| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 298,885 | G→A | P684S (CCG→TCG) | paoC ← | aldehyde dehydrogenase: molybdenum cofactor‑binding subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 298,885 | 0 | G | A | 92.5% | 157.3 / ‑3.4 | 53 | P684S (CCG→TCG) | paoC | aldehyde dehydrogenase: molybdenum cofactor‑binding subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/4); new base A (32/17); total (32/21) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.04e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GTGGTCATCGGTGAGAAACGCCTGCTCTGGCTTATGCCAGTGTTCGTCTTTGTCAAAAAGCGGGTATGACATTGTTCCTCCTTAAACCACATCCGGCAGCTTATCGAGCAGCTTATCCAGAGTGATGGGATAATCCCGTACCCGAATACCGGTGGCGTTATACACC‑GCGTTGGCGATAGCCGCGCTCACGCCGCACAGGCCCAGCTCACCGACACCTTTGG‑CCTTCATCGGGGAGGATATGGGGTCGGTATCATCCAGGAAAATCACCTCCTGTTTTGGGATATCCGCATGAACCGGCACCTCATACCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGTCATCCACCGCCAGCTCCTCCATCAGTGCCGCGCCCATGCCCATAGTCATTGCGCCAATGACCTGGCTGCGCGCAGTTTTCGGATTCAGGATGCGTCCTGCAGCACACACAGCGAGCATACGCCGGACC > NC_000913/298655‑299126 | gtggtCATCGGTGAGAAACGCCTGCTCTGGCTTATGCCAGTGTTCGTCTTTGTCAAAAAGCGGGTATGACATTGTTCCTCCTTAAACCACATCCGGCAGCTTATCGAGCAGCTTATCCAGAGTGATGGGATAATCCCGTACCCGAATACCGGTGGCGTTATACACC‑GCGTTGGCGATAGCCGCGCTCACGCCGCACAGGCCCAGCTCACCGACACCTTTGG‑CCTTCATCGAGGAGGATATGGGGTCGGTat > 2:401654/1‑251 (MQ=255) tggtCATCGGTGAGAAACGCCTGCTCTGGCTTATGCCAGTGTTCGTCTTTGTCAAAAAGCGGGTATGACATTGTTCCTCCTTAAACCACATCCGGCAGCTTATCGAGCAGCTTATCCAGAGTGATGGGATAATCCCGTACCCGAATACCGGTGGCGTTATACACC‑GCGTTGGCGATAGCCGCGCTCACGCCGCACAGGCCCAGCTCACCGACACCTTTGG‑CCTTCATCGAGGAGGATATGGGGTCGGTatc > 1:20074/1‑251 (MQ=255) gtCATCGGTGAGAAACGCCTGCTCTGGCTTATGCCAGTGTTCGTCTTTGTCAAAAAGCGGGTATGACATTGTTCCTCCTTAAACCACATCCGGCAGCTTATCGAGCAGCTTATCCAGAGTGATGGGATAATCCCGTACCCGAATACCGATGGCGTTATACACC‑GCGTTGGCGATAGCCGCGCTCACGCCGCACAGGCCCAGCTCACCGACACCTTTGG‑CCTTCATCGAGGAGGATATGGGGTCGGTatcat < 1:25538/251‑1 (MQ=255) cATCGGTGAGAAACGGCTGCTCGGGCTTATGCCAGTGTTCGTCTTTGTCAAAAAGCGGGGATGACATTGGTCCTCCTTAAACCTCATCCGGCAGCTTATCGAGCAGCTTATCCAGATTGATGGGATAATCCCGTACCCGAATACCGGTGGCGTTATACACC‑GCGGTGGCGATAGCCGCGCTCACGCCGCACAGGCCCAGCTCACCGACGCCTTTGG‑CCTTCATCGGGGAGGATATCTGGTCGGTACCATcc < 2:76120/251‑1 (MQ=255) cATCGGTGAGAAACGCCTGCTCTGGCTTATGCCAGTGTTCGTCTTTGTCAAAAAGCGGGTATGACATTGTTCCTCCTTAAACCACATCCGGCAGCTTATCGAGCAGCTTATCCAGAGTGATGGGATAATCCCGTACCCGAATACCGGTGGCGTTATACACC‑GCGTTGGCGATAGCCGCGCTCACGCCGCACAGGCCCAGCTCACCGACACCTTTGG‑CCTTCATCGAGGAGGATATGGGGACGGTCTCATcc > 2:89106/1‑251 (MQ=255) aTCGGTGAGAAACGCCTGCTCTGGCTTATGCCAGTGTTCGTCTTTGTCAAAAAGCGGGTATGACATTGTTCCTCCTTAAACCACATCCGGCAGCTTATCGAGCAGCTTATCCAGAGTGATGGGATAATCCCGTACCCGAATACCGGTGGCGTTATACACC‑GCGTTGGCGATAGCCGCGCTCACGCCGCACAGGCCCAGCTCACCGACACCTTTGG‑CCTTCATCGAGGAGGATATGGGGTCGGTATCATcc > 2:73048/1‑250 (MQ=255) aTCGGTGAGAAACGCCTGCTCTGGCTTATGCCAGTGTTCGTCTTTGTCAAAAAGCGGGTATGACATTGTTCCTCCTTAAACCACATCCGGCAGCTTATCGAGCAGCTTATCCAGAGTGATGGGATAATCCCGTACCCGAATACCGGTGGCGTTATACACC‑GCGTTGGCGATAGCCGCGCTCACGCCGCACAGGCCCAGCTCACCGACACCTTTGG‑CCTTCATCGAGGAGGATATGGGGTCGGTATCATCCa < 1:3363/251‑1 (MQ=255) ggTGAGAAACGCCTGCTCTGGCTTATGCCAGTGTTCGTCTTTGTCAAAAAGCGGGTATGACATTGTTCCTCCTTAAACCACATCCGGCAGCTTATCGAGCAGCTTATCCAGAGTGATGGGATAATCCCGTACCCGAATACCGGTGGCGTTATACACC‑GCGTTGGCGATAGCCGCGCTCACGCCGCACAGGCCCAGCTCACCGACACCTTTGG‑CCTTCATCGAGGAGGATATGGGGTCGGTATCATCCAgg > 2:309954/1‑250 (MQ=255) gttataaaCGGCTGCTCTGGCTTTTGCCAGTGTTCGTCTTTGTCAAAAAGCGGGTATGACATTGTTCCTCCTTAAACCACATCCGGCAGCTTATCGAGCAGCTTATCCAGAGTGATGGGATAATCCCGTACCCGAATACCGGTGGCGTTATCCACC‑GCGTTGGCGATAGCCGCGCTCACGCCGCACAGGCCCAGCTCACCGACACCTTTGG‑CCTTCATCGAGGAGGATATGGGGTCGGTATCATCCAGGaa < 2:423717/246‑1 (MQ=255) gCCTGCTCTGGCTTATGCCAGTGTTCGTCTTTGTCAAAAAGCGGGTATGACATTGTTCCTCCTTAAACCACATCCGGCAGCTTATCGAGCAGCTTATCCAGAGTGATGGGATAATCCCGTACCCGAATACCGGTGGCGTTATACACC‑GCGTTGGCGATAGCCGCGCTCACGCCGCACAGGCCCAGCTCACCGACACCTTTGG‑CCTTCATCGAGGAGGATATGGGGTCGGTATCATCCAGGAAAATCAcctc > 1:137053/1‑251 (MQ=255) gcgctGGCTTATGCCAGTGTTCGTCTTGGTCAAAAAGCGGGTATGACAGTGTTCCTCCTTAAACCACATCCGGCAGCTTATCGAGCAGCTTATCCAGAGTGATGGGATAATCCCGTACCCGAATACCGGTGGCGTTATACACC‑GCGTTGGCGATAGCCGCGCTCGCGCCGCACAGGCCCAGCTCACCGACACCTTGGG‑CCTTCATCGAGGAGGATATGGGGTCGGTATCATCCAGGAAAATCCCCTCCTGt < 2:181344/248‑1 (MQ=255) ctGGCTTATGCCAGTGTTCGTCTTTGTCAAAAAGCGGGCATGACATTGTTCCTCCTTAAACCACATCCGGCAGCTTATCGAGCAGCTTATCCAGAGTGATGGGATAATCCCGTACCCGAATACCGGTGGCGTTATACACC‑GCGTTGGCGATAGCCGCGCTCACGCCGCACAGGCCCAGCTCACCGACACCTTTGG‑CCTTCATCGAGGAGGATATGGGGTCGGTATCATCCAGGACAATCACCTCCTGtttt > 1:70968/1‑251 (MQ=255) ggCTTATGCCAGTGTTCGTCTTTGTCAAAAAGCGGGTATGACATTGTTCCTCCTTAAACCACATCCGGCAGCTTATCGAGCAGCTTATCCAGAGTGATGGGATAATCCCGTACCCGAATACCGGTGGCGTTATACACC‑GCGTTGGCGATAGCCGCGCTCACGCCGCACAGGCCCAGCTCACCGACACCTTTGG‑CCTTCATCGAGGAGCATATGGGGTc > 1:482738/1‑218 (MQ=255) ggCTTATGCCAGTGTTCGTCTTTGTCAAAAAGCGGGTATGACATTGTTCCTCCTTAAACCACATCCGGCAGCTTATCGAGCAGCTTATCCAGAGTGATGGGATAATCCCGTACCCGAATACCGGTGGCGTTATACACC‑GCGTTGGCGATAGCCGCGCTCACGCCGCACAGGCCCAGCTCACCGACACCTTTGG‑CCTTCATCGAGGAGCATATGGGGTc < 2:482738/218‑1 (MQ=255) gCCAGTGTTCGTCTTTGTCAAAAAGCGGGTATGACATTGTTCCTCCTTAAACCACATCCGGCAGCTTATCGAGCAGCTTATCCAGAGTGATGGGATAATCCCGTACCCGAATACCGGTGGCGTTATACACC‑GCGTTGGCGATAGCCGCGCTCACGCCGCACAGGCCCAGCTCACCGACACCTTTGG‑CCTTCATCGAGGAGGATATGGGGTCGGTATCATCCAGGAAAATCACCTCCTGTTTTGGGATATcc < 2:20074/251‑1 (MQ=255) cAGTGTTCGTCTTTGTCAAAAAGCGGGTATGACATTGTTCCTCCTTAAACCACATCCGGCAGCTTATCGAGCAGCTTATCCAGAGTGATGGGATAATCCCGTACCCGAATACCGGTGGCGTTATACACC‑GCGTTGGCGATAGCCGCGCTCACGCCGCACAGGCCCAGCTCACCGACACCTTTGG‑CCTTCATCGAGGAGGATATGGGGTCGGTATCATCCAGGAAAATCACCTCCTGTTTTGGGATATCCGc < 1:216864/251‑1 (MQ=255) aGTGTTCGTCTTTGTCAAAAAGCGGGTATGACATTGTTCCTCCTTAAACCACATCCGGCAGCTTATCGAGCAGCTTATCCAGAGTGATGGGATAATCCCGTACCCGAATACCGGTGGCGTTATACACC‑GCGTTGGCGATAGCCGCGCTCACGCCGCACAGGCCCAGCTCACCGACACCTTTGG‑CCTTCATCGAGGAGGATATGGGGTCGGTATCATCCAGGAAAAGCACCTCCTGTTTTGGGATATCCGCa < 1:178246/251‑1 (MQ=255) aaatcGGGTATGACATTGTTCCTCCTTAAACCACATCCGGCAGCTTATCGTGCAGCTTATCCAGAGTGATGGGATAATCCCGTACCCGAATACCGGTGGCGTTATTCACC‑GCGTTGGCGATAGCCGCGCTCACGCCGCACAGGCCCAGCTCACCGACATCTTTGG‑CCTTCATCGAGGAGGATATGGGGTCGGTATCATCCAGGAAAATCACCTCCTGTTTTGGGATATCCGCATGAACCGGCACCTCATAc < 1:467070/247‑1 (MQ=255) aaGCGGGTATGACATTGTTCCTCCTTAAACCACATCCGGCAGCTTATCGAGCAGCTTATCCAGAGTGATGGGATAATCCCGTACCCGAATACCGGTGGCGTTATACACC‑GCGTTGGCGATAGCCGCGCTCACGCCGCACAGGCCCAGCTCACCGACACCTTTGG‑CCTTCATCGAGGAGGATATGGGGTCGGTATCATCCAGGAAAATCACCTCCTGTTTTGGGATATCCGCATGAACCGGCACCTCATAcc < 1:418793/251‑1 (MQ=255) aGCGGGTATGACATTGTTCCTCCTTAAACCACATCCGGCAGCTTATCGAGCAGCTTATCCAGAGTGATGGGATAATCCCGTACCCGAATACCGGTGGCGTTATACACC‑GCGTTGGCGATAGCCGCGCTCACGCCGCACAGGCCCAGCTCACCGACACCTTTGG‑CCTTCATCGAGGAGGATATGGGGTCGGTATCATCCAGGAAAATCACCTCCTGTTTTGGGATATCCGCATGAACCGGCACCTCATAccc < 1:83181/251‑1 (MQ=255) gCGGGTATGACATTGTTCCTCCTTAAACCACATACGGCAGCTTATCGAGCAGCTTATCCAGAGTGATGGGATAATCCCGTACCCGAATACCGGTGGCGTTATACACC‑GCGTTGGCGATAGCCGCGCTCACGCCGCACAGGCCCAGCTCACCGACACCTTTGG‑CCTTCATCGAGGAGGATATGGGGTCGGTATCATCCAGGAAAATCACCTCCTGTTTTGGGATATCCGCATGAACCGGCACCTCATAcccc > 1:157847/1‑251 (MQ=255) aTGACATTGTTCCTCCTTAAACCACATCCGGCAGCTTATCGAGCAGCTTATCCAGAGTGATGGGATAATCCCGTACCCGAATACCGGTGGCGTTATACACC‑GCGTTGGCGATAGCCGCGCTCACGCCGCACAGGCCCAGCTCACCGACACCTTTGG‑CCTTCATCGAGGAGGATATGGGGTCGGTATCATCCAGGCAAATCACCTCCTGTTTTGGGATATCCGCATGAACCGGCCCCTCATACCCCGccct > 2:244821/1‑248 (MQ=255) tGACATTGTTCCTCCTTAAACCACATCCGGCAGCTTATCGAGCAGCTTATCCAGAGTGATGGGATAATCCCGTACCCGAATACCGGTGGCGTTATACACC‑GAGTTGGCGATAGCCGCGCTCACGCCGCACAGGCCCAGCTCACCGACACCTTTGG‑CCTTCATCGAGGAGGATATGGGGTCGGTATCATCCAGGAAAATCACCTCCTGTTTTGGGATATCCGCATGAACCGGCACCTCATACCCCGCCatat > 1:333500/1‑251 (MQ=255) aTTGTTCCTCCTTAAACCACATCCGGCAGCTTCTCGAGCAGCTTATCCAGAGTGATGGGATAATCCCGTACCCGAATACCGGTGGCGTTATACACC‑GCGTTGGCGATAGCCGCGCTCACGCCGCACAGGCCCAGCTCACCGACACCTTTGG‑CCTTCATCGAGGAGGATATGGGGTCGGTATCATCCAGGAAAATCACCTCCTGTTTTGGGATATCCGCATGAACCGGCACCTCATACCCCGCCATATAGTg > 1:388137/1‑251 (MQ=255) tAAACCACATCCGGCAGCTTATCGAGAAGCTTATCCAGAGTGATGGGATCATCCCGTACCCGAATACCGGAGGCGTTATACACC‑GCGTTGGCGATAGCCGCGCTCACGCCGCACAGGCCCAGCTCACCGACACCTTTGG‑CCTTCCTCGAGGAGGATATGGGGTCGGTATCATCCAGGAAAATCACCTCCTGTTTTGGGATATCCGCATGAACCGGCACCTCATACCCCGCCATATCGTGCTTACCGAAGt > 2:164422/1‑250 (MQ=255) aaaCCACATCCGGCAGCTTATCGAGCAGCTTATCCAGAGTGATGGGATAATCCCGTACCCGAATACCGGTGGCGTTATACACC‑GCGTTGGCGATAGCCGCGCTCACGCCGCACAGGCCCAGCTCACCGACACCTTTGG‑CCTTCATCGAGGAGGATATGGGGTCGGTATCATCCAGGAAAATCACCTCCTGTTTTGGGATATCCGCATGAACCGGCACCTCATACCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGt > 1:390642/1‑249 (MQ=255) aaCCACATCCGGCAGCTTATCGAGCAGCTTATCCAGAGTGATGGGATAATCCCGTACCCGAATACCGGTGGCGTTATACACC‑GCGTTGGCGATAGCCGCGCTCACGCCGCACAGGCCCAGCTCACCGACACCTTTGG‑CCTTCATCGAGGAGGATATGGGGTCGGTATCATCCAGGAAAATCACCTCCTGTTTTGGGATATCCGCATGAACCGGCACCTCATACCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGc > 1:137364/1‑251 (MQ=255) cggcggCTTATCGAGAAGTTTACCGAGAGTGGGGGGATACCCCCGTACCCGAATCCCGGGGGCGTTATACACC‑GCGGTGGCGATACCCGCGCTCGCGCCGCACAGGCCCAGCTCACCGCCACCTTTGG‑CCTTCATCGAGGAGGATAGGGGGGCGTTACCACCCAGGAAAACCCCCCCCTGTTTTGGGATAGCCGAATGACCCGGCCCCTAATCCCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGt < 2:157847/251‑1 (MQ=255) gcagtttctcgggcatcttcgccAGGGTGATGGGATATTCCCTTCCCCGATTACGGGGGGCTTTATACCCC‑GGGTTGGCGAGAGCCGCGCTCCCGCCGCACAGGCCCAGCTCACCGACCCCTTTGG‑CCTTCAGCGAGGAGGATAGGGGGTCGGGATAATCCGGGAAAACCCCCTCCTGTTTTGGGATATCCGCATGACCCGCCCCCTCATCCCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGTCa < 1:457383/230‑1 (MQ=255) gCAGCTTATCGAGCAGCTTATCCAGAGTGATGGGATAATCCCGTACCCGAATACCGGTGGCGTTATACACC‑GCGTTGGCGATAGCCGCGCTCACGCCGCACAGGCCCAGCTCACCGACACCTTTGG‑CCTTCATCGAGGAGGATATGGGGTCGGTATCATCCAGGAAAATCACCTCCTGTTTTGGGATATCCGCATGAACCGGCACCTCATACCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTCGCCCAAACGGTc > 2:380180/1‑250 (MQ=255) gcagcTTATCCAGAGGGATGGGATAATCCCGTCCCCGAATACCGGCGGCATTATACCCC‑GCGTTGGCGATAGCCGCGCTCACGCCGCACAGGCCCAGCTCACCGACACCTTTGG‑CCTTCATCGACGAGGATATGGGGTCGGTATCATCCAGGAAAATCCCCTCCTGTTTTGGGATATCCGCATGAACCGGCACCTCATACCCCTCCATATCGTGATTAACGACGTCGCCAAAACGGTCATACACCGCCaac > 2:509962/1‑249 (MQ=255) gtttATCCAGAGTGATGGTATAACCCCGTCCCAGAATCCCGGTGGCGTAATACCCC‑GCGTGGGCGATGGCGGCCCTCCCGCCCCAAAGGCCCAGCCCACCGACCCTTTTGG‑CCTTCACCGAGGAGAATAGGGGGTGGGTATCACCCAGAAAAACCCCCCCCTTTTTGGGGATACCCGCATGAACCGGCACCTCATCCCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGTCATCCACCGCCAGctcc < 1:169504/249‑1 (MQ=255) actcAGAGGGATGGGAAAACCCCGCCCCCAAATGCCGGTGGGGTTAT‑CACCCGCGTGGGCGATAGCCGCGCTCCCGCCGCACGGCCCCAGCTCCCCGAC‑CCTTTGGACTTTCATGGGGGAGGAGATGGGGTCGTAATCACCAAGGAAAACCCCCCCCTGTTTTGGAGTACCCTAAGGACCCGGCCCCCGAGCCCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGTCATCCACCGCCAGCtcctcc < 2:34268/247‑1 (MQ=255) tCCAGAGTGATGGGATAATCCCGTACCCGAATACCGGTGGCGTTATACACC‑GCGTTGGCGATAGCCGCGCTCACGCCGCACAGGCCCAGCTCACCGACACCTTTGG‑CCTTCATCGAGGAGGATATGGGGTCGGTATCATCCAGGAAAATCACCTCCTGTTTTGGGATATCCGCATGAACCGGCACCTCATACCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGTCATCCACCGCCAGCTCCTCCAt > 1:129860/1‑251 (MQ=255) gTACCCGAATACCGGTGGCGTTATACACC‑GCGTTGGCGATAGCCGCGCTCACGCCGCACAGGCCCAGCTCACCGACACCTTTGG‑CCTTCATCGAGGAGGATATGGGGTCGGTATCATCCAGGAAAATCACCTCCTGTTTTGGGATATCCGCATGAACCGGCACCTCATACCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGACATCCACCGCCAGCTCCTCCATCAGTGCCGCgcacatccccat > 2:391211/1‑250 (MQ=255) cccGAATACCGGTGGCGTTATACACC‑GCGTTGGAGATAGCCGCGCTCACGCCGCACAGGCCCAGCTCACCGACACCTTTGG‑CCTTCATCGAGGAGGATATGGGGTCGGTATCATCCAGGAAAATCACCTCCTGTTTTGGGATATCCGCATGAACCGGCACCTCATACCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGTCATCCACCGCCAGCTCCTCCATCAGTGCCGCGCCCATGCCCATAGTc > 1:453794/1‑251 (MQ=255) gCGTTATACACC‑GCGTTGGCGATAGCCGCGCTCACGCCGCACAGGCCCAGCTCACCGACACCTTTGG‑CCTTCATCGAGGAGGATATGGGGTCGGTATCATCCAGGAAAATCACCTCCTGTTTTGGGATATCCGCATGAACCGGCACCTCATACCCCGCCATCTCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGTCATCCACCGCCAGCTCCTCCATCAGTGCCGCGCCCATGCCCATAGTCATTGCGCCAATGAc > 2:182168/1‑251 (MQ=255) gTTATACACC‑GCGTTGGCGATAGCCGCGCTCACGCCGCACAGGCCCAGCTCACCGACACCTTTGG‑CCTTCAACGAGGAGGATATGGGGTCGGTATCATCCAGGAAAATCACCTCCTGTTTTGGGATATCCGCATGAACCGGCACCTCATACCCCGCAATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGTCATCCACCGCCAGCTCCTCCATCAGTGCCGCGCCCATGCCCATAGTCATTGCGCCAATGACCt > 1:206065/1‑251 (MQ=255) tataCACC‑GCGTTGGCGATAGCCGCGCTCACGCCGCACAGGCCCAGCTCACCGACACCTTTGG‑CCTTCATCGAGGAGGATATGGGGTCGGTATCATCCAGGAAAATCACCTCCTGTTTTGGGATATCCGCATGAACCGGCACCTCATACCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGTCATCCACCGCCAGCTCCTCCATCAGTGCCGCGCCCATGCCCATAGTCATTGCGCCCATAACCTgg > 1:366800/1‑251 (MQ=255) acacC‑GCGTTGGCGATAGCCGCGCTCACGCCGCACAGGCCCAGCTCACCGACACCTTTGG‑CCTTCATCGAGGAGGATATGGGGTCGGTATCATCCAGGAAAATCACCTCCTGTTTTGGGATATCCGCATGAACCGGCACCTCATACCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGTCATCCACCGCCAGCTCCTCCATCAGTGCCGCGCCCATGCCCATAGTCATTGCGCCAATGACCTGGCTg > 1:246721/1‑251 (MQ=255) c‑gcgTTGGCGATACCCGCGCCCACGCCCCACAGCCCCGCCCCACCGACCCCTTTGG‑CCTTCATGGGGGAGGATAGGGGGGCGGTATCACCCAGAAAAACCACCCCCTGTTTGGGGATACCCGAATGACCCGGCACCTCACCCCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGTCATCCACCGCCAGCTCCTCCATCAGTGCCGCGCCCATGCCCATAGTCATTGCGCCAATGACCTGGCTgcgcg < 2:137364/251‑1 (MQ=255) cgTTGGCGATAGCCGCACTCACGCCGCACAGGCCCAGCTCACCGACACCTTTGG‑CCTTCATCGAGGAGGATATGGGGTCGGTATCATCAAGGAAAATCACCTCCTGTTTTGGGATATCCGCATGAACCGGCACCTCATACCCCGCCATATCGTGATTAACGCAGTAGCCCAAACGGTCATCCACCGCCAGCTCCTCCATCCGTGCCGCGCCCATGCCCATAGTCATTGCGCCAATGACCTGGCTgcgcgc > 2:181832/1‑250 (MQ=255) gCGATAGCCGCGCTCACGCCGCACAGGCCCAGCTCACCGACACCTTTGG‑CCTTCATCGAGGAGGATATGGGGTCGGTATCATCCAGGAAAATCAACTCCTGTTTTGGGATATCCGCATGAACCGGCACCTCATACCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGTCATCCACCGCCAGCTCCTCCATCAGAGCCGCGCCCATGCCCCTAGTCATTGCGCCAATGCCCTGTCTGCGCGCAGtttt > 1:504681/1‑251 (MQ=255) cGATAGCCGCGCTCACGCCGCACAGGCCCAGCTCACCGACACCTTTGG‑CCTTCATCGAGGAGGATATGGGGTCGGTATCATCCAGGAAAATCACCTCCTGTTTTGGGATATCCGCATGAACCGGCACCTCATACCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGTCATCCACCGCCAGCTCCTCCATCAGTGCCGCGCCCATGCCCATAGTCATTGCGCCAATGACCTGGCTGCGCGCAGTTTTc > 1:509423/1‑251 (MQ=255) gCCGCGCTCACGCCGCACAGGCCCAGCTCACCGACACCTTTGG‑CCTTCATCGAGGAGGATATGGGGTCGGTATCATCCAGGAAAATCACCTCCTGTTTTGGGATATCCGCATGAACCGGCACCTCATACCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGTCATCCACCGCCAGCTCCTCCATCAGTGCCGCGCCCATGCCCATAGTCATTGCGCCCATGACCTGGCTGCGCCCAGTTTTCGGAtt > 2:429989/1‑251 (MQ=255) cgcgCTCACGCCGCACAGGCCCAGCTCACCGACACCTTTGG‑CCTTCATCGAGGAGGATATGGGGTCGGTATCATCCAGGAAAATCACCTCCTGTTTTGGGATATCCGCATGAACCGGCACCTCATACCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGTCATCCACCGCCAGCTCCTCCATCAGTGCCGCGCCCATGACCATAGTCATTGCGCCAATGACCTGGCTGCGAGCAGTTTTCGGATTc > 2:383830/1‑250 (MQ=255) caccgccgcCCGGGCCCGGCTCACCGAC‑CCTTTGGGCCTTCATCGAGGAGGATAGGGGGTGGGTATCAGCCAGAAAAACCACCCCCTGTTTGGGGATACCCGCATGAACCGGCCCCTCACCCCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGTCATCCACCGCCAGCTCCTCCATCAGTGCCGCGCCCATGCCCATAGTCATTGCGCCAATGACCTGGCTGCGCGCAGTTTTCGGATTCAGGATg < 1:161719/248‑1 (MQ=255) ccgccgcACAGGCCCAGCCCCCCGCCCCCTTGGG‑CCTTCATCGAGGAGGATAGGGGGCCGGTATCATCCAGGAAAATCCCCCCCTTTTTTGGGATATCCGCAGAAACCGGCACCTCATCCCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGTCATCCACCGCCAGCTCCTCCATCAGTGCCGCGCCCATGCCCATAGTCATTGCGCCAATGACCTGGCTGCGCGCAGTTTTCGGATTCAGGATGCg < 1:401654/250‑1 (MQ=255) caggccccAGCCCCCCGACCCCTTGGG‑CCTTCATCGGGGGGGTTATGGGGTCGGTATCCTCCAGAAAAACCCCCTCCTGTTTTGGGATATCCGCATGACCCGCCCCCCCATCCCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGTCATCCACCGCCAGCTCCTCCATCAGTGCCGCGCCCATGCCCATAGTCATTGCGCCAATGACCTGGCTGCGCGCAGTTTTCGGATTCAGGATGCGTCCTgca < 1:341256/246‑1 (MQ=255) caGGCCCAGCTCACCGACACCTTTGG‑CCTTCATCGAGGAGGATATGGGGTCGGTATCATCCAGGAAAATCACCTCCTGTTTTGGGATATCCGCATGAACCGGCACCTCATACCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGTCATCCACCGCCAGCTCCTCCATCAGTGCCGCGCCCATGCCCATAGTCATTGCGCCAATGACCTGGCTGCGCGCAGTTTTCGGATTCAGGATGc > 2:89868/1‑242 (MQ=255) gCCCAGCTCACCGACACCTTTGG‑CCTTCATCGAGGAGGATATGGGGTCGGTATCATCCAGGAAAATCACCTCCTGTTTTGGGATATCCGCATGAACCGGCACCTCATACCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGTCATCCACCGCCAGCTCCTCCATCAGTGCCGCGCCCATGCCCATAGTCATTGCGCCAATGACCTGGCTGCGCGCAGTTTTCGGATTCAGGATGCGTCCTGCAGcac > 2:494664/1‑251 (MQ=255) cccgacccTTTGGGCCTTCATCGAGGAGGATATGGGGTCGGTACCACCCAGAAAAATCCCCCCCTGTTTTGGGTTATCCGCATAACCCGCCCCCTAATCCCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGTCATCCACCGCCAGCTCCTCCATCAGTGCCGCGCCCATGCCCATAGTCATTGCGCCAATGACCTGGCTGCGCGCAGTTTTCGGATTCAGGATGCGTCCTGCAGCACACACAGCGa < 1:167421/245‑1 (MQ=255) ccTTCATCGAGGAGGATATGGGGTCGGTATCATCCAGGAAAATCACCTCCTGTTTTGGGATATCCGCATGAACAGGCACCTCATACCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGTCATCCACCGCCAGCTCCTCCATCAGTGCCGCGCCCATGCCCATAGTCATTGCGCCAATGACCTGGCTGCGCGCAGTTTTCGGATTCAGGATGCGTCCTGCAGCACACACAGCGAGCATACGCCGGAcc > 1:366851/1‑251 (MQ=255) | GTGGTCATCGGTGAGAAACGCCTGCTCTGGCTTATGCCAGTGTTCGTCTTTGTCAAAAAGCGGGTATGACATTGTTCCTCCTTAAACCACATCCGGCAGCTTATCGAGCAGCTTATCCAGAGTGATGGGATAATCCCGTACCCGAATACCGGTGGCGTTATACACC‑GCGTTGGCGATAGCCGCGCTCACGCCGCACAGGCCCAGCTCACCGACACCTTTGG‑CCTTCATCGGGGAGGATATGGGGTCGGTATCATCCAGGAAAATCACCTCCTGTTTTGGGATATCCGCATGAACCGGCACCTCATACCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGTCATCCACCGCCAGCTCCTCCATCAGTGCCGCGCCCATGCCCATAGTCATTGCGCCAATGACCTGGCTGCGCGCAGTTTTCGGATTCAGGATGCGTCCTGCAGCACACACAGCGAGCATACGCCGGACC > NC_000913/298655‑299126 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |