| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,219,128 | G→A | intergenic (‑52/‑366) | aer ← / → patA | aerotaxis receptor/putrescine aminotransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,219,128 | 0 | G | A | 100.0% | 79.8 / NA | 23 | intergenic (‑52/‑366) | aer/patA | aerotaxis receptor/putrescine aminotransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (9/14); total (9/14) | |||||||||||
CATATCCGGGTGACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAGGTATAGCCGCTCACCTGCACAAAAGTGTCATTAGCATGAGTGATATAGCTTTGCAGATCGGTAGTGGACATCAGAGTGGTATCGTCCGCCAGCGGGGTATTTTGCTGGGTGACATACGGATGAGAAGACATGTTCGCGTCCTGTGCAGGTTATATGGTTGTTAACTTCTTGTCAGAGTTTATGTCGGCCCCGCTGCGGTTATCTTTAACCGATTAATTTGATTTAGATCGCAATTTGCGATTTAAACACAAATCTAATTCCTTGATTTAAAATACTTTCACTCTGTTACTATACGAAAACGTTAATTATCTTGCCCAAAAATCAGGCAATTATTGCCCTGAAAACGTGCATTTGCGCAGCAATCATCAAATCCATACCCGACAAAAACCGTGCAAAATAACAACAAATGTTAACAGATAGCATTAA > NC_000913/3218894‑3219371 | cATATCCGGGTGACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAGGTATAGCCGCTCACCTGCACAAAAGTGTCATTAGCATGAGTGATATAGCTTTGCAGATCGGTAGTGGACATCAGAGTGGTATCGTCCGCCAGCGGGGTATTTTGCTGGGTGACATACGGATGAGAAGACATGTTCGCGTCCTGTGCAGGTTATATGGTTGTTAACTTCTTGTCAGAGTTTATATCGGCCCCGCTGCGGt < 2:372512/251‑1 (MQ=255) atatCCGGGTGACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAGGTATAGCCGCTCACCTGCACAAAAGTGTCATTAGCATGAGTGATATAGCTTTGCAGATCGGTAGTGGACATCAGAGTGGTATCGTCCGCCAGCGGGGTATTTTGCTGGGTGACATACGGATGAGAAGACATGTTCGCGTCCTGTGCAGGTTATATGGTTGTTAACTTCGTGTCAGAGTTTATATCGGCCCCGCTGCGGtt < 1:394249/251‑1 (MQ=255) aCCATGTTGTGCGGCTACACTTGGAACTCTTGCAAGGTAGAGCCGCTCACCTGCACAAAAGTGTCATTAGCATGAGTGATATAGCTTTGCAGATCGGTAGTGGAGATCAGAGTGGTATCGTCCGCCAGCGGGGTATTTTGCTGGGTGACATACGGATGAGAATACATGTTCGCGTCCTGTGCGGGTTATATGGTTGTTAACTTCGTTTCAGAGTGGATATCGGCCCCGCTGCGGTTATCTTGAACCGATTa < 2:43991/251‑1 (MQ=255) cATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAGGTATAGCCGCTCACCTGCACAAAAGTGTCATTAGCATGAGTGATATAGCTTTGCAGATCGGTAGTGGACATCAGAGTGGTATCGTCCGCCAGCGGGGTATTTTGCTGGGTGACATACGGATGAGAAGACATGTTCGCGTCCTGTGCAGGTTATATGGTTGTTAACTTCTTGTCAGAGTTTATATCGGCCCCGCTGCGGTTATCTTTAACCGATTAAt < 1:141221/251‑1 (MQ=255) gCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAGGTATAGCCGCTCACCTGCACAAAAGTGTCATTAGCATGAGTGATATAGCTTTGCAGATCGGTAGTGGACATCAGAGTGGTATCGTCCGCCAGCGGGGTATTTTGCTGGGTGACATACGGATGAGAAGACATGTTCGCGTCCTGTGCAGGTTATATGGTTGTTAACTTCTTGTCAGAGTTTATATCGGCCCCGCTGCGGTTATCTTTAACCGATTAATTTGATTTAGAt < 1:376033/251‑1 (MQ=255) aaGGTATAGCCGCTCCCCTGCACAAAAGCGTCATTAGCATGAGTGATATAGCTTTGCAGATCGGTAGTGGACATCAGAGTGGTATCGTCCGCCAGCGGGGTATTTTGCTGGGTGACATACGGATGAGAAGACATGTTCGCGTCCTGTGCAGGTTATATGGTTTTTAACTTCTTGTCAGAGTTTATATCGGCCCCGCTGCGGTTATCTTTAACCGATTAATTTGATTTAGATCGCAATTTGCGATTTAAaca < 2:343623/251‑1 (MQ=255) ccGCTCACCTGCACAAAAGTGTCATTAGCATGAGTGATATAGCTTTGCAGATCGGTAGTGGACATCAGAGTGGTATCGTCCGCCAGCGGGGTATTTTGCTGGGTGACATACGGATGAGAAGACATGTTCGCGTCCTGTGCAGGTTATATGGTTGTTAACTTCTTGTCAGAGTTTATATCGGCCCCGCTGCGGTTATCTTTAACCGATTAATTTGGTTTAGATCGCAATTTGCGATTTACACACAAATCTa > 1:275124/1‑250 (MQ=255) cACCTGCACAAAAGTGTCATTAGCATGAGTGATATAGCTTTGCAGATCGGTAGTGGACATCAGAGTGGTATCGTCCGCCAGCGGGGTATTTTGCTGGGTGACATACGGATGAGAAGACATGTTCGCGTCCTGTGCAGGTTATATGGTTGTTAACTTCTTGTCAGAGTTTATATCGGCCCCGCTGCGGTTATCTTTAACCGATTAATTTGATTTAGATCGCAATTTGCGATTTAAACACAAATCTAATTcc < 1:430956/250‑1 (MQ=255) gtCATTAGCATGAGTGATATAGCTTTGCAGATCGGTAGTGGACATCAGAGTGGTATCGTCCGCCAGCGGGGTATTTTGCTGGGTGACATACGGATGAGAAGACATGTTCGCGTCCTGTGCAGGTTATATGGTTGTTAACTTCTTGTCAGAGTTTATATCGGCCCCGCTGCGGTTATCTTTAACCGATTAATTTGATTTAGATCGCAATTTGCGATTTAAACACAAATCTAATTCCTTGATTTAAAATACtt < 2:5050/251‑1 (MQ=255) tGCAGATCGGTAGTGGACATCAGAGTGGTATCGTCCGCCAGCGGGGTATTTTGCTGGGTGACATACGGATGAGAAGACATGTTCGCGTCCTGTGCAGGTTATATGGTTGTTAACTTCTTGTCAGAGTTTATATCGGCCCCGCTGCGGTTATCTTTAACCGATTAATTTGATTTAGATCGCAATTTGCGATTTAAACACAAATCTAATTCCTTGATTGAAAATACTTTCTCTCTGTTGCTATACTAAAACg < 2:205915/250‑1 (MQ=255) gTGGTATCGTCCGCCAGCGGGGTATTTTGCTGGGTGACATACGGATGAGAAGACATGTTCGCGTCCTGTGCAGGTTATATGGTTGTTAACTTCTTGTCAGAGTTTATATCGGCCCCGCTGCGGTTATCTTTAACCGATTAATTTGATTTAGATCGCAATTTGCGATTTAAACACAAATCTAATTCCTTGAtt > 1:235766/1‑192 (MQ=255) gTGGTATCGTCCGCCAGCGGGGTATTTTGCTGGGTGACATACGGATGAGAAGACATGTTCGCGTCCTGTGCAGGTTATATGGTTGTTAACTTCTTGTCAGAGTTTATATCGGCCCCGCTGCGGTTATCTTTAACCGATTAATTTGATTTAGATCGCAATTTGCGATTTAAACACAAATCTAATTCCTTGAtt < 2:235766/192‑1 (MQ=255) ttttGCTGGGTGACATACGGATGAGAAGACATGTTCGCGTCCTGTGCAGGTTATATGGTTGTTAACTTCTTGTCAGAGTTTATATCGGCCCCGCTGCGGTTATCTTTAACCGATTAATTTGATTTAGATCGCAATTTGCGATTTAAACACAAATCTAATTCCTTGATTTAAAATACTTTCACTCTGTTACTATACGAAAACGTTAATTATCTTGCCCAAAAATCAGGCAATTATTGCCCTGAAAACGTGc > 2:409730/1‑250 (MQ=255) cATACGGATGAGAAGACATGTTCGCGTCCTGTGCAGGTTATATGGTTGTTAACTTCTTGTCAGAGTTTATATCGGCCCCGCTGCGGTTATCTTTAACCGATTAATTTGATTTAg > 2:87751/1‑114 (MQ=255) cATACGGATGAGAAGACATGTTCGCGTCCTGTGCAGGTTATATGGTTGTTAACTTCTTGTCAGAGTTTATATCGGCCCCGCTGCGGTTATCTTTAACCGATTAATTTGATTTAg < 1:87751/114‑1 (MQ=255) ggATGAGAAGACGTGTTCGCGTCCTGTGCAGGTTATATGGTTGTTAACTTCTTGTCAGAGTTTATATCGGCCCCGCTGCGGTTATCTTTAACCGATTAATTTGATTTAGATCGCAATTTGCGATTTAAACACAAATCTAATTCCTTGATTTAAAATACTTTCACTCTGTTACTATACGAAAACGTTAATTATCTTGCCCAAAAATCAGGCAATTATTGCCCTGAAAACGTGc > 2:187444/1‑232 (MQ=255) ggATGAGAAGACGTGTTCGCGTCCTGTGCAGGTTATATGGTTGTTAACTTCTTGTCAGAGTTTATATCGGCCCCGCTGCGGTTATCTTTAACCGATTAATTTGATTTAGATCGCAATTTGCGATTTAAACACAAATCTAATTCCTTGATTTAAAATACTTTCACTCTGTTACTATACGAAAACGTTAATTATCTTGCCCAAAAATCAGGCAATTATTGCCCTGAAAACGTGc < 1:187444/232‑1 (MQ=255) aCATGTTCGCGTCCTGAGCAGGTTATATTGTTGTTAACTTCTTGTCAGAGTTTATATCGGCCCCGCTGCGGTTATCTTTAACCGCTTAATTTGATTTAGATCGCAATTTGCGATTTAAACACAACTCTAATTCCTTGATTTAAAATACTTTCACTCTGTTACTATACGACAACGTTAATTATCTTGCCCAAAAATCAGGCAATTATTGCCCTGAAAACGTGCATTTGCGCAGCAATCATCAAATCCATAcc > 2:19111/1‑251 (MQ=255) gTTCGCGTCCTGTGCAGGTTATATGGTTGTTAACTTCTTGTCAGAGTTTATATCGGCCCCGCTTCGGTTATCTTTAACCGATTAATTTGATTTAGATCGCAATTTGCGATTTAAACACAAATCTAATTCCTTGATTTAAAATACTTTCACTCTGTTACTATACGAAAACGTTAATTATCTTGCCCAAAAATCATGCAATTATTGCCCTGAAAACGTGCATTTGCTCAGCAATCATCAAATCCATAccctac < 2:372274/251‑4 (MQ=255) tCCTGTGCAGGTTATATGGTTGTTAACTTCTTGTCAGAGTTTATATCGGCCCCGCTGCGGTTATCTTTAACCGATTAATTTGATTTAGATCGCAATTTGCGATTTAAACACAAATCTAATTCCTTGATTTAAAATACTTTCACTCTGTTACTATACGAAAACGTTAATTATCTTGCCCAAAAATCAGGCAATTATTGCCCTGAAAACGTGCATTTGCGCAGCAATCATCAAATCCATACCCGACAAAAAcc > 2:184734/1‑251 (MQ=255) aGGTTATATGGTTGTTAACTTCTTGTCAGAGTTTATATCGGCCCCGCTGCGGTTATCTTTAACCGATTAATTTGATTTAGATCGCAATTTGCGATTTAAACACAAATCTAATTCCTTGATTTAAAATACTTTCATTCTGTTACTATACGAAAACGTTAATTATCTTGCCCAAAAATCAGGCAATTATTGCCCTGAAAACGTGCATTTGCGCAGCAATCATCAAATCCATACCCGACAAAAACCGTGCaaa > 1:135078/1‑250 (MQ=255) tcttGTCAGAGTTTATATCGGCCCCGCTGCGGTTATCTTTAACCGATTAATTTGATTTAGATCGCAATTTGCGATTTAAACACAAATCTAATTCCTTGATTTAAAATACTTTCACTCTGGGACTATACGAAAACGTTAATTATCTTGCCCAAAAATCAGGCAATTATTGCCCTGAAAACGTGCATTTGCGCAGCAATCATCAAATCCATACCCGACAAAAACCGTGCAAAATAACAACAAATGTTAACAg < 1:392618/250‑1 (MQ=255) gTTTATATCGGCCCCGCTGCGGTTATCTTTAACCGATTAATTTGATTTAGCTCGCAATTTGCGATTTAAACACAAATCTAATTCCTTGATTTAAAATACTTTCACTCTGTTACTATACGAAAACGTTAATTATCTTGCCCAAAAATCAGGCAATTATTGCCCTGAAAACGTGCATTTGCGCAGCAATCATCAAATCCATACCCGACAAAAACCGTGCAAAATAACAACAAATGTTAACAGATAGCATTaa > 1:42151/1‑250 (MQ=255) | CATATCCGGGTGACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAGGTATAGCCGCTCACCTGCACAAAAGTGTCATTAGCATGAGTGATATAGCTTTGCAGATCGGTAGTGGACATCAGAGTGGTATCGTCCGCCAGCGGGGTATTTTGCTGGGTGACATACGGATGAGAAGACATGTTCGCGTCCTGTGCAGGTTATATGGTTGTTAACTTCTTGTCAGAGTTTATGTCGGCCCCGCTGCGGTTATCTTTAACCGATTAATTTGATTTAGATCGCAATTTGCGATTTAAACACAAATCTAATTCCTTGATTTAAAATACTTTCACTCTGTTACTATACGAAAACGTTAATTATCTTGCCCAAAAATCAGGCAATTATTGCCCTGAAAACGTGCATTTGCGCAGCAATCATCAAATCCATACCCGACAAAAACCGTGCAAAATAACAACAAATGTTAACAGATAGCATTAA > NC_000913/3218894‑3219371 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |