| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (69/27); new base C (0/28); total (69/56) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.68e-13 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 126 total aligned reads displayed.
AAGCCAGAGCTATTATCCAACAGATCGACGAAGCCGGTGGCATGGCGAAAGCGATCGAAGCAGGTCTGCCAAAACGAATGATCGAAGAGGCCTCAGCGCGCGAACAGTCGCTGATCGACCAGGG‑CAAGCGTGTCA‑TCGTTGGTGT‑CAACAA‑GT‑ACAAA‑CTGGATCACGAAGA‑CGAAACCGATG‑TACTTGAGA‑TCGACAACGTGATGGTGCGTAACGAGCAAATTGCTTC‑GCTGGAACGC‑ATTCGCGCCACCCGTGATGATGCCGCCGTAACCGCCGCGTTGAACGCCCTGACTCACGCCGCACAGCATAACGAAAACCTGCTGGCTGCCGCTGTTAATGCCGCTCGCGTTCGCGCCACCCTGGGTGAAATTTCCGATGCGCTGGAAGTCGCTTTCGACCGTTATCTGGTGCCAAGCCAGTGTGTTACCGGCGTGATTGCGCAAAGCTATCATCAGTCTGAGAAATCGGCCTCCGAGTTCGATGCCATTGTTGCGCA > NC_000913/3062072‑3062567 | aaGCCAGCGCTATTATCCAACAGATCGACGAAGCCGGTGGCCTGGCGAAAGCGATCGAAGCAGGTCTGCCAAAACGAATGATCGAAGAGGCCTCAGCGCGCGAACAGTCGCTGATCGACCAGGG‑CACGCGTGTCA‑TCGTTGGTGT‑CAACAA‑GT‑ACAAA‑CTGGCTCACGAAGA‑CGAAACCGATG‑TACTTGAGC‑TCGACAACGTGATGGTGCGTAACGAGCAAATTGCTTC‑GCTGGAACGC‑ATTCGCGCCAcc > 2:205334/1‑251 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |