| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 16,974 | IS150 (–) +3 bp | noncoding (23‑25/59 nt) | sokC → | small regulatory RNA antitoxin SokC |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 16974 = | 0 (0.000) | 16 (0.360) | 16/484 | 1.1 | 100% | noncoding (23/59 nt) | sokC | small regulatory RNA antitoxin SokC |
| ? | NC_000913 | 3720633 = | NA (NA) | noncoding (1/1443 nt) | IS150 | repeat region | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 16976 | 0 (0.000) | 55 (1.250) | 48/478 | 0.1 | 100% | noncoding (25/59 nt) | sokC | small regulatory RNA antitoxin SokC |
| ? | NC_000913 | = 3722075 | NA (NA) | noncoding (1443/1443 nt) | IS150 | repeat region | |||||
ATGGGATCACTCCCCGCCGTTGCTCTTACTCGGATTCGTAAGCCGTGAAAACAGCAACCTCCGTCTGGCCAGTTCGGATGTGAACCTCACAGAGGTCTTTTCTCGTTACCAGCGCCGCCACTACGGCGGTGATACAGATGACGATCAGGGCGACAATCATCGCCTTATGCTGCTTCATTGCTCTCTTCTCCTTGACCTTACGGTCAGTAAGAGGCACTCTACATGTGTTCAGCATATAGGAGGCCTCGGGTTGATGGTAAAATATCACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATGCCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTCATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGGCCTAA > NC_000913/16726‑17224 | aTGGGATCACTCCCCGCCGTTGCTCTTACTCGGATTCGTAAGCCGTGAAAACAGCAACCTCCGTCTGGCCAGTTCGGATGTGAACCTCACAGAGGTCTTTTCTCGTTACCAGCGCCGCCACTACGGCGGTGATACAGATGACGATCAGGGCGGCAATCATCGCCTTATTCTGCTTCATTTCTCTCTTCTCCTTGACCTTACGGTCAGTAAGAGGCACTCTACATGTGTTCATCATATAAGAGGCCTCGGGt > 1:275722/1‑251 (MQ=255) ccgccgTTGCTCTTACTCGGATTCGTAAGCCGTGAAAACAGCAACCTCCGTCTGGCCAGTTCGGATGTGAACCTCACAGAGGTCTTTTCTCGTTACCAGCGCCGCCACTACGGCGGTGATACAAATGACGATCCGGGCGACAATCATCGCCTTATGCTGCTTCAATGCTCTCTTCTCCTTGACCTTACGGTCAGTAAGAGGCACTCTACATGTGTTCCGCATATAGGAGGCCTCGGGTtgtactgacccc > 1:60247‑M1/1‑238 (MQ=255) cTCGGATTCGTAAGCCGTGAAAACAGCAACCTCCGTCTGGCCAGTTCGGATGTGAACCTCACAGAGGTCTTTTCTCGTTACCAGCGCCGCCACTACGGCGGTGATACAGATGACGATCAGGGCGACAATCCTCGCCTTATGCTGCTTCATTGCTCTCTTCTCCTTGACCTTACGGTCAGTAAGAGGCACTCTACATTTGTTCAGCATATAGGAGGCCTCGGGGtgtactgaccccaaaaagttggacagtt > 1:165596‑M1/1‑223 (MQ=255) ggATTCGTAAGCCGTGAAAACAGCAACCTCCGTCTGGCCAGTTCGGATGTGAACCTCACAGAGGTCTTTTCTCGTTACCAGCGCCGCCACTACGGCGGTGATACAGGTGACGATCAGGGCGACAATCATCGCCTTATGCTGCTTCATTGATCTCTTCTCCTTGACCTTACGGGCAGTGAAAGGCAATCTACATGTGTGCAGCATATAGGAGGGCTCGGGTtgtactgaacccaaaaagttggacagttaa > 1:90552‑M1/1‑220 (MQ=255) ggaattaaacctttttctccatgtttttcatagagggcaacccatgtcctgacctgggttcgggggacaccaaaacgtgccgagatgatcctgtaaccatcatcagttgtgaagtagtgattcacgacttcaaggcgcttttcaaaagggtattttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGGTTGATGGTAAAATATCACTCGGGGCTTTTCTCTAt > 1:364496‑M1/215‑251 (MQ=255) aattaaacctttttctccatgtttttcatagagggcaacccatgtcctgacctgggttcgggggacaccaaaacgtgccgagatgatcctgtaaccatcatcagttgtgaagtagtgattcacgacttcaaggcgcttttcaaaagggtattttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGGTTGATGGTAAAATATCACTCGGGGCTTTTCTCTATCt > 1:79263‑M1/213‑251 (MQ=255) aaGCCGTGAAAACAGCAACCTCCGTCTGGCCAGTTCGGATGTGAACCTCACAGAGGTCTTTTCTCGTTACCAGCGCCGCCACTACGGCGGTGATACAGATGACGATCAGGGCGACAATCATCGCCTTATGCTGCTTCATTTCTCTCTTCTCCTTTACCTTACGGTCAGTAAGAGGCACTCTACATGTGTTCAGCATCTAGGAGGCCTCGGGTtttactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggc > 2:386210‑M1/1‑212 (MQ=255) 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gtttttcatagagggcaacccatgtcctgacctgggttcgggggacaccaaaacgtgccgagatgatcctgtaaccatcatcagttgtgaagtagtgattcacgacttcaaggcgcttttcaaaagggtattttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGGTTGATGGTAAAATATCACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATGCCTg > 1:390408‑M1/193‑250 (MQ=255) ccctCCGTCTGGCCCGTTCGGATGTGACCCTCACAGAGTTCTTTTCTCGTTACCAGCGCCGCCACTACGGCGGTGATACAGATGACGATCAGGGCGACAATCATCGCCTTATGCTGCTTCATTGCTCTCTTCTCCTTGACCTTACGGTCAGTAAGAGGCACTCTACATGTGTTCAGCATATAGGAGGCCTCGGGTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccg < 1:409375‑M1/250‑57 (MQ=255) gggcCAGTTCGGATGTGACCCTCACAGAGGTCTTTTCTCGTTCCCAGCTCCGCCACTACGGCGGTGATACAGATGACGATCAGGGCGACAATCATCGCCTTATGCTGCTTCATTGCTCTCTTCTCCTTGACCTTACGGTCAGTAAGAGGCACTCTACATGTGTTCAGCATATAGGAGGCCTCGGGTtgtactgaccccaaaaagttggacagtt < 1:206140‑M1/213‑29 (MQ=255) 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1:76192‑M1/136‑195 (MQ=255) gccACTACGGCGGTGATACAGATGACGATCAGGGCGACAATCATCGCCTTATGCTGCTTCATTGCTCTCTTCTCCTTGACCTTACGGTCAGTAAGAGGCACTCTACATGTGTTCAGCATATAGGAGGCCTCGGGTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtagtattc > 1:414953‑M1/1‑135 (MQ=255) agatgatcatgtaaccatcatcagttgtgaagtagtgattcacgacttcaaggcgcttttcaaaagggtattttggctttgacatattaggggctattcaatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGGTTGATGGTAAAATATCACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATGCCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATCTCGCTCTCTTTAACCCCTTTTgttttt < 2:43474‑M1/119‑2 (MQ=255) aCTACGGCGGTGATACAGATGACGATCAGGGCGACAATCATCGCCTTATGCAGCTTCATTGCTCTCTTCTCCTTGACCTTACGGTCAGTAAGAGGCACTCTAAATCTGTTCAGCCTATAGGAGGCCTCGGGTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcataaaggtctgattccgatattcaattggggtcagaccttttaatttccggctaatttttctgctgttgtagtatttaat > 1:194184‑M1/1‑132 (MQ=255) 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2:262771‑M1/150‑76 (MQ=255) aTTGCTCTCTTCTCCTTGACCTTACGGTCAGTAAGAGGCACTCTACATGTGTTCAGCATATAGGAGGCCTCGGGTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcaga > 1:262771‑M1/1‑75 (MQ=255) tGCTCTCTTCTCCTTGACCTTACGGTCAGTAAGAGGCACTCTACATGTGTTCAGCATATAGGAGGCCTCGGGTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtagtattc > 1:133332‑M1/1‑73 (MQ=255) tGCTCTCTTCTCCTTGACCTTACGGTCAGTAAGAGGCACTCTACATGTGTTCAGCATATAGGAGGCCTCGGGTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtagtattc < 2:133332‑M1/189‑117 (MQ=255) gCTCTCTTCTCCTTGACCTTACGGTCAGTAAGAGGCACTCTACATGTGTTCAGCATATAGGAGGCCTCGGGTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtagtattcaatatattccgtaacagcatccttcagttcgcttatattactgaactcatcaagataaaaac < 2:142515‑M1/250‑179 (MQ=255) 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ggTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtagtattcaatatattccgtaacagcatccttcagttcgcttatattactgaactcatcaagataaaaacactccgactttaaggttccaaagaaacactccaccacagcattatccagacaattgccttttctggacat > 1:82634‑M1/1‑3 (MQ=255) ggTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtagtattcaatatattccgtaacagcatccttcagttcgcttatattactgaactcatcaagataaaaacactccgactttaaggttccaaagaaacactccaccacagcattatccagacaattgccttttctggacat > 1:385123‑M1/1‑3 (MQ=255) ggTTGATGGTAAAATATCACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATGCCTGAGACAGACAGCCTCACGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTCATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGGCCTa > 2:214654/1‑250 (MQ=255) | ATGGGATCACTCCCCGCCGTTGCTCTTACTCGGATTCGTAAGCCGTGAAAACAGCAACCTCCGTCTGGCCAGTTCGGATGTGAACCTCACAGAGGTCTTTTCTCGTTACCAGCGCCGCCACTACGGCGGTGATACAGATGACGATCAGGGCGACAATCATCGCCTTATGCTGCTTCATTGCTCTCTTCTCCTTGACCTTACGGTCAGTAAGAGGCACTCTACATGTGTTCAGCATATAGGAGGCCTCGGGTTGATGGTAAAATATCACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATGCCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTCATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGGCCTAA > NC_000913/16726‑17224 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |