| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 249545 | 66 (1.490) | 60 (1.390) | 52/470 | 0.1 | 48.8% | intergenic (+1411/‑1353) | rayT/dinB | REP‑associated tyrosine transposase/DNA polymerase IV |
| ? | NC_000913 | 373870 = | 62 (1.440) | coding (950/951 nt) coding (3/1014 nt) |
mhpF mhpE |
acetaldehyde dehydrogenase (acetylating) MhpF 4‑hydroxy‑2‑oxovalerate aldolase |
|||||
Only 100 of 126 total aligned reads displayed.
TCCGCTGGGTGAGCGGGTTACCCTGTGCTTTGTCCACCAGCGCCACCAGTTTGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAA‑CTGACCTG‑CTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATTCCCGGTACCACCGCCAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTACGCACGTCATGGGCGATATCGCCG‑TTGTCGCTGACGCGGGTGACGATAATCGCCGCCGCGGTGGAGAGCAGCAGGGAAGGGATCTGCGCCACCAGGCCGTCGCCGATGGTCATCAGCACATACTGCTGGAAGGCAGCATCGGCGCTCAGGTTGTATTTGAAGATCCCGATAC > NC_000913/249296‑249793 | cccgCTGGGTGAGCGGTTTACCCTGTGTTTTGTCCACCAGCGCCACCAGTGTGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAA‑CTGACCTG‑CTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTAAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATg < 2:170770‑M1/250‑2 (MQ=255) gCTGGGTGAGCGGGTTAACCTGTGCTTTGTCCACCAGCGCCACCAGTTTGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAA‑CTGACCCG‑CTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGGGCGGCATgaa > 1:282685‑M1/1‑247 (MQ=255) cTGGGTGAGCGGGTTACCCTGTGCTTTGTCCACCAGCGCCACCAGTTTGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAA‑CTGACCTG‑CTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATTCCCg > 1:345111/1‑251 (MQ=255) gggTGAGCGGGTTACCCTGTGCTTTGTCCACCAGCGCCCCCAGTTTGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAA‑CTGACCTG‑CTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTGCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGATGCGGCATgaacggt < 2:131299‑M1/251‑8 (MQ=255) gggTGAGCGGGTTACCCTGTGCTTTGTCCACCAGCGCCACCAGTTTGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAA‑CTGACCTG‑CTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATTCCCgg < 1:363342/250‑1 (MQ=255) gTGAGCGGGTTACCCTGTGCTTTGTCCACCAGCGCCACCAGTTTGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAA‑CTGACCTG‑CTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATgaacggtaa < 1:194278‑M1/251‑10 (MQ=255) tGAGCGGGTTACCCTGTGCTTTGTCCACCAGCGCCACCAGTTTGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAA‑CTGACCTG‑CTGATCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGACAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACAAAGCAGGGCGCTGAAAAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATTCCCGGTacc > 1:412746/1‑251 (MQ=255) gggcgGGTTACCCTGTGCTTTGTCCCCCAGCGCCCCCAGTTTGTAACCGAGGTTTAAACGGATAGGCTCGAGCGGCGGAATGGTTTCCCAA‑CTGCCCTG‑CTGCTCGTTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATgaacggtaaa < 2:282466‑M1/248‑11 (MQ=255) gggTTCCCCTGTGCTTTGTCCACCAGCGCCACCAGTTTGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAA‑CTGACCTG‑CTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCACAAACGGCAGGCGCGGCATTTCCGGTACCACCGc > 1:155349/1‑251 (MQ=255) ggTTACCCTGTGCTTTGTCCACCAGCGCCACCAGTTTGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAA‑CTGACCTG‑CTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCGGAACAGCAAAAACGGCAGGGGCGGCATggaaggtcaaaaactt > 1:415864‑M1/1‑235 (MQ=255) 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gcgtctgttTGCTCTCCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACTGCAGGTGCGGCATgaacggtaaaaaactttatatctcggacgtcacattgcgtgacggtatgcacgccattcgtcatcagtattctctggaaatcgttctccagattgccaaagcactggtcgatgcccgcgttgattcgattgaagtgtcccacggcgacggtttgcaaggttccatctttatctatggt < 2:65637‑M1/247‑179 (MQ=255) ggCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATgaacggtaaaaaactttatatctcggacgtcacattgcgtgacggtatgcacgccattagtcatcagtattcgctggaaaacgttcgccagattaccaaagcactggacgatgcccgcgtggattcgattgaagtggcccacggcgacggtttgcaaggttccagctttaactatggttt > 1:64962‑M1/1‑71 (MQ=255) tGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGTGGCATgaacggtaaaaaactttatatctcggacgtcacattgcgtgacggtatgcacgccattcgtcatcagtattcgctggaaaacgttcgccagattgccaaagcactggacgatgcccgcgtggattcgattgaagtggcccacggcgacggtttgcaaggttc < 1:102671‑M1/230‑163 (MQ=255) 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gCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATgaacggtaaaaaactttatatctcggacgtcacattgcgtgacggtatgcacgccatgcgtcatcagtattcgctggaaaacgttcgccagattgccaaagcactggacgatgcccgcgtggattcgattgaagtggcccacggcgacggtttgcaaggttcca < 1:168131‑M1/201‑165 (MQ=255) cAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGAAATGTGCGGCCTGCCCTGTCCCTCCGCCAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTTCCAGCAGCTGGTTACGCACGTCATGGGCGATATCGCCG‑TTGTCGCTGACGCGGGTGACGAGAATCGCCGCCGCGGTGGAGAGCAGCAGGGAAGGGATCTGCGCCGCCACGCCGTCGCCGATGGTCATCAGCACAGACTGCAGGAAGGCAGCAt < 2:294911/251‑1 (MQ=255) gggCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATgaacggtaaaaaactttatatctcggacgtcacattgcgtgacggtatgcacgccattcgtcatcagtattcgctggaaaacgttcgccagattgccaaagcactggacgatgcccgcgtggattcgattgaagtggcccacggcgacggtttgcaaggttccagctttaactatggtttcggcgcacatagcgaccttgaatggattgaagcggcg < 1:172213‑M1/251‑218 (MQ=255) 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cAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATTCCCGGTCCCACCGCCAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTACGCACGTCATGGGCGATATCGCCG‑TTGTCGCTGACGCGGGTGACGATAATCGCCGCCGCGGTGGAGAGCAGCAGGGAAGGGATCTGCGCCACCAGGCCGTCGCCGATGGTCATCAGCACATACTGCTGGAAGGCAGCATCGGCGCTCAGGt < 2:83738/251‑1 (MQ=255) aaaaaCGGCAGGTGCGGGATgaacggtaaaaaactttatatttcggacgtcaccttgcgtggcggtatgcacgccattcgtcatcaggattcgctggaaaacgttcggcagattgccaaagaactgggcgatgcccgcgtgggttcgattgaagtggcccaaggggacggtttgcaaggttcccgctttaactatgggtttggcgggcatagcgaccttgaatggattgaagcggcggcgggggtggtgg > 2:165298‑M1/1‑20 (MQ=255) aaaCGGAAGGTCCGCCTTTCCCGGTCCCCCCGCCAGCCCGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTACGCACGTCATGGGCGATATCGCCG‑TTGGCGCTGACGCGGGTGACGATAATCGCCGCCGCGGTGGAGAGCAGCAGGGAAGGGATCTGCGCCACCAGGCCGTCGCCGATGGTCATCAGCACATACTGCTGGAAGGCAGCATCGGCGCTCAGGTTGTAtt < 1:394685/251‑1 (MQ=255) 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TCCGCTGGGTGAGCGGGTTACCCTGTGCTTTGTCCACCAGCGCCACCAGTTTGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAA‑CTGACCTG‑CTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATTCCCGGTACCACCGCCAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTACGCACGTCATGGGCGATATCGCCG‑TTGTCGCTGACGCGGGTGACGATAATCGCCGCCGCGGTGGAGAGCAGCAGGGAAGGGATCTGCGCCACCAGGCCGTCGCCGATGGTCATCAGCACATACTGCTGGAAGGCAGCATCGGCGCTCAGGTTGTATTTGAAGATCCCGATAC > NC_000913/249296‑249793 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |