| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 2,629,601 | IS2 (+) +5 bp | intergenic (+120/‑187) | yfgG → / → yfgH | nickel/cobalt stress response protein YfgG/lipoprotein YfgH |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 2629601 = | 0 (0.000) | 43 (0.620) | 43/488 | 0.5 | 100% | intergenic (+120/‑191) | yfgG/yfgH | nickel/cobalt stress response protein YfgG/lipoprotein YfgH |
| ? | NC_000913 | 2996361 = | NA (NA) | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
GCTCATCAGCTTTATCTTCTTCTTTGGCCGTTTTATCTACTCGTCCGTCGGTGCCTGGCAGCACCATCAGAGCAAAAAAGAAGCTCAGCAATCCACACTCTCCGTCGAATCACCGGTACAACGTTAGCGGTTACCTTCTCCACTTTCACAGAACATAACGGCACTTCGCTGTCGGATGCTTTTGCTGTTTGGGATTATCAAAGCGGCAGATATTCTTTCATCTTAAATTTTACGTCTTTATCCTGACTGATGTTTATCCTGTTTGGCTGCGAAATAAATATAAAATTAATATATATGTTGTAATGATATATTTTTATAAATTATTCCCTGCGTGAATTTTAATAAATTTAATCTATCCCTTTATACGCAATACATTTACTTTCCTCTTTTGATGATCTTAAATGTCTTATTTTTCGTAATGTGTATAACAAGGAATAGTGATGAAATTTAAAAAATGTCTTCTGCCTGTGGCAATGTTAGCGTCATTCACTCTGG > NC_000913/2629355‑2629849 | gcggagtccggagagtaacggaatagcagagagcttcgtgaaaacgataaagcgtgactacatcagtatcatgcccaaaccagacgggttaacggcagcaaagaaccttgcagaggcgttcgagcattataacgaatggcatccgcatagtgcgctgggttatcgctcgccacgggaatatcggcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatggctggaaatataggggcaaatccaCTGAt > 2:683159‑M1/247‑251 (MQ=255) cggagtccggagagtaacggaatagcagagagcttcgtgaaaacgctaaagcgtgactacatcagtatcttgcccaaaccagacgggttaacggcagcaaagatccttgcagaggcgttcgagcattctaacgaatggcctccgcatagtgcgctgggttatcgctcgcaacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaCTGAt < 1:96720‑M1/5‑1 (MQ=255) tcaGCTTTATCTTCTTCTTTGGCCGTTTTATCTACTCGTCCGTCGGTGCCTGGCAGCACCATCAGAGCAAAAACGAAGCTCAGCAATCCACACTCTCCGTCGAATCACCGGTACAACGTTAGCGGTTACCTTCTCCACTTTCACAGAACATAACGGCACTTCGCTGTCGGATGCTTTTGCTGTTTGGGATTATCAAAGCGGCAGATATTCTTTCATCTTAAATTTTACGTCTTTATCCTGACTGATtaga < 1:471219‑M2/250‑5 (MQ=255) gtccggagagtaacggaatggcagagagcttcgtgaaaacgataaagcgtgactacatcagtattaggcccaaaccagacgggttaacggcagcaaagagccttgcataggcgttcgagcattataacgaatggcatccgaatagtgcgcggggttatcgttcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagggataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaCTGATGTTTa > 2:620938‑M1/242‑251 (MQ=255) caGCTTTATCTTCTTCTTTGGCCGTTTTAGCTACTCGTCCGTCGGTGCCTGGCAGCACCATCAGAGCAAAAAAGAAGCTCAGCAATCCACACTCTCCGTCGAATCACCGGTACAACGTTAGCGGTTACCTTCTCCACTTTCACAGAACATAACGGCACTTCGCTGTCGGATGCTTTTGCTGTTTGGGATTATCAAAGCGGCAGATATTCTTTCATCTTAAATTTTACGTCTTTATCCTGACTGATtagact > 1:300731‑M2/1‑245 (MQ=255) cggagagtaacggaatagcagagagcttcgtgaaaacgataaagcgtgactacatcagtatcatgcccaaaccagacgggttaacggcagcaaagaaccttgcagaggcgttcgagcattataacgaatggcatccgcatagtgcgctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagctggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaagcccCGGATGTTTATcc > 2:242374‑M1/239‑251 (MQ=255) ggagagtaacggaatagcagagagcttcgtgaaaacgataaagcgtgactacatcagtatcatgcccaaaccagacgggttaacggcagcaaagaaccttgcagaggcgttcgagcattataacgaatggcatccgcatagtgcgctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaagccaCTGATGTTTATCCt > 1:215607‑M1/238‑251 (MQ=255) 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cggaatagcagagagcttcgtgaaaacgataaagcgtgactacatcagtatcatgcccaaaccagacgggttaacggcagcaaagaaccttgcagaggcgttcgagcattataacgaatggcatccgcatagtgcgctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcgtgtaatgtgttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaCTGATGTTTATCCTGTTTGGCTg > 1:481922‑M1/229‑251 (MQ=255) tccttgtcCGTTTTATCTACTCGTCCGACGGTGCCTGGCAGCACCATCAGAGCAAAAAAGAAGCTCAGCAATCCACACTCTCCGTCGAATCACCGGTACAACGTTAGCGGTTACCTTCTCCACTTTCACAGAACATAACGGCACTTCGCTGTCGGATGCTTTTTCTGTTTGGGATTATCAAAGCGGCAGATATTCTTTCATCTTAAATTTTACGTCTTTATCCTGACTGATtagactggccccctgaat > 2:205257‑M2/4‑231 (MQ=255) ttGGCCGTTTTATCTACTCGTCCGTCGGTGCCTGGCAGCACCATCCGAGCAAAAAAGAAGCTCAGCAATCCACACTCTCCGTCGAATCACCGGTACAACGTTAGCGGTTACCTTCTCCACTTTCACAGAACATAACGGCACTTCGCTGTCGGATGCTTTTGCTGTTTGGGATTATCAAAGCGGCAGATATTCTTTCATCTTAAATTTTACGTCTTTATCCTGACTGATtagactggccccctgaatctcc < 1:421807‑M2/250‑23 (MQ=255) 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agagagcttcgtgaaaacgataaagcgtgactacatcagtatcatgcccaaacaagacgggttaacggcagcaaagaaccttgcagaggcgttcgagcattataacgaatggaatccgcatagtgcgctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataaaagatgtctggaaatataggggcaaatccaCTGATGTTTATCCTGTTTGGCTGCGaaataa < 1:316359‑M1/31‑1 (MQ=255) gagagcttcgtgaaaacgataaagcgtgactacatcagtatcatgcccaaaccagacgggttaacggcagcaaagaaccttgcagaggcgttcgagcattataacgaatggcatccgcatagtgcgctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggtttagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaCTGATGTTTATCCTGTTTGGCTGCGaaataaat > 1:14428‑M1/219‑251 (MQ=255) agagcttcgtgaaaacgataaatcgtgactacatcagtatcatgcccaagccagacgggttaacgtcagcaaagaaccttgcagaggcgttcgagcagtataacgaatggcatccgcatagtgcgctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaCTGATGTTTATCCTGTTTGGCTGCGAaataaata > 2:590961‑M1/218‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |