| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 431330 | 11 (0.340) | 17 (0.530) | 17/488 | 0.7 | 60.7% | coding (684/885 nt) | tsx | nucleoside‑specific channel‑forming protein Tsx |
| ? | NC_000913 | = 1979270 | NA (NA) | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
ACAATCAGAAATGCCGGGAATAAATCCCGGCATTTTCATAATCAGAAGTTGTAACCTACTACCAGGTAACCACCCCAGCCGGTAGAGCGAACGTTGAAGTTGCCGTTGCCGAAGTTCAGTTCTGCATCGTCGTTCCACTGACCACCGTCGTGCCAGTAACGAGCTACGACAGAGTAGTGCCAGTGATCGTAGTTCAGAGCCAGAATATGGCTGGAAGCGATAGAGTTATTAGTACGGGTCTTAATACCGTTGATTGCGTTACCGCTGTCATCCCCTAAATCGGAACCCCAGTCGAAGTTGGTGAAGCCGATGTAGCTCAGCTGACCGCCCCACAGATCGGTAATCGGCACAAAGTATTTAATTTTGAAACGGTAACCGTCCCACTCGTTTTCGTTCGCTGCGCCATAGTTCTGCCACTGGTATTTCGCATAGACGTTCATGGACAGGCTCATCGGCAGGCCAGTGTCGAT > NC_000913/431088‑431557 | aCAATCAGAAATGCCGGGAATAAATCCCGGCATTTTCATAATCAGAAGTTGTAACCTACTACCAGGTAACCACCCCAGCCGGTAGAGCGAACGTTGAAGTTGCCGTTGCCGAAGTTCAGTTCTGCATCGTCGTTCCACTGACCACCGTCGTGCCAGTAACGAGCTACGACAGAGTAGTGCCAGTGATCGTAGTTCAGAGCCAGAATATGGCTGGAAGCGATAGAGTTATTAGTACGGGTCTTAATACCGtt < 2:249079/251‑1 (MQ=255) 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atacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCGGGTCTTAATACCGTTGATTGCGTTACCGCTGTCATCCCCTAAATCGGAACCCCAGTCGAAGTTGGTGACGCCGATGTAGCTCAGCTGCCCg > 2:258784‑M2/159‑251 (MQ=255) ccGGTAGAGCGAACGTTGAAGTTGCCGTTGCCGAAGTTCAGTTCTGCATCGTCGTTCCACTGACCACCGTCGTGCCAGTAACGAGCTACGACAGAGTAGTGCCAGTGATCGTAGTTCAGAGCCAGAATATGGCTGGAAGCGATAGAGTTATTAGTACGGGTCTTAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcct < 1:61345‑M1/251‑87 (MQ=255) tAGAGCGAACGTTGAAGTTGCCGTTGCCGAAGTTCAGTTCTGCATCGTCGTTCCACTGACCACCGTCGTGCCAGTAACGAGCTACGACAGAGTAGTGCCAGTGATCGTAGTTCAGAGCCAGAATATGGCTGGAAGCGATAGAGTTATTAGTACGGGTCTTAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttc > 1:43393‑M1/1‑161 (MQ=255) 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tGCCAGTAACGCGCTACGACAGAGTAGTGCCAGTGATCGTAGTTCAGAGCCAGAATATGGCTGGAAGCGATAGAGTTATTAGTACGGGTCTTAATACCGTTGATTGCGTTACCGCTGTCATCCCCTAAATCGGAACCCCAGTCGAAGTTGGTGAAGCCGATGTAGCTCAGCTGACCGCCCCACAGATCGGTAATCGGCACAAAGTATTTAATTTTGAAACGGTAACCGTCCCACTCGTTTTCGTTCGCTgc > 2:17671/1‑251 (MQ=255) tcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCGGGTCTTAATACCGTTGATTGCGTTACCGCTGTCATCCCCTAAATCGGAACCCCAGTCGAAGTTGGTGAAGCCGATGTAGCTCAGCTGACCGCCCCACAGATCGGTAATCGGc > 2:98150‑M2/82‑195 (MQ=255) gAGCTACGACAGAGTAGTGCCAGTGATCGTAGTTCAGAGCCAGAATATGGCTGGAAGCGATAGAGTTATTAGTACGGGTCTTAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatcagcgctatctctgctctcactgccgtaaaa > 1:156366‑M1/1‑83 (MQ=255) agtGCCAGTGATCGTAGTTCAGAGCCAGAATATGGCTGGAAGCGATAGAGTTATTAGTACGGGTCTTAATACCGTTGATTGCGTTACCGCTGTCATCCCCTAAATCGGAACCCCAGTCGAAGTTGGTGAAGCCGATGTAGCTCAGCTGACCGCCCCACAGATCGGTAATCGGCACAAAGTATTTAATTTTGAAACGGTAACCGTCCCACTCGTTTTCGTTCGCTGCGCCATAGTTCTGCCACTGGTATTTc < 1:95673/251‑1 (MQ=255) acaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCGGGTCTTAATACCGTTGATTGCGTTACCGCTGTCATCCCCTAAATCGGAACCCCAGTCGAAGTTGGTGAAGCCGATGTAGCTCAGCTGACCGCCCCACAGATCGGTAATCGGCACAAAGTATTTAATTTTGAAACGGTAACCGTCCCACTCGTTTTCGTTCGCTGCGCCATAGTTCTGCCACTGGTATTTc > 2:56640‑M2/60‑251 (MQ=255) cAGTGATCGTAGTTCAGAGCCAGAATATGGCTGGAAGCGATAGAGTTATTAGTACGGGTCTTAATACCGTTGATTGCGTTACCGCTGTCATCCCCTAAATCGGAACCCCAGTCGAAGTTGGTGAAGCCGATGTAGCTCAGCTGACCGCCCCACAGATCGGTAATCGGCACAAAGTATTTAATTTTGAAACGGTAACCGTCCCACTCGTTTTCGTTCGCTGCGCCATAGTTCTGCCACTGGTATTTCGCATa < 1:17671/251‑1 (MQ=255) tcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCGGGTCTTAATACCGTTGATTGCGTTACCGCTGTCATCCCCTAAATCGGAACCCCAGTCGAAGTTGGGGAAGCCGATGTAGCTCAGATGCCCGCCCCACAGATCGGAAATCGGCACAAAGTATTTAATTTTGAAACGGTAACAGTCCCACTCGTTTTCGTTCGCTGCGCCCTAGTTAGGCCACTGGTATTTCGCATAGACg > 1:316281‑M2/51‑251 (MQ=255) cGTAGTTCAGAGCCAGAATATGGCTGGAAGCGATAGAGTTATTAGTACGGGTCTTAATACCGTTGATTGCGTTACCGCTGTCATCCCCTAAATCGGAACCCCAGTCGAAGTTGGTGAAGCCGATGTAGCTCAGCTGACCGCCCCACAGATCGGTAATCGGCACAAAGTATTTAATTTTGAAACGGTAACCGTCCCACTCGTTTTCGTTCGCTGCGCCATAGTTCTGCCACTGGTATTTCGCATAGACGtt < 1:11872/250‑1 (MQ=255) ggCTGGAAGCGATAGAGTTATTAGTACGGGTCTTAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatcagcgctatctctgctctcactgccgtaaaacatggcaactgcagttcacttacaccgcttctcaacccggtacgcacca < 2:102520‑M1/251‑217 (MQ=255) ggCTGGAAGCGATAGAGTTATTAGTACGGGTCTTAATACCGTTGATTGCGTTACCGCTGTCATCCCCTAAATCGGAACCCCAGTCGAAGTTGGTGAAGCCGATGTAGCTCAGCTGACCGCCCCACAGATCGGTAATCGGCACAAAGTATTTAATTTTGAAACGGTAACCGTCCCACTCGTTTTCGTTCGCTGCGCCATAGTTCTGCCACTGGTATTTCGCATAGACGTTCATGGACAGGCTCATCGGCAgg < 1:326767/251‑1 (MQ=255) gttggagtcattaccCGGGTCTTAATACCGTTGATTGCGTTACCGCTGTCATCCCCTAAATCGGAACCCCAGTCGAAGTTGGTGAAGCCGATGTAGCTCAGCTGACCGCCCCACAGATCGGTAATCGGCACAAAGTATTTAATTTTGAAACGGTAACCGTCCCACTCGTTTTCGTTCGCTGCGCCATAGTTCTGCCACTGGTATTTCGCATAGACGTTCATGGACAGGCTCATCGGCAGGCCAGTGTCGat > 1:78768‑M2/16‑251 (MQ=255) | ACAATCAGAAATGCCGGGAATAAATCCCGGCATTTTCATAATCAGAAGTTGTAACCTACTACCAGGTAACCACCCCAGCCGGTAGAGCGAACGTTGAAGTTGCCGTTGCCGAAGTTCAGTTCTGCATCGTCGTTCCACTGACCACCGTCGTGCCAGTAACGAGCTACGACAGAGTAGTGCCAGTGATCGTAGTTCAGAGCCAGAATATGGCTGGAAGCGATAGAGTTATTAGTACGGGTCTTAATACCGTTGATTGCGTTACCGCTGTCATCCCCTAAATCGGAACCCCAGTCGAAGTTGGTGAAGCCGATGTAGCTCAGCTGACCGCCCCACAGATCGGTAATCGGCACAAAGTATTTAATTTTGAAACGGTAACCGTCCCACTCGTTTTCGTTCGCTGCGCCATAGTTCTGCCACTGGTATTTCGCATAGACGTTCATGGACAGGCTCATCGGCAGGCCAGTGTCGAT > NC_000913/431088‑431557 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |