| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 420,423 | G→A | G278D (GGC→GAC) | brnQ → | branched chain amino acid transporter BrnQ |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 420,423 | 0 | G | A | 96.7% | 192.1 / NA | 62 | G278D (GGC→GAC) | brnQ | branched chain amino acid transporter BrnQ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (2/0); new base A (22/36); total (24/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.56e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CCATGGATACGCTGGGCGCAATGGTGTTTGGTATCGTTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGGCGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAA > NC_000913/420177‑420662 | ccATGGATACGCTGGGCGCAATGGTGTTTGGTATCGTTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCTGCGACGGt < 1:193428/251‑1 (MQ=255)ccATGGATACGCTGGGCGCAATGGTGTTTGGTATCGTTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGACGGt < 1:79533/251‑1 (MQ=255) gggCGCAATGGTGTTTGGTATCGTTATTGTTAGCGCGGCGCTTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGGCTGCTGGCCCGTTATACCGTCTTGGCTGGCGTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGACGGTAGCTTCctgctg < 1:514020/250‑1 (MQ=255) gggCGCAATGGTGTTTGGTATCGTTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGACGGTAGCTTCctgctg < 1:227517/250‑1 (MQ=255) ggCGCAATGGTGTTTGGTATCGTTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGGCGGTAGCTTCCTGCTggc > 2:102075/1‑251 (MQ=255) gcAATGGTGTTTGGTATCGTTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTAACTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGGCAGAAAGCGCGTCGCTGGGCGATCAGTCTGCACACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGGTCAGCACCCCTTTGGCGGCGACGGGCGCTTCCTGCTgggggg > 2:70131/1‑247 (MQ=255) ggTGTTTGGTATCGTTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGACGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTa < 1:139374/250‑1 (MQ=255) tttGGTATCGTTATTGTTAACGCGTCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTATGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGCCAGCGCGTCGCTGGGCGATCAGTCTGCAAACGGGGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCCTTGGCGGCGACGGTAACCTCCCGCTGGCGGCGTTAATCtt > 2:105829/1‑251 (MQ=255) ggTATCGTTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGACGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCa < 1:165495/250‑1 (MQ=255) gcGTTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGACGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCgcc < 1:368040/250‑1 (MQ=255) cGTTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAATCGCGGCTGCTGACCCGTTATACCGGCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCATACAGCGCTGCTCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCTCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACCCCTTTGGCGGCGACGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCgcc < 1:317614/250‑1 (MQ=255) ttATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTTTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGGCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCCAACGGCGCTGCTATTCTGCCTGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGACGGTCGCTTCCTGCTTGCGGCGGTAATCTTCATCgcctgc > 2:99305/1‑251 (MQ=255) atttttAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTTGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGACGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCgcctgcc < 2:66957/246‑1 (MQ=255) 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cgcgGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGACGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCAGCGCCTGCCTGGTAACgg < 1:507831/251‑1 (MQ=255) gcgTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGACGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTGGTAACGGCAGTTg < 1:13841/251‑1 (MQ=255) gTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGACGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGAcc < 2:306031/251‑1 (MQ=255) gTGGCGATACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGGCTGACTCCGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGGCTGGGGGCCAAAAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACCGCGCTGCTATTCTGCAAGCCTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGGCGGTAGCTTCCTGCTGGGGGCGTTAATCTTCATCGCCTACCCGGTAACGGCCGTTTGCCTgccc > 2:465086/1‑248 (MQ=255) tACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGCAGGCGGGTGTTGGTCTGAACCTGCTGCACCTCGCGCTGTTACGTCTGGGGTCAGACCGAGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTCTTATGCATGCTTACGTTCCGCACACCTTTGGCGGCGACGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATAGCCTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTCTGCtt > 1:505843/1‑251 (MQ=255) gaccgagccgcgTCTGCTGACGCGTTATACCGTGTGGGTTGGCCTGATGGCGGTGGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCGGGCGCGGTTCCGTCTGTTGCTAGACAGCGCGGCGCTGGTCGATCAGTCTGCAATCGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTGTGGCGGCGCCGGTAGCTCTCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCt < 1:198698/242‑1 (MQ=255) ccGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGACGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCGTCATCGCCTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTtgt < 1:253498/251‑1 (MQ=255) aGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTTTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCCGCACACCTTTGGCGGCGACGGTAACTTCCCGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTGGGAACGGCAGTTGGCCCGACCTGGGCTTTTGc > 1:12565/1‑249 (MQ=255) cgTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGGCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGACGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTGGTAACGGCAGTTGGTCTGACCTGTGCTTGTGCAGAAtt < 2:197674/251‑1 (MQ=255) ccGTTATACCGTATGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGACGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTGGGAACGGACGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTTccccgt > 2:330674/1‑248 (MQ=255) ttATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGGGTTTGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCCTGCTTACGTTCAGCACACCTTTTGCGGCGACGGTCGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTGGTAAAGGCAGGTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTTCCCAgta > 2:394351/1‑249 (MQ=255) tGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTGCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGGCGCTGATCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCGTACGGTCAGCACACCTTTGGCTGCGACGGGAGCTTCCTGCTGGGGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCGGGTAACGGCAGTTTGGCTGACCTGTGCTTGTGCAGGATTCATTGCTCTGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATc < 2:192287/250‑1 (MQ=255) ggTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGACGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCt > 2:474984/1‑251 (MQ=255) acgctgctgTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGACGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTcggcgg < 1:18263/248‑1 (MQ=255) ctgctgTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGACGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGCCCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCtt > 1:345250/1‑251 (MQ=255) ctgcggTACCTGGAGCTGTTCCGTCGGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGACGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTTTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCGCTCTTATCGGACGCGGGTGTTTATCCGCggcggc < 2:343649/249‑1 (MQ=255) tgTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGACGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCg > 1:267489/1‑251 (MQ=255) ttACCTGGCGCTGTTCCGGCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGGTCAGCACACCTTTGGCGTCGACGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCATTAATCTTCATCGCCTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCGTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTGATCGTACGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCTtctc < 1:480988/248‑1 (MQ=255) 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aaaCGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGACGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGTCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTgt > 2:211193/1‑250 (MQ=255) aaaCGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGACGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGa < 1:102075/251‑1 (MQ=255) aaaCGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGACGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGa < 1:47972/251‑1 (MQ=255) aCGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTACAGCACACCTTTGGCGGCGACGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTTATCTTCATCGCCTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGAcc < 2:426591/251‑1 (MQ=255) aTTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGACGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATATCCGTCCCGGTGCTGACCGCTATTTATcc > 2:511775/1‑251 (MQ=255) tCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGACGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCAGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCACAGTACGTACCGATCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATACAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATccgc > 2:200055/1‑251 (MQ=255) gCATGCTTACGTTCAGCACACCTGTGGCTGCGACGGTAGCTTCCTGCTTGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAAGTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTAGTCTTGTGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGAGGGGGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCGTCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATccgccg < 1:498552/250‑1 (MQ=255) aCGTTCAGCACGCCTTTTGCGGCGACGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGc < 2:124702/250‑1 (MQ=255) aCGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGACGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGcc > 1:68614/1‑250 (MQ=255) ttCAGCACACCTTTGGCGGCGACGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTg > 1:473921/1‑251 (MQ=255) ccgttGGCGGCGTCGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTTCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCGTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTTCGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTTACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCGCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTa < 2:314611/248‑1 (MQ=255) cTTTGGCGGCGACGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTa > 1:93451/1‑250 (MQ=255) ttGGCGGCGACGGTGGCTTCCACATGGGTGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTTTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTTCCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCGAACCTCGGCTTAAGCCAGCTTATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTAGTTATCCGCCGTTTATCGCTCTGGTTGTATTaa < 2:387422/249‑1 (MQ=255) | CCATGGATACGCTGGGCGCAATGGTGTTTGGTATCGTTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGGCGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAA > NC_000913/420177‑420662 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |