| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 4,414,625 | C→T | R117R (CGC→CGT) | aidB → | putative acyl‑CoA dehydrogenase AidB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,414,625 | 0 | C | T | 94.7% | 209.6 / NA | 76 | R117R (CGC→CGT) | aidB | putative acyl‑CoA dehydrogenase AidB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (30/41); minor base G (2/2); total (33/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GTGCTGGCTGGGATAGCGATTTTCTAGCCAGTATTGGTCAGCAGTTAGGAACGGCTGAATCCCTTGAACTGGGGCGGCTGGCGAATGTGAATCCGCCTGAATTATTGCGCTACGATGCGCAAGGACGCCGTCTGGACGATGTGCGTTTTCACCCCGCCTGGCACCTGCTGATGCAGGCGCTATGTACCAATCGGGTGCACAATCTTGCCTGGGAAGAAGACGCTCGCTCCGGCGCATTTGTGGCGCGCGCGGCGCGTTTTATGTTACATGCGCAGGTTGAGGCAGGGTCGTTATGTCCGATAACCATGACCTTTGCCGCCAC‑GCCATTGTTGTTACAGATGT‑TACCCGCGCCGTTTCAGGACTGGACCACGCCGCTATTGAGCGATCGCTACGATTCTCACTTATTGCCAGGTGGGCAAAAACGCGGTTTGTTGATTGGCATGGGAATGACGGAAAAGCAGGGCGGTTCCGATGTTATGAGCAACACCACCC > NC_000913/4414378‑4414869 | gTGCTGGCTGGGGTAGCGATTTTCTAGCCAGTATTGTTCAGCAGTTAGGAACGGCTGAATCCCTTGAACTGGGGCGGCTGGCGAATGTGAATCCGCCTGAATTATTGCGCTACGATGCGCAAGGACGCCGTCTGGACGATGTGCGTTTTCACCCCGCCTGGCACCTGCTGATGCAGGCGCTATGTACCAATCGGGTGCACAATCTTGCCTGGGAAGAAGACGCTCGCTCCGGCGCATTTGTGGcgcgtgcg < 2:180922/251‑1 (MQ=255) 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GTGCTGGCTGGGATAGCGATTTTCTAGCCAGTATTGGTCAGCAGTTAGGAACGGCTGAATCCCTTGAACTGGGGCGGCTGGCGAATGTGAATCCGCCTGAATTATTGCGCTACGATGCGCAAGGACGCCGTCTGGACGATGTGCGTTTTCACCCCGCCTGGCACCTGCTGATGCAGGCGCTATGTACCAATCGGGTGCACAATCTTGCCTGGGAAGAAGACGCTCGCTCCGGCGCATTTGTGGCGCGCGCGGCGCGTTTTATGTTACATGCGCAGGTTGAGGCAGGGTCGTTATGTCCGATAACCATGACCTTTGCCGCCAC‑GCCATTGTTGTTACAGATGT‑TACCCGCGCCGTTTCAGGACTGGACCACGCCGCTATTGAGCGATCGCTACGATTCTCACTTATTGCCAGGTGGGCAAAAACGCGGTTTGTTGATTGGCATGGGAATGACGGAAAAGCAGGGCGGTTCCGATGTTATGAGCAACACCACCC > NC_000913/4414378‑4414869 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |