| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,153,894 | 0 | A | C | 27.7% | 74.2 / 10.2 | 47 | H111P (CAC→CCC) | yghB | DedA family protein YghB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (22/12); new base C (0/13); total (22/25) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.05e-05 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GTTTACTTTGTCATGTTTGCCACGCTGTTTTTAGAAAACGGCCTGCTGCCCGCCTCATTTTTGCCAGGCGACAGCTTGTTGATACTGGCAGGCGCATTGATTGCCCAGGGGGTT‑ATGGATTTTCTGCCTACGATTGCGATTCTGACCGCCGCAGCAAGTCTGGGCTGCTGGCTAAGTTATATTCAGGGGCGCTGG‑TTAGGGAATACCAAAACGGTGAAAGGCTGGCTGGCACAGCTTCCT‑GCTAAATATCACCAGCGCGCCACCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCAACCATGGCGGGAATTTCCGGTCTGCCAAACCGCCGCTTCCAGTTTTTCAACTGGTTAAGTGGATTGCTGTGGGTCAGCGTGGTAACCAGTTTTGGCTATGCCTTAAGTATGATTCCGTTCGTTAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCTG > NC_000913/3153644‑3154138 | gttTCCTTTGTCATGTTTGCCACGCTGTTTTAAGAAAACGGCCGGCGGCCCGCCTCATTTTTGCCAGGCGACAGCTTGTTGATACTGGCAGGCGCATTGATTGCCCAGGGGGTT‑ATGGATTTTCTGCCTACGATTGCGATTCTGACCGCCGCAGCAAGTCTGGGCTGCTGGCTAAGTTATATTCAGGGGCGCTGG‑TTAGGGAATACCAAAACGGTGAAAGGCTGGCTGGCACAGCTTCCT‑GCTAAATATCa < 1:461228/251‑1 (MQ=255) tttGCCACGCTGTTTTTAGAAAACGGCCTGCTGCCCGCCTCATTTTTGCCAGGCGACAGCTTGTTGATACTGGCAGGCGCATTGATTGCCCAGGGGGTT‑ATGGATTTTCTGCCTACGATTGCGATTCTGACCGCCGCAGCAAGTCTGGGCTGCTGGCTAAGTTATATTCAGGGGCGCTGG‑TTAGGGAATACCAAAACGGTGAAAGGCTGGCTGGCACAGCTTCCT‑GCTAAATATCACCAGCGCGCCACCTg > 1:390949/1‑251 (MQ=255) ccACGCTGTTTTTAGAAAACGGCCTGCTGCCCGCCTCATTTTTGCCAGGCGACAGCTTGTTGATACTGGCAGGCGCATTGATTGCCCAGGGGGTT‑ATGGATTTTCTGCCTACGATTGCGATTCTGACCGCCGCAGCAAGTCTGGGCTGCTGGCTAAGTTATATTCAGGGGCGCTGG‑TTAGGGAATACCAAAACGGTGAAAGGCTGGCTGGCACAGCTTCCT‑GCTAAATATCACCAGCGCGCCACCTGCATg > 1:101253/1‑251 (MQ=255) aaCGGCCTGCTGCCCGCCTCATTTTTGCCAGGCGACAGCTTGTTGATACTGGCAGGCGCCTTGATTGCCCAGGGGGTT‑ATGGATTTTCTGCCTACGATTGCGATTCTGACCGCCGCAGCCAGTCTGGGCTGCTGGCTAAGTTATATTCAGGGGCGCTGG‑TTAGGGAATACCAAAACGGTGAAAGGCTGGCTGGCACAGCTTCCT‑GCTAAATATCACCAGCGCGCCACCTGCCTGTTTGACCGCCACGGTct > 1:90330/1‑251 (MQ=255) cggcCCGCCTCATTTTTGCCAGGGGACAGCTTGTTGATACGGGCAGGCGCATTGATTGCCCAGGGGTTT‑AGGGATTTTCTGCCTACGATTGCGATTCGGCCCGCCGCAGCAAGTCTGGGCTGCTGGCTAAGTTATATTCAGGGGCGCTGG‑TTAGGGAATACCAAAACGGTGAAAGGCTGGCTGGCACAGCTTCCT‑GCTAAATATCCCCAGCGCGCCACCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCgct < 2:119651/249‑1 (MQ=255) cccGCCTCATTTTTGCCAGGCGACAGCTTGTTGATACTGGCAGGCGCATTGATTGCCCAGGGGGTT‑AAGGATTTTCTGCCTACGATTGCGATTCTGACCGCCGCAGCAAGTCTGGGCTGCTGGCTAAGTTATATTCAGGGGCGCTGG‑TTAGGGAATACCAAAACGGTGAAAGGCTGGCTGGCACAGCTTCCT‑GCTAAATATCACCAGCGCGCCACCTGCCTGTTTGACCGCCACGGTCTCCTGGCgctgct > 2:304812/1‑251 (MQ=255) ttttGCCCGGCGACAGATTGTTGATAATGGCAGGCGCATTGATTGCCCTGGGGGTT‑ATGGATTTTCTGCCTACGTTTGCGATTCTGACCGCCGCAGCAAGTCTGGGCTGCGGGCTAAGTTATATGCAGGGGCGCTGG‑TTAGGGAATACCAAAACGGTGAAAGGCTGGCTGGCCCAGCTTCCT‑GCTAAATATCACCAGCGCGCCACCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACg < 1:319346/250‑1 (MQ=255) ttGCCAGGCGCCAGCTTGTTGATACTGGCAGGCGCATTGATTGCCCAGGGGGTT‑ATGGATTTTCTGCCTACCATTGCGATTCTGACCGCCGCAGAAAGTCTGGGCTGCTGGCTACGTTATATTCAGGGGCGCTGG‑TTAGGGAATACCAAAACGGTGAAAGGCTGGCTGGCACAGCTTCCT‑GCTCACTATCACCAGCGCGCCCCCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGttt > 2:230321/1‑251 (MQ=255) gCCAGGCGACAGCTTGTTGATACTGGCAGGCGCATTGATTGCCCAGGGGGTT‑ATGGATTTTCTGCCTACGATTGCGATTCTGACCGCCGCAGCAAGTCTGGGCTGCTGGCTAAGTTATATTCAGGGGCGCTGG‑TTAGGGAATACCAAAACGGTGAAAGGCTGGCTGGCACAGCTTCCT‑GCTAAATATCACCAGCGCGCCACCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTc > 1:418551/1‑251 (MQ=255) ccAGGCGACAGTTTGTTGATACTGGCAGGCGCATTGATTGCCCAGGGGGTT‑ATGGATTTTCTGCCTACGATTGCGATTCTGACCGCCGCAGCAAGTCTGGGCTGCTGGCTAAGTTATATTCAGGGGCGCTGG‑TTAGGGAATACCAAAACGGTGAAAGGCTGGCTGGCACAGCTTCCT‑GCTAAATATCCCCAGCGCGCCACCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCt < 1:158773/251‑1 (MQ=255) cgtgagtccgCTTGTTGACACGGGCAGACGCATTGAGTTCCCAGGGGGTT‑GTGGTTTTGCTGTTGACAGTTCCGTTTCTGCCCGCCGGATCAAGCCTGGGCTGCTGGCTAAGTTATGTTCAGGGGCGCTGG‑TTAGGGAATACCAAAACGGTGAAAGGCTGGCTGGCCCAGCTTCCT‑GCTAAATATCCCCTGCGCGCCACCTGCTTTTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTTGACGTTTTCtt < 2:152337/242‑1 (MQ=255) aaGGCGCCAGTTTGTTGTTCCTGGAGGGCGCATTGATTGCC‑AGGGGGTTTAGGGTTTTTCTCCCTACGATTGCGATTCTGACCGCCGCAGCAAGTCTGGGCTGCTGGCTAAGTTATATTCAGGGGCGCTGG‑TTAGGGAATACCAAAACGGTGAAAGGCTGGCTGGCACAGCTTCCT‑GCTAAATATCACCAGCGCGCCACCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCtt < 2:517774/250‑1 (MQ=255) gACAGCTTGTTGATACTGGCAGGCGCATTGATTGCCCAGGGGGTT‑ATGGATTTTCTGCCTACGATTGCGATTCTGACCGCCGCAGCAAGTCTGGGCTGCTGGCTAAGTTATATTCAGGGGCGCTGG‑TTAGGGAATACCAAAACGGTGAAAGGCTGGCTGGCACAGCTTCCT‑GCTAAATATCACCAGCGCGCCACCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCAtt > 1:142843/1‑251 (MQ=255) catcTTGTTGAAACTGGCAGGCGCTTTGATGGCCTAGGGGGTT‑ATGGTTTTTCTGCCTGCGATTCGGATTCTTACCGCCGCAGCTAGTCTGGGCTGCTGGCTAATTTATATTCAGGGGCGCTGG‑TTAGGGAATACCAAAACGGTGAAAGGCTGGCTGGCTCAGCTTCCT‑GCTAAATATCACCAGCGCCCCCCCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCGGCTGTCGCTGCTGGCTGGAGGTGTTCTTGCATTTg < 1:136968/248‑1 (MQ=255) gttgATACTGGCAGGCGCATTGATTGCCCAGGGGGTT‑ATGGATTTTCTGCCTACGATTGCGATTCTGACCGCCGCAGCAAGTCTGGGCTGCTGGCTAAGTTATATTCAGGGGCGCTGG‑TTAGGGAATACCAAAACGGTGAAAGGCTGGCTGGCACAGCTTCCT‑GCTAAATATCACCAGCGCGCCACCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGGCGTTTTCTTGCATTTGTCCGt > 2:473721/1‑250 (MQ=255) ttgATACTGGCAGGCGCATTGATTGCCCAGGGGGTT‑ATGGATTTTCTGCCTACGATTGCGATTCTGACCGCCGCAGCCAGTCTGGGCTGCTGGCTAAGTTATATTCAGGGGCGCTGG‑TTAGGGAATACCAAAACGGTGAAAGGCTGGCTGGCACAGCTTCCT‑GCTAAATATCACCAGCGCGCCACCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGCCGTTTTCTTGCTTTTGTCCGTAc > 2:353210/1‑251 (MQ=255) ttgATACTGGCAGGCGCATTGATTGCCCAGGGGGTT‑ATGGATTTTCTGCCTACGATTGCGATTCTGACCGCCGCAGCAAGTCTGGGCTGCTGGCTAAGTTATATTCAGGGGCGCTGG‑TTAGGGAATACCAAAACGGTGAAAGGCTGGCTGGCACAGCTTCCT‑GCTAAATATCACCAGCGCGCCACCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTAc > 2:207204/1‑251 (MQ=255) tgATACGGGCAGGCGCATTGATTGCCCGGGGGGTT‑ATGGATTTTCTGCCTACGATGGCGATTCTGACCGCCGCAGCAAGTCTGGGCTGCTGGCTAAGTTATATTCAGGGGCGCTGG‑TTAGGGAATACCAAAACGGTGAAAGGCTGGCTGGCACAGCTTCCT‑GCTAAATATCACCAGCGCGCCACCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTAc < 1:26675/250‑1 (MQ=255) tGGCAGGCGCATTGATTGCCCCGGGGGTT‑TTGGATTTTCTGCCTACGATTGCGATTCTGACCGCCGCAGCAAGTCTGGGCTGCTGGCTAAGTTATATTCAGGGGCGCTGG‑TTAGGGAATACCAAAACGGTGAAAGGCTGGCTGGCACAGCTTCCT‑GCTAAATATCACCAGCGCGCCACCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCCTTTGTCCGTACGctgctg > 1:188509/1‑251 (MQ=255) ggCAGGCGCATTGATTGCCCGGGGGGTT‑AGGGATTTTCTGCCTACGATGGCGATTCTGACCGCCGCAGCAAGTCTGGGCTGCTGGCTAAGTTATATTCAGGGGCGCTGG‑TTAGGGAATACCAAAACGGTGAAAGGCTGGCTGGCACAGCTTCCT‑GCTAAATATCACCAGCGCGCCACCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTACGCtgctgc < 1:134458/251‑1 (MQ=255) cAGGCGGATTGATGGCCCGGGGGGTT‑AGGGATTTTCTGCCTAGGATGGCGATTCTGACCGCCGCAGCAAGTCTGGGCTGCTGGCTAGGTTATATTCAGGGGCGCTGG‑TTAGGGAATACCAAAACGGTGAAAGGCTGGCTGGCACAGCTTCCT‑GCTAAATATCACCAGCGCGCCACCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCa < 2:90330/251‑1 (MQ=255) gggattggattgCCCGGGGGGTT‑TTGGTTTTTCTGTCGACGTTTGCGTTTCTGCCCGCCGCAGCAAGTCTGGGCTGCTGGCTAAGTTATATTCAGGGGCGCTGG‑TTAGGGAATACCAAAACGGTGAAAGGCTGGCTGGCACAGCTTCCT‑GCTAAATATCACCAGCGCGCCACCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCAAcc < 2:318084/244‑1 (MQ=255) cccggggggTT‑ATGGATTTTCTGCCTAGGATTGCGATGCTGCCCGCCGCAGCAAGTCTGGGCTGCTGGCTAAGTTATATTCAGGGGCGCTGG‑TTAGGGAATACCAAAACGGTGAAAGGCTGGCTGGCACAGCTTCCT‑GCTAAATATCACCAGCGCGCCACCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCAACCATGGCGGGAAtt < 2:142843/247‑1 (MQ=255) agggtgttgtggagttgctgccatcGATTGCGATTCTGCCCGCCGCAGCAAGTCTGGGCTGCTGGCTAAGTTATATTCAGGGGCGCTGG‑TTCGGTAATACCAAAACGGTGAAAGGCTGGCTGGCACAGCTTCCT‑GCTAAATATCCCCAGCGCGCCCCCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCACCCATGGCGGGAATTTcc < 2:301000/227‑1 (MQ=255) gTT‑ATGGATTTTCTGCCTACGATTGCGATTCTGACCGCCGCAGCAAGTCTGGGCTGCTGGCTAAGTTATATTCAGGGGCGCTGG‑TTAGGGAATACCAAAACGGTGAAAGGCTGGCTGGCACAGCTTCCT‑GCTAAATATCACCAGCGCGCCACCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCAGCCATGGCGGGGATTTCCCGTCt > 2:389039/1‑251 (MQ=255) gTT‑ATGGATTTTCTGCCTACGATTGCGATTCTGACCGCCGCAGCAAGTCTGGGCTGCTGGCTAAGTTATATTCAGGGGCGCTGG‑TTAGGGAATACCAAAACGGTGAAAGGCTGGCTGGCACAGCTTCCT‑GCTAAATATCACCAGCGCGCCACCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCAACCATGGCGGGAATTTTCGGTCt > 2:308515/1‑251 (MQ=255) aTTTTCTGCCTACGATTGCGCTTCTGACCGCCGCAGCAAGTCTGGGCTGCTGGCTAAGTTATATTCAGGGGCGCTGG‑TTAGGGAATACCAAAACGGTGAAAGGCTGGCTGGCACAGCTTCCT‑GCTAAATATCACCAGCGCGCCACCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGAAGTTTTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCAACCATGGCGGGACTTTCCGGGCTGCCAAAc > 1:90967/1‑251 (MQ=255) ccTACGATTGCGATTCTGACCGCCGCAGCAAGTCTGGGCTGCTGGCTAAGTTATATTCAGGGGCGCTGG‑TTAGGGAATACCAAAACGGTGAAAGGCTGGCTGGCACAGCTTCCT‑GCTAAATATCACCAGCGCGCCACCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCAACCATGGCGGGAATTTCCGGTCTGCCAAACCGCCGCtt > 1:135591/1‑251 (MQ=255) ccgaaCCGCCGCGGCAGGTCTGGGATGTGGGCAAAGTTATATTCAGGGGCGCTGG‑TTAGGAAAACCCAAAGCTGTAAAAGGCTGGCTGGCACAGCTTCCT‑GTTAAATAGCACCAGCGCGCCACCTGCATGTTTGCCCGCCACGGTCTGCGGGCGCTGCGGTCTGGACGTTTCCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCACCCATGGCGGGAATTTCCGGTCTGCCAAACCGCCGCTTCCAGTTTTTCAAc < 1:302989/246‑1 (MQ=255) ccgcAGCAGGTCGGGGCGGTTGGTTAATTTATATTCAGGGGCGCTGT‑TTAGGGAATACAAAAGCGGTGAAGGGCTGCCTGGCACAGCTTCCT‑GCTAAATATCCCCAGCGCGCCCCCGGCATTTTTGCCCGCCACGGTCGGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGCCCGTACGCTGCTGCCAACCATGGCGGGAATTTCCGGTCTGCCAAACCGCCGCTTCCAGTTTTTCAACTGGTTAAGt < 2:424542/251‑1 (MQ=255) caAGTCTGGGCTGCTGGCTAAGTTATATTCAGGGGCGCTGG‑TTAGGGAATACCAAAACGGTGAAAGGCTGGCTGGCACAGCTTCCT‑GCTAAATATCACCAGCGCGCCACCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCAACCATGGCGGGGATTTCCGGTCTTCCAAACCGCCGCTTCCCGTTTTTCAACTGGTTAAGGGGATTg > 2:148478/1‑251 (MQ=255) gcctaatttaatgtCAGGGGC‑CTGGGTTAGGGAATCCCAAAACGGTGAAAGCCTGCCTGGCACACCTCCCT‑GCTAAATTGCCCCAGCGCGCCCCCTGCATGTTTGCCCACCACGGTGTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCACCCATGGCGGGAATTTCCGGTCTGCCAAACCGCCGCTTCCAGTTTTTCAACTGGTTAAGTGGATTGCTGTGGGTCAGCGt < 1:373856/237‑1 (MQ=255) aaatttATATTCGGGGGCGCTGT‑TTGGGAAATACAAAACCGGTAAAGGGCTGCCTGGACCAG‑TTCCTTGCAAAATATCCCCAGCGCGCCACCTGCTTGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTACATTTGTCCGTACGCTGCTGCCAACCATGGCGGGAATTTCCGGTCTGCCAAACCGCCGCTTCCAGTTTTTCAACTGGTTAAGTGGATTGCTGTGGGTCAGCGTGGTa < 2:460326/247‑1 (MQ=255) aaGTTATATTCAGGGGCGCTGG‑TTAGGGAATACAAAAACGGTGAAAGGCTGGCTGGCACAGCTTCCT‑GCTAAATATCACCAGCGCGCCCCCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCATCCATGGCGGGAATTTCCGGTCTGCCAAACCGCCGCTTCCAGTTTTTCAACTGGTTAAGTGGATTGCTGTGGGTCAGCGTGGt < 1:473721/249‑1 (MQ=255) ggCGCTGG‑TTAGGGAATACCAAAACGGTGAAAGGCGGGCGGGCCCAGCTTCCT‑GCTAAATATCCCCAGCGCGCCACCTGCATGTTTGCCCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCAACCATGGCGGGAATTTCCGTTCTGCCAAACCGCCGCTTCCAGTTTTTCAACTGGTTAAGTGGATTGCTGTGGGTCAGCGTGGTAACCAGTTTTGGCTAt < 1:487385/251‑1 (MQ=255) cgcTGG‑TTAGGGAATACCAAAACGGTGAAAGGCTGGCTGGCACAGCTTCCT‑GCTAAATATCACCAGCGCGCCACCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCAACCATGGCGGGAATTTCCGGTCTGCCAAACCGCCGCTTCCAGTTTTTCAACTGGTTAAGTGGATTGCTGTGGGTCAGCGTGGTAACCAGTTTTGGCTTTGc > 2:154998/1‑251 (MQ=255) gcTGG‑CTAGGGAATACCAAAACGGTGAAAGGCTGGCTGGCACAGCTTCCT‑GCTAAATATCACCAGCGCGCCACCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCAACCATGGCGGGGATTTCCGGTCTGCCAAACCCCCGCTTCCAGGTTTTCCACTGGTTAAGTGGCTTGCTGTGGGTCAGCGTGGTAAACAGTTTTTGCTATGcc > 2:368954/1‑251 (MQ=255) cAAAACGGTGAAAGGCTGGCTGGCACAGCTTCCT‑GCTAAATATCACCAGCGCGCCACCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCAACCATGGCGGGAATTTCCGGTCTGCCAAACCGCCGCTTCCAGTTTTTCAACTGGGTAAGTGGATTGCTGTGGGTCAGCGTGGGAAACAGTTTTGGCTATGACTTAAGTATGATTCcgt > 2:407605/1‑251 (MQ=255) gTGAAAGGCTGGCTGGCACAGCTTCCT‑GCTAAATATCACCAGCGCGCCACCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCAACCATGGCGGGAATTTCCGGTCTGCCAAACCGCCGCTTCCAGTTTTTCAACTGGTTAAGTGGATTGCTGTGGGTCAGCGTGGTAACAAGTTTTGGCTATGCCTTAAGTATGATTCCGTTCGTTa > 1:1182/1‑250 (MQ=255) gAAAGGCTGGCTGGCCCAGCTTCCT‑GCAAAATATCACCAGCGCGCCACCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCGGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCAACCATGGCGGGAATTTCCGGTCTGCCAAACCGCCGCTTCCAGTTTTTCAACTGGTTAAGTGGATTGCTGTGGGTCAGCGTGGTAACCAGTTTTGGCTATGCCTTAAGTATGATTCCGTTCGTTAAAc < 1:52394/251‑1 (MQ=255) aaagggttggctgccACAGCTTCCT‑GTAAAATTCCCCCGGCGCGCCCCCTGCTTGTTTGCCCGCCACGGTCTGCGGGCGCTGCTGGCTGGCCGTTTTCTTGCATTTGTCCGTCCGCTGTTGCCAACCATGGCGGGAATTTCCGGTCTGCCAAACCGCCGCTTCCAGTTTTTCAACTGGTTAAGTGGATTGCTGTGGGTCAGCGTGGTAACCAGTTTTGGCTATGCCTTAAGTATGATTCCGTTCGTTAAAc < 2:135591/244‑1 (MQ=255) ctggctggCACAGCTTCCT‑GCTAAATATCACCAGCGCGCCACCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCAACCATGGCGGGAATTTCCGGTCTGCCAAACCGCCGCTTCCAGTTTTTCAACTGGTTAAGTGGATTGCTGTGGGTCAGCGTGGTAACCAGTTTTGGCTATGCCTTAAGTATGATTCCGTTCGTTAAACGCCAtt > 1:324914/1‑250 (MQ=255) ggcccaGCTTCCT‑GCAAAATATCCCCGCCGCGCCTCCTGTGTGTTTGCCCCCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGTCGTTTTCTTGCATTTTTCCGTACGCTGCTGCCAACCATGGCGGGAATTTCCGGTCTGCCAAACCGCCGCTTCCAGTTTTTCAACTGGTTAAGTGGATTGCTGTGGGTCAGCGTGGTAACCAGTTTTGGCTATGCCTGAAGTATGATTCCGTTCGTTAAACGCCATGAAGAt < 1:407605/246‑1 (MQ=255) ggcACATCTTCTT‑GTTAAAGATCCCCAGGGCGCATCCTGATTGTTTGTCCGCCGCGGTATGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCAACCATGGCGGGAATTTCCGGTCTGCCAAACCGCCGCTTCCAGTTTTTCAACTGGTTAAGTGGATTGCTGTGGGTCAGCGTGGTAACCAGTTTTGGCTATGCCTTAAGTAGGATTCCGTTCGTTAAACGCCATGAAGAt < 2:324914/250‑1 (MQ=255) cacaGCTTCCT‑GCAAAATATCACCAGCGCGCCCCCTGCATGTTTGCCCGCCCCGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTGCGCTGCTGCCAACCATGGCGGGAATTTCCGGTCTGCCAAACCGCCGCTTCCAGTTTTTCAACTGGTTAAGTGGATTGCTGTGGGTCAGCGTGGTAACCAGTTTTGGCTATGCCTTAAGTATGATTCCGTTCGTTAAACGCCATGAAGATCAg < 1:471187/251‑1 (MQ=255) aGCTTCCT‑GCTAAATATCACCAGCGCGCCACCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCAACCATGGCGGGAATTTCCGGTCTGCCAAACCGCCGCTTCCAGTTTTTCAACTGGTTAAGTGGATTGCTGTGGGGCAGCGTGGTAACCAGTTTTGGCTATGCCTTAAGTATGCTTCCGTTCGTTAAACGCCATGAAGATCAGGt > 2:428847/1‑250 (MQ=255) cccT‑GCTAAATACCCCCGGCGCGCCCCCTGCAGTTTTGCCCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCAACCATGGCGGGAATTTCCGGTCTGCCAAACCGCCGCTTCCAGTTTTTCAACTGGTTAAGTGGATTGCTGTGGGTCAGCGTGGTAACCAGTTTTGGCTATGCCTTAAGTATGATTCCGTTCGTTAAACGCCATGAAGATCAGGTAATg < 1:247775/249‑1 (MQ=255) aaTATCCCCAGCGCGCTACCTTCGTGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCAACCATGGCGGGAATTTCCGTTCTGCCAAACCGCCGCTTCCAGTTTTTCAACTGGTTAAGTGGATTGCTGTGGGTCAGCGTGGTAACCAGTTTTGGCTATGCCTTAAGTATGATTCCGTTCGTTAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCtg < 1:340187/251‑1 (MQ=255) | GTTTACTTTGTCATGTTTGCCACGCTGTTTTTAGAAAACGGCCTGCTGCCCGCCTCATTTTTGCCAGGCGACAGCTTGTTGATACTGGCAGGCGCATTGATTGCCCAGGGGGTT‑ATGGATTTTCTGCCTACGATTGCGATTCTGACCGCCGCAGCAAGTCTGGGCTGCTGGCTAAGTTATATTCAGGGGCGCTGG‑TTAGGGAATACCAAAACGGTGAAAGGCTGGCTGGCACAGCTTCCT‑GCTAAATATCACCAGCGCGCCACCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCAACCATGGCGGGAATTTCCGGTCTGCCAAACCGCCGCTTCCAGTTTTTCAACTGGTTAAGTGGATTGCTGTGGGTCAGCGTGGTAACCAGTTTTGGCTATGCCTTAAGTATGATTCCGTTCGTTAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCTG > NC_000913/3153644‑3154138 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |