| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,560,455 | +G | intergenic (+589/+167) | rtcR → / ← glpG | DNA‑binding transcriptional activator RtcR/rhomboid protease GlpG |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,560,455 | 1 | . | G | 97.9% | 158.5 / NA | 47 | intergenic (+589/+167) | rtcR/glpG | DNA‑binding transcriptional activator RtcR/rhomboid protease GlpG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/0); major base G (16/30); minor base T (0/1); total (16/31) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.77e-01 | |||||||||||
ATCTTCTTTTACCATCAACGTGTTAGCAACGTTGAGATTGTTGGTGACAATGCGCAAATTGCTGTGATTGAGCAGTGCGTGCGCTACCGCTTCCGGCGTGGTGCC‑GATATCGATAAACAGCGTCGAGCC‑ATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGAT‑CGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGC‑CAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAGTTCGATAATACCGTTGTGACGTTGTGTTTGTTTCATTTATAAATCCCTGGAATTATTTTCGTTTTCGCGCATTGAGCGAATCAACAAAAGCCATCGCTAAACCCACG > NC_000913/3560205‑3560676 | aTCTTCTTTTACAATCAACGTGTTCGCAACGTTGAGATTGTTGGTGACAATGCGCAAATTGCTGTGATTGAGCAGTGCGTGCGCTACCGCTTCCGGCGTGGTGCA‑GATATCGATAAACAGCGTCGAGCC‑ATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGAT‑CGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGc > 2:164689/1‑251 (MQ=255) tcttTTACCATCAACGTGTTAGCAACGTTGAGATTGTTGGTGACAATGCGAAAATTGCTGTGATTGGGCAGGGCGGGCGCTACCGCTTCGGGCGTGGTGCC‑GATATCGATAACCAGCTTCGAGCC‑ATGGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGAT‑CGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGcg < 1:256090/248‑2 (MQ=255) ttaccaaaagcGTGTTAGCAACTTGGAGCTTGTTGGTGAAAATGCCAAAATTGCTGTGATTGAGCAGTGCGGGCGCTCCCGGTTCCGGCGTGGGGCC‑GATATCGAAAACCAGCGTCGAGCC‑TGTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGAT‑CGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGAt < 2:83248/240‑1 (MQ=255) ccaccAACGTGTTAGAAAGGTGGAGATTGTTGGTGACAATGCGCAAATTGCGTTGATTGGGAGGTGCGTGCGCTCCCGCTTCGGTCGTGGGGCG‑TATCTCAATAAACATCGTCGACCC‑ATGGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCGGGGTGGCCTTGCGAT‑CGTGCCACGGCGTTTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAgg < 2:184560/247‑1 (MQ=255) cAACGTGTTAGCAACGTTGAGATTGTTGGTGACAATGCGCAAATTGCTGTGATTGAGCAGTGCGTGCGCTACCGCTTCCGGCGTGGTGCC‑GATATCGATAAACAGCGTCGAGCC‑ATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGAT‑CGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGtttt > 1:70972/1‑251 (MQ=255) aaCGTGTTAGCAACGTTGAGATTGTTGGTGACAATGCGCAAATTGCTGTGATTGAGCAGTGCGTGCGCTACCGCTTCCGGCGTGGTGCC‑GATATCGATAAACAGCGTCGAGCC‑ATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGAT‑CGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTg > 1:156614/1‑251 (MQ=255) aaCGTGTTAGCAACGTTGAGATTGTTGGTGACAATGCGCAAATTGCTGTGATTGAGCAGTGCGTGCGCTACCGCTTCCGGCGTGGTGCC‑GATATCGATAAACAGCGTCGAGCC‑ATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGAT‑CGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTg > 2:41185/1‑251 (MQ=255) cGTGTTAGCAACGTTGAGATTGTTGGTGACAATGCGCAAATTGCTGTGATTGAGCAGTGCGTGCGCTACCGCTTCCGGCGTGGTGCC‑GATATCGATAAACAGCGTCGAGCC‑ATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGAT‑CGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCt > 2:104263/1‑251 (MQ=255) agagtTAGCAACGTTGAGATTGTTGGTGACAATTCGCAAATTGCTGTGATTGAGCAGTGCGTGCGCTACCGATTCCGGCGTGGTGCC‑GATATCGATAAACAGCGTCGAGCC‑ATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGAGGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGAGAT‑CGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAGGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCt > 2:104252/4‑251 (MQ=255) aGCACCGTTGAGATGGTTGGTGACAATGCGCAAATTGCTGTGATTGAGCAGTGCGTGCGTTACCGCTTCCGGCGTGGTGCC‑GATATCGATAAACAGCGTCGAGCC‑ATTGGGTATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGAT‑CGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCa < 1:278590/251‑1 (MQ=255) aaCGTTGAGATTGTTGGTGACAATGCGAAAATTGCTGTGATTGAGCAGTGCGGGCGCTACCGCTTCCGGCGGGGTGCC‑GATATCGATAAACAGCGTCGAGCC‑ATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGAT‑CGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCt < 1:122157/251‑1 (MQ=255) aCGTTGAGATTGTTGGTGACAATGCGCAAATTGCTGTGATTGAGCAGTGCGTGCGCTACCGCTTCCGGCGTGGTGCC‑GATATCGATAAACAGCGTCGAGCC‑ATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGAT‑CGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTc > 1:8063/1‑251 (MQ=255) gagaTTGTTGGTGACAATGCGCAAATTGCTGTGATTGAGCAGTGCGTGCGCTACCGCTTCCGGCGTGGTGCC‑GATATCGATAACCAGCGTCGAGCC‑ATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGAGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGAT‑CGTGCCACGGCGTGTTAACCGCACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTg > 1:289136/1‑250 (MQ=255) gagaTTGTGGGTGACAATGCGCAAATTGCTGTGATTGAGCAGTGCGTGCGCTACCGCTTCCGGCGTGGTGCC‑GATATCGATAACCAGCGTCGACCC‑ATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGAT‑CGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGa < 1:74272/251‑1 (MQ=255) tgttgGTGACAGTGCGCAAATTGCTGTGATTGAGCATTGCGTGCGCTACCGCTTCCGGCGTGGTGCC‑GATATCGATAAACAGCGTCGAGCC‑ATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGAT‑CGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACGGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTc < 1:262011/250‑1 (MQ=255) gACAATGCGCAATTTGCTGTGATGGAGCAGGGCGTGCCCTCCCGCTTCCGGCGGGGTGCC‑GTTTTCTATAAACAGCGGCGAGCC‑ATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGAGGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGAT‑CGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGaa < 1:150040/251‑1 (MQ=255) aaTTGCTGTGATTGAGCAGGGCGTGCGCTACCGTTTCGGGCGTGGTGCC‑GATAGCGATAAACAGCGTCGAGCC‑ATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGAT‑CGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCggg < 1:41185/251‑1 (MQ=255) tGCTGTGATTGAGCAGTGCGTGCGCTACCGCTTCCGGCGTGGTGCC‑GATATCGATAACCAGCGTCGAGCC‑ATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGAT‑CGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTg > 2:216928/1‑251 (MQ=255) gCTGTGATGGAGGAGTGCGTGCGCTACCTCTGCCGGGGGGGTGCC‑GTTATCGATAAACAGCGTCGGCCC‑ATTGGGGTGTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGAGGCGCTCTTTTTCTCCGGTCTGGGTGGCCTTGCGAT‑CGTGCCTCGGCGTTTTAACCGAACTGGAAGGCAGGGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTg < 1:300975/250‑1 (MQ=255) cTGTGATTGAGCAGTGCGTGCGCTACCGCTTCCGGCGTGGTGCC‑GATCTCGATAAACAGCGTCGAGCC‑ATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGAT‑CGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTgcc > 2:3421/1‑249 (MQ=255) cggtgcgtgcGCTACCGCTTCTGGGGGGGTGCA‑GATATTGATAAAGAGCGTCG‑GCCTATTGGGATTTTGCTCTGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGAT‑CGTGCCCCGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGct < 2:238100/249‑1 (MQ=255) cgtgcgCTACCGCTTCCGGCGTGGTGCC‑GATATCGATAAACAGCGTCGAGCC‑ATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGAT‑CGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTATAcc > 2:204967/1‑251 (MQ=255) aCCGCATCCGGCG‑GGTGCCCGATAACGAAAAACAGCGACAAGCC‑ATTGGGTATTTCCTCCGCCACTTTGCGGGAGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGAT‑CGTGCCACGGCTTGTAAACCGAACTGAAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGATGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGctc < 1:192238/248‑1 (MQ=255) ccGGCGTGGTGCC‑GATATCGATAAACAGCGTCGAGCC‑TTTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGTTCGGGGTGGCCTTGCGAT‑CGTGCCACGGCGTGTTACCCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCATCTCTTCGGTACt < 1:271566/250‑1 (MQ=255) ggtggtgCC‑GATATCGATAAACGGCGTCGAGCC‑ATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGAT‑CGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACAt < 1:74281/250‑1 (MQ=255) cc‑GATATCGATAAACAGCGTCGAGCC‑ATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGAT‑CGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATAAGGGTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACACGCTCTTCGGTACTGCCATAACCctg > 2:275702/1‑251 (MQ=255) c‑GATATCGCTAAACAGCGTCGAGCC‑ATTGGGGATTTGCTCCGCAACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGAT‑CGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCctgc > 1:272472/1‑251 (MQ=255) atatCGATAAACAGCGTGGGGCC‑ATTGGGGTTTTGCTCCCCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTCCGGTCTGGGTGGCCTTGCGAT‑CGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCctgctg < 1:169680/251‑1 (MQ=255) aaaaCAGCGCCGATCC‑ATTGGGTCTTGCCTCCGCCTCTGTGCGGGCGATGCGCTCTTTTCCTTCGGTCTGGGGGGCCTTGCGAT‑CGTGCCTCGGCGTGTTACCCATACTTGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCTCAGGATCAGTTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAAcc < 1:287994/250‑1 (MQ=255) cGTCGAGCC‑ATTTGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCTGTCTGTGTGGCCTTGCGAT‑CGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCTAATAGTCTGCTTGCTGCCGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGTTACTGACATAACCCTTCTGTTTAACCCGTTCgt > 1:185121/1‑250 (MQ=255) tCGAGCC‑ATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGAGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGAT‑CGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAGTTCGat > 2:148264/1‑250 (MQ=255) gAGCC‑ATTGGGGTTTTGCCCCGCCACTTTGGGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGAT‑CGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAGTTCGataat < 1:313727/251‑1 (MQ=255) tGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGAT‑CGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAGTTCGATAATACCGtt < 1:189089/250‑1 (MQ=255) gCTCCGCCCCTTTGCGGGCGGTGCCCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGAT‑CGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAGTTCGATAATACCGTTGTGACGTtgt < 1:295136/251‑1 (MQ=255) gCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTTTGGGTGGCCTTGCGAT‑CGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAGTTCGATAATACCGTTGTGACGTTGTGTTTGTTTCAtt < 1:245657/250‑1 (MQ=255) cGGGCTATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCGGGGTGGCCTGGCGAT‑CGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAGTTCGATAATACCGTTGTGACGTTGTGTTTGTTTCATTta < 1:67926/251‑1 (MQ=255) cGGGCGATGCGCTGTTTTTCTTGGGTCTGGGTGGCCTTGCGAT‑CGTGCCACGGCGTGTTAACCGACCTGGAGGGCAGCGCCGCTCCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAGTTCGATAATACCGTTGTGACGTTGTGTTTGTTTCAttt < 1:40082/250‑1 (MQ=255) ggCGATGCGTTCTTTTTCTCCGGGGTGGGTGGCCTTGCGAT‑CGGGCCTGGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCGCCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCGTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTGAACCAGTTCGATAATACCGTGGTGACGTTGTGTTTGTTTCATTtata < 2:132846/251‑1 (MQ=255) gCGATGCGCTTTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGGT‑CGTGCCAGGGGGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATTCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAGTTCGATAATACCGTTGTGACGTTGTGTTTGTTTCATTTATaa < 1:164689/251‑1 (MQ=255) tttCTTCGGTCTGGGGCGCCTGGCGATACG‑CCCACGGAGTATTTACCGAACTGAAAGGCAGCGCCGCCCCGCCATGATGGCGCAGGAGCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGTCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTTTTTAACCAGTTCTATAATACCGTTGTGACGTTGTGTTTGTTTCATTTATAAATCCCTTGAatt < 1:28762/250‑1 (MQ=255) tcGGTCTGGGTGGCCTTGCGAT‑CGTGCCCCGGCGTGTTAACCGAACGGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAGTTCGATAATACCGTTGTGACGTTGTGTTTGTTTCATTTATAAATCCCTGGAattatt < 1:85483/248‑1 (MQ=255) gggggggCCTGGCGGT‑CGTGCCACGGGGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATATCCCTGCTGTTTAACCAGTTCGATAATACCGTTGTGACGTTGTGTTTGTTTCATTTATAAATCCCTGGAATTAttttcgtttt < 2:267207/245‑1 (MQ=255) cGAT‑CGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACGGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAGTTCGATAATACCGTTGTGACGTTGTGTTTGTTTCATTTATAAATCCCTGGAATTATTTTCGTTTTCGCGCATTGAGCg < 1:216928/251‑1 (MQ=255) agcgggCCACGGCGGGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCAGCCCCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAGTTCGATAATACCGTTGTGACGTTGTGTTTGTTTCATTTATAAATCCCTGGAATTATTTTCGTTTTCGCGCATTGAGCGaa < 2:245094/246‑1 (MQ=255) ggAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAGTTCGATAATACCGTTGTGACGTTGTGTTTGTTTCATTTATAAATCCCTGGAATTATTTTCGTTTTCGCGCATTGAGCGAATCAACAAAAGCCATCGCTAAACCCACg < 2:8063/251‑1 (MQ=255) ccGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTAc > 1:42075/1‑103 (MQ=255) ccGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAGTTCGATAATACCGTTGTGACGTTGTGTTTGTTTCATTTATAAATCCCTGGAATTATTTTCGTTTTCGCGCATTGAGCGa > 2:285821/1‑207 (MQ=255) ccGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAGTTCGATAATACCGTTGTGACGTTGTGTTTGTTTCATTTATAAATCCCTGGAATTATTTTCGTTTTCGCGCATTGAGCGa < 1:285821/207‑1 (MQ=255) ccGCCATGATGGCGCAGGATCAGGGTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTAc < 2:42075/103‑1 (MQ=255) | ATCTTCTTTTACCATCAACGTGTTAGCAACGTTGAGATTGTTGGTGACAATGCGCAAATTGCTGTGATTGAGCAGTGCGTGCGCTACCGCTTCCGGCGTGGTGCC‑GATATCGATAAACAGCGTCGAGCC‑ATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGAT‑CGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGC‑CAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAGTTCGATAATACCGTTGTGACGTTGTGTTTGTTTCATTTATAAATCCCTGGAATTATTTTCGTTTTCGCGCATTGAGCGAATCAACAAAAGCCATCGCTAAACCCACG > NC_000913/3560205‑3560676 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |