| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | 2765412 = | 15 (0.270) | 19 (0.420) | 19/400 | 0.8 | 72.7% | intergenic (‑259/+101) | abpA/yfjM | anti‑bacteriophage protein/protein YfjM |
| ? | NC_000913 | = 2765419 | 2 (0.040) | intergenic (‑266/+94) | abpA/yfjM | anti‑bacteriophage protein/protein YfjM | |||||
GACAATTTTGCGAAAATTAAGGAGATGTTATGACACAGTCCAATCGGATCACTGCATCATCACCAGTGATCTAAATACTTCACAGCCATTCTCGGTCGCAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCA‑AATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCA‑ACC‑‑‑‑‑‑‑GCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTAT‑‑‑‑‑‑‑‑GGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCATTATTTCCTGGTTGGTAGGGTCATATCTCGATGCTCTTTGAGCAATGTCAACATCGCGTGTTCATGGCTTTCTATATTGTTGATGCCTTGCCCATCCGGACCCCACTCCTTATAGCTCATCATGATGGCTTGTTTTGGGCTCTC > NC_000913/2765166‑2765656 | gACAATTTTGAGCAAATTACGGAGATGTTATGACACAGTCCAATCGGATAACTGCATCATCACCAGTGATCTAAATACTTCACAGCCATTCTCGGTCGCAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTCACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCA‑AATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCA‑ACA‑‑‑‑‑‑‑gcact > 1:147075/1‑251 (MQ=255) 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aTTAAGGAGATGTTATGACACAGTCCAATCGGATCACTGCATCATCACCAGTGATCTAAATACTTCACAGCCATTCTCGGTCGCAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCA‑AATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCA‑ACC‑‑‑‑‑‑‑gcactatggcactatggcac > 2:21542/1‑251 (MQ=255) tAAGGAGATGTTATGACACAGTCCAATCGGATCACTGCATCATCACCAGTGATCTAAATACTTCACAGCCATTCTCGGTCGCAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCA‑AATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCA‑ACC‑‑‑‑‑‑‑gcactatggcactatggcact < 1:135796/250‑1 (MQ=255) gTTATGACACAGTCCAATCGGATCACTGCATCATCACCAGTGATCTAAATACTTCACAGCCATTCCCGGTCGCAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCA‑AATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCA‑ACC‑‑‑‑‑‑‑gcactatggcactatggcactatggcactat < 2:24870/251‑1 (MQ=255) 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catcaCCAGTGATCTAAATACATAACAGCCATTCTCGGGCGCAGGTACCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATAGTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACGAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGATTTGGTTTGCA‑AATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCA‑GCC‑‑‑‑‑‑‑GCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcaccg > 2:320953‑M2/1‑197 (MQ=255) catcaccagtgatctaaatacataacagccattctcgggcgcaggtaccaagcttttcaggattccacaaatagtgtaaccctgacgtctaatttggttatataacatactgccccaacgaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggatttggtttgcaaatagttcagagctgagaccgccagccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTAT‑‑‑‑‑‑‑‑GGCACTATGGCACTATGGCACCg > 2:320953‑M1/198‑251 (MQ=255) acccccaatGATCTAAAAACTCCACAACCACGCCCGGTCGCAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGGAACCCTGACATCTAATTTTGTTATATAACATAATACCCCAACTAACGAAAGATAGGCACATCCTTAATGAAGGTTTTGGTTTTTA‑AATAGTTCAGAGCTGAGAACGTCA‑ACC‑‑‑‑‑‑‑GCACtatggcactatggcactatggcactat‑‑‑‑‑‑‑‑ggcactatggcactatggcactatggcaccgc < 2:440266/243‑12 (MQ=255) 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cacaAATATTGTAACCCTGACGTCTACTTTGGTTATATAACATACTGCCCCCACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGCTTTTGGTTTTCA‑AATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCA‑ACC‑‑‑‑‑‑‑GCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactctgctactatggcaccgccagcgattgtaatcacaattgatattatcaaacacagttgcacgccttatttcctggttggt < 2:202570‑M2/249‑118 (MQ=255) cacaaatattgtaaccctgacgtctactttggttatataacatactgcccccactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaagcttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTAT‑‑‑‑‑‑‑‑GGCACTCTGCTACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACAATTGATATTATCAAACACAGTTGCACGCCTTATTTCCtggttggt < 2:202570‑M1/117‑1 (MQ=255) aCCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCA‑AATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCA‑ACC‑‑‑‑‑‑‑GCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcaccgccagcgattgtaatcacacttgatattataacacacagttgcacgcattatttcctggttggtagggtcatatctcg < 2:395288‑M2/250‑132 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |