| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 2,187,650 | IS1 (–) +9 bp | coding (757‑765/1035 nt) | yehA ← | putative fimbrial adhesin YehA |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1978503 = | NA (NA) | 18 (0.570) | 18/486 | 0.6 | 100% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 2187658 | 0 (0.000) | coding (757/1035 nt) | yehA | putative fimbrial adhesin YehA | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 1979270 | NA (NA) | 25 (0.790) | 23/486 | 0.4 | 100% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 2187650 = | 0 (0.000) | coding (765/1035 nt) | yehA | putative fimbrial adhesin YehA | |||||
AGTGCGCCAGATTTAACTTTGTTTGTATCGTAGACGTAGTAACTGGCTGTTATCGGAATTGAAACCGTTGTATCTGTAAGTTTTGACTTCGCCGCAACTTCCTTTAAATTTGTATATCCTTTACTGCTGTTAGTGATATTTAAAAGTGTGACTGGCGAACCATTACTTTCAAGAATAAATCCTACGCCATTATCTTCCGCACCTTTCAGTATTGTGTTGCTGTTGGTTAACAAGTCAGAACTTGATAAATACACCTGCATTTTCCGTGATGTTTGATTTTGTTGACCTAATAAATTTTTACAACGCAGAATAATATCCCCTTGTTTACTATTTATTGTTGCTTTGTTACCTGTGGCTGGTAATTGTGAAACGGGAATACTGTCTAAAGTAATTAATAAATCGTCCGGTTTGCAGGTTGTGGTTATCGGGTTGTATGACAATGTCAGATTAAAGGAATAG > NC_000913/2187417‑2187875 | aGTGCGCCAGATTTAACTTTGTTTGTATCGTAGACGTAGTAACTGGCTGTTATCGGAATTGAAACCGTTGTATCTGTAAGTTTTGACTTCGCCGCAACTTCCTTTAAATTTGTATATCCTTTACTGCTGTTAGTGATATTTAAAAGTGTGACTGGCGAACCATTACTTTCAAGAATAAATCCTACGCCATTATCTTCCGCACCTTTCAGTATTGTGTTGCTGTTGGTTAACAAGTCAGAACTggtaatgac < 2:13525‑M2/251‑10 (MQ=255) gTGCGCCAGATGTAACTTGGTTTGTATCGGAGACGTAGTAACTGGCTGTTTTCGGAATTGAAACCGTTGTAGCTGTAAGTTGTGACTTCGCCGCAACTTCCTTTAAATGTGTATATCCTTTACTGCGGTTAGTGAGATTTAAAAGTGTGACTGGCGAGCCATTACTTGCAAGAATAAATCCTACGCCATTATCTTCCGCACCGTTCAGTATTGTGTTGCTGTTGGTTAACAAGTCAGAACTggtaatgact > 1:25605‑M2/1‑241 (MQ=255) tttctggtgcgtaccgggttgagaagcggtgtaagtgaactgcagttgccatgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGTCAGAACTTGATAAATACACCTGCATTTTc > 1:224338‑M2/221‑251 (MQ=255) ggtgcgtaccgggttgagaagaggtgtaagtgaactgcagttgccatgttttacggcagtgagagcagagctagcgctgctgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgcacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcataccctaaatcagtaagttggcagcatcaccGTCAGAACTTGATAAATAAACCTGCATTTTCCGTg > 2:144712‑M2/216‑250 (MQ=255) ttgtATCGTAGACGTAGTAACTGGCTGTTATCGGAATTGAAACCGTTGTATCTGTAAGTTTTGACTTCGCCGCAACTTCCTTTAAATTTGTATATCCTTTACTGCTGTTAGTGATATTTAAAAGTGTGACTGGCGAACCATTACTTTCAAGAATAAATCCTACGCCATTATCTTCCGCACCGTTCAGTATTGTGTTGCTGTTGGTTAACAAGTCAGAACGggtaatgactccaacttattgatagtgttt > 2:30702‑M2/1‑220 (MQ=255) aTCGTAGACGTAGTAACTGGCTGTTATCGGAATTGAAACCGTTGTATCTGTAAGTTTTGACTTCGCCGCAACTTCCTTTAAATTTGTATATCCTTTACTGCTGTTAGTGATATTTAAAAGTGTGACTGGCGAACCATTACTTTCAAGAATAAATCCTACGCCATTATCTTCCGCACCTTTCAGTATTGTGTTGCTGTTGGTTAACAAGTCAGAACTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatg > 2:288345‑M2/1‑216 (MQ=255) gggttgagaagcggtgtaagtgaactgcagttgccatgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGTCAGAACTTGATAAATACACCTGCATTTTCCGTGATGTTTGAttt > 2:129893‑M2/206‑251 (MQ=255) gttgagaagcggtgtaagtgaactgcagttgccatgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGTCAGAACTTGATAAATACACCTGCATTTTCCGTGATGTTTGATTttg < 1:223553‑M2/48‑1 (MQ=255) ggtgtaagtgaactgcagttgccatgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGTCAGAACTTGATAAATACACCTGCATTTTCCGTGATGTTTGATTTTGTTGACCtaat < 1:153964‑M2/58‑1 (MQ=255) tGGCTGTTATCGGAATTGAAACCGTTGTATCTGTAAGTTTTGACTTCGCCGCAACTTCCTTTACATTTGTATATCCTTTACTGCTGTTAGTGATATTTAAAAGTGTGACTGGCGAACCATTACTTTCAAGAATAAATCCTACGCCATTATCTTCCGCACCTTTCAGTATTGTGTTGCTGTTGGTTAACAAGTCAGAACTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatg < 2:18806‑M2/251‑53 (MQ=255) gaagtgaactgcagttgccatgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGTCAGAACTTGATAAATACACCTGCATTTTCCGTGATGTTTGATTTTGTTGACCTAATAAAt < 2:178327‑M2/62‑1 (MQ=255) agtgaactgcagttgccatgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgaagtccggcggtgcttttgccgttacgcacctccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaaggtggcagcatcaccGTCATAACTTGATAAATACACCTGTATTTTCCGTGATGTTTGATTTTGTTGACCTaataaaatt < 2:245950‑M2/64‑4 (MQ=255) gaactgcagttgccatgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGTCAGAACTTGATAAATACACCTGCATTTTCCGTGATGTTTGATTTTGTTGACCTAATAAATTTTTa < 1:129893‑M2/67‑1 (MQ=255) aaTTGAAACCGTTGTATCTGTAAGTTTTGACTTCGCCGCAACTTCCTTTAAATTTGTATATCCTTTACTGCTGTTAGTGATATTTAAAAGTGTGACTGGCGAACCATTACTTTCAAGCATAAATCCTACGCCATTATCTTCCGCACCTTTCAGTATTGTGTTGCTGTTGGTTAACAAGTCAGAACTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcc < 2:148261‑M2/251‑66 (MQ=255) gccatgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaatttggcagcatctccGTCAGAACTTGATAAATACACCTGCATTTGCCGTGATGTTTGATTTTGTTGACCTAATAAATTTTTACAACGCAGaat < 2:200489‑M2/78‑1 (MQ=255) tgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGTCAGAACTTGATAAATACACCTGCATTTTCCGTGATGTTTGATTTTGTTGACCTAATAACTTTTTACAACGCAGaataat > 2:73285‑M2/170‑250 (MQ=255) cggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGTCAGAACTTGATAAATACACCTGCATTTTCCGTGATGTTTGATTTTGTTGACCTAATAAATTTTTACAACGCAGAATAATATCCCCtt < 2:244780‑M2/89‑1 (MQ=255) cTGTAAGTTTTGACTTCGCCGCAACTTCCTTTAAATTTGTATATCCTTTACTGCTGTTAGTGATATTTAAAAGTGTGACTGGCGAACCATTACTTTCAAGAATAAATCCTACGCCATTATCTTCCGCACCTTTCAGTATTGTGTTGCTGTTGGTTAACAAGTCAGAACTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgcctttgtcatgcagctccaccgattttg < 2:69245‑M2/249‑81 (MQ=255) aGTTTTGACTTCGCCGCAACTTCCTTTAAATTTGTATATCCTTTACTGCTGTTAGTGATATTTAAACGTGTGACTGGCGAACCATTACTTTCAAGAATAAATCCTACGCCATTATCTTCCGCACCTTTCAGTATTGTGTTGCTGTTGGTTAACAAGTCAGAACTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacg < 1:309122‑M2/250‑87 (MQ=255) gACTTCGCCGCAACTTCCTTTAAATTTGTATATCCTTTACTGCTGTTAGTGATATTTAAAAGTGTGACTGGCGAACCATTACTTTCAAGAATAAATCCTACGCCATTATCTTCCGCACCTTTCAGTATTGTGTTGCTGTTGGTTAACAAGTCAGAACTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcg < 1:178220‑M2/250‑93 (MQ=255) atagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGTCAGAACTTGATAAATACATCTGCATTTTCCGTGATGTTTGATTTTGTTGACCTAATAATTTTTTACAACTCAGAATAATATCCCCTTGTTTACTATTTAttgtt < 2:219141‑M2/106‑1 (MQ=255) cgcggatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGTCAGAACTTGATAAATACACCTGCATTTGCCGTGATGTTTGATTTTGTTGACCTAATAAATTTTTACAACGCAGAATAATATCCCCTTGTTTTCTAGTTATTGTTGCtt < 2:249423‑M2/110‑1 (MQ=255) gctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGTCAGAACTTGATAAATACACCTGCATTTTCCGTGATGTTTGATTTTGTTGACCTAATAAATTTTTACAACGCAGAATAATATCCCCTTGTTTACTATTTATTGTTGCttt > 2:105213‑M2/141‑251 (MQ=255) aaCTTCCTTTAAATTTGTATATCCTTTACTGCTGTTAGTGATATTTAAAAGTGTGACTGGCGAACCATTACTTTCAAGAATAAATCCTACGCCATTATCTTCCGCACCTTTCAGTATTGTGTTGCTGTTGGTTAACAAGTCAGAACTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtccc < 2:91942‑M2/250‑104 (MQ=255) atgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGTCAGAACTTGATAAATACACCTGCATTTTCCGTGATGTTTGATTTTGTTGACCTAATAAATTTTTACAACGCAGAATAATATCCCCTTGTTTACTATTTATTGTTGCTTTGTTa < 1:144712‑M2/115‑1 (MQ=255) tccggcggtgcttttgccgttacgcaccaacccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacgctaaatcagtaagttggcagcatcaccGTCAGAACTTGATAAATACACCTGCATTTTCCGTGATGTTTGATTTTGTTGACCTAATAAATTTTTACAACGCAGAATAATATCCCCTTGTTTACTATTTATTGTTGCTTTGTTACCt > 1:114267‑M2/134‑251 (MQ=255) tttGTATATCCTTTACTGCTGTTAGTGATATTTAAAAGTGTGACTGGCGAACCATTACTTTCAAGAATAAATCCTACGCCATTATCTTCCGCACCTTTCAGTATTGTGTTGCTGTTGGTTAACAAGTCAGAACTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtg < 2:268615‑M2/251‑118 (MQ=255) ggcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGTCAGAACTTGATAAATACACCTGCATTTTCCGTGATGTTTGATTTTGTTGACCTAATAAATTTTTACAACGCAGAATAATATCCCCTTGTTTACTATTTATTGTTGCTTTGTTACCTGTGGCTgg < 2:1250‑M2/126‑1 (MQ=255) ccgtcagtagctgaacaggagggacagctgctagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGTCAGAACTTGATAACTACACCTGCATTTTCCGTGATGTTTGATTTTGTTGACCTAATAAATTTTTACAACGCAGAATAATATCCCCTTGTTTACTATTTATTGTTGCTTTGTTACCTGTGGCTGGTAATTGTGAAACGGGAATACTGt > 2:109764‑M2/103‑251 (MQ=255) aGTGATATTTAAAAGTGTGACTGGCGAACCATTACTTTCAAGAATAAATCCTACGCCATTATCTTCCGCACCTTTCAGTATTGTGTTGCTGTTGGTTAACAAGTCAGAACTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgcc > 1:290574‑M2/1‑111 (MQ=255) tcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggcgcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGTCAGAACTTGATAAAt > 1:24817‑M2/100‑116 (MQ=255) tcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGTCAGAACTTGATAAAt < 2:24817‑M2/17‑1 (MQ=255) aaaGTGTGACTGGCGAACCATTACTTTCAAGAATAAATCCTACGCCATTATCTTCCGCACCTTTCAGTATTGTGTTGCTGTTGGTTAACAAGTCAGAACTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgc < 1:173632‑M2/251‑152 (MQ=255) ggCGAACCATTACTTTCAAGAATAAATCCTACGCCATTATCTTCCGCACCTTTCAGTATTGTGTTGCTGTTGGTTAACAAGTCAGAACTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatat > 1:13525‑M2/1‑89 (MQ=255) aaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagtatcaccGTCAGAACTTGATAAATACACCTGCATTTTCCGTGATGTTTGATTTTGTTGACCTAATAAAGTTTTACAACGCAGAATAATATCCCCTTGTTTACTATTTATTGTTGCTTTGTTACCTGTGGCTGGTAATTGTGAAACGGGAATACTGTCTAACGTAATTAATAAACCGTCCGGTTTGCAGGt < 2:244934‑M2/183‑1 (MQ=255) aacagaagccactggagcaccgcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaatttggcagcatcaccGTCAGAACTTGAGAAATACACTTGCATTTTCCGTGATGTTTGATTTTGTTGACCTAATAAATTTTTACAACGCAGAATAATATCCCCTTGTTTACTATGTATTGGTGCTTTGTTACCTGTGGCTGGTAATTGTGAAACGGGAATACTGTCTAAAGTAATTAATAAAGCGTCCGGTTTGCAGGtt < 1:295406‑M2/184‑1 (MQ=255) cACCTTTCAGTATTGTGTTGCTGTTGGTTAACAAGTCAGAAATggtaatcactccaacttattgatcgtgttttatgttcagataatgcacgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatctcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgggattcatacagc < 2:311673‑M2/251‑209 (MQ=255) ctacactaaatcagtcagttggcagcctcaccGTCAGAACTTGATAAATACACCTGCATTTTCCGTGATGTTTGATTTTGTTGACCTAATAAATTTTTACAACGCAGAATAATATCCCCTTGTTTACTCTTTATTTTTGCTTTGTTACCTGTGGCTGGt > 2:293493‑M2/33‑159 (MQ=255) atacactaaagcagtaagttggcagcatcaccGTCAGAACTTGATAAATACACCTGCATTTGCCGTGATGTTTGATTTTGTTGACCTAATAAATTTGTACAACGCAGAATAATATCCCCTTGTTTACTATTTATTGTTGCTTTGTTACCTGTGGCTGGt < 1:293493‑M2/127‑1 (MQ=255) acgctaaatcagtaagttggcagcatcaccGTCAGAACTTGATAAATACACCTGCATTTTCCGTGATGTTTGATTTTGTTGACCTAATAAATTTTTACAACGCAGAATAATATCCCCTTGTTTACTATTTATTGTTGCTTTGTTACCTGTGGCTGGTAATTGTGAAACGGGAATACTGTCTAAAGTAATTAATAAATCGTCCGGTTTGCAGGTTGTGGTTATCGGGTTGTATGACAATGTCAGATTAAAg < 2:114267‑M2/220‑1 (MQ=255) gTATTGTGTTGCTGTTGGTTAACAAGTCAGAACTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgggattcatacagcggccagcca > 1:21855‑M2/1‑34 (MQ=255) | AGTGCGCCAGATTTAACTTTGTTTGTATCGTAGACGTAGTAACTGGCTGTTATCGGAATTGAAACCGTTGTATCTGTAAGTTTTGACTTCGCCGCAACTTCCTTTAAATTTGTATATCCTTTACTGCTGTTAGTGATATTTAAAAGTGTGACTGGCGAACCATTACTTTCAAGAATAAATCCTACGCCATTATCTTCCGCACCTTTCAGTATTGTGTTGCTGTTGGTTAACAAGTCAGAACTTGATAAATACACCTGCATTTTCCGTGATGTTTGATTTTGTTGACCTAATAAATTTTTACAACGCAGAATAATATCCCCTTGTTTACTATTTATTGTTGCTTTGTTACCTGTGGCTGGTAATTGTGAAACGGGAATACTGTCTAAAGTAATTAATAAATCGTCCGGTTTGCAGGTTGTGGTTATCGGGTTGTATGACAATGTCAGATTAAAGGAATAG > NC_000913/2187417‑2187875 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |