| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 256107 | 49 (1.010) | 33 (0.700) | 31/478 | 0.5 | 43.6% | coding (131/459 nt) | gpt | xanthine‑guanine phsophoribosyltransferase |
| ? | NC_000913 | 371382 = | 38 (0.810) | coding (144/867 nt) | mhpC | 2‑hydroxy‑6‑ketonona‑2,4‑dienedioate hydrolase | |||||
CGTAGCGAAGGGCGTTATTACCGCCCAATCCCGGAGTGGATTGCCGGATTTGGCTCGTTAAGCGCCAGAACAGAGAACTGAATATGCAGGAGAAGATGATGAGTTATCAGCCACAAACCGAAGCCGCCACCAGCCGTTTTCTGAATGTAGAAGAAGCGGGTAAAACGCTGCGCATCCATTTTAATGACTGCGGACAAGGCGACGAAACCGTTGTCCTGCTGCATGGTTCCGGCCCGGGTGCTACTGGCTGGGCGAACTTCAGCCGCAATATCGATCCGCTGGTAGAGGCGGGCTATCGGGTGATCCTGCTGGATTGTCCGGGTTGGGGCAAGAGCGATTCGGTCGTTAATAGTGGTTCGCGATCGGATCTTAATGCACGAATCCTGAAAAGCGTGGTGGATCAACTGGATATCGCCAAAATCCACCTGCTGGGCAACTCGATGGGGGGCCATAGTTCTGTGGCGTTCACCCTTAAATGGCCGGAGCG > NC_000913/371141‑371627 | cGTAGCGAAGGGCGTTATGACCGCCCAACCCCGGAGTGGATTGCCGGATTTGGCTCGTTAAGCGCCAGAACAGAGAACTGAATATGCAGGAGAAGATGATGAGTTATCAGCCACAAACCGAAGCCGCCACCAGCCGTTTTCTGAATGTAGAAGAAGCGGGTAAAACGCTGCGCATCCATGTTAATGGCTGCGGACAAGGCGACGAACCCGTTGTGCGGCTGCATGGGGCCGGCCCGGGTGCTActggctgg < 2:60513/251‑1 (MQ=255) tcatgtgaaatactggtttttagtgcgccagatctctataatctcgagcaacctattttcccctcgaacactttttaagccgtagataaacaggctgggacacttcacatgagcgaaaaatacatcgtcacctgggacatgttgcagatccatgcacgtaaaatcgcaagccgactgatgccttctgaacaatggaaaggcattattgccgtaagccgtggcggtctgggaacgggtgcTACTGGCTGGGc > 1:326391‑M2/240‑251 (MQ=255) aGGGCGTTATTACCGCCCAATCCCGGAGTGGATTGCCGGATTTGGCTCGTTAAGCGCCAGAACAGAGAACTGAATATGCAGGAGAAGATGATGAGTTATCAGCCACAAACCGAAGCCGCCACCAGCCGTTTTCTGAATGTAGAAGAAGCGGGTAAAACGCTGCGCATCCATTTTAATGACTGCGGACAAGGCGACGAAACCGTTGTCCTGCTGCATGGTTCCGGCCCGGGTGCTACTGGCTGGGCGAACtt < 1:162102/251‑1 (MQ=255) gTTATTACCGCCCAATCCCGGAGTGGATTGCCGGATTTGGCTCGTTAAGCGCCAGAACAGAGAACTGAATATGCAGGAGAAGCTGCTGAGTTATCAGCCACAAACCGAAGACGCCACCAGCCGTTTTCTGAATGTAGAAGAAGCGGGTAAAACGCTGCGCATACATTTTAATGACTGCGGACAAGGCGACGAAACCGTTGTCCTGCTGCATGGTTCCGGCCCGGGTGCTACTGGCTGGGCGAACTTCAGcc > 1:234483/1‑251 (MQ=255) actgggttttagtgcgccagatcactataatctcgcgcagcctattgtccccgcgaacacgtcttaagccgtagataaacagtctgggacacttcacatgagcgaaaaatacatctacacctgggacatgttgcagatccatgcacgtaaactcgcatgcctactgattccttctgaacaatggaaaggcattattgccgtaattcgtggcggtctggtacccggtgcTACTGGCTGGGCGAACTTCAgca < 2:16544‑M2/23‑2 (MQ=255) tattaCCGCCCAATCCCGGAGTGGATTGCCGGATTTGGCTCGTTAAGCGCCAGAACAGAGAACTGAATATGCAGGAGAAGATGATGAGTTATCAGCCACAAACCGAAGCCGCCACCAGCCGTTTTCTGAATGTAGAAGAAGCGGGTAAAACGCTGCGCATCCATTTTAATGACTGCGGACAAGGCGACGAAACCGTTGTCCTGCTGCATGGTTCCGGCCCGGGTGCTACTGGCTGGGCGAACTTCAGCCGc > 2:156441/1‑251 (MQ=255) ttaCCGCCCAATCCCGGAGTGGATTGCCGGATTTGGCTCGTTAAGCGCCAGAACAGAGAACTGAATATGCAGGAGAAGATGATGAGTTATCAGCCACAAACCGAAGCCGCCACCAGCCGTTTTCTGAATGTAGAAGAAGCGGGTAAAACGCTGCGCATCCATTTTAATGACTGCGGACAAGGCGACGAAACCGTTGTCCTGCTGCATGGTTCCGGCCCGGGTGCTACTGGCTGGGCGAACTTCAGCCGCa > 1:188124/1‑250 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |