| Predicted mutation | ||||||
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| JC JC | NC_000913 | 3,368,685 | IS2 (–) +5 bp | coding (859‑863/1128 nt) | yhcG → | DUF1016 domain‑containing protein YhcG |
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| * | ? | NC_000913 | = 3187426 | NA (NA) | 64 (1.440) | 53/484 | 0.1 | 98.4% | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 3368689 | 1 (0.020) | coding (863/1128 nt) | yhcG | DUF1016 domain‑containing protein YhcG | |||||
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ATATTCTTCCGCAACAGGCGATACGCGATCCCTTTGTGCTCGAATTTCTGGAATTGAAAGATGAATATTCAGAATCCGATTTTGAGGAGGCGCTGATCAACCACCTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGTTACGCATTGATGACAACTGGTTTCGTGTCGATCTGCTGTTTTTCCACCGCCGTTTACGCTGCCTGCTAATCGTCGATCTAAAAGTGGGCAAATTCAGCTATAGCGATGCCGGACAGATGAATATGTATCTCAACTACGCCAAAGAGCACTGGACGCTACCGGATGAAAATCCGCCCATCGGTCTGGTTCTCTGTGCAGAGAAAGGAGCCGGAGAAGCGCATTATGCTCTGGCAGGTTTGCCTAACACCGTTCTGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGG > NC_000913/3368437‑3368934 | atatTCTTCCGCAACAGGCGATACGCGATCCCTTTGTGCTCGAATTTCTGGAATTGAAAGATGAATATTCAGAATCCGATTTTGAGGAGGCGCTGATCAACCACCTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGACGGTTACGCATTGATGACAACTGGTTTCGTGTCGATCTGCTGTTTTTCCACCGCCGTTTACGCTGCCTGCTAATCGTCGATCTAAAAGTg > 1:74113/1‑251 (MQ=255) 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agaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTGGGCAAATTCAGCt > 1:427177‑M2/235‑250 (MQ=255) aataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccttcatcccctgttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacagcaatcatctgttctccaatgactagtcttaaaactattattaagactatcacgtatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTGGGCAAATTCAGCTATAg < 1:441796‑M2/20‑1 (MQ=255) aataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTGGGCAAATTCAGCTATAg < 1:368687‑M2/20‑1 (MQ=255) aataactggatgactgctacaacatgttgccgggcaccgagggagaccgtcatccccggctcaacgctatgctgaacaattgcgatcttttcctgcgaggtacgccgtctgcgtttctccggcactaagacctcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTGGGCAAATTCAGCtat > 2:225868‑M2/232‑249 (MQ=255) gATACGCGATCCCTTTGTGCTCGAATTTCTGGAATTGAAAGATGAATATTCAGAATCCGATTTTGAGGAGGCGCTGATCAACCACCTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGTTACGCATTGATGACAACTGGTTTCGTGTCGATCTGCTGTTTTTCCACCGCCGTTTACGCTGCCTGCTAATCGTCGATCTAAAAGTGGGtggatttgcccctatat < 1:180992‑M2/251‑18 (MQ=255) gATACGCGATCCCTTTGTGCTCGAATTTCTGAAATTGAAAGATGAATATTCAGAATCCGATTTTGAGGAGGCGCTGATCAACCACCTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGTTACGCATTGATGACAACTGGTTTCGTGTCGATCTGCTGTTTTTCCACCGCCGTTTACGCTGCCTGCTAATCGTCGATCTAAAAGTGGGtggatttgcccctatat < 1:153277‑M2/251‑18 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |