| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 4,433,459 | C→T | G189D (GGC→GAC) | qorB ← | NAD(P)H:quinone oxidoreductase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 4,433,459 | 0 | C | T | 98.4% | 198.1 / ‑6.8 | 62 | G189D (GGC→GAC) | qorB | NAD(P)H:quinone oxidoreductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base T (36/25); total (36/26) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.19e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.92e-01 | |||||||||||
TGGGTGGCCAATCAATTTGCTAAGTGTTTTG‑CTGTCATCAAA‑CAGACCGCCTTTCGATGCGCCAACGTCAGAATCCGCCAGCATATCCGCCAGTCCGTCGGGCAGTCCGACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTG‑TGTCAACGTCCAGG‑CACTATC‑GCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGC‑CTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGATTTTGCCATCGCCCGCCGCACCGATAAATACGCCGTGTTCCAGTGCTGCCGGGGCGCTGGCGAGGTAGTTTTCGCTGTACCAGCCGTTGCGCAGCAGGGTGTAAACGATGCCAGAATCAGCCAGCATTTTCTCCGTCTCGATGTGCTCATCGGCGAGGCCGAGCGGGGAGGTATCTG > NC_000913/4433215‑4433705 | ggggTGGCCAATCAATTTTCTAGGTGTTTCG‑C‑GTAAAAAAAACAGCCCGCCTTTGGATCCGCCACCGTCAAAACCCCCCAGCATATCCGCCAGTCAGTCGGGCAGTCCGACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTACCCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTG‑TGTCAACGTCCAGG‑CACTATC‑GCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGT‑CTTCGt < 2:113580/250‑1 (MQ=255) 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cGCTAACTG‑TGTCAACGTCCAGG‑CACTATC‑GCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGT‑CTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCCCGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGATTTTGCCATCGCCCGCCGCACCGATAAATACGCCGTGTTCCAGTGCTGCCGGGGCGCTGGCGCGGTAGTTTTCGCTGTACCAGCCGTTGCGCAGCAGGGTGTAAACGATGCCAGAATCAGCCAGCAttt > 1:205235/1‑251 (MQ=255) gtCAACGCCCAGG‑CACTATC‑GCCCGCCAGTTCGTAACCCTTGT‑CTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGATTTTGCCATCGCCCGCCGCACCGATAAATACGCCGTGTTCCAGTGCTGCCGGGGCGCTGGCGAGGTAGTTTTCGCTGTACCAGCCGTTGCGCAGCAGGGTGTAAACGATGCCAGAATCAGCCAGCATTTTCTCCGtct < 1:359011/250‑1 (MQ=255) cACTATC‑GCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGT‑CTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGATTTTGCCATCGCCCGCCGCACCGATAAATACGCCGTGTTCCAGTGCTGCCGGGGCGCTGGCGAGGTAGTTTTCGCTGTACCAGCCGTTGCGCAGCAGGGTGTAAACGATGCCAGAATCAGCCAGAATTTTCTCCGTCTCGATGTGCTCATCg > 1:245534/1‑251 (MQ=255) aTC‑GCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGT‑CTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGATTTTGCCATCGCCCGCCGCACCGATAAATACGCCGTGTTCCAGTGCTGCCGGGGCGCTGGCGAGGTAGTTTTCGCTGTACCAGCCGTTGCGCAGCAGGGTGTAAACGATGCCAGAATCAGCCAGCATTTTCTCCGTCTCGATGTGCTCATCGGCg > 1:216408/1‑250 (MQ=255) gcccgccAGTTCGTAAACCTTGT‑CTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGATTTTGCCATCGCCCGCCGCACCGATAAATACGCCGTGTTCCAGTGCTGCCGGGGCGCTGGCGAGGTAGTTTTCGCTGTACCAGCCGTTGCGCAGCAGGGTGTAAACGATGCCAGAATCAGCCAGCATTTTCTCCGTCTCGCTGTGCTCATCGGCGAGGc > 2:90631/1‑251 (MQ=255) cAGTTCGTAAACCTTGT‑CTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGATTTTGCCATCGCCCGCCGCACCGATAAATACGCCGTGTTCCAGTGCTGCCGGGGCGCTGGCGAGGTAGTTTTCGCTGTACCAGCCGTTGCGCAGCAGGGTGTAAACGATGCCAGAATCAGCCAGCATTTTCTCCGTCTCGATGTGCTCATCGGCGAGGCCGAGCg > 1:324873/1‑251 (MQ=255) gTAAACCTTGT‑CTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGATTTTGCCATCGCCCGCCGCACCGATAAATACGCCGTGTTCCAGTGCTGCCGGGGCGCTGGCGAGGTAGTTTTCGCTGTACCAGCCGTTGCGCAGCAGGGTGTAAACGATGCCAGAATCAGCCAGCATTTTCTCCGTCTCGATGTGCTCATCGGCGAGGCCGAGCGGGGAgg > 1:73458/1‑251 (MQ=255) aaCCTTGT‑CTTCGTGACCGGCATCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGATTTTGCCATCGCCCGCCGCACCGATAAATACGCCGTGTTCCAGTGCTGCCGGGGCGCTGGCGAGGGAGTTTTCGCTGTACCAGCCGTTGCGCAGCAGGGTGTAACCGATGCCAGAATCAGCCAGCATTTTCTCCGTCTCGATGTGCTCATCGGCGAGGCCGAGCGGGGAgggat > 1:91456/1‑248 (MQ=255) cTTGT‑CTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGATTTTGCCATCGCCCGCCGCACCGATAAATACGCCGTGTTCCAGTGCTGCCGGGGCGCTGGCGAGGTAGTTTTCGCTGTACCAGCCGTTGCGCAGCAGGGTGTAAACGCTGCCAGAATCAGCCAGCATTTTCTCCGTCTCGATGTGCTCATCGGCGAGGCCGAGCGGGGGGGTATCTg > 2:294796/1‑251 (MQ=255) | TGGGTGGCCAATCAATTTGCTAAGTGTTTTG‑CTGTCATCAAA‑CAGACCGCCTTTCGATGCGCCAACGTCAGAATCCGCCAGCATATCCGCCAGTCCGTCGGGCAGTCCGACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTG‑TGTCAACGTCCAGG‑CACTATC‑GCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGC‑CTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGATTTTGCCATCGCCCGCCGCACCGATAAATACGCCGTGTTCCAGTGCTGCCGGGGCGCTGGCGAGGTAGTTTTCGCTGTACCAGCCGTTGCGCAGCAGGGTGTAAACGATGCCAGAATCAGCCAGCATTTTCTCCGTCTCGATGTGCTCATCGGCGAGGCCGAGCGGGGAGGTATCTG > NC_000913/4433215‑4433705 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |