTGGTCACCAGGCGGTGGCGCTCGACACGAACGATACCGACCAGATGGACATGCGCACATTGTGGAACACTGACACCGATCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGTGTATCACGTTGGTATTCACCGTGTTTATGATGGc > 2:61758/1‑251 (MQ=255) gCTGCGCGACGGCTCCCAGGTCGTCACTCTCAACCAGGGAACGCGCTTCGAAGGCACTGCAATGTTACTTGATTTCCGCATTACGGACTTCCAGGATTATCAGGCGATCATTGGTCACCAGGCGGTGGCGCTCGACCCGAACGATACCGACCAGATGGACATGCGCACATTGTGGAACACTGACACCGATCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGTGTATCACGTTGTTATTCACCGTGTTTATGATGGCAc < 2:396786/251‑1 (MQ=255) gcgcGACGGCTCCCAGGTCGTCACTCTCAACCAGGGAACGCGCTTCGAAGGCACTGCAATGTTACGTGATTTCCGCATTACGGACTTCCAGGATTATCAGGCGATCATTGGTCACCAGGCGGTGGCGCTCGACCCGAACGATACCGACCAGATGGACATGCGCACATTGTGGAACACTGACACCGATCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGTGTATCACGTTGGTATTCACCGTGTTTATGATGGCACTTa < 2:41994/251‑1 (MQ=255) gACGGCTCCCAGGTCGTCACTCTCCACCAGGGAACGCGCTTCGAAGGCACTGCAATGTTACGTGATTTCCGCATTACGGACTTCCAGGATTATCAGGCGATCATTGGTCACCAGGCGGTGGCGCTCGACCCGAACGATACCGACCAGATGGACATGCGCACATTGTGGAACACTGACACCGATCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGTGTATCACGTTGGTATTCACCGTGTTTATGATGGCACTTATGGt > 2:178490/1‑251 (MQ=255) gACGGCTCACAGGTCGTCACTCTCAACCAGGGAACGCGCTTAGAAGGCACTGCAATGTTACGTGCTTTCCGCATTACGGACTTCCAGGATTATCAGGCGATCATTGGTCACCAGGCGGTGGCGCTCGACCCGAACGATACCGACCAGATGGACATGCGCACATTGTGGAACACTGACACCGCTCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGTGTATCACGTTGGTATTCACCGTGTTTATGATGGCACTTATGGt > 2:433342/1‑251 (MQ=255) tCCCAGGTCGTCACTCTCAACCAGGGAACGCGCTTCGAAGGCACTGCAATGTTACGTGATTTCCGCATTACGGACTTCCAGGATTATCAGGCGATCATTGGTCACCAGGCGGTGGCGCTCGACCCGAACGATACCGACCAGATGGACATGCGCACATTGTGGAACACTGACACCGATCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGTGTATCACGTTGGTATTCACCGTGTTTATGATGGCACTTATGGTCGTAcc > 1:93914/1‑251 (MQ=255) aGGTCGTCACTCTCAACCAGGGAACGCGCTTCGAAGGCACTGCAATGTTACGTGATTTCCGCATTACGGACTTCCAGGATTATCAGGCGATCATTGGTCACCAGGCGGTGGCGCTCGACCCGAACGATACCGACCAGATGGACATGCGCACATTGTGGAACACTGACACCGATCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGTGTATCACGTTGGTATTCACCGTGTTTATGATGGCACTTATGGTCGTACCGCTg > 2:159983/1‑251 (MQ=255) aGGTCGTCACTCTCAACCAGGGAACGCGCTTCGAAGGCACTGCAATGTTACGTGATTTCCGCATTACGGACTTCCAGGATTATCAGGCGATCATTGGTCACCAGGCGGTGGCGCTCGACCCGAACGATACCGACCAGATGGACATGCGCACATTGTGGAACACTGACACCGATCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGTGTATCACGTTGGTATTCACCGTGTTTATGATGGCACTTATGGTCGTACCGCTg < 1:289663/251‑1 (MQ=255) gtcgtcACTCTCAACCAGGGAACGCGCTTCGAAGGCACTGCAATGTTACGTGATTTCCGCATTACGGACTTCCAGGATTATCAGGCGATCATTGGTCACCAGGCGGTGGCGCTCGACCCGAACGATACCGACCAGATGGACATGCGCACATTGTGGAACACTGACACCGATCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGTGTATCACGTTGGTATTCACCGTGTTTATGATGGCACTTATGGTCGTACCGCTGAg < 1:452856/251‑1 (MQ=255) ctcAACCAGGGAACGCGCTTCGAAGGCACTGCAATGTTACGTGATTTCCGCATTACGGACTTCCAGGATTATCAGGCGATCATTGGTCACCAGGCGGTGGCGCTCGACCCGAACGATACCGACCAGATGGACATGCGCACATTGTGGAACACTGACACCGATCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGTGTATCACGTTGGTATTCACCGTGTTTATGATGGCACTTATGGTCGTACCGCTGAGCGTGGTTa > 1:91879/1‑250 (MQ=255) cAACCAGGGAACGCGCTTCGAAGGCACTGCAATGTTACGTGATTTCCGCATTACGGACTTCCAGGATTATCAGGCGATCATTGGTCACCAGGCGGTGGCGCTCGACCCGAACGATACCGACCAGATGGACATGCGCACATTGTGGAACACTGACACCGATCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGTGTATCACGTTGGTATTCACCGTGTTTATGATGGCACTTATGGTCGTACCGCTGAGCGTGGTTAAcc > 1:17180/1‑251 (MQ=255) aCCAGGGAACGCGCTTCGAAGGCACTGCAATGTTACGTGATTTCCGCATTACGGACTTCCAGGATTATCAGGCGATCATTGGTCACCAGGCGGTGGCGCTCGACCCGAACGATACCGACCAGATGGACATGCGCACATTGTGGAACACTGACACCGATCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGTGTATCACGTTGGTATTCACCGTGTTTATGATGGCACTTATGGTCGTACCGCTGAGCGTGGTTAAccc > 1:319420/1‑250 (MQ=255) cAGGGAACGCGCTTCGAAGGCACTGCAATGTTACGTGATTTCCGCATTACGGACTTCCAGGATTATCAGGCGATCATTGGTCACCAGGCGGTGGCGCTCGACCCGAACGATACCGACCAGATGGACATGCGCACATTGTGGAACACTGACCCCGATCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGTGTATCACGTTGGTATTCACCGTGTTTATGATGGCACTTATGGTCGTACCGCTGAGCGTGGTTAACCCACg < 1:430075/251‑1 (MQ=255) ttCGAAGGCACTGCAATGTTACGTGATTTCCGCATTACGGACTTCCAGGATTATCAGGCGATCATTGGTCACCAGGCGGTGGCGCTCGACCCGAACGATACCGACCAGATGGACATGCGCACATTGTGGAACACTGACACCGATCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGTGTATCACGTTGGTATTCACCGTGTTTATGATGGCACTTATGGTCGTACCGCTGAGCGTGGTTAACCCACGTCAGGGACGCGt > 1:205685/1‑251 (MQ=255) cGAAGGCACTGCAATGTTACGTGATTTCCGCATTACGGACTTCCAGGATTATCAGGCGATCATTGGTCACCAGGCGGTGGCGCTCGACCCGAACGATACCGACCAGATGGACATGCGCACATTGTGGAACACTGACACCGATCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGTGTATCACGTTGGTATTCACCGTGTTTATGATGGCACTTATGGTCGTACCGCTGAGCGTGGTTAACCCACGTCAGGGACGCGTAc < 2:359098/251‑1 (MQ=255) aaGGCACTGCAATGTTACGTGATTTCCGCATTACGGACTTCCAGGATTATCAGGCGATCATTGGTCACCAGGCGGTGGCGATCGACCCGAACGATACCGACCAGATGGCCATGCGCACATTGTGGAACACTGACACCGATCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGTGTATCACGTTGGTATTCACCGTGTTTATGATGGCACTTATGGTCGTACCGCTGAGCGTGGTTAACCCACGTCAGGGACGCGTACTg > 1:392501/1‑251 (MQ=255) aaGGCACTGCAATGGTACGTGATTTCCGCATTACGGACTTCCAGGATTATCAGGCGATCATTGGTCACCAGGCGGTGGCGCTCGACCCGAACGATACCGACCAGATGGACATGCGCACATTGTGGAACACTGACACCGATCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGTGTATCACGTTGGTATTCACCGTGTTTATGATGGCACTTATGGTCGTACCGCTGAGCGTGGTTAACCCACGTCAGGGACGCGTACTg < 2:214493/251‑1 (MQ=255) aCTGCAATGTTACGTGATTTCCGCATTACGGACTTCCAGGATTATCAGGCGATCATTGGTCACCAGGCGGTGGCGCTCGACCCGAACGATACCGACCAGATGGACATGCGCACATTGTGGAACACTGACACCGATCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGTGTATCACGTTGGTATTCACCGTGTTTATGATGGCACTTATGGTCGTACCGCTGAGCGTGGTTAACCCACGTCAGGGACGCGTACTGTCGAt < 1:101276/251‑1 (MQ=255) aCTGCAATGTTACGTGATTTCCGCATTACGGACTTCCAGGATTATCAGGCGATCATTGGTCACCAGGCGGTGGCGCTCGACCCGAACGATACCGACCAGATGGACATGCGCACATTGTGGAACACTGACACCGATCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGTGTATCACGTTGGTATTCACCGTGTTTATGATGGCACTTATGGTCGTACCGCTGAGCGTGGTTAACCCACGTCAGGGACGCGTACTGTCGAt < 2:346297/251‑1 (MQ=255) tgcaatgatACGTGATTTCCGCATTACGGACTTCCAGGATTATCAGGCGATCATTGGTCACCAGGCGGTGGCGCTCGACCCGAACGATACCGACCAGATGGACATGCGCACATTGTGGAACACTGACACCGATCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGTGTATCCCGTTGGTATTCACCGTGTTTATGATGGCCCTTATGGTCGTACCGCTGAGCGTGGTTAACCCACGTCAGGGACGCGTACTGTCGAtgc > 2:136384/9‑251 (MQ=255) tGCAATGTTACGTGCTTTCCGCATTACGGACTTCCAGGATTATCAGGCGATCATTGGTCACCAGGCGGTGGCGCTCGACCCGAACGATACCGACCAGATGGACATGCGCACATTGTGGAACACTGAAACCGCTCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGTGTATCACGTTGGTATTCACCGAGTTTATGATGGCACTTATGGTCGTACCGCTGAGCGTGGTTAACCCACGTCAGGGACGCGAACTGTAGAtgc > 2:419740/1‑251 (MQ=255) caatGTTACGTGATTTCCGCATTACGGACTTCCAGGATTATCAGGCGATCATTGGTCACCAGGCGGTGGCGCTCGACCCGAACGATACCGACCAGATGGGCATGCGCACATTGTGGAACACTGACACCGATCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGTGTATCACGTTGGTATTCACCGTGTTTATGATGGCACTTATGGTCGTACCGCTGAGCGTGGTTAACCCACGTCAGGGACGCGTACTGTCGAtgctg < 1:193184/248‑1 (MQ=255) tACGTGATTTCCGCATTACGGACTTCCAGGATTATCAGGCGATCATTGGTCACCAGGCGGTGGCGCTCGACCCGAACGATACCGACCAGATGGACATGCGCACATTGTGGAACACTGACACCGATCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGTGTATCACGTTGGTATTCACCGTGTTTATGATGGCACTTATGGTCGTACCGCTGAGCGTGGTTAACCCACGTCAGGGACGCGTACTGTCGATGCTgccagc < 2:26729/250‑1 (MQ=255) tACGTGATTTCCGCATTACGGACTTCCAGGATTATCAGGCGATCAATGGTCACCAGGCGGTGGCGCTCGACCCGAACGATTCCGACCAGATGGACATGCGCACATTGTGGAACACTGACACCGATCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGTGTATCACGTTGGTATTCACCGTGTTTATGATGGCACTTATGGTCGTACCGCTGAGCGTGGTTAACCCACGTCAGGGACGCGTACTGTCGATGCTgccagc < 2:93914/250‑1 (MQ=255) aCGTGATTTCCGCATTACGGACTTCCAGGATTATCAGGCGATCATTGGTCACCAGGCGGTGGCGCTCGACCCGAACGATACCGACCAGATGGACATGCGCACATTGTGGAACACTGACACCGATCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGTGTATCACGTTGGTATTCACCGTGTTTATGATGGCACTTATGGTCGTACCGCTGAGCGTGGTTAACCCACGTCAGGGACGCGTACTGTCGATGCTgccagccc > 2:349092/1‑250 (MQ=255) aCGTGATTTCCGCATTACGGACTACCAGGATTATCAGGCGATCATTGGTCACCAGGCGGTGGCGCTCGACCCGAACGATACCGACCATATGGACATGCGCACATTGTGGAACACTGACACCGAGCGTGCTCGCGCAGATCTGAACTGGTGTATCACGTTGCTAGTCACCGTGTTTATGATGGCACTTATGGTCGTACCGCTGAGCGTGGTTAACCCACGGCAGGTACGCGTACTGGCGATGCTgccagcc < 2:83510/250‑1 (MQ=255) gTGATTTCCGCATTACGGACTTCCAGGATTATCAGGCGATCATTGGTCACCAGGCGGTGGCGCTCGACCCGAACGATACCGACCAGATGGACATGCGCACATTGTGGAACACTGACACCGATCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGTGTATCACGTTGGTATTCACCGTGTTTATGATGGCACTTATGGTCGTACCGCTGAGCGTGGTTAACCCACGTCAGGGACGCGTACTGTCGATGCTGCCAGCCAtg < 1:214283/251‑1 (MQ=255) gATTTCCGCATTACGGACTTCCAGGATTATCATGCGATCATTGTTCACCAGGCGGTTGCGCTCGACCCGAACGATACCGACTAGATGGACATGCGCACATTGTGGAACACTGACACCGATCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGTGTATCTCGTTGGTATTCACCGTGTTTATGGTTGCACTTATGGGCGTACCGCTGAGCGTGGTTAGCCCACGTCTGGGACGCGTGCTGTCGATGCTGCCAGCCAtgc < 2:408882/250‑1 (MQ=255) cGCATTACGGACTTCCAGGATTATCAGGCGATCATTGGTCACCAGGCGGTGGCGCTCGACCCGAACGATACCGACCAGATGGACATGCGCACATTGTGGAACACTGACACCGATCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGTGTATCACGTTGGTATTCACCGTGTTTATGATGGCACTTATGGTCGTACCGCTGAGCGTGGTTAACCCACGTCAGGGACGCGTACTGTCGATGCTGCCAGCCATGCTGCTGt > 1:287785/1‑250 (MQ=255) cATTACGGACTTCCAGGATTATCAGGCGATCATTGGTCACCAGGCGGTGGCGCTCGACCCGAACGATACCGACCAGATGGACATGCGCACATTGTGGAACACTGACACCGATCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGTGTATCACGTTGGTATTCACCGTGTTTATGATGGCACTTATGGTCGTACCGCTGAGCGTGGTTAACCCACGTCAGGGACGCGTACTGTCGATGCGGCCAGCCATGCTGCTGTATc < 2:132750/251‑1 (MQ=255) aTTACGGACTTCCAGGATTATCAGGCGATCATTGGTCACCAGGCGGTGGCGCTCGACCCGAACGATACCGACCAGATGGACATGCGCACATTGTGGAACACTGACACCGATCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGTGTATCACGTTGGTATTCACCGTGTTTATGATGGCACTTATGGTCGTACCGCTGAGCGTGGTTAACCCACGTCAGGGACGCGTACTGTCGATGCTGCCAGCCATGCTGCTGTATCt < 1:420617/251‑1 (MQ=255) tACGGACTTCCAGGATTATCAGGCGATCATTGGTCACCAGGCGGTGGCGCTCGACCCGAACGATACCGACCAGATGGACATGCGCACATTGTGGAACACTGACACCGATCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGTGTATCACGTTGGTATTCACCGTGTTTATGCTGGCACTTATGGTCGTAACGCTGAGCGTGGTTAACCCACGTCAGGGACGCGTACTGTCGATGCTGCCAGCCATGCTGCTGTATCTAc > 2:355214/1‑251 (MQ=255) cTTCCAGGATTATCAGGCGATCATTGGACACCAGGCGGTGGCGCTCGACCCGAACGATACCGACCAGATGGACATGCGCACATTGTGGAACCCTGACACCGATCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGTGTATCACGTTGGTATTCACCGTGTTTATGATGGCACTTATGGTCGTACCGCTGAGCGTGGTTAACCCACGTCAGGGACGCGTACTGTCGATGCTGCCAGCCCTGCTGCTGTATCTACTTttct > 2:450037/1‑251 (MQ=255) ccAGGATTATCAGGCGAGCATTGGTCACCAGGCGGTTGCGCTCGACCCGACCGATACCGACCAGATGGACATGCGCACATTGTGGAACACTGACACCGATCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGTGTATCACGTTGGTATTCACCGTGTTTATGATGGCACTTATGGTCGTACCGCTGAGCGTGGTTAACCCACGTCAGGGACGCGTACTGTTGATGCTGCCAGCCATGCTGCTGTATCTACTTTTCTTcc < 1:461837/251‑1 (MQ=255) gATTATCAGGCGCTCCTTGGTCACCAGGCGGTGGCGCTCGACCCGAACGGTACCGACAAGATGGACCTGCGAACATTGTGGACCACTGACACCGATCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGTGTATCCCGTTGGTATTCACCGTGTTTATGATGGAACTTATGGTCGTACCGCTGAGCGTGGTTAACCCACGTCAGGGACGCGTACTGTCGATGCTGCCAGCCATGCTGCTTTATCTACTTTTCTTACTgct > 2:312492/1‑249 (MQ=255) gATTATCAGGCGATCATTGGTCACCAGGCGGTGGCGCTCGACCCGAACGATACCGACCAGATGGACATGCGCACATTGTGGAACACTGACACCGATCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGTGTATCACGTTGGTATTCACCGTGTTTATGATGGCACTTATGGTCGTACCGCTGAGCGTGGTTAACCCACGTCAGGGACGCGTCCTGTCGATGCTGCCAGCCATGCTGCTGTATCTACTTTTCTTCCTGAt > 2:306358/1‑251 (MQ=255) aTTATCAGGCGATCATTGGTCACCAGGCGGTGGCGCTCGACCCGAACGATACCGACCAGATGGACATGCGCACATTGTGGAACACTGACACCGATCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGCGTATCACGTTGGTATTCACCGTGTTTATGATGGCACTTATTGTCGGACCGCTGAGCGTGGTTAACCCACGTCAGGGAGGCGTACTGTCTATGCTGCCAGCCATGCTGCTGTATCTACTTTTCTGCCTGATc < 2:413107/251‑1 (MQ=255) tCAGGCGATCATTAGTCACCAGGCGGTGGCGCTCGCCCCGAACGATACCGACCAGATGGACCTGCGCACATTGTGGCCCACTGACACCGATCGTGCTCGCGCAGCACTGAACTGGTGTATCACGTTGGTATTCCCCGTGTTTATGATGGCACTTATGGTCGTACCGCTGAGCGTGGTTAACCCACGTCAGGGACGCGTACTGTCGATGCTGACAGCCATGCTGCTGTATCTACTTTTCTTCCTGATcc > 2:231329/1‑248 (MQ=255) gCGATCATTGGTCACCAGGCGGTGGCGCTCGACCCGCACGATACCGACCAGATGGACATGCGCACATTGTGAAACACTGAAACCGATCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGTGTATCACTTTGGTATTCACCGTGTTTATGATGGCACTTATGGTCGTACCGCTGAGCGTGGTTAACCCACGACAGGGACGCGTACTGTCGATGCTGCCAGCCATGCTGCTGTATCTACTTTTCTTCCTGATCCAGAcatc > 1:382620/1‑248 (MQ=255) gCGATCATTGGTCACCAGGCGGTGGCGCTCGACCCGAACGATACCGACCAGATGGACATGCGCACATTGTGGAACACTGACACCGATCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGTGTATCACGTTGGTATTCACCGTGTTTATGATGGCACTTATGGTCGTACCGCTGAGCGTGGTTAACCCACGTCAGGGACGCGTACTGTCGATGCTGCCAGCCATGCTGCTGTATCTACTTTTCTTCCTGATCCAGACCTc > 1:151127/1‑251 (MQ=255) cATTGGTCACCAGGCGGTGGCGCTCGACCCGAACGATACCGACCAGATGGACATGCGCACATTGTGGAACACTGACACCGATCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGTGTATCACGTTGGTATTCACCGTGTTTATGATGGCACTTATGGTCGTACCGCTGAGCGTGGTTAACCCACGTCAGGGACGCGTACTGTCGATGCTGCCAGCCATGCTGCTGTATCTACTTTTCTTCCTGATCCAGACCTCCCTg > 2:31264/1‑250 (MQ=255) cATTGGTCACCAGGCGGTGGCGCTCGACCCGAACGATAACGACCAGATGGACATGCGCACATTGTGGAACACTGACACCGATCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGTGTATCACGTTGGTATTCACCGTGTTTATGATGGCACTTATGGTCGTACCGCTGAGCGTGGTTAACCCACGTCAGGGACGCGTACTGTCGATGCTGCCAGCCATGCTGCTGTATCTACTTTTCTTCCTGATCCAGATCTCCCTg < 1:354023/250‑1 (MQ=255) ggTCACCAGGCGGTGGCGCTCGACCCGAACGATACCGACCAGATGGACATGCGCACATTGTGGAACACTGACACCGATCGTGCGCGCGCAGAACTGAACTGGTGTAGCACGTTGGTATTCACCGTGTTTATGATGGCACTTATGTTCGTACCGCTGAGCGTGGTTAACCCACGTCAGTGACGCGTACTGTCGATGCTGCCAGCCATGCTGCTGTATCTACTTTTCTTCCTGATCCAGACCTCCCTGAAATc < 2:392002/251‑1 (MQ=255) ccAGGCGGTGGCGCTCGACCCGAACGATACCGACCAGATGGACATGCGCACATTGTGGAACACTGACACCGATCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGTGTATCACGTTGGTATTCACCGTGTTTATGATGGCACTTATGGTCGTACCGCTGAGCGTGGTTAACCCACGTCAGGGACGCGTACTGTCGATGCTGCCAGCCATGCTGCTGTATCTACTTTTCTTCCTGATCCAGACCTCCCTGAAATCGAAcg < 2:205685/251‑1 (MQ=255) cAGGCGGTGGCGCTCGACCCGAACGATACCGACCAGATGGACATGCGCACATTGTGGAACACGGACACCGAGCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGTGTATCACGTTGGTATTCACCGTGTTTATGATGGCACTGATGGGCGTACCGCTGAGCGTGGTTAACCCACGTCAGGGACGCGTACTGTCGATGCTGCCAGCCATGCTGCTGTATCTACTTTTCTTCCTGATCCAGACCTCCCTGAAATCGAAcgg < 1:395197/251‑1 (MQ=255) ggTGGCGCTCGACCCGCACGATACCGACCAGATGGACATGCGCACATTGTGGAACACTGACACCGATCGTGCTCGCGCGGAACTGAACTGGTGTATCACGTCGGTATTCACCGTGTTTATGATGGCACTTATGGTCGTACCGCTGAGCGTGGTTAACCCTCGTCAGGGCCGCGTACTGTCGATGCTGCCAGCCATCCTGCTGTATCTACTTTTCTTCCTGATCCAGACCTCCCTGAACTCGAAcagcggg > 2:148912/1‑249 (MQ=255) gTGGCGCTCGACCCGAACGATACCGACCAGATGGACATGCGCACATTGTGGAACACTGACACCGATCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGTGTATCACGTTGGTATTCACCGTGTTTATGATGGCACTTATGGTCGTACCGCTGAGCGTGGTTAACCCACGTCAGGGACGCGTACTGTCGATGCTGCCAGCCATGCTGCTGTATCTACTTTTCTTCCTGATCCAGACCTCCCTGAAATCGAACGGCGGTaa < 1:142359/251‑1 (MQ=255) tGGCGCTAGACCCGAACGATACTGACCAGATGGACATGCGCCCATTGTGCAACACTGAAACCGATCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGTGTATCACGTTGGTATTCACCGTGTTTATGATGGCACTTATGGTCGTACCGCTGAGAGTGGTTAACCCACGTCAGGGACGCGTACTGTCGATGCTGCCAGCCATGCTGCTGTCTCTACTTTTCTTCCTGATCCAGACCTCCCTGAAATCGAACGGCGGTaa > 2:419664/1‑250 (MQ=255) cGACCCGAACGATACCGACCAGATGGACATGCGCACATTGTGGAACACTGACACCGATCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGTGTATCACGTTGGTATTCACCGTGTTTATGATGGCACTTATGGTCGTACCGCTGAGCGTGGTTAACCCACGTCAGGGACGCGTACTGTCGATGCTGCCAGCCATGCTGCTGTATCTACTTTTCTTCCTGATCCAGACCTCCCTGAAATCGAACGGCGGTAAAGGTAAg < 1:2412/250‑1 (MQ=255) gACCCGAACGATACCGACCAGATGGACATGCGCACATTGTGGAACACTGACACCGATCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGTGTATCACGTTGGTATTCACCGTGTTTATGATGGCACTTATGGTCGTACCGCTGAGCGTGGTTAACCCACGTCAGGGACGCGTACTGTCGATGCTGCCAGCCATGCTGCTGTATCTACTTTTCTTCCTGATCCAGACCTCCCTGAAATCGAACGGCGGTAAAGGTAAGCt > 1:255011/1‑251 (MQ=255) cccGAACGATACCGACCAGATGGACATGCGCACATTGTGGAACACTGACACCGATCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGTGTATCACGTTGGTATTCACCGTGTTTATGATGGCACTTATGGTCGTACCGCTGAGCGTGGTTAACCCACGTCAGGGACGCGTACTGTCGATGCTGCCAGCCATGCTGCTGTATCTACTTTTCTTCCTGATCCAGACCTCCCTGAAATCGAACGGCGGTAAAGGTAAGCTgg > 1:294066/1‑251 (MQ=255) cccGAACGATACCGACCAGATGGACATGCGCACATCGTGGAACACTGACACCGAGCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGTGTATCACGTTTGTATTCACCGTGTTGATGATGGCACTTATGGTCGTACCGCTGAGCGTGTTTAACCCACGTCAGTGACGTGTACTGTCGATGCTGCCAGCCATGCTGCTGTATCTACTTTTCTGCCTGATCCAGACCTCCCTGAAATCGAACGGCGGTAAAGGTAAGCTgg < 2:162090/251‑1 (MQ=255) cccGAACGATACCGACCAGATGGACATGCGAACATTGTGGAACACTGACACCGATCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGTGTATCACGTTGGAATTCACCGTGTTTATGATGGCACTTATGATCGTCCCGCTGAGCGTGGTTATCCCACGTCAGGGACGCGTACTGTCGATGCTGCCAGCCCTGCTGCTGTATCTACTTTTCTTCCTGATCCAGACCTCCATGAAATCGAACGGCGGTaaaagttaactgg > 2:219712/1‑241 (MQ=255) aaCGATACCGACCAGATGGACATGCGCACATTGTGGAACACTGACACCGATCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGTGTATCACGTTGGTATTCACCGTGTTTATGATGGCACTTGTGGTCGTACCGCTGAGCGTGGTTAACCCACGTCAGGGACGCGTACTGTCGATGCTGCCAGCCATGCTGCTGTATCTACTTTTCTTCCTGATCCAGACCTCCCTGAAATCGAACGGCGGTAAAGGTAAGCTGGAccc < 1:75548/251‑1 (MQ=255) gATACCGACCAGATGGACATGCGCACATTGTGGAACACTGACACCGATCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGTGTATCACGTTGGTATTCACCGTGTTTATGATGGCACTTATGGTCGTACCGCTGAGCGTGGTTAACCCACGTCAGGGACGCGTACTGTCGATGCTGCCAGCCATGCTGCTGTATCTACTTTTCTTCCTGATCCAGACCTCCCTGAAATCGAACGGCGGTAAAGGTAAGCTGGACCCGAc < 1:31264/251‑1 (MQ=255) aCCAGATGGACAAGCGCACATTGTGGAACACTGACACCTATCGTGCTCGCGCAGAACTGATCTGGTGTATCACGTTGGTATTCACCGTGTTTATGATGGCACTTAGGGTCGTTCCGCTGAGCGTGGTTAACCCACGGCAGGGACGCGTACTGTCGATGCTGCCAGCCAGGCTTCTGTATCTTCTTGTCTTACGGATCCAGACCTCCCTTAAATCGAACGGCGGTAAAGGTAAGCTGGACCCTACGCtgtgg < 2:434459/251‑1 (MQ=255) aCATGCGCACATTGTGGAACACTGACACCGATCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGTGTATCACGTTGGTATTCACCGTGTTTATGATGGCACTTATGGTCGTACCGCTGAGCGTGGTTAACCCACGTCAGGGACGCGTACTGTCGATGCTGCCAGCCATGCTGCTGTATCTACTTTTCTTCCTGATCCAGACCTCCCTGAAATCGAACGGCGGTAAAGGTAAGCTGGACCCGACGCTGTGGATGTGGAcc < 1:412895/251‑1 (MQ=255) gcgcACATTGTGGAACACTGACACCGATCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGTGTATCACGTTGGTATTCACCGTGTTTATGATGGCACTTATGGTCGTACCGCTGAGCGTGGTTAACCCACGTCAGGGACGCGTACTGTCGATGCTGCCATCCATGCTGCTGTATCTACTTTTCTTCCTGATCCAGACCTCCCTGAAATCGAACGGCGGTAAAGGTAAGCTGGACCCGACGCTGTGGATGTGGACCGTTa < 1:466005/251‑1 (MQ=255) cgcACATTGTGGAACACTGACTCCGATCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGTGTATCACGTTGGTATGCACCGTGTTTATGATGGCACTTAGGGTCGTACCGCTGAGCGTGGTTAACCCACGTCAGGGACGCGTACTGTCGATGCTTCCAGCCATGCTGCTGTATCttcgttgct < 2:457892/175‑9 (MQ=255) cgcACATTGTGGAACACTGACACCGATCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGTGTATCACGTTGGTATTCACCGTGTTTATGATGGCACTTATGGTCGTACCGCTGAGCGTGGTTAACCCACGTCAGGGACGCGTACTGTCGCTGCTGCCAGCCATGCTGCTGTATCTACTTttct > 1:457892/1‑175 (MQ=255) caTTGTGGAACACTGACACCGATCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGTGTATCACGTTGGTATTCCCCGTGTTTATGATGGCACTTATGGTCGTACCGCTGAGCGTGGTTAACCCACGTCAGGGACGCGTACTGTCGATGCTGCCAGCCATGCTGCTGTATCTACTTTTCTTCCTGATCCAGACCTCCCTGAAATCGAACGGCGGTAAAGGTAAGCTGGACCCGACGCTGTGGATGTGGACCGTTAACCTg < 1:263495/251‑1 (MQ=255) ggaacccttaccccGATCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGTGTATCACGTTGGTATTCACCGTGTTTATGATGGCACTTATGGTCGTACCGCTGAGCGTGGTTAACCCACGTCAGGGACGCGTACTGTCGATGCTGCCAGCCATGCTGCTGTATCTACTTTTCTTCCTGATCCAGACCTCCCTGAAATCGAACGGCGGTAAAGGTAAGCTGGCCCCGACGCTGTGGATGTGGACCGTTAACCTGATTTAt < 2:105479/239‑1 (MQ=255) cacTGACACCGATCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGTTTATCACTTTGGTATTCCCCGTGTTTATGATGGCACTTATGGTCGTACCGCTGAGCGTGGTTAACCCACGTCAGGGACGCGTACTGTCGATGCTGCCAGCCATGCTGCTGTATCTACTTTTCTTCCTGATCCAGACCTCCCTGAAATCGAACGGCGGTAAAGGTAAGCTGGACCCGACGCTGTGGATGTGGACCGTTAACCTGATTTATCTgg < 2:344959/251‑1 (MQ=255) cacTGACACCGATCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGTGTATCACGTTGGTATTCACCGTGTTTATGATGGCACTTATGGTCGTACCGCTGAGCGTGGTTAACCCACGTCAGGGACGCGTACTGTCGATGCTGCCAGCCATGCTGCTGTATCTACTTTTCTTCCTGATCCAGACCTCCCTGAAATCGAACGGCGGTAAAGGTAAGCTGGACCCGACGCTGTGGATGTGGACCGTTAACCTGATTTATCTgg < 1:159983/251‑1 (MQ=255) gACACCGATCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGTGTATCACGTTGGTATTCACCGTGTTTATGATGGCACTTATGGTCGTACCGCTGAGCGTGGTTAACCCACGTCAGGGACGCGTACTGTCGATGCTGCCAGCCATGCTGCTGTATCTACTTTTCTTCCTGATCCAGACCTCCCTGAAATCGAACGGCGGTAAAGGTAAGCTGGACCCGACGCTGTGGATGTGGACCGTTAACCTGATTTATCTGGCttt > 2:116651/1‑251 (MQ=255) acacCGATCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGTGTATCACGTTGGTATTCACCGTGTTTATGATGGCACTTATGGTCGTACCGCTGAGCGTGGTTAACCCACGTCAGGGACGCGTACTGTCGATGCTGCCAGCCATGCTGCTGTATCTACTTTTCTTCCTGATCCAGACCTCCCTGAAATCGAACGGCGGTAAAGGTAAGCTGGACCCGACGCTGTGGATGTGGACCGTTAACCTGATTTATCTGGCtttt > 1:215062/1‑250 (MQ=255) gATCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGTGTATCACGTTGGTATTCACCGTGTTTATGATGGCACTTATGGTCGTACCGCTGAGCGTGGTTAACCCACGTCAGGGACGCGTACTGTCGATGCTGCCAGCCATGCTGCTGTATCTACTTTTCTTCCTGAGCCAGACCTCCCTGAAATCGAACGGCGGTAAAGGTAAGCTGGACCCGACGCTGTGGATGTGGACCGTTAACCTGATTTATCTGGCTTTAGCGAt < 1:107003/251‑1 (MQ=255) aTCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGTGTATCACGTTGGTATTCACCGTGTTTATGATGGCACTTATGGTCGTACCGCTGAGCGTGGTTAACCCACGTCAGGGACGCGTACTGTCGATGCTGCCAGCCCTGCTGCTGTATCTACTTTTCTTCCTGATCCAGACCTCCCTGAAATCGAACGGCGGTAAAGGTAAGCTGGGCCCGACGCTGGGGGTGTTGAGCGGTAACATGATTTATCTTGCTTTAGCgctt > 2:116425/1‑248 (MQ=255) cGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGTGTATCACGTTGGTATTCACCGGGTTTATGATGGCACTTATGGTCGTACCGCTGAGCGTGGTTAACCCACGTCAGGGACGCGTACTGTCGATGCTGCCAGCCATGCTGCTGTATCTACTTTTCTTCCTGATCCAGACCTCCCTGAAATCGAACGGCGGTAAAGGTAAGCTGGACCCGACGCTGTGGATGTGGACCGTTAACCTGATTTATCTGGCTTTAGCGATTg < 2:17180/250‑1 (MQ=255) cGTGCTCGCGCAGAACGGAACTGGTGTATCCCGTTGGGTGTCAACGTGTTTATGATGGCACTTATGGTCGTACCGCTGAGCGTGGTTAACCCACGTCAGGGCCGCGTACTGTCGATGCTGTCAGCCATGCTGCTGTAGCTACTTTTCTTCCTGATCTAGACCTCCCTGAAATCGAACGGCGGTAAAGGTAAGCTGGACCCGACGCTGTTGATGTGGACCGTTAACCTGATGTATCTGGCTTTCGCGATTGt < 2:208114/251‑1 (MQ=255) gTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGTGTATCACGTTGGTATTCACCGTGTTTATGATGGCACTTATGGTCGTACCGCTGAGCGTGGTTAACCCACGTCAGGGACGCGTACTGTCGATGCTGCCAGCCATGCTGCTGTATCTACTTTTCTTCCTGATCCAGACCTCCCTGAAATCGAACGGCGGTAAAGGTAAGCTGGACCCGACGCTGTGGATGTGGACCGTTAACCTGATTTATCTGGCTTTAGCGATTGtt < 2:151127/251‑1 (MQ=255) gtgcgcgCAGACCTGATCTGGTGTGTCTCGTTGGTCTTTCCCGGGTTTATTATGGCACGTTTGGTAGTACCGCGGAGCGTGGTGAACCTACGTCAGGGAAGCGTACTGTCGATGCTACCAGCCATGCTGCTGTATCTACTTTTCGTCCTGATCCAGACCTCATTGAAATCGAACGTCGGTAAAGGTAAGCTGGAATCGACGCTGTGGATGTGGACCGTTAACCTGATTTATCTGGCTTTAGCGATTTTtct < 2:359731/248‑1 (MQ=255) gCTCGCGCAGAACTGAACTGGTGTATCACGTTGGTATTCACCGTGTTTATGATGGCACTTATGGTCGTACCGCTGAGCGTGGTTAACCCACGTCAGGGACGCGTACTGTCGATGCTGCCAGCCATGCTGCTGTATCTACTTTTCTTCCTGATCCAGACCTCCCTGAAATCGAACGGCGGTAAAGGTAAGCTGGACCCGAAGCTGTGGATGTGGACCGTTAACCTGATTTATCTGGCTTTAGCGATTGTtct > 1:388797/1‑251 (MQ=255) cgcgcgCAGAACTGAACTGGTGTATCACGTTGGTATTCACCGGTTTTATTATGGCACTTATGTTCGTACCGCTTAGCGTGGTTAACCCACGTCAGGGACGCGTACGGTCGAGGCTGCCAGCCATGCGGCTGTATCTGCTTTTCTGCCTGATCCAGACCTCCCTGAAATCGAACGGCGGTAAAGGTAAGCTGGACCCGACGCGGTGGATGTGGACCGTTATCCTGAGTTATCTGGCTTTAGCGATTGTtct < 2:392501/248‑1 (MQ=255) gcAGAACTGAACTGGTGTATCACGTTGGTATTCACCGTGTTTATGATGGCACTTATGGTCGTACCGCTGAGCGTGGTTAACCCACGTCAGGGACGCGTACTGTCGATGCTGCCAGCCATGCTGCTGTATCTACTTTTCTTCCTGATCCAGACCTCCCTGAAATCGAACGGCGGTAAAGGTAAGCTGGACCCGACGCTGTGGATGTGGACCGTTAAACTGATTTATCTGGCTTTAGCGATTGTTCTCAACCt > 1:373777/1‑251 (MQ=255) cAGAACTGAACTGGTGTATCACGTTGGTATTCACCGTGTTTATGATGGCACTTATGGTCGTACCGCTGAGCGTGGTTAACCCACGTCAGGGACGCGTACTGTCGATGCTGCCAGCCATGCTGCTGTATCTACTTTTCTTCCTGATCCAGACCTCCCTGAAATCGAACGGCGGTAAAGGTAAGCTGGACCCGGCGCTGTGGATGTGGACCGGTAACCTGGTTTATCTgggtaggttgggagggcgtcgggtg > 2:184568/1‑228 (MQ=255) cAGAACTGAACTGGTGTATCACGTTGGTATTCACCGTGTTTATGATGGCACTTATGGTCGTACCGCTGAGCGTGGTTAACCCACGTCAGGGACGCGTACTGTCGATGCTGCCAGCCATGCTGCTGTATCTACTTTTCTGCCTGATCCAGACCTCCCTGAAATCGAACGGCGGTAAAGGTAAGCTGGACCCGACGCTGTGGATGTGGACCGTTAACCTGATTTATCTGGCt < 1:184568/230‑1 (MQ=255) | GTGGTGGCCGATTCCGGACATTTAACCCAGCTGCGCGACGGCTCCCAGGTCGTCACTCTCAACCAGGGAACGCGCTTCGAAGGCACTGCATTGTTACGTGATTTCCGCATTACGGACTTCCAGGATTATCAGGCGATCATTGGTCACCAGGCGGTGGCGCTCGACCCGAACGATACCGACCAGATGGACATGCGCACATTGTGGAACACTGACACCGATCGTGCTCGCGCAGAACTGAACTGGCGTATCACGTTGGTATTCACCGTGTTTATGATGGCACTTATGGTCGTACCGCTGAGCGTGGTTAACCCACGTCAGGGACGCGTACTGTCGATGCTGCCAGCCATGCTGCTGTATCTACTTTTCTTCCTGATCCAGACCTCCCTGAAATCGAACGGCGGTAAAGGTAAGCTGGACCCGACGCTGTGGATGTGGACCGTTAACCTGATTTATCTGGCTTTAGCGATTGTTCTCAACCTT > NC_000913/4486779‑4487258 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |