| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 256107 | 43 (0.900) | 43 (0.930) | 39/470 | 0.3 | 50.1% | coding (131/459 nt) | gpt | xanthine‑guanine phsophoribosyltransferase |
| ? | NC_000913 | 371382 = | 44 (0.960) | coding (144/867 nt) | mhpC | 2‑hydroxy‑6‑ketonona‑2,4‑dienedioate hydrolase | |||||
AACTGGCGTAGCGAAGGGCGTTATTACCGCCCAATCCCGGAGTGGATTGCCGGATTTGGCTCGTTAAGCGCCAGAACAGAGAACTGAATATGCAGGAGAAGATGATGAGTTATCAGCCACAAACCGAAGCCGCCACCAGCCGTTTTCTGAATGTAGAAGAAGCGGGTAAAACGCTGCGCATCCATTTTAATGACTGCGGACAAGGCGACGAAACCGTTGTCCTGCTGCATGGTTCCGGCCCGGGTGCTACTGGCTGGGCGAACTTCAGCCGCAATATCGATCCGCTGGTAGAGGCGGGCTATCGGGTGATCCTGCTGGATTGTCCGGGTTGGGGCAAGAGCGATTCGGTCGTTAATAGTGGT‑TCGCGATCGGATCTTAATGCACGAATCCTGAAAAGCGTGGTGGATCAACTGGATATCGCCAAAATCCACCTGCTGGGCAACTCGATGGGGGGCCATAGTTCTGTGGCGTTCACCCTTAAATGGCCGG > NC_000913/371135‑371623 | acgcggactcatgtgaaatactggtttttagtgcgccagatctctataatctcgcgcaacctattttcccctcgaacactttttaagccgtagataaacaggctgggacacttcacatgagcgaaaaatacatcgtcacctgggacatgttgcagatccatgcacgtaaactcgcaagccgactgatgccttctgaacaatggaaaggcattattgccgtaagccgtggcggtctggtaccgggtgcTAct > 2:7669‑M2/248‑251 (MQ=255)aaCTGGCGTAGCGAAGGGCGTTATTACCGCCCAATCCCGGAGTGGATTGCCGGATTTGGCTCGTTAAGCGCCAGAACAGAGAACTGAATATGCAGGAGAAGATGATGCGTTATCAGCCACAAACCGAAGCCGCCACCAGCCGTTTTCTGAATGTAGAAGAAGCGGGTAAAACGCTGCGCATCCATTTTAATGACTGCGGACAAGGCGACGAAACCGTTGTCCTGCTGCATGGTTCCGGCCCGGGTGCTAct > 1:164433/1‑251 (MQ=255) cgcggactcatgtgaaatactggtttttagtgcgccagatctctataatctcgcgcaacctattttcccctcgaacactttttaagccgtagataaacaggctgggacacttcacatgagcgaaaaatacatcgtcacctgggacatgttgcagatccatgcacgtacactcgcaagccgactgatgccttctgaacaatggaaaggcattattgccgtaagccgtggcggtctggtaccgggtgcTActg > 2:491442‑M2/247‑251 (MQ=255) ggCGTAGCGAAGGGCGTTATTACCGCCCAATCCCGGAGTGGATTGCCGGATTTGGCTCGTTAAGCGCCAGAACAGAGAACTGAATATGCAGGAGAAGATGATGAGTTATCAGCCACAAACCGAAGCCGCCACCAGCCGTTTTCTGAATGTAGAAGAAGCGGGTAAAACGCTGCGCATCCATTTTAATGACTGCGGTCAAGGCGACGAAACCGTTGTCCTGCTGCATGGTTCCGGCCCGGGTGCTActgg < 2:41799/249‑1 (MQ=255) 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2:248531‑M2/149‑150 (MQ=255) aggctgggacacttcacatgagcgaaaaatacatcgtcacctgggacatgttgcagatccatgcacgtaaactcgcaagccgactgatgccttctgaacaatggaaaggcattattgccgtaagccgtggcggtctggtaccgggtgcTa < 1:248531‑M2/2‑1 (MQ=255) aggctgggacacttcacatgagcgaaaaatacatcgtcacctgggacatgttgcagatccatgcacgtaaactcgcaagccgactgatgccttctgaacaatggaaaggcattattgccgtaagccgtggcggtctggtaccgggtgcTACTGGCTGGGCGAACTTCAGCCGCAATATCGATCCGCTGGTAGAGGCGGGCTATCGGGTGGTCCTGCTGGATTGTTCGGGTTGGGGCAAGAGCGGTTTGGTc > 2:266306‑M2/149‑251 (MQ=255) atgatgAGTTATCAGCCACAAACCGAAGCCGCCACCAGCCGTTTTCTGAATGTAGAAGAAGCGGGTAAAACGCTGCGCATCCATTTTAATGACTGCGGACAAGGCGACGAAACCGTTGTCCTGCTGCATGGTTCCGGCCCGGGTGCTACTGGCTGGGCGAACTTCAGCCGCAATATCGATCCGCTGGTAGAGGCGGGCTTTCGGGTGATCCTGCTGGATTGTCCGGGTTGGGGCAAGAGCGATTCGGTCGt > 1:486633/1‑251 (MQ=255) 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2:345045/1‑202 (MQ=255) ctggtaccgggtgcTACTGGCTGGGCGAACTTCAGCCGCAATATCGATCCGCTGGTAGAGGCGGGCTATCGGGTGATCCTGCTGGATTGTCCGGGTTGGGGCAAGAGCGATTCGGTCGTTAATAGGGGT‑TCGCGATCGTATCTTAATGCCCGAATCCTGAAAAGCGTGGTGGATCAACTGGATATCGCCAAAATCCCCCTGCTGGGCAACTCGATGGGGGGCCATAGTTTTGTGGCGTTCACCCTTAAATg > 1:137508‑M2/15‑251 (MQ=255) cccGGGTGCTACTGGCTGGGCGAACTTCAGCCGCAATATCGATCCGCTGGTAGAGGCGGGCTATCGGGTGATCCTGCTGGATTGTCCGGGTTGGGGCAAGAGCGATTCGGTCGTTAATAGTGGT‑TCGCGATCGGATCTTAATGCACGAATCCTGAAAAGCGTGGTGGATCAACTGGATATCGCCAAAATCCACCTGCTGGGCAACTCGATGGGGGGCCATAGTTCTGTGGCGTTCACCCTTAAATGGCCgg > 1:212806/1‑251 (MQ=255) | AACTGGCGTAGCGAAGGGCGTTATTACCGCCCAATCCCGGAGTGGATTGCCGGATTTGGCTCGTTAAGCGCCAGAACAGAGAACTGAATATGCAGGAGAAGATGATGAGTTATCAGCCACAAACCGAAGCCGCCACCAGCCGTTTTCTGAATGTAGAAGAAGCGGGTAAAACGCTGCGCATCCATTTTAATGACTGCGGACAAGGCGACGAAACCGTTGTCCTGCTGCATGGTTCCGGCCCGGGTGCTACTGGCTGGGCGAACTTCAGCCGCAATATCGATCCGCTGGTAGAGGCGGGCTATCGGGTGATCCTGCTGGATTGTCCGGGTTGGGGCAAGAGCGATTCGGTCGTTAATAGTGGT‑TCGCGATCGGATCTTAATGCACGAATCCTGAAAAGCGTGGTGGATCAACTGGATATCGCCAAAATCCACCTGCTGGGCAACTCGATGGGGGGCCATAGTTCTGTGGCGTTCACCCTTAAATGGCCGG > NC_000913/371135‑371623 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |