| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 1,641,158 | IS1 (–) +8 bp | intergenic (+183/+174) | ynfU → / ← cspB | putative zinc‑binding protein YnfU/cold shock‑like protein CspB |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 258675 | NA (NA) | 15 (0.460) | 15/488 | 0.8 | 100% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 1641158 = | 0 (0.000) | intergenic (+183/+181) | ynfU/cspB | putative zinc‑binding protein YnfU/cold shock‑like protein CspB | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 1641165 | 0 (0.000) | 18 (0.560) | 18/488 | 0.6 | 100% | intergenic (+190/+174) | ynfU/cspB | putative zinc‑binding protein YnfU/cold shock‑like protein CspB |
| ? | NC_000913 | 1978503 = | NA (NA) | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
CTCATTGCAACAAAGTATTCCAGACAAATCTTAAAGCTGTAGCCTGATTGATTTTATTAGTAACAAGTATTTTTTATATTTTAATAATATATTTAAAGCAGATAATAAAAAACCCGCCTGAGCGGGTTTGAGATTGTGGTGCTTTTTGTGGGAGTCATCCACTTACGCACTTTGTTTTGCCATGCCAGCAGTTAGCTTCTGCTGTAAAACTATTCATGCAGCAAACCTGCACTTCACCACAATGGTTAGCATACTTTTCCTGATTAAGATTTTGCCAAATATGCTAGCCATTGTTTCATGTATTGGACCTCCTTACTTTTTATTAAAGAGATCCAATATTCACTACTCTGTCCGTATCTCTACTCAGGCATCAGCCTTCTTCGTTATCGTATACAGACGAGCGATGAATTTTAATCAGTAATGATGACATTTGCTGCTGCAGGACCTTTAGCACCACTCTCTATAGAGAAGGTAACCTTT > NC_000913/1640929‑1641408 | atcaatgattttctggtgcgtaccgggttgagaagcggtgtaagtgaactgcagttgccatgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCACTTCACCACAATGGTTAGc < 2:95875‑M2/21‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |