| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 3,350,556 | IS1 (–) +8 bp | intergenic (‑97/‑14) | elbB ← / → arcZ | low activity glyoxalase ElbB/small regulatory RNA ArcZ |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3350556 = | 0 (0.000) | 29 (0.610) | 28/486 | 0.6 | 100% | intergenic (‑97/‑21) | elbB/arcZ | low activity glyoxalase ElbB/small regulatory RNA ArcZ |
| ? | NC_000913 | 3583428 = | NA (NA) | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 3350563 | 0 (0.000) | 44 (0.920) | 40/486 | 0.3 | 100% | intergenic (‑104/‑14) | elbB/arcZ | low activity glyoxalase ElbB/small regulatory RNA ArcZ |
| ? | NC_000913 | = 3584195 | NA (NA) | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
GTAATGAAGTTAGTATTCTTTTTAAGAATCAACCTGATTATCTTACTTTTTTAAGAGCAATGGATGGATTCGAAGTTAATGGATTACGATTATTTAGCCTCTCGATTCCAGAACCTTCAGTTAAAAACCTTTTTGCCGTAAATGAATTTTATAGAAATAATGATGATTTCATAAACCCTGATCTACAAGAACGGTTAGTGATCGGGGATTATAGCATTTCAATATTTACTTATGACATTAAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCGCTTCTCAACCCGGTACGCACCAGAAAATCATTGATATGGCCATGAATGGCGTTG > NC_000913/3583186‑3583675 | gTAATGAAGTTAGTATTCTTTTTAAGAATCAACCTGATTATCTTACTTTTTTAAGAGCAATGGATGGATTCGAAGTTAATGGATTACGATTATTTAGCCTCTCGATTCCAGAACCTTCAGTTAAAAACCTTTTTGCCGTAAATGAATTTTATAGAAATAATGATGATTTCATAAACCCTGATCTACAAGAACGGTTAGTGATCGGGGATTATAGCATTTCAATATTTACTTATGACATTAAAGGTGAtgc < 1:319729/250‑1 (MQ=255)gTAATGAAGTTAGTATTCTTTTTAAGAATCAACCTGATTATCTTACTTTTTTAAGAGCAATGGATGGATTCGAAGTTAATGGATTACGATTATTTAGCCTCTCGATTCCAGAACCTTCAGTTAAAAACCTTTTTGCCGTAAATGAATTTTATAGAAATAATGATGATTTCATAAACCCTGATCTACAAGAACGGTTAGTGATCGGGGATTATAGCATTTCAATATTTACTTATGACATTAAAGGTGAtgc < 1:321535/250‑1 (MQ=255) aTTCTTTTTAAGAATCAACCTGATTATCTTACTTTTTTAAGAGCAATGGATGGATTCGAAGTTAATGGATTACGATTATTTAGCCTCTCGATTCCAGAACCTTCAGTTAAAAACCTTTTTGCCGTAAATGAATTTTATAGAAATAATGATGATTTCATAAACCCTGATCTACAAGAACGGTTAGTGATCGGGGATTATAGCATTTCAATATTTACTTATGACATTAAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGAt > 2:475947/1‑251 (MQ=255) tCAACATGATTATCTTACTTGTTTAAGAGCAATGGATGTATTCGAAGGTAATGTATTACGATTATTTAGCCTCTCGATTCCAGAACCTTCAGTAACAAACCTTTTTGCCGTAGATGAATTTTATAGAAATAATGATTATTTCATAAACCATGGTCTACACGTACGGTTAGTTATCTGGGATTATAACATTTCTATATTTACTTATTACATTACAGTTGATGCTGCCACCTTACTGATTTCGTGTatgtagg > 2:278307/1‑247 (MQ=255) 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GTAATGAAGTTAGTATTCTTTTTAAGAATCAACCTGATTATCTTACTTTTTTAAGAGCAATGGATGGATTCGAAGTTAATGGATTACGATTATTTAGCCTCTCGATTCCAGAACCTTCAGTTAAAAACCTTTTTGCCGTAAATGAATTTTATAGAAATAATGATGATTTCATAAACCCTGATCTACAAGAACGGTTAGTGATCGGGGATTATAGCATTTCAATATTTACTTATGACATTAAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCGCTTCTCAACCCGGTACGCACCAGAAAATCATTGATATGGCCATGAATGGCGTTG > NC_000913/3583186‑3583675 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |