| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 249545 | 83 (1.970) | 54 (1.320) | 50/468 | 0.1 | 42.8% | intergenic (+1411/‑1353) | rayT/dinB | REP‑associated tyrosine transposase/DNA polymerase IV |
| ? | NC_000913 | 373870 = | 64 (1.570) | coding (950/951 nt) coding (3/1014 nt) |
mhpF mhpE |
acetaldehyde dehydrogenase (acetylating) MhpF 4‑hydroxy‑2‑oxovalerate aldolase |
|||||
Only 100 of 138 total aligned reads displayed.
CGCTGGGTGAGCGGGTTACCCTGTGCTTTGTCCACCAGCGCCACCAGTTTGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTT‑CGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCC‑GCCGCCAGCGGCTGTTTGC‑TCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATTCCCGGTACCACCGCCAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTA‑CGCACGTCATGGGCGATATCGCCGTTGTCGCTGACGCGGGTGACGATAATCGCCGCCGCGGTGGAGAGCAGCAGGGAAGGGATCTGCGCCACCAGGCCGTCGCCGATGGTCATCAGCACATACTGCTGGAAGGCAGCATCGGCGCTCAGGTTGTATTTGAAGATCCCGATACA > NC_000913/249298‑249794 | cGCTGGGTGAGCGGGTTACCCTGTGCTTTGTCCACCAGCGCCACCAGTTTGTAACCGTGGCTTCAACTGATAGGCTCGATCCGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTT‑CGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCTCCTCC‑GCCGCCAGCGGCTGTTTGC‑TCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCCAAAACGGCAGGTGCGGCCTTcc > 1:37579/1‑251 (MQ=255) gcgggggtggcgggttcccCTGTGCTTTGCCCACCAGCGCCACCAGGTTGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGAGCAGCGGAAGGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTG‑CGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCC‑GCCGCCAGCGGCTGTTTGC‑TCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATgaac < 2:52118‑M1/242‑5 (MQ=255) gAGCGGGTTACCCTGTGCTTTGTCCACCAGCGCCACCAGTTTGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTT‑CGGGGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCC‑GCCGCCAGCGGCTGTTTGC‑TCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGCACAGCAAAAACGGCAGGGGCGGCATTCCCGGTaca > 2:157361/1‑249 (MQ=255) aGCGGGTTACCCCGTGCCTTGCCCACCAGCGCCACCAGTTTGTAACCGAGGCGCCAACTGATCGGCTCGATCAGCGGTGAGGTTTCACAAATGACCCGCTGCTCGCTGGTTT‑CGGGGATGGTGCGGGTCAGCGGTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCC‑GCCGCCCGCGGCTGTTTGC‑TCTTACGCCAGCCGGGAAAACCAAGAAAGGCGCAGTACAGCACACACGGCGGGGGGGGCAATCCCGGTaccac > 2:290195/1‑251 (MQ=255) cGGGTTACCCTGTGCTTTGTCCACCAGCGCCACCAGTTTGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTT‑CGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCC‑GCCGCCAGCGGCTGTTTGC‑TCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATgaacggtaaaaaac < 1:42934‑M1/251‑15 (MQ=255) gggTTCCCCTGTGCTTTGTCCCCCAGCGCCCCCAGTTTGTACCCGAGGATTAAACTGATAGTCTCGCTCAGCGGAATTGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCGGGTTG‑CTGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCTCCTCC‑GCCGCCAGCGGCTGTTTGC‑TCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAATCGGCAGGGGCGGCATgaacggtaaaaaact < 2:198139‑M1/251‑16 (MQ=255) ggTTACCCTGTGCTTTGTCCACCAGCGCCACCAGTTTGTAACCGCGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTT‑CGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCC‑GCCGCCAGCGGCTGTTTGC‑TCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATgaacggtaaaaaactt > 1:377175‑M1/1‑235 (MQ=255) ttACCCTGTGCTTTGTCCACCAGCGCCACCAGTTTGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTT‑CGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCC‑GCCGCCAGCGGCTGTTTGC‑TCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGAGCGGCCTgaacgggaaaaaactttt > 1:350421‑M1/1‑233 (MQ=255) tACCCGGTGCTTTGTCCACCAGCGCCCCCAGTTTGTAACCGAGGCTTAACCTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTT‑CGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCC‑GCCGCCAGCGGCTGTTTGC‑TCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATTCCCGGTACCACCGCCAg < 2:372478/250‑1 (MQ=255) gtgCTGTGTCCACCATCTCCCCCTGTTGTTAACCGAGGCTTAAACTGATGGGCGCGTTCAGTGGAAGGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTT‑CGGTGAGGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCTCCGCC‑GCCGCCAGCGGCTGTGTGC‑TCAGCCGCGAGCCGGTAAAGCCAAGCAGTGCGCTGAACAGCAAAAACGGCATGTGCGGCAtgaacggtaaaaaactgtatatctct < 2:285276/251‑26 (MQ=255) tttGTCCACCAGCGCCACCAGTTTGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTT‑CGGTGATGGTGCGGGTCCGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCC‑GCCGCCAGCGGCTGTTTGC‑TCATCCGCCAGCCGGTCAACACAAGCCGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATggacggagaacaacttgatatctcgggcg > 2:262989‑M1/1‑222 (MQ=255) tttGTCCACCAGCGCCACCAGTTTGTAACAGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTT‑CGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCC‑GCCGCCAGCGGCTGTTTGC‑TCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCCGGGGCGGCATTCCCGGTACCACCGCCAGCACCAACATa > 2:418058/1‑250 (MQ=255) caccaGCGCCACCAGTTTGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTT‑CGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCC‑GCCGCCAGCGGCTGTTTGC‑TCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGGGCGGCATTCCCGGTACCACCCCCACCACGaaacaaaacccgg > 2:241885/1‑240 (MQ=255) gcCACCAGTTTGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTT‑CGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCC‑GCCGCCAGCGGCTGTTTGC‑TCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATTCCCGGTACCACCGCCAGCACGAACATAATCCCGGTGGCggg > 1:415689/1‑250 (MQ=255) ccaGTTTGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTT‑CGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCC‑GCCGCCAGCGGCTGTTTGC‑TCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATTCCCGGTACCACCGCCAGCACGAACAAAATCCCGGTGGCGgtgt > 1:421190/1‑249 (MQ=255) cagttgtaaaacgaggttgcaagtGATAGGCTCTATCCGCGGGAGGGTTGCCCAACGTCCCCGCTGCTCGC‑GGTTTGCGGTGATGGTGCGGGTCAGCTTCTCGAGGCGTTTCTCTGCCTCCCCA‑GCCGCCAGCGGGTGTTGGC‑CAATCCGCCAGCGGGTAAACCCAAGCAGGTCGCTGAACAGCAAAAGCGGCAGGTGCGGCTTTCCTGGTACCACCGCCAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTaga < 2:308791/228‑1 (MQ=255) tGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTT‑CGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCC‑GCCGCCAGCGGCTGTTTGC‑TCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATggacggtaaaaaactttatatctcggacggcacattgcgtgacggtatgcac > 1:262237‑M1/1‑199 (MQ=255) tAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTT‑CGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCC‑GCCGCCAGCGGCTGTTTGC‑TCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGGGCGGCATgaacggtaaacaactttatatctcggacagcacattgcgggacggtatggaccc > 2:378414‑M1/1‑197 (MQ=255) aCCGAGGCTGAAACTGAGAGGCTCGACCAGCGTAATGGTTTCCCAACTGACCGCCTGCTCGCTGGTTT‑CGGTGATGTTGCGGGTCAGCTTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCC‑GCCGCCAGCGGCTGTTTGC‑TCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATTCCCGGTCCCACCGCCAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACg < 1:87920/251‑1 (MQ=255) ccGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTT‑CGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCC‑GCCGCCAGCGGCTGTTTGC‑TCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATTCCCGGTACCACCGCCAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACgg < 1:106560/251‑1 (MQ=255) cGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTT‑CGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCC‑GCCGCCAGCGGCTGTTTGC‑TCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATTCCCGGTACCACCGCCAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGGGTAGAGAACCAACggg > 2:69313/1‑251 (MQ=255) gAGGCTTAAACGGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTCCCCAACTGACCGGCTGCTCGCTGGTTT‑CGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCGCC‑GCCGCCAGCGGCTGTTTGC‑GCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTTCGGCATgaacggtaaaaaactttatatctcggacgtcacattgcgtgacggtatgcacgccattc < 1:22544‑M1/251‑60 (MQ=255) 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cGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTT‑CGTTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCC‑GCCGCCAGCGGCTGTTTGC‑TCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATgaacggtaaaaaactttatatctcggacgtcacattgcgtgacggtatgcacgccattcgtcatcagtattcgctgga < 2:350421‑M1/250‑79 (MQ=255) cAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTT‑CGGTTATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTCCCGCCTCC‑GCCGCCAGCGGCTTTTTGC‑TCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATTCCCGGTACCACCGCCAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTA‑CGCACg < 1:24570/250‑1 (MQ=255) cGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTT‑CGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCC‑GCCGCCAGCGGCTGTTTGC‑TCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATgaacggtaaaaaactttatatctccgacgtcacatttggtgacggtatgcaagccattcgtcatcagtattcgctggaaaacgttt > 2:154052‑M1/1‑165 (MQ=255) ggAATGGTTTCCCAACTGATCTGCTGCTCGCTGGTCT‑CGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCC‑GCCGCCAGCGGCTGTTTGC‑TCAGCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATgaacggtaaaaaactttatatctcggacgtcacattgcgtgacggtatgcacgccattcgtcatcagtattcgctggaaaacgttcg < 1:280320‑M1/251‑88 (MQ=255) gAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTT‑CGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCC‑GCCGCCAGCGGCTGTTTGC‑TCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATTCCCGGTACCACCGCCAGCACGCAAATAATCCCGGGGGTGGGGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCCGCTGGTTT‑CGCCCGttag > 2:337462/1‑246 (MQ=255) aaTGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTT‑CGGTGATGGAGCGGGTAAGCGATTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCC‑GCAGCCAGCGGCTATCTGC‑TCATCCGCAAGCCGGTAAAACCCAGCAGGGAGCTGCAAAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATTCCCGGTACCCCCGCCAGCCCGAAAATAATACCGGTGGCGGCTTAGAGCACCGACAGACTTGCCAGCAGGTAGTTA‑CGACCGTCATggg > 1:251928/1‑251 (MQ=255) aTGGTTTCCCAACTGCCCTGCTGCTCGCTGGTTT‑CGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTCCCGCCCCC‑GCCGCCAGCGGCTGTTTGC‑TCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATTCCCGGTACCACCGCCAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTA‑CGCACGTCATGGGc < 1:238290/251‑1 (MQ=255) tGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTT‑CGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCC‑GCCGCCAGCGGCTGTTTGC‑TCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATTCCCGGTACCACCGCCAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTA‑CGCACGTCATGGGCg > 1:318125/1‑251 (MQ=255) gTTTCCCAACTGACATGCTGATCGCTGGTTT‑CGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCC‑GCCGCCAGCGGCTGTTTGC‑TCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATTCCCCGTAACCCCGCCAGCACGCACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGCGCACCGACGGGCTTGACAGCAGCTGGTTA‑CGCCCGTCGTGGGCGat > 2:195720/1‑251 (MQ=255) 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CGCTGGGTGAGCGGGTTACCCTGTGCTTTGTCCACCAGCGCCACCAGTTTGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTT‑CGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCC‑GCCGCCAGCGGCTGTTTGC‑TCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATTCCCGGTACCACCGCCAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTA‑CGCACGTCATGGGCGATATCGCCGTTGTCGCTGACGCGGGTGACGATAATCGCCGCCGCGGTGGAGAGCAGCAGGGAAGGGATCTGCGCCACCAGGCCGTCGCCGATGGTCATCAGCACATACTGCTGGAAGGCAGCATCGGCGCTCAGGTTGTATTTGAAGATCCCGATACA > NC_000913/249298‑249794 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |